Proptiétés de l'eau et liaisons chimiques Flashcards
Dans quel milieu de matière se trouvent les réactions chimiques de la cellule?
Chimie aqueuse (ou l’eau est le solvant)
Biochimie= chimie en phase aqueuse
Quelles sont les propriétés macroscopiques de l’eau et qulles sont les particularités de sa structure?
Est un solvant et est abondant dans l’organisme.
La molécule H2O est polaire, il existe un déséquilibre au niveau de la répartition des charges sur la liaison O-H.
Cela veut dire qu’il y a la présence de dipôles permanent (la charge partielle de l’oxygène est négative alors que celle des hydrogènes est positive).
Qu’est ce qu’une interaction ionique (ponts salins)?
Interaction électrostatique entre deux groupements de charges opposées (ions).
Comme l’interaction entre le groupement carboxylate (COO-) et amino (NH3+)
Qu’est-ce qu’une liaison hydrogène (ponts H) et pourquoi l’eau est-elle en mesure d’en produire?
Une liaison hydrogène peut se produire entre deux molécules polaires, par conséquant, (l’eau étant une molécule polaire) les molécules d’eau peuvent s’attirer entre-elles. (Pont H= 1/20 d’énergie comparé à une liaison covalente)
De quels endroits est mesuré le rayon de van der Waals?
C’est la distance entre le noyau et sa surface électronique réele.
Dans la glace (T plus petit que 0 degrés Celcius), quel structure se forme?
La structure cristalline, en forme tétrahédrique. (Liaisons H autour du O). Contribuant à la solidité de la glace.
Pour quelles molécules l’eau est-elle un excellent solvant?
Pour les molécules ionisables et polaires.
Ex NaCl
Ex Glucose et saccharose (Ponts H)
Que sont les interactions de van der Waals?
Interactions électrostatiques entre des molécules polaires non-chargées, force de liaison plus faible que les liaisons hydrogène. (les molécules ne doivent pas être loin de 3 Aanstrom pour une interaction optimale, sinon répulsion ou attraction).
C’est quoi l’effet hydrophobe?
Les molécules non polaires vont génerer des interactions hydrophobes avec des molécules polaires.
Le phénomène d’exclusion se produit, dans laquelle des gouttes d’huile diminuent la surface de contact avec H2O.
Cet effet est important pour le repliement des protéines et pour la formation des membranes.
C’est quoi une molécule amphipathique/amphiphile?
C’est des molécules qui possèdent 2 portions; une polaire/ionique et une apolaire.
Donc une va être hydrophile et l’autre hydrophobe. (Ex les acides gras)
Comment est-ce que les monocouches réduisent leur surface de contact avec H2O?
Il va y avoir une formation de têtes polaires/ionisées (hydrophile) et de queues apolaires à l’intérieur (hydrophobe)
À quoi est-ce que toutes ces forces/liaisons servent-elles en biologie?
Elles maintiennent les conformations des polymères biologiques.
Quelles-sont les structures formées par des liaisons non-covalentes?
Le cytosquelette (Filaments d’actine et microtubules) et les membranes lipidiques (têtes = Ponts H + interactions ioniques) (queues = van der Waals + effet hydrophobe)
Quel est l’avantage des liaisons non covalentes face aux liaisons covalentes?
Les liaisons covalentes sont dynamiques, il est beaucoup plus facile/rapide de les former et les défaire.
Explique le phénomène de l’osmose…
C’est la diffusion de l’eau (solvant) à travers une membrane semi-perméable (d’un endroit ou la concentration de soluté est moins présente à plus présente). La pression osmotique est nécaissaire pour empêcher le flux du solvant.