Semaine 11 Flashcards
Quand on parle de longueur d’un microsatellite, on parle de la taille totale de l’accumulation de la répétion ou bien du nombre de pb du motif
Nombre de pb de motif
” (GGAT)165” est un minisatellite ou microsatellite
micro
où était minisatellite a “parti la balle “ de la médecine légale
dans un premier intron
Qu’est ce qui apartie la bal des empritn eà l,ADN
C’est le minisatellite du premier intron de 33pb
Au début, avec quelle analyse on didentifier les personnes ?
Sous quel principe est-ce basé ?
Southern génomiques
à l’aide de
sondes
multi-locus
Mais le principe est simple car il s’agit d’appliquer les
principes de la première loi et de la deuxième lois
de Mendel
Il s’agit de la séparation des allèles d’un même
locus et de la séparation indépendante des allèles
de locus différents
Est ce que on utilise toujours les minisatellite en medecine légale
Les minisatellites ont été remplacés pour l’identification , on prend microsatellite
Quelle a été l’importance de la contribution des travaux de Jeffreys
importance Jeffrey :
IDÉE d’utiliser test ADN
Quel microsatellites on utilise en medecine légale
motif de 4pb
Motif polymorphe dérivant de sequences poly A des rep de la famille aly
COmment sont nommées les allèles des str
Les allèles des STR sont nommés selon le
nombre de répétitions qu’ils comportent ( de microsatellite)
Comment on utilise les microsatellite ( STR
pour
identifier les personnes
on les amplifie par PCR à l’aide d’amorces
spécifiques
dont une marqué par fluorescence
suivie de séparation par électrophorèse en
capillaire
vrai ou faux
Le système d’électrophorèse en capillaire
utilisé pour déterminer les génotypes des
STR
est du même type que celui dont on se sert
dans la méthode de séquençage Sanger
automatisé
Est ce que les echelles alléliques de STr sont les même s
non
sont des mélanges artificielles de tous les allèles connus à chaque locus Chaque personne en aura deux (si hétérozygote) ou un (si homozygote)
Que sont les avantages des STR pour la médecine légale ?
désavantage ?
même question pour SNP
STR ;
avantage: Très discriminant
pas très bon avec les ADN dégraéd
SNP :
Utilisable sur de l’ADN dégradé
Peu discriminant
On utilisera des SNP ou STR pour un ADN dégradé
SNP
De quoi se sert on pour suivre la lignée paternelle?
Maternelle ?
On se sert des STR du chromosome Y pour suivre la lignée paternelle
On se sert des SNP de l’ADN mitochondrial pour suivre la lignée maternelle
Comment a t’on une confirmation de sexe ?
…une confirmation du sexe grâce à la technique d'amplification du premier intron du gène de l'amélogénine… Ce gène se trouve sur le chromosome X et sur le chromosome Y Il se trouve dans la région du chromosome Y qui ne recombine pas avec le chromosome X
Le gène codant l’amélogénine permet
d’obtenir par PCR des fragments dont la
taille varie en fonction du sexe
Pourquoi on peut calculer la pb de retrouve run genotype particulier ?
Que signifie une probabilité forte &
faible
On connaît la fréquence des ≠ allèles à chaque locus dans la population Donc on peut calculer la probabilité de retrouver un génotype particulier celui de la personne en question pour l’ensemble des locus mis à l’épreuve
Faible= faible chance de se tromper
C’est parce qu‘il existe beaucoup d’allèles ≠ à
chaque locus
8 à 23 (et même plus)
Donc avec une quinzaine de locus comme ça
Il y a beaucoup de variabilité… !!
haute = bcp de chance de se tromper
Qu’est ce que l’equilibre de HArdy Weinberge
L’équilibre de Hardy-Weinberg permet de passer facilement de la fréquence d'un allèle à la proportion d'homozygotes et d'hétérozygotes (et inversement)
On connait la frequence des allèle dans la population
Donc on peut calculer la proba de trouver par hasard le génotype de chaque locus ainsi que la probabilité de tomber sur un
individu avec le profil en question
Les fréquences respectives des deux allèles sont désignés par p et q Les fréquences respectives des deux homozygotes sont p2 et q2 La fréquence des hétérozygotes est 2pq
La règle des produits peut elle s’appliquer à l’ADN mitochrondial ?
Chromosome Y
L’ADN mitochondrial et le chromosome Y sont chacun une seule molécule
d’ADN
de sorte que l’on ne peut multiplier les probabilités de polymorphismes
individuels comme on le peut pour les STR des autosomes
Donc le « product rule » ne s’applique pas aux fréquences des
polymorphismes individuels de l’ADN mitochondrial ou du chromosome Y
Même raisonement
VRAi ou faux Donc la probabilité de tomber par hasard sur
deux profils identiques de l’ADN
mitochondrial et du chromosome Y est non
négligeable (un sur 1000 environ)
vrai
Les SNP sont ils toujours sans effet
Faut, s’ils sont dans séquence regulatrice il peut y avoir des effets. Dans seuqnece non codante non, Sauf si dans sequence regulatrice