Régulation transcription - eucaryotes Flashcards
La transcription par Pol II est régulée par quels éléments?
Des activateurs et des répresseurs
Pourquoi dit-on que le substrat est partiellement masqué chez les eucaryotes?
Parce que l’ADN est compacté en chromatine
Qu’est-ce qu’un promoteur?
Région du gène où se fixe la machinerie transcriptionnelle
Qu’est-ce qu’un site de liaison régulateur?
Sites individuels où se lient des régulateurs
Qu’est-ce que des séquences régulatrices?
Tronçons d’ADN contenant plusieurs sites de liaisons pour un gène
Qu’est-ce qu’un enhancer?
Plusieurs sites activateurs regroupés en une seule unité
Quels sont les 3 éléments présents dans la transcription chez tous les eucaryotes?
- Machinerie transcriptionnelle élaborée
- Nucléosomes
- Modificateurs
Quel est l’activateur le plus étudié des eucaryotes?
Gal4
Quel est le rôle de Gal4?
Active la transcription des gènes galactose (GAL1)
Quels sont les 2 parties distinctes d’un activateur?
- Domaine de liaison à l’ADN (DLA)
- Domaine d’activation
Vrai ou faux. Un DLA bactérien peut remplacer un DLA eucaryote.
Vrai, car il n’y a pas de différences fondamentales dans la façon dont les DLA lient l’ADN
Quel motif est le plus souvent utilisé par les DLA?
Hélice-Coude-Hélice
Quels sont les 4 principaux types de DLA?
- Protéines à homéodomaine
- Protéines à doigts de zinc
- Motif à fermeture à glissière à leucine
- Motif hélice-boucle-hélice
Qu’est-ce qu’un homéodomaine?
Région très conservée de 60 acides aminés
Quel est le motif des protéines à homéodomaine?
Hélice-coude-hélice
Que peuvent être les protéines contenant des homéodomaines?
Des activateurs et des répresseurs
Quel est le rôle du zinc dans les protéines à doigts de zinc?
Rôle structural
Comment est le motif qui forme le motif à fermeture à glissière à leucine?
Il combine des surfaces de dimérisation et de liaison à l’ADN dans une même unité structurale
Comment est formée la surface de dimérisation du motif hélice-boucle-hélice?
Par 2 régions en hélice
Qu’est-ce que la boîte E?
Région conservée du site de reconnaissance de l’ADN du motif hélice-boucle-hélice
Quelle est la différence structurale entre les DLA et les régions activatrices?
Les régions activatrices ne possèdent pas de structures définies
Pourquoi dit-on que les régions activatrices sont des surfaces adhérentes?
Parce qu’ils recrutent d’autres protéines
Comment sont les régions activatrices acides?
Fortes et fonctionnent dans tous les organismes eucaryotes
Quelle est la différence entre les activateurs bactériens et eucaryotes par rapport à leur interaction avec l’ARN Pol?
- Bactéries: interagissent directement avec l’ARN Pol
- Eucaryotes: recrutent la polymérase indirectement (pas d’intraction directe)
Donner des exemples de complexes préformés formant des modificateurs?
- Médiateur
- TFIID
Quels sont les 2 types de modificateurs du nucléosome?
- Ceux qui ajoutent des groupements chimiques sur les queues d’histones
- Ceux qui déplacent les nucléosomes
Quels sont les 2 rôles de l’acétylation?
- Modifie les interactions entre les histones et les nucléosomes, ce qui desserre la structure de la chromatine
- Crée des sites de liaisons spécifiques sur les nuclésomes pour les protéines contenant des bromodomaines
Quel modificateur possède un bromodomaine?
TFIID
Avec quels 3 composants Gal4 peut-il interagir?
- Médiateur
- TFIID
- SAGA
Comment IHF peut aider la communication entre des enhancers situés très loin et des gènes?
En courbant l’ADN
Qu’est-ce qui empêche un enhancer très loin d’un gène d’activer un autre gène près de lui?
La présence d’isolateurs
Qu’est-ce que l’effet synergique?
L’action de 2 activateurs agissant ensemble est plus grand que la somme de chacun agissant seul
De quoi peut résulter la synergie?
- Multiples activateurs recrutant un seul composant de machinerie transcriptionnelle
- Multiples activateurs recrutant chacun un composant différent
- Multiples activateurs s’entraidant pour lier leurs sites à proximité du gène qu’ils contrôlent
Comment se divise la levure S. cerevisiae?
Par bourgeonnement
Comment les répresseurs peuvent-ils agir pour réprimer la transcription?
- Compacter la chromatine
- Enlever des groupements reconnus par la machinerie transcriptionnelle
Quel est le mécanisme d’action des histones déacétylases?
Enlèvent des groupements acétyles des queues des histones
