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Introduction à la génétique moléculaire (SBM-1004) > Les mécanismes de la transcription > Flashcards

Les mécanismes de la transcription Flashcards

1
Q

Quelles sont les 4 grandes différences entre la transcription et la réplication?

A
  • Transcription produit un brin de ribonucléotides
  • ARN polymérase ne nécessite pas d’amorce
  • ARN synthétisé ne reste pas apparié au brin matrice
  • Transcription est moins fidèle que la réplication
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Q

Pourquoi la réplication doit-elle être plus fidèle que la transcription?

A

Parce que la réplication transmet le bagage génétique aux cellules filles

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3
Q

Combien y a-t-il d’ARN polymérases dans les cellules eucaryotes et procaryotes?

A
  • Procaryotes: une seule

- Eucaryotes: 3

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4
Q

De quoi est responsable la Pol II?

A

Responsable de la transcription de la plupart des gènes (tous les gènes codant des protéines)

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Q

De quoi est responsable la Pol I?

A

Responsable de la transcription des gènes codant pour le grand précurseur des ARNr

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6
Q

De quoi est responsable la Pol III?

A

Responsable de la transcription des gènes codant les ARNt, des petits ARN nucléaires et l’ARNr 5S

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7
Q

Quelles sont les 3 étapes de la transcription par l’ARN polymérase?

A
  • Initiation
  • Élongation
  • Terminaison
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8
Q

Qu’est-ce qu’un promoteur?

A

Séquence d’ADN qui fixe l’ARN polymérase et les facteurs de transcription requis

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9
Q

Qu’est-ce que la bulle de transcription?

A

Ouverture de l’ADN autour du point de démarrage de la transcription dans laquelle l’ADN est simple brin

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10
Q

Vrai ou faux.

Les 2 brins d’ADN seront transcrits.

A

Faux, un seul des 2 brins d’ADN sert de matrice et sera transcrit en ARN

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11
Q

Quelles sont les 3 étapes de l’initiation de la transcription?

A
  1. Formation d’un complexe fermé
  2. Transition vers un complexe ouvert
  3. Polymérase démarre la transcription et se détache du promoteur
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12
Q

En quoi constitue le complexe fermé?

A

Liaison de la polymérase au promoteur (l’ADN est double brin)

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13
Q

En quoi constitue le complexe ouvert?

A

Fusion des brins d’ADN (devient simple brin)

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14
Q

Quel facteur d’initiation est nécessaire pour convertir l’ARN polymérase minimale?

A

Facteur sigma

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15
Q

En quoi sigma convertit l’enzyme minimale?

A

Une holoenzyme de l’ARN polymérase

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16
Q

Quel est le rôle de l’élément UP?

A

Augmenter la liaison de la polymérase en permettant des interactions spécifiques entre l’enzyme et l’ADN

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17
Q

En combien de régions sigma70 peut-il être divisé?

A

4 régions

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18
Q

Quelle est la particularité de la région 4 de sigma70?

A

Porte 2 hélices formant un motif hélice-coude-hélice

19
Q

Quelles régions de sigma70 reconnaissent respectivement les éléments -10 et -35 des promoteurs?

A

Régions 2 et 4

20
Q

Comment se déroule la transition du complexe fermé au complexe ouvert dans l’enzyme bactérienne?

A

Réaction d’isomérisation, ne nécessite pas l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP

21
Q

Vrai ou faux.

L’isomérisation est un processus réversible.

A

Faux, une fois réalisée, garantit que la transcription va démarrer

22
Q

Combien de canaux l’enzyme bactérienne possède-t-elle?

A

5 canaux

23
Q

Quels sont les rôles des canaux de l’enzyme bactérienne?

A
  • Permettre l’arrivée des NTPs (1 canal)
  • Permettre la sortie de l’ARN (1 canal)
  • Permettre l’entrée et la sortie de l’ADN (3 canaux)
24
Q

Quels sont les 2 changements structuraux observés dans l’enzyme bactérienne durant l’isomérisation?

A
  • Mâchoires à l’avant de l’enzyme se referment sur l’ADN en aval
  • Déplacement important de la région N-terminale de sigma
25
Q

Qu’est-ce que la synthèse abortive?

A

L’ARN produit de courts ARN de moins de 10 nucléotides avant de se libérer du promoteur

26
Q

Qu’arrive-t-il lorsque la polymérase parvient à synthétiser un transcrit qui atteint le seuil de 10 nucléotides?

A

Elle se libère du promoteur et passe à la phase d’élongation

27
Q

Comment évolue la taille de la bulle de transcription au court de l’élongation?

A

Elle reste toujours constante

28
Q

Quelles sont les 2 fonctions correctrices de l’ARN polymérase?

A
  • La correction pyrophospholytique

- La correction hydrolytique

29
Q

Nommer une cause courante de l’arrêt d’un ARN polymérase

A

Présence d’un brin d’ADN endommagé

30
Q

Quelle protéine enlève la polymérase et recrute des enzymes de réparation suite à un bris?

A

La TRCF

31
Q

Qu’arrive-t-il lors de la collision entre la TRCF et la polymérase qui pousse cette dernière vers l’avant?

A
  • La polymérase reprend l’élongation

- La polymérase se dissocie du complexe

32
Q

Qu’est-ce qu’un terminateur?

A

Séquence d’ADN qui conduit la polymérase en phase d’élongation à se dissocier de l’ADN et et à libérer l’ARN produit

33
Q

Quels sont les 2 types de terminateurs chez les bactéries?

A
  • Terminateurs Rho-dépendants

- Terminateurs Rho-indépendants

34
Q

Qu’est-ce qu’un site Rut?

A

Éléments d’ARN mal définis qui nécessitent l’action de Rho

35
Q

Que requierent les ARN polymérases des eucaryotes de plus que les ARN polymérase des proacryotes?

A

Des facteurs généraux de transcription et des facteurs supplémentaires

36
Q

Quels éléments font parti d’un promoteur minimal eucaryote?

A
  • Élément reconnu par TFIIB
  • Boîte TATA
  • Élément initiateur
  • Éléments d’aval du promoteur
37
Q

Les facteurs généraux de transcription peuvent être comparé à quelle structure chez les procaryotes?

A

Le facteur sigma

38
Q

Quelles sont les principaux rôle des FGT?

A
  • Aident la Pol II à se fixer au promoteur et à séparer les brins d’ADN
  • Aident la Pol II à se détacher du promoteur et à débuter l’élongation
39
Q

Par quoi est formé le complexe de préinitiaiton?

A
  • Facteurs généraux de transcriptions
  • Pol II
  • Promoteur
40
Q

Quelles étapes absentes chez les bactéries sont nécessaires à la libération du promoteur chez les eucaryotes?

A
  • Hydrolyse d’ATP

- Phosphorylation de la Pol II

41
Q

Pourquoi a-t-on besoin de l’intervention de facteurs supplémentaires pour la transcription in vivo?

A

Parce que l’ADN matrice in vivo est empaquetée sous forme de chromatine

42
Q

Quels facteurs remplaces les facteurs d’initiations au début de la phase d’élongation?

A

Les facteurs d’élongation

43
Q

Quel est le rôle de FACT?

A

Démanteler et réassembler les nucléosomes

44
Q

Quelles modification doivent être apportées à l’ARN eucaryote après avoir été transcrit?

A
  • Formation de la coiffe à l’extrémité 5’
  • L’épissage de l’ARN
  • La polyadénylation à l’extrémité 3’

Introduction à la génétique moléculaire (SBM-1004) (9 decks)

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