artefacten

Question 1

verschillende artefacten

meest voorkomende

Answer 1

stotter piek
split piek
pull up
OL
Te veel/weinig DNA
Gedegradeerd
Mengprofiel

Question 2

stotter piek

Answer 2

repeat korter dan werkelijke allel. Hoogte is 15% minder dan werkelijke repeat

Question 3

ontstaan stotter piek

Answer 3

tijdens de TAQ polemerase slaat een repeat over. Of maakt een circkel en begint weer opnieuw (repeat langer)

Dit is strand slippage.

Question 4

Andere artefacten

Answer 4

overloaded profile

Question 5

split piek

Answer 5

taq bouwt overal aan het einde een nucleotide in.

ook bekend als terminal transferase

oorzaak: taq werkt niet optimaal of teveel DNA
oplossing: nog een x de extentie stap uitvoeren

Question 6

pull up

Answer 6

dit ontstaat doordat er een emissie spectra dat overlapt

bestaat uit meer dan 1 kleur

Question 7

OL

Answer 7

of ladder, piek is onbekend en staat niet op de allelen ladden.

range is 0,5

Question 8

te veel DNA

Answer 8

er is veel fluorisatie van de fluor wat er toe leidt dat de camera geen goede indicatie meer kan geven van de hoeveelheid DNA

veel ruis, stotter pieken, split pieken, pull ups

Question 9

te weinig DNA

(low copy number DNA)

Answer 9

DNA monster zit onder de 100 pg.

Allel drop out en drop in, geen piek blans, locus drop out, ernstige stotter pieken
Aantal cycli verhogen naar 34 , wel meer artefacten.

Question 10

mengprofielen

Answer 10

meer dan twee allelen op 1 loci zichtbaar.