Régulation transcription - eucaryotes

Question 1

La transcription par Pol II est régulée par quels éléments?

Answer 1

Des activateurs et des répresseurs

Question 2

Pourquoi dit-on que le substrat est partiellement masqué chez les eucaryotes?

Answer 2

Parce que l’ADN est compacté en chromatine

Question 3

Qu’est-ce qu’un promoteur?

Answer 3

Région du gène où se fixe la machinerie transcriptionnelle

Question 4

Qu’est-ce qu’un site de liaison régulateur?

Answer 4

Sites individuels où se lient des régulateurs

Question 5

Qu’est-ce que des séquences régulatrices?

Answer 5

Tronçons d’ADN contenant plusieurs sites de liaisons pour un gène

Question 6

Qu’est-ce qu’un enhancer?

Answer 6

Plusieurs sites activateurs regroupés en une seule unité

Question 7

Quels sont les 3 éléments présents dans la transcription chez tous les eucaryotes?

Answer 7

• Machinerie transcriptionnelle élaborée
• Nucléosomes
• Modificateurs

Question 8

Quel est l’activateur le plus étudié des eucaryotes?

Answer 8

Gal4

Question 9

Quel est le rôle de Gal4?

Answer 9

Active la transcription des gènes galactose (GAL1)

Question 10

Quels sont les 2 parties distinctes d’un activateur?

Answer 10

• Domaine de liaison à l’ADN (DLA)

- Domaine d’activation

Question 11

Vrai ou faux. Un DLA bactérien peut remplacer un DLA eucaryote.

Answer 11

Vrai, car il n’y a pas de différences fondamentales dans la façon dont les DLA lient l’ADN

Question 12

Quel motif est le plus souvent utilisé par les DLA?

Answer 12

Hélice-Coude-Hélice

Question 13

Quels sont les 4 principaux types de DLA?

Answer 13

• Protéines à homéodomaine
• Protéines à doigts de zinc
• Motif à fermeture à glissière à leucine
• Motif hélice-boucle-hélice

Question 14

Qu’est-ce qu’un homéodomaine?

Answer 14

Région très conservée de 60 acides aminés

Question 15

Quel est le motif des protéines à homéodomaine?

Answer 15

Hélice-coude-hélice

Question 16

Que peuvent être les protéines contenant des homéodomaines?

Answer 16

Des activateurs et des répresseurs

Question 17

Quel est le rôle du zinc dans les protéines à doigts de zinc?

Answer 17

Rôle structural

Question 18

Comment est le motif qui forme le motif à fermeture à glissière à leucine?

Answer 18

Il combine des surfaces de dimérisation et de liaison à l’ADN dans une même unité structurale

Question 19

Comment est formée la surface de dimérisation du motif hélice-boucle-hélice?

Answer 19

Par 2 régions en hélice

Question 20

Qu’est-ce que la boîte E?

Answer 20

Région conservée du site de reconnaissance de l’ADN du motif hélice-boucle-hélice

Question 21

Quelle est la différence structurale entre les DLA et les régions activatrices?

Answer 21

Les régions activatrices ne possèdent pas de structures définies

Question 22

Pourquoi dit-on que les régions activatrices sont des surfaces adhérentes?

Answer 22

Parce qu’ils recrutent d’autres protéines

Question 23

Comment sont les régions activatrices acides?

Answer 23

Fortes et fonctionnent dans tous les organismes eucaryotes

Question 24

Quelle est la différence entre les activateurs bactériens et eucaryotes par rapport à leur interaction avec l’ARN Pol?

Answer 24

• Bactéries: interagissent directement avec l’ARN Pol

- Eucaryotes: recrutent la polymérase indirectement (pas d’intraction directe)

Question 25

Donner des exemples de complexes préformés formant des modificateurs?

Answer 25

- Médiateur | - TFIID

Question 26

Quels sont les 2 types de modificateurs du nucléosome?

Answer 26

- Ceux qui ajoutent des groupements chimiques sur les queues d'histones - Ceux qui déplacent les nucléosomes

Question 27

Quels sont les 2 rôles de l'acétylation?

Answer 27

- Modifie les interactions entre les histones et les nucléosomes, ce qui desserre la structure de la chromatine - Crée des sites de liaisons spécifiques sur les nuclésomes pour les protéines contenant des bromodomaines

Question 28

Quel modificateur possède un bromodomaine?

Answer 28

TFIID

Question 29

Avec quels 3 composants Gal4 peut-il interagir?

Answer 29

- Médiateur - TFIID - SAGA

Question 30

Comment IHF peut aider la communication entre des enhancers situés très loin et des gènes?

Answer 30

En courbant l'ADN

Question 31

Qu'est-ce qui empêche un enhancer très loin d'un gène d'activer un autre gène près de lui?

Answer 31

La présence d'isolateurs

Question 32

Qu'est-ce que l'effet synergique?

Answer 32

L'action de 2 activateurs agissant ensemble est plus grand que la somme de chacun agissant seul

Question 33

De quoi peut résulter la synergie?

Answer 33

- Multiples activateurs recrutant un seul composant de machinerie transcriptionnelle - Multiples activateurs recrutant chacun un composant différent - Multiples activateurs s'entraidant pour lier leurs sites à proximité du gène qu'ils contrôlent

Question 34

Comment se divise la levure S. cerevisiae?

Answer 34

Par bourgeonnement

Question 35

Comment les répresseurs peuvent-ils agir pour réprimer la transcription?

Answer 35

- Compacter la chromatine | - Enlever des groupements reconnus par la machinerie transcriptionnelle

Question 36

Quel est le mécanisme d'action des histones déacétylases?

Answer 36

Enlèvent des groupements acétyles des queues des histones