Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Biochemia > Nukleotydy, kwasy nukleinowe > Flashcards

Nukleotydy, kwasy nukleinowe Flashcards

1
Q

Rola DNA

A
  • ​Zapis informacji o sekwencjach wszystkich białek organizmu i sekwencjach RNA
  • Zapis informacji dotyczących regulacji syntezy poszczególnych białek, różnicowania komórek, rozwoju etc.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Rola RNA

A
  • bezpośrednia rola w procesie syntezy białka
  • elementy strukturalne rybosomów
  • rybozym - transferaza peptydowa
  • rola regulacyjna (np. miRNA)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Co jest podstawowym elementem strukturalnym kwasów nukleinowych DNA i RNA (polinukleotydów)?

A

NUKLEOTYDY

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Budowa nukleotydu

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Jakie wiązanie występuje w nukleotydzie pomiędzy cukrem a zasadą?

A

wiązanie β-N-glikozydowe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Jakie wiązanie występuje w nukleotydzie pomiędzy cukrem a resztą kwasu fosforowego?

A

Wiązanie fosfoestrowe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Jakie wyróżniamy zasady pirymidynowe?

A
  • U - uracyl (RNA)
  • T - tymina (DNA)
  • C - cytozyna (DNA i RNA)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Jakie wyróżniamy zasady purynowe?

A
  • A - adenina
  • G - guanina
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Jaka to zasada?

A

adenina

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Jaka to zasada?

A

guanina

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Jaka to zasada?

A

tymina

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Jaka to zasada?

A

cytozyna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Jaka to zasada?

A

uracyl

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Z czego zbudowany jest nukleozyd?

A

Z zasady azotowej połączonej wiązaniem β-N-glikozydowym z pentozami

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Jaki to związek?

A

Ryboza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Jakie konformacje może przyjmować pierścień rybofuranozy?

A
  • C-2’ endo (w helisie typu B DNA)
  • C-3’endo (w helisie typu A DNA)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Funkcje nukleotydów

A
  1. Wchodzą w skład koenzymów (NAD+, FAD)
  2. Stanowią efektory allosteryczne reakcji enzymatycznych (ATP, AMP, CTP….)
  3. Aktywują metabolity na drogach przemian (UDPG, CDP-DAG)
  4. Stanowią podstawową formę energii chemicznej (ATP)
  5. Pośredniczą w procesach przekazywania sygnałów pomiędzy komórkami (cAMP, cGMP)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Właściwości fizyko-chemiczne zasad azotowych

A
  • planarność
  • tautomeria keto-enolowa i amino-iminowa
  • pochłanienie promieniowania UV
  • słaba rozpuszczalność w pH obojętnym
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Jakie formy tautomeryczne dominują w purynach i pirymidynach?

A

Zarówno w purynach jak i w pirymidynach doinują formy keto (okso-) i amino-

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Cechy helisy DNA typu B

A
  • 10,4 bp/skręt
  • prawoskrętna
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Co oznacza, że nukleotyd ma konformacje syn-? Gdzie taka konformacja występuje?

A

Oznacza to, że zasada może rotować wokół wiązania N-glikozydowego. Konformację taką ma wyłącznie guanina w Z DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Co oznacza, że nukleotyd ma konformację anti-? Gdzie taka konformacja występuje?

A

W nukleotydach o takiej konformacji zasada nie rotuje wokół wiązania N-glikozydowego. Jest to najczęstsza konformacja w DNA i w RNA

23
Q

Jakie siły stabilizują strukturę DNA?

A
  • wiązania wodorowe pomiędzy komplementarnymi zasadami
  • ,,stacking interactions” interakcja hydrofobowa i siły van der Waalsa
24
Q

Przez co neutralizowane są ujemnie naładowane grupy fosforanowe w cząsteczce DNA?

A
  • jony (Mg2+)
  • poliaminy
  • dodatnio naładowane białka
25
Q

Czy sekwencja wpływa na strukturę większego rowka?

A

TAK

=> możliwe specyficzne wiązanie białek (regulacja!)

26
Q

Komplementarność zasad według Watson’a i Crick’a

A

GΞC

A=T

27
Q

Czynniki denaturujące

A
  • wysoka temperatura
  • rozpuszczalniki organiczne (np. formamid)
  • mocznik
  • wysokie pH
28
Q

Na czym polega efekt hiperchromowy

A

Roztwór zdenaturowanego DNA wykazuje większą absorbancję niż roztwór DNA niezdenaturowanego

29
Q

Rejony cząsteczki DNA bogate w jakie pary topnieją najszybciej?

A

W pary A=T

30
Q

Co dzieje się w środowisku alkalicznym z DNA i RNA

A
  • DNA - ulega rozdzieleniu na pojedyncze nici
  • RNA - ulega hydrolizie
31
Q

Która struktura DNA jest najczęstsza?

A

B DNA

32
Q

Gdzie występuje A DNA?

A

W RNA i hybrydach DNA/RNA

33
Q

Gdzie występuje Z-DNA?

A

W odcinkach 56 DNA o sekwencji CGCGCG

34
Q

Czym jest spowodowany ,,zygzak” szkieletu deoksyrybozowo-fosforanowego w Z-DNA?

A

Obecnością form syn- puryn

35
Q

Porównanie struktury A- B- i Z- DNA

A
36
Q

Który koniec wydłużają polimerazy DNA i RNA?

A

Koniec 3’

37
Q

W jakim kierunku odczytywana jest matryca?

A

3’ -> 5’

38
Q

W jakim kierunku zachodzi synteza nowej nici?

A

5’ -> 3’

39
Q

Jakie nukleazy wyróżniamy?

A
  • endonukleazy
  • egzonukleazy
40
Q

Jakie wiązanie hydrolizują egzonukleazy?

A

Wiązanie fosfodiestrowe pomiędzy końcowym nukleotydem a resztą nici

41
Q

Rodzaje egzonukleaz

A
  • 5’ -> 3’
  • 3’ -> 5’
42
Q

Jakie wyróżniamy typy helis DNA?

A
  1. B-DNA
  2. Z-DNA
  3. A-DNA
43
Q

Jaki kierunek skrętu ma helisa w A-DNA?

A

prawo

44
Q

Jaki kierunek skrętu ma helisa w B-DNA?

A

prawo

45
Q

Jaki kierunek skrętu ma helisa w Z-DNA?

A

lewo

46
Q

Ile zasad wypada na jeden skręt helisy A-DNA?

A

11

47
Q

Ile zasad wypada na jeden skręt helisy B-DNA?

A

10.4

48
Q

Jaki jest jeden z warunków występowania trójniciowej struktury DNA?

A

w jednej z nici muszą być same puryny

49
Q

Co to jest sekwencja palindromowa?

A

taka sekwencja DNA, dla której sekwencja komplementarna jest identyczna (przy założeniu, że obie sekwencje czytamy z uwzględnieniem polarności nici; zgodnie z przyjętym obyczajem - od końca 5’ do 3’)

5’ A A T T 3’
3’ T T A A 5’

lub

5’ A G G C C T 3’
3’ T C C G G A 5’

50
Q

Na czym polega powtórzenie lustrzane?

A
51
Q

Jak wygląda struktura “spinki do włosów”?

A
52
Q

Jak tworzy się “struktura krzyżowa”?

A

poprzez rozluźnienie struktur helikalnych

53
Q

Jak wygląda “struktura krzyżowa”?

A
54
Q

Za co odpowiedzialna jest sekwencja TATA?

A

Do sekwencji TATA wiąże się białko TBP (ang. TATA-binding protein) wchodzące w skład kompleksu preinicjacyjnego, który umożliwia polimerazie RNA rozpoznanie sekwencji promotora i rozpoczęcie transkrypcji. Po związaniu się TBP DNA ulega wygięciu.

Biochemia (10 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions