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Virologie > Filoviridae et Ebola > Flashcards

Filoviridae et Ebola Flashcards

1
Q

Que sont les réservoirs naturels des Filoviridae ?

A

Nous ne connaissons pas le(s) réservoir(s) des Filoviridae.

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Q

Chez quels animaux les Filoviridae ont-ils été isolés ?

A
  • Chauve-souris
  • Singes
  • Porc
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3
Q

En général, que sont les symptômes des infections causées par les Filoviridae ?

A
  • Fièvre hémorragique (muqueuses)
  • Nécrose du foie, des reins et de la rate
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4
Q

Quel était le premier Filoviridae isolé ? Qu’est-il arrivé ?

A

Marburgvirus.
Des scientifiques ont manipulé des organes de singes verts et sont devenus malades. Les organes ont été envoyés ailleurs et ont causé des épidémies.

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5
Q

Combien d’épidémies de Filovirus ont eu lieu ? Quel est le taux de mortalité moyen ? Dans quels pays ?

A

Plus de 40 poussées épidémiques ont eu lieu. Les épidémies ont été limitées à l’Afrique et aux Philippines. Le taux de mortalité varie entre 23 et 100 %.

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6
Q

Vrai ou faux : Presque toutes les épidémies sont reliées à la chasse et à l’abattage des porcs.

A

Faux. Elles sont presque toutes reliées à la chasse et à l’abattage des grands singes.

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7
Q

Pourquoi les Filovirus ont-ils été classés comme pathogènes de biosécurité 4 ?

A
  • Taux de mortalité élevé
  • Potentiel de transmission de personne à personne
  • Aucun vaccin ou traitement disponible
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8
Q

Vrai ou faux : Il y a 2 laboratoires de biosécurité de niveau 4 au Canada.

A

Faux. Il n’y en a qu’un seul à Winnipeg.

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9
Q

Dans quel groupe de classification de Baltimore appartiennent les Filovirus ?

A

Goupe V

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9
Q

Quel type de génome possèdent les Filovirus ?

A
  • ARN
  • Polarité négative
  • Non segmenté
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10
Q

Les Filovirus font partie de quel ordre ?

A

Mononegavirales

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11
Q

Combien de genres pouvons-nous compter dans la famille des Filoviridae ? Lesquels sont les plus importants ?

A
  • 6 genres
  • Ebolavirus
  • Marburgvirus
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12
Q

Quelle est l’espèce d’Ebolavirus la plus importante ? Pourquoi ?

A
  • Zaire ebolavirus
  • Le plus populaire et l’espèce qui se transmet le plus facilement entre humains.
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13
Q

Vrai ou faux : Les Filovirus sont des particules virales filamenteuses.

A

Vrai.

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14
Q

Quelle est le diamètre moyen et la longueur moyenne des Filovirus ?

A
  • Diamètre de 80 nm
  • Longueur entre 860 et 1200 nm.

**Des particules de 14,000 nm ont déjà été observées

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15
Q

Vrai ou faux : L’ARN des Filovirus est nu.

A

Faux. Il est entouré d’une nucléocapside.

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16
Q

Quelles protéines composent la nucléocapside ?

A
  • Nucléoprotéine (N)
  • Protéine VP30
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17
Q

Quelle forme est la nucléocapside ?

A

Hélicoïdale

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18
Q

Vrai ou faux : L’ARN du virion rempli l’entièreté de la capside.

A

Faux. Il y a un vide d’environ 20nm entre la RNP et la capside.

19
Q

Quelles protéines/structures composent l’extérieur du virion ?

A
  • Protéine M
  • Enveloppe de membrane plasmique cellulaire
  • Glycoprotéines (GP) ancrées dans la membranes jusqu’à 10 nm de la surface
20
Q

Quelle est la longueur moyenne des génomes des Filovirus ? Combien de gènes sont codés par ce génome ?

A
  • 19 000 nt
  • 7 gènes
21
Q

Qu’a-t-il de particulier à propos des génomes de Filovirus ?

A
  • Certains gènes se chevauches
  • Le nombre de chevauchements varie selon l’espèce
22
Q

Décrivez les régions non codantes du génome des Filovirus.

A
  • Régions intergéniques
  • Région 3’ UTR = leader
  • Région 5’ UTR de longueur variable

Les régions UTR sont hautement conservées et pourraient former des structures en tige-boucle (lorsqu’en forme d’ARNm (+)).

23
Q

Que sont les 2 types de protéines virales ? Que sont leurs rôles ?

A
  • Protéines de la capside : Impliquées dans l’assemblage du virion et l’entrée du virus
  • Protéines de la ribonucléocapside : impliquées dans la transcription et la réplication du génome.
24
Q

Quelle protéine joue un rôle dans la pénétration du virus, la pathogénèse et l’antigénicité ? Que sont ses deux formes ?

A

La GP.

La GP se présente initialement sous la forme de GP0. Elle est clivée lors de la sécrétion et conduit à la formation de GP1,2 qui est la forme mature de la protéine.

Les spicules viraux sont formés par 3 hétérodimères de GP1,2

25
Q

Quelle protéine est la plus abondante chez le virion ? Quel est son rôle ?

A

La protéine M. Elle joue un rôle critique dans le processus de bourgeonnement et conduit à l’enveloppement de la RNC par la membrane plasmique. Elle joue également un rôle dans la régulation et la transcription du génome.

26
Q

Quelles protéines font partie de la RNC ?

A
  • Protéine N, VP30, VP35 et L
27
Q

Comment s’assemble les protéines N ?

A

Elles s’auto-assemblent pour former des structures de forme tubulaire essentielles à la formation du RNC.

28
Q

Que sont les rôles de VP30 ? Où se lie-t-elle dans sur le génome ?

A

Elle se lie près de l’extrémité 3’. Elle est :

  • Activateur de transcription (contrôlée par son degré de phosphorylation)
  • Pont entre la RNC et la polymérase L
  • Suppresseur de la réponse immunitaire antivirale de la cellule.
29
Q

Vrai ou faux : La polymérase est toujours présente dans la capside.

A

Vrai.

30
Q

Quelles protéines forment le complexe de la polymérase ? Quel type de polymérase est utilisée par les Filovirus ?

A
  • Les protéines L et VP35 forment le complexe de la polymérase
  • La protéine L est la RdRp
31
Q

Nommez les caractéristiques de la RdRp.

A
  • Se lie à l’ARN servant de gabarit
  • Possède un site catalytique où les liaisons phosphodiesters sont formées
  • Se lie aux ribonucléotides utilisés durant la synthèse d’ARN
32
Q

Quel est le rôle de la protéine VP35 ?

A

Elle est un cofacteur affectant le mode de synthèse de l’ARN (switch le mode de traduction de la polymérase entre synthèse d’ARNm et réplication).

33
Q

Décrivez les 11 étapes de la réplication.

A
  1. GP permet au virus de se lier à une gamme de protéines de surface, ce qui explique pourquoi le récepteur spécifique n’a pas encore été découvert.
  2. Le virus pénètre dans la cellule via le macropinome.
  3. Le virus est acheminé vers le compartiment endosomal contenant des protéases.
  4. GP est clivée par les protéases et le faible pH déclenche la fusion entre les membranes virales et endosomales.
  5. RNP est libérée dans le cytoplasme.
  6. Génome est répliqué et transcrit.
  7. ARNm viraux sont traduits par des ribosomes cellulaires.
  8. ARNm de la GP sont traduits par des ribosomes du RE.
  9. Les GP sont glycosylées, trimérisées et transportées vers la membrane plasmique via le Golgi.
  10. Le complexe RNP est assemblé et s’associe avec les protéines insérées dans la membrane plasmique.
  11. Les virions bourgeonnent à partir de la surface cellulaire.
34
Q

Qu’est-ce qu’un macropinosome ? Pourquoi est-il acheminé vers le compartiment endosomal contenant des protéases et des nucléases ? Quel est son effet sur les Filovirus ?

A

Le macropinosome est une vésicule permettant la phagocytose de liquides. Il est employé lorsque de la cellule est déshydratée.

Il est acheminé vers le compartiment endosomal pour purifier les liquides que la cellule vient tout juste de phagocyter. Les protéases et les nucléases permettent d’éliminer la plupart des pathogènes qui seraient entrés par cette voie.

Les Filovirus quant à eux ne sont pas détruits dans l’endosome parce qu’ils sont recouverts d’une RNC. De plus, lorsque les protéines GP sont clivées, ceci signal au virion qu’il est temps de commencer l’infection (GP0 est clivée en GP1,2 qui est la forme mature de la protéine).

35
Q

Pourquoi les ARNm de la GP sont-ils traduits par les ribosomes du RE ?

A

Ce sont des protéines qui seront insérées dans la membrane, donc elles doivent être sécrétées par des vésicules pour se rendre à la membrane plasmique.

36
Q

Quelle est la stratégie des Filoviridae ?

A

Les Filoviridae ont pour but demeurer inaperçus le plus longtemps possible. Donc, les cellules infectées par un Filovirus seront gardées en vie (en générale). Leur membrane est nécessaire pour la production de virions. Cependant, plus il y a de virus produits, plus les fonctions de la cellules seront perturbées.

37
Q

Quelle protéine bloque la voie des interféron ?

A

VP24

38
Q

Comment se fait la transmission des Filovirus ?

A
  • Muqueuses
  • Coupures ou abrasions de la peau
  • Voie parentérale (piqûres par aiguille = majeure)
  • Sperme, sécrétions génitales
  • Fluides corporels
  • Abattage des primates
  • Peut se retrouver dans les aérosols
39
Q

Expliquez comment les Filovirus infectent le système immunitaire. Expliquez la dissémination et l’amplification de l’infection.

A
  • Les Filovirus démontrent un tropisme cellulaire à large spectre et infectent une grande variété de cellules — incluant les macrophages et les monocytes.
  • Les macrophages et les monocytes (globules blancs) peuvent se rendre partout (dans tous les tissus du corps), donc les Filovirus peuvent se reproduire partout.
40
Q

Épidémie d’Ebolavirus 2014-2016

A
  • Plus importante de l’histoire
  • Première en Afrique de l’Ouest
  • Ebolavirus du Zaïre
  • Nigéria, Royaume-Uni, États-Unis (et 6 autres pays)
  • 663 nouveaux cas chaque semaine, au moins 50% de mortalité
  • Durée de 2 ans (très long pour une épidémie, normalement quelques mois)
  • Facteurs sociaux-politiques ont contribués à la longue durée : pauvreté extreme, système de santé dysfonctionnel et mal équipé, méfiances envers le gouvernement, délai dans la réponse à l’épidémie (nationale et internationale).
  • A fait avancer la science
  • La circulation prolongée chez l’humain a conduit à des changements génétiques qui ont augmenté la transmissibilité virale
  • 28 616 cas, 11 310 décès (40%)
  • Quarantaine de 63 jours
41
Q

Épidémie d’Ebolavirus 2018 (Congo)

A
  • Ebolavirus du Zaïre
  • Pas reliée à l’épidémie de 2014-2016
  • Souche séquencée 5 jours après l’annonce de l’épidémie
  • Vaccin développé rapidement à cause du travail qui a été fait lors de l’épidémie précédente
42
Q

Épidémie d’Ebolavirus 2021 (Congo et Guinée)

A
  • Moins de 100 cas au total (6 décès)
  • Vaccin disponible
  • 1600 personnes vaccinées
  • Durée de 3 mois
43
Q

Épidémie du Marburgvirus 2023

A
  • 17 février 2023
  • Pas de vaccin
  • Pas de traitement
  • Cameroun
  • 18 infectés, 9 morts, aucun survivant
  • Fièvre, céphalées, douleurs musculaires, nausées, vomissements, hémorragies, délires violents
  • Marburgvirus peut persister dans l’organisme (rechute, excrétion pendant des mois ou des années)
44
Q

Épidémie d’Ebolavirus 2022-2023 (Soudan)

A
  • Ebolavirus du Soudan
  • 4 mois
  • 164 cas, 77 morts (46 %)
  • Cliniquement indifférenciable de l’Ebola du Zaïre, mais pas la même séquence
  • Réservoir inconnu
  • Transmission peu efficace entre humains
  • Vaccin ne fonctionne pas

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