Retroviridae et VIH Flashcards
Vrai ou faux : Les Retroviridae sont retrouvés chez tous les vertébrés.
Vrai.
Expliquez le dogme central de la génétique et pourquoi les Retroviridae sont particuliers.
Le dogme central de la génétique explique que la transition de l’ADN vers les protéines ne se fait que dans une seule direction (ADN → ARN → protéine).
Les rétrovirus suivent le flux inverse. Ils ont la capacité de transformer l’ARN en ADN (sous une forme intégrée dans le génome de l’hôte).
Quelle enzyme est nécessaire afin de transformer l’ARN en ADN ?
Une rétrotranscriptase (ADN polymérase ARN-dépendante).
AKA : transcriptase inverse rétrovirale (RT)
Les rétrovirus ont contribué à plusieurs découvertes importantes dans plusieurs domaines. Donnez quelques exemples.
- RT et l’intégrase sont utilisés dans la manipulation des acides nucléiques.
- Épidémiologie du VIH
- Provirus rétroviraux permettent le suivi de spéciation et la migration de populations
- Formation de tumeurs (oncologie)
- Thérapie génique (livrer des gènes thérapeutiques dans des cellules)
Taxonomie des rétrovirus
Sept genres divisés en 2 grands groupes :
1. Rétrovirus simples
2. Rétrovirus complexes
Expliquez la différence entre les rétrovirus simples et complexes.
Les rétrovirus simples produisent 4 gènes : Gag, Pro, Pol et Env tandis que les rétrovirus complexes codent pour ces 4 protéines ainsi qu’un ensemble de protéines régulatrices.
Vrai ou faux : Les rétrovirus sont phylogénétiquement liés à des éléments génétiques capables de transcription inverse.
Vrai.
Donnez des exemples des molécules capables de transcription inverse (rétroéléments).
- D’autres familles de virus
- Rétrotransposons
- Introns auto-clivés
Quelles sont les caractéristiques générales de la structure des rétrovirus.
- Sphériques
- Diamètre d’environ 100 nm
Vrai ou faux : Les rétrovirus sont thermorésistants et insensibles aux détergents.
Faux. Les rétrovirus sont sensibles à la chaleur, aux détergents et au formaldéhyde.
Quelles sont les protéines présentes dans le virion ?
- Protéase (PR)
- Intégrase (IN)
- Transcriptase inverse (RT)
De quel groupe de la classification de Baltimore font partie les rétrovirus ?
Le 6e groupe.
Vrai ou faux : Les rétrovirus ont deux copies de leur génome, qui est composé d’ARNsb+.
Vrai.
Expliquez pourquoi les rétrovirus sont dits “pseudo-diploïdes.”
Malgré le fait qu’ils ont 2 copies de leur matériel génétique, ils n’ont pas d’allèles différentes sur chaque copie.
Expliquez la différence entre la membrane et l’enveloppe.
L’enveloppe correspond à la bicouche lipidique tandis que la membrane correspond à tout ce qui n’est pas dans le noyau.
Vrai ou faux : L’ARN génomique est associée à la NC (forme la RNC) et est contenue dans le noyau.
Vrai.
Quelles protéines forment le “core” ? Quelles protéines l’entourent ?
Le core est formé majoritairement de la protéine CA. Le core est entouré d’une coquille sphérique constituée de la protéine MA.
Quelles protéines sont contenues dans la membrane du virion ?
- TM
- La protéine SU est associée à la TM (mais est complètement à l’extérieur du virion)
Vrai ou faux : Les deux copies du génome s’apparient ensemble sur toute la longueur.
Faux. Seulement quelques sections s’apparient.
Le génome d’ARN est généré par la machinerie de transcription de l’hôte. Quelles structures se retrouvent sur ces ARN ?
Une coiffe en 5’ et une queue poly-A
De quel type d’ARN est composé le génome rétroviral et quelle est sa longueur ?
- ARN sb +
- Chaque monomère possède une longueur de 13,7 kB.
Nommez les blocs importants de la séquence du génome et les protéines pour lesquelles ils codent.
- U5 : site requis pour l’intégration provirale
- gag : capside, nucléocapside, matrice et protéase
- pol : transcriptase inverse et intégrase
- env : protéines de surface et transmembranaires.
- U3 : expression des gènes viraux et intégration de l’ADN