repetidos comunes Flashcards
qué son los repetidos comunes?
regiones del DNA que contienen secuencias repetidas
dónde estan los repetidos comunes?
dispersos (cromatina o heterocromatina)
en qué regiones pueden estar los repetidos comunes?
- transposones
- regiones intergénicas
- pseudogenes
- repeticiones cortas, largas, en tandem
cuál es la característica mas importante de un transposon?
elemento movil del genoma
definición de transposon
secuencias que se pueden replicar e insertar en dif localizaciones (genes saltarines)
tipos de transposones
- clase I
- clase II
qué son los transposones de clase I?
retrotransposones
a que se transcriben los retrotransposones (clase I)
a ARN en la duplicación o desplazamiento
en que se clasifican los retrotransposones (clase I)?
- repeticiones terminales largas (LTRs)
- repeticiones terminales NO largas (no TLR)
qué es una repetición terminal larga y dónde se ubica?
- sec largas (100pb-5k b)
- en extremos de los cromosomas
qué incluyen las repeticiones terminales no largas?
- elementos intercalados largos (LINES) –>20% del genoma
- elementos intercalados cortos (SINEs)–> 30% del genoma
qué hacen los DNA transposones (clase II)?
saltan directamente
qué necesita un retrotransposon para convertirse en DNA complementario?
transcriptasa reversa
que bases nitrogenadas cambia la transcriptasa reversa?
U x T
en qué regiones se localizan los LINES (retrotransposones) ?
en regiones eucromáticas en bandas G (Giemsa + ricas en A-T)
característica mas importante de LINES
son AUTONOMOS
qué significa que los LINES sean autónomos?
pueden hacer los productos para realizar la transposición (transcriptasa reversa)
familias de LINES
- 1 (6kb: 17%)
- 2
- 3
proteínas que forma LINE 1
- p40 (chaperona de A nucleicos)
- TR
- endonucleasa
que otra característica es importante de los LINES aparte de que son autónomos?
bidireccional
características de los SINES
- 100-400 pb
- no autónomos (no cofician prot)
- comparten sec con LINES
de qué es responsable la maquinaria de LINES?
de retrotranscripción de SINES (no autonomos)
forma mas comun de SINES
elementos ALU
qué son los elementos ALU?
secuencia mas abundante con longitud de 280 pb
qué compone a los ALU?
2 repetidos en tandem (120 pb cada uno)
seguido de sec de An/T
(2 monomeros asimétricos)
en qué bandas están los SINES (ALU)?
bandas R (GC)
