Structure des acides aminés Flashcards
Quels sont les unités de base des protéines?
Les acides aminés
Quel est la structure des acides aminés?
Ils comportent une fonction acide (COOH) et une fonction amine (NH2).
Qu’est ce qu’une substance amphotérique?
Une substance qui peut servir de base ou d’acide dépendant de la réaction (l’eau en est un exemple).
Dans les protéines, sous quelle forme retrouve-t-on toujours les acides aminés?
On les retrouves toujours en forme L et non D.
Comment est-ce qu’on détermine les propriétés des acides aminés et en quoi varient-ils?
On détermine leur propriétés à l’aide de la chaîne latérale R, et ils varient en taille, forme, charge, hydrophobicité et réactivité.
Nomme les types dans lesquels se catégorisent les acides aminés…
Acides aminés hydrophobes, acides aminés polaires non-chargés, acides aminé polaires chargés (négativement ou positivement).
Quelle est la particularité de l’acide aminé de l’histidine?
Le groupement imidazole de l’histidine peut gagner ou perdre un proton en fonction du pH, module son activité en fonction du pH. (Des fois polaire chargé positivement des fois non-chargé).
Quelle est la particularité de la glycine (acide aminé)?
C’est le seul acide aminé non-chiral, on le classe parfois en a.a polaire.
Ou se situent souvent les acides aminés hydrophobes?
À l’intérieur de la molécule/cellule car ils réagissent très faiblement avec l’eau. (ne participent pas directement aux réactions chimiques).
Avec quelle substance réagissent le plus les acides aminés polaires non-chargés?
Ils réagissent beaucoup avec l’eau, cela veut dire qu’il forment des contacts avec le solvant. Aussi, ils peuvent se retrouver à l’intérieur si des ponts H sont possibles.
À quel pH sont les acides aminés polaires chargés se chargent-ils?
Leur chaîne latérale est chargée à pH physiologique. Ils peuvent se situer aux mêmes endroits que les a.a polaires non-chargés.
Écrit la fonction Hendersson-Hasselbalch d’un acide aminé…
pH= pKa + log(base/acide)
Qu’est ce que le point isoélectrique?
C’est le point ou l’acide aminé est électriquement neutre.
pI = (pKa1 + pKa2)/2 , deux fonctions ionisables
pI = (pKa1 + pKa2)/2 , si diacide
pI = (pKa2 + pKa3)/2, si dibasique
Même principe s’applique aux peptides
Comment les chaînes latérales influencent-elles le point isoélectrique et le comportement en lien avec le pH?
Certains acides aminés possèdent des chaînes latérales ionisables.
Que sont les protéines?
Se sont des polymères d’acides aminés
Ou se situe le lien peptidique?
Entre le C=O et le N-H
Quelle est la différence entre un polypeptide et une protéine?
Les polypeptides sont des courtes chaînes d’acides aminés (moins que 50)
Les protéines sont des polypeptides longs ayant une structure tridimensionnelle définie.
Combien y a-t-il d’acides aminés et combien de combinaisons différentes existent de ceux-cis?
Il y a 20 a.a, et les combinaisons se multiplient exponentiellement à chaque peptide ajouté. Ex dipeptide = 20^2 = 400
Ou Tripeptide = 20^3 = 8000.
Quelles sont les différentes structures des protéines?
Structure primaire: arrangement linéaire des A.A
Structure secondaire: formations locales de structures tridimensionnellesà plusieurs A.A
Structure tertiaire: assemblage de structures secondaires en motifs formant la configuration native de la protéine
Structure quaternaire: assemblage de plusieurs polypeptides entre eux pour former une protéine fonctionnelle (sous-unités)
pI ou point isoélectrique correspond à quoi?
Ça correspond au pH dans lequel une molécule va être électriquement neutre. Soit porte pas de charge, soit une molécule dans laquelle les charges positives ou négatives vont s’équivaloir.
Qu’est ce que le zwitterion?
Espèce qui a des charges qui s’annulent.
