Semaine 12: Enzymologie

Question 1

Plus le km est haut, plus l’affinité est _

Answer 1

basse

Question 1

Qu’est ce que l’énergie d’activation?

Answer 1

Qté d’énergie nécessaire pour atteindre l’état de transition

Question 2

Plus le km est bas, plus l’affinité est _

Answer 2

haute

Question 3

Plus le kcat est haut, plus la vitesse est _

Answer 3

haute

Question 4

Quel est l’effet d’un catalyseur sur une réaction chimique spontanée?

Answer 4

augmente la vitesse

Question 5

Comment une enzyme accélère une réaction ?

Answer 5

En diminuant l’énergie d’activation

Question 6

Qu’est ce que l’énergie d’activation?

Answer 6

Énergie nécessaire pour atteindre l’état de transition

Question 7

que représente le Kcat?

Answer 7

nombre de réactions catalysées par seconde

Question 8

Que représente le Knon?

Answer 8

nombre de réaction par seconde (sans catalyseur)

Question 9

Comment on calcul le taux d’accélération d’une réaction?

Answer 9

kcat/knon

Question 10

Dans quelles conditions fonctionnent les enzymes?

Answer 10

Température similaire à celle de l’hôte, pression normale, milieux aqueux

Question 11

Qu’est ce que le site actif d’un enzyme?

Answer 11

faible fraction de l’enzyme dont la géométrie et les propriétés biophysiques sont complémentaires à celles du substrat

Question 12

Quelles sont les deux régions que contient le site actif et à quoi servent-elles?

Answer 12

Région de spécificité: les groupements polaires et non polaires de l’enzyme forment des interactions faibles avec le substrat
Région de réaction: des groupements provenant de
résidus d’acides aminés et de cofacteurs/coenzymes participent à la réaction chimique

Question 13

Par quelles liaisons sont maintenus le substrat + site actif?

Answer 13

liaisons H et liaisons hydrophobes

Question 14

Quel est le produit principal de l’hydrolyse de l’amidon par l’amylase?

Answer 14

maltose

Question 15

Quels sont les deux modèles de liaison du substrat et comment fonctionnent-ils?

Answer 15

Clé-serrure: le site actif est préformé, si le SA et substrat fit il y aura la réaction

Réarrangement induit: a liaison du substrat entraine un changement conformationnel de l’enzyme qui aligne correctement certains résidus importants pour la catalyse.

Question 16

Comment fonctionne l’amylase?

Answer 16

Hydrolyse les liens alpha 1-4 des molécules d’amidon

Question 17

Comment fonctionnent les oxydoréductases ?

Answer 17

Oxydation d’un substrat avec la réduction d’un autre substrat. Ajout/retrait d’O et/ou H
Ex: C=O devient CH-OH

Question 18

Comment fonctionnent les transférases?

Answer 18

Transfert d’un groupement contenant C, N, P ou S d’un substrat à un autre

Question 19

Comment fonctionnent les hydrolases?

Answer 19

Rupture de liaisons C-O, C-N, O-P et C-S par l’addition d’une molécule d’eau.

Question 20

Comment fonctionnent les lyases?

Answer 20

rupture de liaisons C-C, C-O ou C-N autrement que par l’addition d’une molécule d’eau.

Question 21

Comment fonctionnent les isomérases?

Answer 21

réarrangements intramoléculaires et produisent des
isomères (optiques, géométriques ou de position).

Question 22

Comment fonctionnent les ligases?

Answer 22

union de deux molécules aux dépens de l’hydrolyse d’une liaison phosphate à haute énergie.

Question 23

Comment fonctionnent les translocases?

Answer 23

Transfèrent des ions ou des molécules de part et d’autre d’une membrane ou catalysent leur séparation dans une membrane
Source d’énergie: ATP
p25

Question 24

C’est quoi un cofacteur et un coenzyme? Quelle est la différence?

Answer 24

Ce sont des groupement non protéiques des enzymes
Coenzymes si ce sont des molécules organiques

Question 25

Les ions métalliques et les groupements prothétiques sont des _

Answer 25

cofacteurs

Question 26

Qu’est ce qu’un groupement prosthétique?

Answer 26

Groupements liés fortement à l’apoenzyme (partie protéique de l’enzyme)

Question 27

De quoi dépend la vitesse de réaction?

Answer 27

Quantité de complexes enzyme-substrat multipliée par la constante catalytique, kcat.

Question 28

De quoi dépend la qté de complexe enzyme-substrat à l’équilibre dynamique?

Answer 28

de la quantité de substrat présente, de l’affinité de l’enzyme pour son substrat, et de la valeur de kcat.

Question 29

Qu’est ce que la constante de michaelis?

Answer 29

concentration en substrat où la vitesse de réaction vaut la moitié de la vitesse maximale.

Question 30

Quelle est l’unité de la constante de michaelis?

Answer 30

la concentration

Question 31

Comment on calcule kcat ?

Answer 31

Vmax / concentration d’enzyme

Question 32

Quelle est l’unité de kcat?

Answer 32

temps^-1(équivaut au nombre d’évenement de catalyse par unité de temps

Question 33

Comment on calcule l’activité enzymatique?

Answer 33

qté de S ou P / t

Question 34

Qu’est ce qu’une unité enzymatique?

Answer 34

1 hmol de substrat pour 1 min

Question 35

Comment on calcule l’activité spécifique ?

Answer 35

Activité enzymatique (U)/ qté de protéine

Question 36

Comment on calcule l’activité total ?

Answer 36

U / qté de prot mg