ENCODE 2 Flashcards
1
Q
qué se hizo en la etapa de motivos de FT?
A
mapear 119 regiones en donde se observa union de protes a DNA
2
Q
puntos incluidos en 1. MOTIVOS DE LOS FT
A
- RNA pol en 72 tipos de cel (Chip-Seq)
- 87 fueron sec especifica de FT
- 8.1% del genoma tiene regiones de DNA con union a protes
- FACTORBOOK
3
Q
qué es el factorbook y para qué sirve?
A
- catálogo de sitios de unión a FT
- puedes ver funcion y sitios de union de FT
4
Q
puntos del artículo 7 METILACIÓN DE DNA
A
- descubrimiento y caracterización de enhacers
- conexiones 3D a lo largo del genoma
- caracterizacion de la red topográfica
- machine learning genomics
- entendiendo la variación con base en el impacto de la info funcional
- impacto de la selección evolutiva en regiones funcionales
5
Q
qué es un enhacer?
A
regulador a distancia
6
Q
cuál es la función de machine learning genomics?
A
permite saber función de FT y CpG
7
Q
en vez de solo ser 44 regiones del ENCODE a que pasó en ENCODE 2?
A
se amplió a todo el genoma
