Nukleotydy, kwasy nukleinowe Flashcards
Rola DNA
- Zapis informacji o sekwencjach wszystkich białek organizmu i sekwencjach RNA
- Zapis informacji dotyczących regulacji syntezy poszczególnych białek, różnicowania komórek, rozwoju etc.
Rola RNA
- bezpośrednia rola w procesie syntezy białka
- elementy strukturalne rybosomów
- rybozym - transferaza peptydowa
- rola regulacyjna (np. miRNA)
Co jest podstawowym elementem strukturalnym kwasów nukleinowych DNA i RNA (polinukleotydów)?
NUKLEOTYDY
Budowa nukleotydu

Jakie wiązanie występuje w nukleotydzie pomiędzy cukrem a zasadą?
wiązanie β-N-glikozydowe
Jakie wiązanie występuje w nukleotydzie pomiędzy cukrem a resztą kwasu fosforowego?
Wiązanie fosfoestrowe
Jakie wyróżniamy zasady pirymidynowe?
- U - uracyl (RNA)
- T - tymina (DNA)
- C - cytozyna (DNA i RNA)
Jakie wyróżniamy zasady purynowe?
- A - adenina
- G - guanina
Jaka to zasada?

adenina
Jaka to zasada?

guanina
Jaka to zasada?

tymina
Jaka to zasada?

cytozyna
Jaka to zasada?

uracyl
Z czego zbudowany jest nukleozyd?
Z zasady azotowej połączonej wiązaniem β-N-glikozydowym z pentozami
Jaki to związek?

Ryboza
Jakie konformacje może przyjmować pierścień rybofuranozy?
- C-2’ endo (w helisie typu B DNA)
- C-3’endo (w helisie typu A DNA)
Funkcje nukleotydów
- Wchodzą w skład koenzymów (NAD+, FAD)
- Stanowią efektory allosteryczne reakcji enzymatycznych (ATP, AMP, CTP….)
- Aktywują metabolity na drogach przemian (UDPG, CDP-DAG)
- Stanowią podstawową formę energii chemicznej (ATP)
- Pośredniczą w procesach przekazywania sygnałów pomiędzy komórkami (cAMP, cGMP)
Właściwości fizyko-chemiczne zasad azotowych
- planarność
- tautomeria keto-enolowa i amino-iminowa
- pochłanienie promieniowania UV
- słaba rozpuszczalność w pH obojętnym
Jakie formy tautomeryczne dominują w purynach i pirymidynach?
Zarówno w purynach jak i w pirymidynach doinują formy keto (okso-) i amino-
Cechy helisy DNA typu B
- 10,4 bp/skręt
- prawoskrętna
Co oznacza, że nukleotyd ma konformacje syn-? Gdzie taka konformacja występuje?
Oznacza to, że zasada może rotować wokół wiązania N-glikozydowego. Konformację taką ma wyłącznie guanina w Z DNA