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Virologie > Picornavirus > Flashcards

Picornavirus Flashcards

1
Q

Que signifie le nom picornaviridae ?

A

Pico = petit
RNA = génome d’ARN
viridae = famille

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Q

Donnez des exemples de virus faisant partie de la famille picornaviridae.

A
  • Poliovirus
  • Virus de l’hépatite A
  • Virus de la fièvre aphteuse
  • Entérovirus 71
  • Rhinovirus
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Q

Quel était le premier virus animal découvert ?

A

FMDV

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4
Q

Classification de picornavirus.

A
  • Classe : Pisoniviricetes
  • Ordre : Picornavirales
  • Famille : picornaviridae
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Q

Vrai ou faux : Les picornaviridae infectent une large gamme d’espèces vertébrés.

A

Vrai

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6
Q

Les picornavirus font partie de quel groupe de la classification de Baltimore ?

A

Groupe IV (ARN + … ARN - … ARNm)

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7
Q

Décrivez la structure des picornavirus.

A
  • Capside non enveloppée
  • Capside icosaédrique formée de 4 protéines VP1, VP2, VP3 et VP4 (interne)
  • La surface est composée de plateaux en forme d’étoile et plusieurs canyons

La structure est similaire chez tous les picornavirus.

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8
Q

Quel est l’avantage de ne pas avoir une enveloppe ?

A

Le virus est plus résistant. Il est insensible aux solvants organiques.

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9
Q

Quel est le rôle de la VP4 ?

A

Cette protéine se trouve sur la surface interne de la capside et permet de stabiliser la capside et le génome.

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10
Q

Comment s’assemble la capside ?

A

Les 4 protéines VP s’assemblent pour former un protomère qui s’assemble avec d’autre protomères.

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11
Q

Quelles protéines déterminent le sérotype viral ?

A

L’extrémité C-terminale des protéines VP1-4

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12
Q

Décrivez la structure du génome.

A
  • 7000 à 8000 pb
  • Protéine VPg à l’extrémité 5’ du génome
  • 5’-UTR très longue, contrôle la réplication du génome
  • 1 ORF = 1 ARNm traduit et puis traité pour former les différentes protéines
  • Extrémité 3’ impliquée dans le contrôle de la synthèse de l’ARN
  • Queue poly-A ad 100 nt
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13
Q

Quelle est la première chose que font les picornavirus lorsqu’ils entrent dans une cellule ?

A

Traduction du génome.

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14
Q

Combien de temps dure le cycle de réplication des picornavirus ?

A

5 à 10 heures

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15
Q

Attachement du virus à la cellule.

A
  • Fixation au récepteur de la membrane plasmique sur le virus (canyon ou plateau)
  • Certains ont besoin d’un co-récepteur
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16
Q

Entrée du virus dans la cellule.

A

Le virus déclenche la voie endocytique de la cellule et entre par moyen d’une vésicule.

17
Q

Libération du matériel génétique dans la cellule.

A

Dépend de l’espèce.
FMDV : le faible pH rencontré durant l’endocytose déclenche la libération de l’ARN
Poliovirus : Attachement du virus cause la transformation de la protéine A qui forme ensuite des pores dans la membrane

18
Q

Traduction du génome des picornavirus.

A
  • Utilisation du IRES dans la 5’-UTR agit comme une coiffe en 5’ pour permettre la liaison du ribosome
  • S-U 40S du ribo est recrutée par eIF3
  • eIF3 se lie à eIF4G (composé de eIF4A et eIF4E)
19
Q

Rôle de eIF4A et eIF4E ?

A
  • eIF4A : hélicase
  • eIF4E : positionne la S-U 40S sur l’ARNm
20
Q

Certains picornavirus clivent l’eIF4G. Conséquence ?

A
  • Permet d’empêcher la traduction des ARNm de la cellule
  • Cause plus de symptômes car met la cellule en mode panique
21
Q

Vrai ou faux : les picornavirus synthétisent une polyprotéine.

A

Vrai. Elle est ensuite clivée pour former les différentes protéines

22
Q

Rôles des 3 régions de la polyprotéine.

A
  • P1 : protéines de la capside
  • P2 : protéines associées à la transformation des protéines
  • P3 : protéines impliquées dans la réplication du génome
23
Q

Vrai ou faux : La polyprotéine est facilement observée chez les cellules infectées par un picornavirus.

A

Faux. Elle est clivée immédiatement après que les séquences des protéases sont traduites.

24
Q

Vrai ou faux : la polyprotéine est traitée par auto-clivage.

A

Vrai.

25
Q

Étapes de traitement de la polyprotéine.

A
  • 2Apro clive P1 du reste de la polyprotéine
  • 3Cpro et 3CDpro effectuent un clivage secondaire dans P1, P2 et P3
  • VP0 s’auto-clive pour former VP2 et VP4
26
Q

Caractéristiques de l’ARN polymérase virale.

A
  • ARN pol ARN dépendante
  • Structure de la main
  • Site actif = paume
  • Synthèse amorcée par VPg modifiée
27
Q

Ratio entre la synthèse du brin + versus brin -

A

Brin + est synthétisé 30 à 70 fois plus que le brin -

28
Q

Pourquoi la réplication cause-t-elle la destruction du Golgi et le RE ?

A

Les vésicules membranées doubles sont le site de la réplication de l’ARN viral (permet la protection). Ces organelles sont la source des vésicules.

29
Q

Quelles protéines sont impliquées dans le transport des complexes de réplication dans l’appareil de Golgi et le RE ?

A

2C et 3AB

30
Q

Comment la RdRp et le ribosome évitent-ils les collisions ?

A
  • Les 2 procédés n’ont pas lieu en même temps.
  • Les protéines qui stimulent la traduction dépendante de IRES sont clivées par la protéase virale 3Cpro
  • La traduction est régulée à la baisse, les ribos sont retirés et la RdRp peut passer.
31
Q

Rôle des protéines 2A, 2B, 2C, 2BC, 3AB et L.

A
  • 2A : clive polyprotéine, stimule synthèse brin -
  • 2B : stade précoce synthèse de la RdRp, formation de vésicules et libération des virions
  • 2C : initie synthèse du brin - (travaille avec 2A). Est une hélicase.
  • 2BC : formation de vésicules
  • 3AB : ancre la VPg dans les membranes (amorce la synthèse de l’ARN)
  • L : protéase, clive la polyprotéine
32
Q

Comment la diversité est-elle introduite chez les picornavirus ?

A
  • Taux d’erreurs très élevé (1/1000)
  • Mauvaise incorporation des bases
  • Polymérase incapable de réviser et corriger
  • Erreurs = maximise la diversité et l’adaptabilité
  • Recombinaison fréquente (proximité dans les vésicules)
  • Template switching
33
Q

Expliquez la signification de “quasi-espèce.”

A

Les populations existent sous forme de mélanges de plusieurs génomes différents.

34
Q

Template switching

A
  • Polymérase copie un des brins + en 3’
  • Change de molécule d’ARN lors du recopiage.
  • La copie formée est composée d’éléments du premier brin + et du deuxième brin +
  • Déclenché par une pause de la polymérase après une erreur. La polymérase détecte qu’elle a commis une erreur mais ne peut pas la corriger. Elle bouge plus lentement après des erreurs.
35
Q

Étapes d’assemblage des virions

A
  • P1 est clivée par 3CDpro = VP0, VP1 et VP3
  • 5 protomères (VP0, VP1 et VP3) se forment et s’assemblent en capsides vides
  • VP0 clivé en VP2 et VP4 = particule infectieuse finale
  • VP2 et VP4 augmentent la stabilité
36
Q

Remplissage des capsides

A
  • Mécanisme inconnu
  • Théorie 1 : ARN est vissé dans la particule
  • Théorie 2 : pentamères s’assemblent avec l’ARN
37
Q

Quels sont les effets sur l’hôte d’une infection par un picornavirus ?

A
  • Traduction de l’ARNm cellulaire arrêté en 2 heures
  • Séquestration de l’ARNm cellulaire dans des granules de stress et des “p-bodies”
  • Granules de stress sont désagrégés par les protéines virales durant les derniers stades de l’infection
  • Trafic nucléoplasmatique inhibé par protéolyse des pores nucléaires
  • Perturbation du transport des protéines sécrétoires

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