La réplication de l'ADN

Question 1

Combien de temps dure environ la réplication de l’ADN?

Answer 1

10h

Question 2

Quels éléments sont nécéssaires à la réplication de l’ADN?

Answer 2

• dNTP
• Jonction amorce:matrice
• ADN polymérase

Question 3

En quoi consiste la matrice dans jonction amorce:matrice?

Answer 3

Le brin-mère simple brin

Question 4

En quoi consiste l’amorce dans la jonction amorce:matrice?

Answer 4

Brin complémentaire au brin-mère

Question 5

Quel groupement effectue une attaque nucléophile sur le groupement phosphate du dNTP?

Answer 5

L’extrémité libre 3’-OH de l’amorce

Question 6

D’où provient le dNTP qui s’ajoute à l’amorce?

Answer 6

Du noyau

Question 7

Vrai ou faux.
La liaison entre le dNTP et l’amorce peut se faire même si les bases ne sont pas appariées entre elles. (Ex: Ajout d’un A sur un C)

Answer 7

Vrai, mais la liaison sera 10 000x plus efficace si la base est appariée

Question 8

Quels sont les 2 activités de la paume de la main de l’ADN polymérase?

Answer 8

• La polymérisation

- L’exonucléase

Question 9

Quels sont les rôles des ions métalliques divalents présents dans la paume de la main?

Answer 9

• Modifier l’environnement chimique du 3’-OH et du dNTP
• Un des ions rédiut le 3’-OH en 3’-O
• L’autre ion stabilise les phosphates B et Y

Question 10

Quel est le rôle de l’exonucléase?

Answer 10

Vient couper les nucléotides mésappariés

Question 11

Quel est le rôle des “doigts” de la main de l’ADN polymérase?

Answer 11

Lors d’un appariement correct, les doigts se referment sur le dNTP

Question 12

Quel est l’effet de la fermeture des doigts sur le dNTP?

Answer 12

• Rapprocher le nucléotide des ions métalliques

- Augmenter la vitesse de catalyse

Question 13

Qu’est-ce qui empêche tout appariement d’un dNTP avec la 2eme base?

Answer 13

La rotation de 90 degrés induite entre la 1ère et la 2ème base de la matrice

Question 14

Quel est le rôle du pouce de la main de l’ADN polymérase?

Answer 14

• Maintient l’amorce et le site actif de la paume en position optimale
• Permet de maintenir une association forte entre l’ADN polymérase et son substrat

Question 15

Pourquoi l’ADN polymérase est dite processive?

Answer 15

Parce qu’à chaque liaison à son substrat, elle catalyse l’ajout de plusieurs nucléotides

Question 16

Qu’est-ce que la fourche de réplication?

Answer 16

L’endroit où l’ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaire

Question 17

Dans quel sens se fait la réplication?

Answer 17

5’ - 3’

Question 18

À quoi sert la primase?

Answer 18

Créer des petits ARN qui servent d’amorces

Question 19

Quel est le rôle de la RNase H?

Answer 19

Dégrade spécifiquement les ARN appariés à l’ADN, sauf le dernier ribonucléotide

Question 20

Pourquoi la RNase H ne peut pas enlever le dernier ribonucléotide?

Answer 20

Parce qu’il peut seulement cliver la liaison d’un ribonucléotide (ARN-ARN)

Question 21

Quel enzyme enlève le dernier ribonucléotide?

Answer 21

L’exonucléase 5’

Question 22

Quel type d’énergie les hélicases utilisent-elles?

Answer 22

L’ATP

Question 23

À quoi servent les protéines SSB?

Answer 23

Se lient à l’ADN simple brin pour empêcher le réappariement, la dégradation et la formation de boucles

Question 24

Vrai ou faux.

Les SSB sont spécifiques.

Answer 24

Faux, car elles ne forment pas de liaisons hydrogènes avec les bases

Question 25

Quel est le rôle de la topoisomérase dans la fourche de réplication?

Answer 25

Éliminer le surenroulement généré par l’hélicase

Question 26

Quelle est la processivité des Pol α, ε et δ?

Answer 26

Pol α possède une processivité faible alors que les deux autres ont une processivité élevée

Question 27

Quels brins synthétisent respectivement les Pol δ et ε?

Answer 27

δ: Brin discontinu

ε: Brin continu

Question 28

Quel est le rôle principal de l’anneau coulissant?

Answer 28

Augmenter de beaucoup la processivité de l’ADN polymérase

Question 29

Quel est le rôle des poseurs d’anneaux coulissants?

Answer 29

Catalysent l’ouverture et le positionnement des anneaux coulissants

Question 30

De quoi est formé l’holoenzyme de l’ADN Pol III?

Answer 30

• 2 noyaux d’ADN Pol III
• 2 protéines T
• Complexe Y (poseur d’anneaux coulissants)
• Anneau coulissant

Question 31

De quelles structures est formé le répliosome?

Answer 31

• L’holoenzyme d’ADN Pol III
• L’hélicase
• La primase

Question 32

Où se déroule normalement l’ouverture initiale de la double hélice pour y fixer l’hélicase?

Answer 32

Dans des séquences internes des chromosomes

Question 33

Comment se nomment les sites spécifiques où débute la réplication?

Answer 33

Origines de réplication

Question 34

Combien y a-t-il d’origines de réplication chez les procaryotes et les eucaryotes?

Answer 34

• Procaryotes: Très variable

- Eucaryotes: 1/30 kpB

Question 35

Quels sont les 2 composants de l’initiation?

Answer 35

• Le réplicateur

- L’initiateur

Question 36

Quelles sont les 2 parties du réplicateur?

Answer 36

• Site de liaison des protéines initiatrices

- Séquences facilement déroulées (A:T riches)

Question 37

Qu’est-ce que l’initiateur?

Answer 37

Protéine qui reconnaît spécifiquement une séquence du réplicateur

Question 38

Qu’est-ce que le réplicateur?

Answer 38

Séquences d’ADN suffisantes pour l’initiation de la réplication

Question 39

Quels sont les 3 rôles des initiateurs?

Answer 39

• Se lient à l’ADN du réplicateur
• Viennent dérouler/déformer la région adjacente à leur site de liaison
• Recrutent les protéines nécéssaires à l’initiation de la réplication

Question 40

Quels sont les 2 événements distincts de l’initiation de la réplication chez les eucaryotes et à quel moment se déroulent-ils?

Answer 40

• Sélection des réplicateurs (phase G1)

- Activation des origines de réplication (phase S)

Question 41

Qu’est-ce qui forme le complexe pré-réplicatif?

Answer 41

• Le réplicateur
• L’initiateur
• Les poseurs d’hélicase
• Les hélicases

Question 42

Comment se déroule la fin de la réplication dans les chromosomes circulaires?

Answer 42

La topoisomérase II vient séparer les chromosomes filles enlacées une dans l’autre

Question 43

Comment se nomment les extrémités des chromosomes linéaires?

Answer 43

Les télomères

Question 44

Comment est organisée l’extrémité des chromosomes linéaires?

Answer 44

Répétitions bicaténaires possèdant une extrémité 3’ monocaténaire

Question 45

Quelle enzyme est recrutée par la structure des télomères?

Answer 45

La télomérase

Question 46

Que fait la télomérase?

Answer 46

Vient allonger l’extrémité 3’ monocaténaire

Question 47

Pourquoi y a-t-il la formation de boucles T aux extrémités des chromosomes?

Answer 47

Permet de garder intact l’extrémité monocaténaire du télomère