*RÉVISION* MMD1042 - ADN

Question 1

Qu’est-ce que le phénotype?

Answer 1

L’apparence ou comportement observable chez un organisme.

Question 2

Qu’est-ce que le génotype?

Answer 2

Information portée par le génome

Question 3

Quel est le nom du principe par lequel une souche bactérienne peut transférer son phénotype et sa pathogénicité à une autre souche?

Answer 3

Principe de transformation

Question 4

Quelle est l’unité de base des acides nucléiques (ADN et ARN)?

Answer 4

Nucléotides

Question 5

Quels sont les composantes d’un nucléotide?

Answer 5

1. Une base azotée
2. Un sucre à 5 carbones
3. Un ou plusieurs groupements phosphate

Question 6

Quelles sont les composantes d’un nucléoside?

Answer 6

1. Base azotée
2. Sucre

Question 7

Quelles sont les 5 bases que l’ont peut retrouver dans un nucléotide?

Laquelle se trouve uniquement dans l’ARN?

Laquelle se trouve uniquement dans l’ADN?

Answer 7

• Adénine
• Guanine
• Cytosine
• Uracile (Uniquement dans ARN)
• Thymine (Uniquement dans ADN)

Question 8

Quels sont les 5 nucléosides?

Answer 8

• Adénosine
• Guanosine
• Cytidine
• Uridine
• Thymidine

Question 9

Parmi les bases azotées, lesquelles sont:

1. Des purines?
2. Des pyrimidines?

Answer 9

1. Adénine et Guanine
2. Thymine, cytosine, uracile

Question 10

L’ADN diffère de l’ARN de par la composition du pentose (sucre à 5 carbones) de leurs nucléotides.

1. Qu’est-ce qui est à la base de cette différence de composition?
2. Quel est le nom de chacun de ces deux pentoses?
3. Quelle est sa conséquence sur la stabilité de l’ADN vs celle de l’ARN?

Answer 10

1. Groupement hydroxyle (OH) sur le carbone 2’ de l’ARN. On ne retrouve que H sur le carbone 2’ de l’ADN.
2. Ribose (ARN) et Désoxyribose (ADN)
3. l’ADN est beaucoup plus stable que l’ARN

Question 11

Lorsqu’on ajoute un phosphate à un nucléotide, quel effet cela a-t-il sur la charge électrique de ce dernier?

Answer 11

Cela rend le nucléotide négativement chargé.

Question 12

Sur quel carbone du sucre d’un nucléotide le groupement phosphate est-il ajouté?

Sur quel groupement de ce carbone?

Answer 12

Le carbone 3’.

Sur son groupement hydroxyle.

Question 13

Quels liens unissent les nucléotides?

Entre quels carbones du pentose (sucre du nucléotide) se trouvent ces liens?

Answer 13

Les liens phosphodiester

Entre les carbones 5’ et 3’

Question 14

Décrivez la structure de l’ADN selon:

• Sa forme dans l’espace
• Sa polarité
• L’orientation de ses brins l’un par rapport à l’autre
• La relation des bases azotées d’un brin par rapport à l’autre

Answer 14

• Forme de double hélice, les bases azotées sont situées à l’intérieur
• Polarité 5’ -> 3’
• Brins antiparallèles
• Brins complémentaires (A-T, C-G) (liés ensemble par des ponts hydrogène)

Question 15

De quoi est constitué le squelette de l’ADN?

Answer 15

Sucres et phosphates

Question 16

Combient y a-t’il de pont H entre l’adénine et la thymine?

Combien y en a-t’il entre la guanine et la cytosine?

Quel appariement est plus fort ou plus stable ?

Answer 16

A-T: 2 ponts H

G-C: 3 ponts H

Le G-C est plus stable (car plus de ponts H)

Question 17

Dans l’ADN, combien y a-t’il de paires de bases par tour d’hélice?

Answer 17

10

Question 18

Dans quelle phase du cycle cellulaire a lieu la réplication de l’ADN?

Answer 18

Lors de l’interphase, dans la phase S.

Question 19

À quoi s’attache le centromère d’un chromosome lors de la phase M du cycle cellulaire?

Answer 19

Aux microtubules du fuseau mitotique par des kinétochores.

(Durant la prométaphase)

Question 20

Quelles sont les 3 contraintes de l’ADN polymérase lors de la réplication de l’ADN?

Answer 20

• Elle ne peut synthétiser que dans le sens 5’ -> 3’
• Elle requiert une amorce d’ADN ou d’ARN (elle ne peut pas initier la réplication, elle doit ajouter à un bout 3’ existant)
• Elle requiert une matrice (brin matrice à copier)

Question 21

Pendant la réplication de l’ADN, qu’est-ce qui fournit l’énergie nécessaire à la polymérisation?

Answer 21

Les nucléotides triphosphates, par l’hydrolyse de 2 phosphates.

L’ADN polymérase utilise l’énergie de cette hydrolyse pour ajouter le troisième phosphate au groupe hydroxyle du carbone 3’ du nucléotide précédent.

Question 22

Les origines de réplication sont riches en quelles bases?

Pourquoi?

Answer 22

La paire de bases A-T, car il n’y a que deux pont H entre A et T ; elles sont donc moins stables que G-C et plus faciles à ouvrir.

Question 23

Lors de la réplication d’ADN, quelle protéine d’initiation est responsable d’ouvrir l’ADN double-brin (le “dézipper”)?

Answer 23

Hélicase

Question 24

Lors de la réplication d’ADN, quelle protéine d’initiation est responsable de créer des amorces d’ARN à partir d’une matrice d’ADN?

Answer 24

Primase

Question 25

Quel brin d'ADN est synthétisé de façon **continue** à partir **d'une seule amorce**?

Answer 25

Brin conducteur

Question 26

1. Quel brin d'ADN est synthétisé de façon **discontinue**, sous forme de **courts fragments**? 2. Quel est le nom de ces courts fragments?

Answer 26

1. Brin retardé (tardif) 2. Fragments d'Okasaki

Question 27

Quelle enzyme utilise l'ATP pour lier ensemble deux bouts d'ADN existants en créant un lien phosphodiester entre eux?

Answer 27

Ligase

Question 28

Quelle protéine circulaire maintient l'ADN polymérase et l'ADN ensemble pendant la synthèse d'ADN?

Answer 28

Clamp coulissant (Sliding clamp)

Question 29

Quelle protéine fixe l'ADN simple brin et l'empêche de s'apparier avec son brin complémentaire lors de la réplication?

Answer 29

Protéine SSB (Single stranded binding)

Question 30

1. Quelle protéine synthétise l'ADN lors de la réplication? 2. Quelle variante de cette protéine utilise les amorces d'ARN pour synthétiser les fragments d'Okasaki (ADN) et le brin conducteur (ADN)? 3. Quelle variante de cette protéine a une activité de **nucléase** (enlève l'amorce d'ARN) et une activité d'ADN polymérase de **réparation** (remplace l'ARN par de l'ADN)?

Answer 30

1. ADN Polymérase 2. ADN Polymérase III 3. ADN Polymérase I

Question 31

1. Quelle protéine permet de relâcher le stress causé par un super-enroulement en aval de la fourche de réplication ? 2. Comment cette protéine effectue cela ?

Answer 31

1. Topoisomérase 2. En faisant une coupure simple-brin dans l'ADN

Question 32

Quelles sont les deux parties de la télomérase et quel est leur rôle respectif?

Answer 32

**Partie protéique**: Activité d'ADN polymérase capable d'utiliser de l'ARN comme matrice (transcriptase inverse). **Partie ARN**: Matrice d'ARN faisant partie intégrante de la télomérase (3' - ACCCCAAC - 5').

Question 33

À quel brin d'ADN la télomérase va-t'elle s'attacher? À quelle extrémité de ce brin?

Answer 33

Brin tardif, à l'extrémité 3'.

Question 34

Vrai ou Faux: Les maladies liées à l'âge et les syndromes de veillissement précoce sont caractérisés par un allongement des télomères.

Answer 34

Faux. Ils sont caractérisés par un **racourcissement** des télomères (car les télomères raccourcissent avec chaque division!)

Question 35

Les cellules des métastases (tumeurs tardives) ont tendance à **augmenter** ou à **diminuer** l'activité de la télomérase?

Answer 35

À **augmenter**.

Question 36

Quelle sorte de mutation de l'ADN peut être héritée par la descendance, et ainsi causer des maladies génétiques?

Answer 36

Mutation germinale (des cellules sexuelles)

Question 37

Des mutations dans l'ADN de cellules somatiques peuvent être à la base de certains \_\_\_\_.

Answer 37

Cancers

Question 38

Comment est-ce que les mutations de l'ADN sont reconnues par la cellule?

Answer 38

Les nucléotides erronés causent une torsion/déformation de la double hélice (les ponts H ne se forment pas).

Question 39

Quel est le mécanisme de réparation de l'ADN lors duquel l'ADN polymérase vérifie son propre travail de réplication et le corrige au besoin?

Answer 39

Correction co-réplicationnelle ou Correction sur épreuve (*Proofreading*) : se fait durant la synthèse d'ADN

Question 40

L'ADN polymérase a deux sites distincts. Quels sont ces deux sites et quelles sont leur fonction?

Answer 40

Site P: Site catalytique de polymérisation Site E: Site d'édition pour la réparation des erreurs de réplication

Question 41

Décrire les différentes étapes de la correction post-réplicationnelle de mésappariements (DNA Mismatch Repair).

Answer 41

1. **Distorsion de la double hélice détectée** par des protéines spécifiques. 2. Les protéines de reconnaissance forment un complexe qui **recrute une exonucléase** (Exo1). Celle-ci rentre au sein de l'ADN à travers un « nick ». 3. Une portion du nouveau brin incluant le nucléotide erroné est **dégradée par l'exonucléase**. 4. **Réparation** de l'erreur par l'ADN polymérase et ligation par la ligase.

Question 42

Remplir l'espace manquant: Des collisions thermiques entre les molécules causent la perte de ____ de certains nucléotides. Comment se nomme ce phénomène?

Answer 42

purines (G, A) Ce phénomène se nomme la dépurination.

Question 43

Quelle est la cause de la désamination de l'ADN? Quelle est la conséquence de cette désamination?

Answer 43

Cause: Activité métabolique Conséquence: **Perte du groupement amino des cytosines** causant la **transformation en base uracile** (non-complémentaire avec la base de l'autre brin d'ADN).

Question 44

Les rayons UV du soleil peuvent endommager l'ADN de quelle façon?

Answer 44

Formation de liens covalents entre deux thymines adjacentes (création d'un dimère de thymine). (Comment: causé par un bris du lien double carbone-carbone dans le cycle de la base de la thymine)

Question 45

L'ADN polymérase I possède deux activités. Lesquelles?

Answer 45

1. Activité de nucléase (enlève les amorces d'ARN) 2. Activité de réparation (remplace l'ARN pas de l'ADN)