La réplication de l'ADN Flashcards
Combien de temps dure environ la réplication de l’ADN?
10h
Quels éléments sont nécéssaires à la réplication de l’ADN?
- dNTP
- Jonction amorce:matrice
- ADN polymérase
En quoi consiste la matrice dans jonction amorce:matrice?
Le brin-mère simple brin
En quoi consiste l’amorce dans la jonction amorce:matrice?
Brin complémentaire au brin-mère
Quel groupement effectue une attaque nucléophile sur le groupement phosphate du dNTP?
L’extrémité libre 3’-OH de l’amorce
D’où provient le dNTP qui s’ajoute à l’amorce?
Du noyau
Vrai ou faux.
La liaison entre le dNTP et l’amorce peut se faire même si les bases ne sont pas appariées entre elles. (Ex: Ajout d’un A sur un C)
Vrai, mais la liaison sera 10 000x plus efficace si la base est appariée
Quels sont les 2 activités de la paume de la main de l’ADN polymérase?
- La polymérisation
- L’exonucléase
Quels sont les rôles des ions métalliques divalents présents dans la paume de la main?
- Modifier l’environnement chimique du 3’-OH et du dNTP
- Un des ions rédiut le 3’-OH en 3’-O
- L’autre ion stabilise les phosphates B et Y
Quel est le rôle de l’exonucléase?
Vient couper les nucléotides mésappariés
Quel est le rôle des “doigts” de la main de l’ADN polymérase?
Lors d’un appariement correct, les doigts se referment sur le dNTP
Quel est l’effet de la fermeture des doigts sur le dNTP?
- Rapprocher le nucléotide des ions métalliques
- Augmenter la vitesse de catalyse
Qu’est-ce qui empêche tout appariement d’un dNTP avec la 2eme base?
La rotation de 90 degrés induite entre la 1ère et la 2ème base de la matrice
Quel est le rôle du pouce de la main de l’ADN polymérase?
- Maintient l’amorce et le site actif de la paume en position optimale
- Permet de maintenir une association forte entre l’ADN polymérase et son substrat
Pourquoi l’ADN polymérase est dite processive?
Parce qu’à chaque liaison à son substrat, elle catalyse l’ajout de plusieurs nucléotides
Qu’est-ce que la fourche de réplication?
L’endroit où l’ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaire
Dans quel sens se fait la réplication?
5’ - 3’
À quoi sert la primase?
Créer des petits ARN qui servent d’amorces
Quel est le rôle de la RNase H?
Dégrade spécifiquement les ARN appariés à l’ADN, sauf le dernier ribonucléotide
Pourquoi la RNase H ne peut pas enlever le dernier ribonucléotide?
Parce qu’il peut seulement cliver la liaison d’un ribonucléotide (ARN-ARN)
Quel enzyme enlève le dernier ribonucléotide?
L’exonucléase 5’
Quel type d’énergie les hélicases utilisent-elles?
L’ATP
À quoi servent les protéines SSB?
Se lient à l’ADN simple brin pour empêcher le réappariement, la dégradation et la formation de boucles
Vrai ou faux.
Les SSB sont spécifiques.
Faux, car elles ne forment pas de liaisons hydrogènes avec les bases
Quel est le rôle de la topoisomérase dans la fourche de réplication?
Éliminer le surenroulement généré par l’hélicase
Quelle est la processivité des Pol α, ε et δ?
Pol α possède une processivité faible alors que les deux autres ont une processivité élevée
Quels brins synthétisent respectivement les Pol δ et ε?
δ: Brin discontinu
ε: Brin continu
Quel est le rôle principal de l’anneau coulissant?
Augmenter de beaucoup la processivité de l’ADN polymérase
Quel est le rôle des poseurs d’anneaux coulissants?
Catalysent l’ouverture et le positionnement des anneaux coulissants
De quoi est formé l’holoenzyme de l’ADN Pol III?
- 2 noyaux d’ADN Pol III
- 2 protéines T
- Complexe Y (poseur d’anneaux coulissants)
- Anneau coulissant
De quelles structures est formé le répliosome?
- L’holoenzyme d’ADN Pol III
- L’hélicase
- La primase
Où se déroule normalement l’ouverture initiale de la double hélice pour y fixer l’hélicase?
Dans des séquences internes des chromosomes
Comment se nomment les sites spécifiques où débute la réplication?
Origines de réplication
Combien y a-t-il d’origines de réplication chez les procaryotes et les eucaryotes?
- Procaryotes: Très variable
- Eucaryotes: 1/30 kpB
Quels sont les 2 composants de l’initiation?
- Le réplicateur
- L’initiateur
Quelles sont les 2 parties du réplicateur?
- Site de liaison des protéines initiatrices
- Séquences facilement déroulées (A:T riches)
Qu’est-ce que l’initiateur?
Protéine qui reconnaît spécifiquement une séquence du réplicateur
Qu’est-ce que le réplicateur?
Séquences d’ADN suffisantes pour l’initiation de la réplication
Quels sont les 3 rôles des initiateurs?
- Se lient à l’ADN du réplicateur
- Viennent dérouler/déformer la région adjacente à leur site de liaison
- Recrutent les protéines nécéssaires à l’initiation de la réplication
Quels sont les 2 événements distincts de l’initiation de la réplication chez les eucaryotes et à quel moment se déroulent-ils?
- Sélection des réplicateurs (phase G1)
- Activation des origines de réplication (phase S)
Qu’est-ce qui forme le complexe pré-réplicatif?
- Le réplicateur
- L’initiateur
- Les poseurs d’hélicase
- Les hélicases
Comment se déroule la fin de la réplication dans les chromosomes circulaires?
La topoisomérase II vient séparer les chromosomes filles enlacées une dans l’autre
Comment se nomment les extrémités des chromosomes linéaires?
Les télomères
Comment est organisée l’extrémité des chromosomes linéaires?
Répétitions bicaténaires possèdant une extrémité 3’ monocaténaire
Quelle enzyme est recrutée par la structure des télomères?
La télomérase
Que fait la télomérase?
Vient allonger l’extrémité 3’ monocaténaire
Pourquoi y a-t-il la formation de boucles T aux extrémités des chromosomes?
Permet de garder intact l’extrémité monocaténaire du télomère
