DNA kwatificatie Flashcards
Wanner moet je concentratie van DNA aanpassen?
te veel - sampel verdunnen
te weinig - sample concentreren
DNA kwatificatie heeft een optimale range
Methodes DNA visualiseren
- agarose gel
- UV spectrofotometrie
- Fluorescentie spectrofotometrie
- hybridisatie
- Real time PCR (QPCR)
agarose gel
Concentratie van DNA
krijgt snel uitslag en zegt iets over lengte van DNA (voordeel)
Is subjectief, carcinogeen en niet specifiek. (nadelen)
UV spectrofotometrie
Nucleinezuren absorberen licht vanwege de ringstructuren van de nucleinezuren. (bij maximaal 260 nm)
meet slecht lage concentraties (+0,1) , niet humaan specifiek
werkt snel
Fluorescentie spectrofotometrie
werkt als UV spetrometrie, alleen wordt de fluorisentie gemeten. Fluoriscentie van picogreen wordt gemeten. Door pico green toe te voegen neemt de fluoriscentie 1000x toe.
ijklijn maken om concentratie te meten
niet humaan specifiek
erg gevoelig (25 pg)
hybridisatie
DNA wordt op nylon membraan gedaan en werd gedenaturaseerd. Er werd vervolgens een humaan specifieke probe toegevoegd.
humaan specifiek
lage gevoeligheid, subjectief, kost veel tijd.
Waarom DNA kwantificeren?
Om ervoor te zorgen dat de concentratie DNA in de optimale range komt van een PCR.