ARNs no codificantes Flashcards
funciones de los ARN
- info genética
- sintesis de prot
- maduración de ARN
- regula expresion de genes
- RNA catalítico (ribozimas->splicing)
qué es la transcripción?
copia de DNA a RNA
diferencias entre DNA y RNA
- timinas cambian a uracilos
- azucar del RNA es ribosa
hélice simple en RNA
nucleotido de RNA
- azúcar
- base
- fosfato
nucleosido de ARN
- azucar
- base
estructuras que puede adaptar el ARN segun su función
- secundaria
- terciacia
cómo es la estructura secundaria del ARN?
- hairpins: 5-10 nt
- stem-loops: miles de nt
como es la estructura terciaria?
pseudoknot: 2 stem loops
ARN no codificantes
- snRNA: maduran ARN primario
- snoRNA: precursor ARNr
- scaRNA: modifican sn y snoRNA
- irRNA: silenciamiento genético, interferencia (incluye miRNA y siRNA)
- lncRNA: arazón, regular procesos y heterocromatiación del crom X
función de:
* RNAr
* RNAt
* RNAm
todos: modif postranscripcionales
* r: ribosomas
* t: llevar aminoácidos
* m: plantilla de traducción
función de snRNA
splicing
funciones de snoRNA
- procesa ARNr
- regulación epigenética
- splicing
función de XIST
silenciar crom X
función de H19
imprinting-> silencia o activa genes paterno o materno
tipos de snRNA
U1, U2, U4, U5 y U6
en que se involucra el snRNA?
en el proceso de splicing pre RNA
qué compone numero de nt snRNA?
107-210 nt
a que se asocia el snRNA?
6-10 proteinas que forman el small nuclear ribonucleoprotein particles (snRNPs)
en donde están los snRNA?
núcleo
a donde se une U1?
al 5’ del pre RNA (parte del exon e intron)
a donde se une U2?
sitio de ramificación del intron 1
de qué forman parte U1 y U2?
del spliceosoma
función de los miRNA
regulan traducción por complementaridad de bases de los transcritos
forma activa e inactiva de los miRNA
- activa: monocatenaria
- inactiva: bicateriana
proceso de la síntesis de miRNA
- RNA pol 2 sintetiza pri-miRNA y se organiza en hairpin
- DROSHA corta el pri-miRNA ->Sale hacia el citoplasma ya como pre-miRNA (corta cola de poli A y Cap)
- Dicer corta el pre-miRNA ->miRNA (corta el bucle de ausencia de compatibilidad)
- Argonauta->Degrada una de las hebras de RNA para pasar a su forma activa
- Además, DICER produce un RNA 21-23 nts que forman el complejo RISC por el RNA de cadena sencilla y múltiples proteínas
a. RISC agarra a la hebra de miRNA y la pega en un ARNm y lo hace de doble cadena, lo que impide su traducción ->Si la compatibilidad de este miRNA < 100% se formará otro loop
que experimento hicieron en 1990 con los miRNA?
intro de copias extras de un gen productor de pigmento (intensificar el color)
* el experimentó falló porque las plantas crecieron sin color
qué es el fenómeno de interferencia RNA?
destrución de RNAm que contenían la misma secuencia del dsRNA
los siRNA forman loops?
no
mecanismo de acción de siRNA
- Dicer (endonucleasa) ->Corta el siRNA para hacerlo pequeños
- El complejo RISC y ARGONAUTA (formado por el siRNA) ->Se vuelve monocatenario y se une a la cadena blanco
- Eliminación del RNA blanco (cuando ya se pegó el siRNA)