Régulation transcription - eucaryotes Flashcards

1
Q

La transcription par Pol II est régulée par quels éléments?

A

Des activateurs et des répresseurs

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2
Q

Pourquoi dit-on que le substrat est partiellement masqué chez les eucaryotes?

A

Parce que l’ADN est compacté en chromatine

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3
Q

Qu’est-ce qu’un promoteur?

A

Région du gène où se fixe la machinerie transcriptionnelle

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4
Q

Qu’est-ce qu’un site de liaison régulateur?

A

Sites individuels où se lient des régulateurs

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Q

Qu’est-ce que des séquences régulatrices?

A

Tronçons d’ADN contenant plusieurs sites de liaisons pour un gène

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6
Q

Qu’est-ce qu’un enhancer?

A

Plusieurs sites activateurs regroupés en une seule unité

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7
Q

Quels sont les 3 éléments présents dans la transcription chez tous les eucaryotes?

A
  • Machinerie transcriptionnelle élaborée
  • Nucléosomes
  • Modificateurs
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8
Q

Quel est l’activateur le plus étudié des eucaryotes?

A

Gal4

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9
Q

Quel est le rôle de Gal4?

A

Active la transcription des gènes galactose (GAL1)

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10
Q

Quels sont les 2 parties distinctes d’un activateur?

A
  • Domaine de liaison à l’ADN (DLA)

- Domaine d’activation

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11
Q

Vrai ou faux. Un DLA bactérien peut remplacer un DLA eucaryote.

A

Vrai, car il n’y a pas de différences fondamentales dans la façon dont les DLA lient l’ADN

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12
Q

Quel motif est le plus souvent utilisé par les DLA?

A

Hélice-Coude-Hélice

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13
Q

Quels sont les 4 principaux types de DLA?

A
  • Protéines à homéodomaine
  • Protéines à doigts de zinc
  • Motif à fermeture à glissière à leucine
  • Motif hélice-boucle-hélice
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14
Q

Qu’est-ce qu’un homéodomaine?

A

Région très conservée de 60 acides aminés

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15
Q

Quel est le motif des protéines à homéodomaine?

A

Hélice-coude-hélice

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16
Q

Que peuvent être les protéines contenant des homéodomaines?

A

Des activateurs et des répresseurs

17
Q

Quel est le rôle du zinc dans les protéines à doigts de zinc?

A

Rôle structural

18
Q

Comment est le motif qui forme le motif à fermeture à glissière à leucine?

A

Il combine des surfaces de dimérisation et de liaison à l’ADN dans une même unité structurale

19
Q

Comment est formée la surface de dimérisation du motif hélice-boucle-hélice?

A

Par 2 régions en hélice

20
Q

Qu’est-ce que la boîte E?

A

Région conservée du site de reconnaissance de l’ADN du motif hélice-boucle-hélice

21
Q

Quelle est la différence structurale entre les DLA et les régions activatrices?

A

Les régions activatrices ne possèdent pas de structures définies

22
Q

Pourquoi dit-on que les régions activatrices sont des surfaces adhérentes?

A

Parce qu’ils recrutent d’autres protéines

23
Q

Comment sont les régions activatrices acides?

A

Fortes et fonctionnent dans tous les organismes eucaryotes

24
Q

Quelle est la différence entre les activateurs bactériens et eucaryotes par rapport à leur interaction avec l’ARN Pol?

A
  • Bactéries: interagissent directement avec l’ARN Pol

- Eucaryotes: recrutent la polymérase indirectement (pas d’intraction directe)

25
Q

Donner des exemples de complexes préformés formant des modificateurs?

A
  • Médiateur

- TFIID

26
Q

Quels sont les 2 types de modificateurs du nucléosome?

A
  • Ceux qui ajoutent des groupements chimiques sur les queues d’histones
  • Ceux qui déplacent les nucléosomes
27
Q

Quels sont les 2 rôles de l’acétylation?

A
  • Modifie les interactions entre les histones et les nucléosomes, ce qui desserre la structure de la chromatine
  • Crée des sites de liaisons spécifiques sur les nuclésomes pour les protéines contenant des bromodomaines
28
Q

Quel modificateur possède un bromodomaine?

A

TFIID

29
Q

Avec quels 3 composants Gal4 peut-il interagir?

A
  • Médiateur
  • TFIID
  • SAGA
30
Q

Comment IHF peut aider la communication entre des enhancers situés très loin et des gènes?

A

En courbant l’ADN

31
Q

Qu’est-ce qui empêche un enhancer très loin d’un gène d’activer un autre gène près de lui?

A

La présence d’isolateurs

32
Q

Qu’est-ce que l’effet synergique?

A

L’action de 2 activateurs agissant ensemble est plus grand que la somme de chacun agissant seul

33
Q

De quoi peut résulter la synergie?

A
  • Multiples activateurs recrutant un seul composant de machinerie transcriptionnelle
  • Multiples activateurs recrutant chacun un composant différent
  • Multiples activateurs s’entraidant pour lier leurs sites à proximité du gène qu’ils contrôlent
34
Q

Comment se divise la levure S. cerevisiae?

A

Par bourgeonnement

35
Q

Comment les répresseurs peuvent-ils agir pour réprimer la transcription?

A
  • Compacter la chromatine

- Enlever des groupements reconnus par la machinerie transcriptionnelle

36
Q

Quel est le mécanisme d’action des histones déacétylases?

A

Enlèvent des groupements acétyles des queues des histones