SNP +sanger sequencen Flashcards
Wat is een SNP?
een mutatie op ons chromosoom, die 1 nucleotide verschilt. SNP komen om doe 1000 bp voor. HEt zijn mutaties die in de geslachtscellen hebben plaatsgevonden. Het allee moet in meer dan 1% voorkomen in de populatie.
discriminerende waarde is laag. 50-80 SNPs voor DNA profiel.
Methode om SNP te indentificeren.
Sanger sequencen
primer-extensie (mini sequencen, single base extensie)
Welke allelen zijn verantwoordlijk voor oogkleur.
OCA2, HERC2, MATP
waarom is sanger sequencing interessant?
ziekte indentificeren
gebruik van medicijnen
evolutionair
forensich –> genotypen in bepaalde regio’s
Wat doen ddNTP’s
Deze stoppen de ketenverlenging de door de taqpolymerase wordt gedaan. ddNTP’s missen een OH-groep.