Coronavirus & Covid-19 Flashcards
Les coronavirus font partie de quel groupe de la classification de Baltimore ?
Groupe IV
Vrai ou faux : Les morphologies des différents virus de cette famille sont identiques.
Faux. Beaucoup de variété au niveau de la morphologie des coronavirus.
Quels animaux peuvent être infectés par le coronavirus ?
Les mammifères et les oiseaux.
Quel type de génome ont les coronavirus ? Quelles sont ses caractéristiques ?
ARN sb, polarité +
Coiffe en 5’
Queue de poly-A en 3’
Linéaire
Protégée par une nucléocapside
D’où dérive le nom “coronavirus?”
La frange de spicules observée avec un microscope électronique. Ressemble à une couronne.
Vrai ou faux : Les coronavirus ont les plus grands génomes à ARN.
Vrai.
Quels types de maladies sont causées par les coronavirus ?
- Respiratoires
- Gastro-intestinales
Nommez des coronavirus importants.
- SRAS
- MERS
- Covid-19
Les coronavirus font partie de quel ordre ?
Nidovirales
Quelles sont les caractéristiques morphologiques des coronavirus ?
- Particules enveloppées
- Pléomorphes (leur structure n’est pas régulière comme une capside, elle change à cause de la membrane plasmique)
Quels gènes peuvent être utilisés pour suivre les taxons de coronavirus ?
Les gènes de la polymérase. Ils peuvent réunir les groupes monophylétiques (transmission verticale).
Taille du virion
118 à 136 nm
Composition de l’enveloppe
- Bicouche lipidique
- Protéines membranaires (M) = donne une forme au virion
- Protéines de l’enveloppe (E) = essentielles pour l’infectivité (attachement)
- Protéines de spicule (S) = 20 m de long, impliquées dans l’attachement
Structure de la nucléocapside
- Une protéine en répétition
- Symétrie hélicoïdale
- Constituée du génome d’ARN et de nucléoprotéines (N)
Que se passe-t-il lors de la première étape de traduction ? Que forment les produits ?
Les polyprotéines 1a et 1ab sont produites. Elles sont traitées pour former le complexe d’ARN polymérase
Combien d’ARNm sont nécessaires pour former les protéines structurales ?
6
Adsorption
- Interaction entre la protéine S et le récepteur
- Variété de récepteurs (protéines de surface cellulaire)
Décapsidation
- Déclenchée par la liaison au récepteur, le clivage de la protéine S et par l’exposition à un pH bas (endosome)
- Certains coronavirus fusionnent avec la membrane et d’autres entrent par endocytose.
- Changement de conformation de la protéine S entraîne le mélange des bicouches lipidiques du virus et de la cellule hôte
- Libération du contenu du virion dans le cytoplasme (nucléocapside)
Réplication du génome
- Traduction de l’ensemble de la réplicase dépend d’un mécanisme appelé “ribosomal frameshifting”
- Changement du cadre de lecture causé par le ribosome = ribo recule d’un nucléotide entre 1a et 1b
Comment le ribo change-t-il de cadre de lecture entre les protéines 1a et 1b ?
- Séquence glissante en amont de la jonction entre les 2 gènes
- Pseudo-nœud (le rib fait une pause puis recule)