Altérations et réparations de l'ADN Flashcards
Quelle serait la conséquence d’un haut taux de mutations dans une cellule somatique?
Destruction d’un individu
Quelle serait la conséquence d’un haut taux de mutations dans une cellule germinale?
Destruction de la lignée d’une espèce
De quels facteurs dépend la probabilité d’apparition d’une mutation?
- La fréquence des dommages
- La vitesse de réparation
- Du potentiel mutagène des dommages
Quelle sont les 2 causes principales des mutations?
- Les erreurs de réplication
- Les lésions chimiques ou physiques
Qu’est-ce qu’une mutation?
Tout changement de séquence de l’ADN
Quels sont les 2 types de substitution de bases possibles?
Transition et transversion
Vrai ou faux. Un mésappariement entraîne toujours une mutation.
Faux, car il y a toujours un deuxième cycle de réplication
Où se passent principalement les insertions?
Dans les régions de répétition courtes en tandem
Quelle structure corrige les mésappariement durant la réplication?
L’endonucléase 3’
Quand le système de réparation des mésappariements agit-il?
Après la réplication
De combien augmente la fidélité par le système de réparation des mésappariements?
100 à 1000x supplémentaire
Quels sont les 2 défis du système de réparation des mésappariements?
- Inspecter et réparer les mésappariements rapidement avant la fixation de la mutation par la réplication de l’ADN
- Doit reconnaître le nucléotide mal apparié et non celui sur l’autre brin
Comment E Coli peut-il choisir quel brin il doit casser pour réparer?
Lors de la réplication, seul le brin parental est méthylé. MutH casse l’ADN sur le brin non-méthylé
Quel dimère inspecte et reconnaît le mésappariement?
MutS
Quelle protéine est recrutée par MutS?
MutL
Quelle protéine se fixe au complexe suite à la liaison de MutL?
MutH
Qu’est-ce qui entraîne l’activation de mutH?
Lorsque le complexe va se localiser au premier GATC hémiméthylé
Où clivera MutH activé?
En 5’ du GATC et en 3’ du mésappariement
Quelle protéine enlève le bout d’ADN contenant le mésappariement?
Une hélicase
Quelles protéines remplissent la brèche créée?
Pol II et ligase
Quelle est la principale différence entre les eucaryotes et les procaryotes dans le processus de réparation des mésappariements?
Il n’y a pas d’hémiméthylation chez les eucaryotes
Quels sont les analogues de MutS et MutL chez les eucaryotes?
MutS: MSH
MutL: MLH
Qu’est-ce qui permet la réparation sur le brin discontinu des eucaryotes?
Avant d’être ligaturés, les fragments d’Okazaki ont une cassure qui sert de point de départ à la réparation
Quels types d’altérations peuvent être effectuées sur l’ADN?
Des altérations exogènes et endogènes
Qu’est-ce qu’une désamination
Le retrait d’un groupement amine sur une base
Quelles bases peuvent être désaminées et quel est le résultat?
Cytosine = uracile Adénine = Hypoxanthine Guanine = xanthine Thymine = ne peut pas être désaminée (n'a pas de groupement amine)
Quelle base est la plus fréquemment désaminée?
La cytosine
La cytosine désaminée s’apparie préférentiellement à quelle base?
Une adénine
Une adénine désaminée s’apparie à quelle base?
Une cytosine
Une guanine désaminée s’apparie à quelle base?
Une cytosine (ne provoque pas de mutation)
Que donne une méthylation des cytosines?
Des 5’méthylcytosines
Qu’est-ce qui résulte de la désamination d’une 5’méthylcytosine?
Une thymine
Quelle type d’altération constitue la désamination?
Une altération endogène
Quelles bases peuvent subir une transition?
A vers G
T vers C
(vice versa)
Quelles bases peuvent subir une transversion?
-A vers C
-A vers T
-T vers G
-T vers A
(vice versa)
Qu’est-ce qu’une dépurination?
Hydrolyse spontanée de la liaison N-Glycosidique
Quelle type d’altération constitue la dépurination?
Une altération endogène
Quelle type d’altération constitue l’oxydation?
Peut être à la fois endogène ou exogène
Quelle est la source endogène de l’oxydation?
La chaîne respiratoire
Quelles sont les sources exogènes de l’oxydation?
- Radiations ionisantes
- Ultraviolets
- Agents chimiques générant des radicaux libres
Quelle est l’oxydation la plus fréquente dans la cellule?
Oxydation de la guanine
Dans quel type de pathalogie retrouve-t-on des transversions G vers T?
Dans les cancers humains
Avec quoi s’apparie la guanine oxydée?
L’adénine
En quoi consiste une alkylation?
Des groupements méthyle ou éthyle sont ajoutés sur les phosphates ou les bases de l’ADN
Nommer quelques agents alkylants?
- Nitrosamines
- Agent mutagène de laboratoire
Quel est un site sensible à l’alkylation?
L’oxygène du carbone 6 de la guanine
Quel est la résultat de l’alkylation de la guanine?
O6-méthylguanine
Avec quoi peut s’apparier l’O6-méthylguanine?
Avec la thymine
Que cause l’O6-méthylguanine dans la double hélice?
Une distorsion
Quels type d’ultraviolet sont absorbés par l’ADN?
UVC et UVB
Quelles sont les effets des dommages directs des UV sur l’ADN?
Fusion photochimique entre 2 pyrimidines adjacentes
Quelle est la conséquence d’une fusion de 2 pyrimidines?
Bloquage des ADN et ARN polymérase
Quels types d’ultraviolets sont impliqués dans les effets indirects sur l’ADN?
Les UVA (longs)
Vrai ou faux. Les UVA sont fortement absorbés par l’ADN.
Faux, elles ne sont que peu ou pas absorbées par l’ADN
Quel est l’effet des UVA?
Ils excitent d’autres chromophores cellulaires
Quels sont les effets des rayons y et x (radiations ionisantes)?
Cassures bicaténaires de l’ADN
Les radiations ionisantes attaquent quoi?
Le désoxyribose du squelette de l’ADN
Qu’est-ce qu’un analogue de base?
Composé qui se substitue aux bases normales
Nommer l’analogue de la thymine.
5-bromo-uracile
À quoi s’apparie l’5-bromo-uracile?
À la guanine
Que provoquent les agents intercalants?
Des additions ou délétions d’une à plusieurs paires de bases
Quelles sont les 2 conséquences possibles des altérations de l’ADN?
- Empêchent la réplication ou la transcription
- Provoquent un changement permanent de l’ADN après la réplication
Quel mécanisme fait partie de la réversion directe?
La photoréactivation
Quel est le mode d’action de la photolyase?
Utilise l’énergie de la lumière pour rompre les liens covalents entre les pyrimidines adjacents
Chez quels organismes est présente la photolyase?
Les procaryotes et les eucaryotes inférieures
Vrai ou faux. La réversion directe enlève la base endommagée.
Faux, elle ne l’enlève pas, elle la répart.
Pourquoi dit-on que la méthytransférase est une enzyme suicide?
Car la cellule ne peut l’utiliser qu’une seule fois
Quel est le rôle de la BER?
Enlever seulement la base endommagée
Quelle est la double action de la BER?
- Glycosylase (enlève la base et génère un site AP)
- AP endonucléase (enlève le site AP)
Vrai ou faux. Les BER et NER possèdent une spécificité semblable.
Faux, la BER est très spécifique alors que la NER n’est pas spécifique
Quels types de dommages sont gérés par les NER?
Les dommages non reconnus par les autres mécanismes de réparation
Quel est le mode d’action des NER?
- Reconnaît une déformation de la double hélice d’ADN
- Enlève une partie d’ADNsb responsable de la déformation
- Rempli la brèche par une ADN pol et une ligase
Quel est le mode d’action des protéines du NER chez les procaryotes?
- UvrA et B scrutent lMADN
- UvrA détecte les déformations de l’ADN
- UvrB ouvre la double hélice et recrute UvrC
- UvrC créé 2 incisions
- Hélicase UvrD enlève le fragment contenant la lésion
- ADN pol et ligase remplissent la brèche
Quelles incisions sont créées par UvrC?
- 8 nucléotides de la lésion en 5’
- 4-5 nuclétoides de la lésion en 3’
Comme la NER est générale, pourquoi a-t-on besoin de la BER?
- Parce que BER est beaucoup plus rapide
- Parce que NER répare seulement des dommages qui causent des distorsions de l’ADN
Quand intervient la synthèse translésionnelle?
Quand un dommage n’est pas réparé et que l’ADN pol est bloqué
Chez les mammifères, comment a lieu la translésion?
- Anneau coulissant est ubiquitiné suite à un blocage de l’ADN pol par un dommage
- Anneau ubiquitiné recrute l’ADN pol translésionnelle
Dans quels processus est impliqué la recombinaison?
- Méiose
- Réparation de l’ADN
Lors de cassures bicaténaires, que peut-on utiliser comme modèle pour la réparation?
Le chromosome homologue
Quand peut-on dire que deux molécules d’ADN sont homologues?
Quand elles sont identiques ou quasi-identiques sur une longueur d’au moins 100 pb
Qu’est-ce qu’une jonction de Holliday?
Une jonction mobile entre 4 brins d’ADN
À quoi sert la voie RecBCD?
À la réparation des cassures bicaténaires chez E. Coli
Quel est le mécanisme d’action de la voie RecBCD?
- RecBCD aménage l’ADN au site de cassure
- RecA catalyse l’échange des brins en recouvrant les séquences homologues
- RuvA et RuvB catalysent la migration d’embranchement
- RuvC permet la résolution de la jonction de Holliday
Quelles sont les 2 fonctions de RecBCD?
Hélicase et nucléase
Quels sont les 2 types d’hélicase de RecBCD?
- RecB = hélicase lente
- RecD = hélicase rapide
Quelle est la nucléase de RecBCD?
RecB
Que reconnaît RecC?
Le site “chi”
Qu’est-ce qu’un site chi?
Séquence GCTGGTGG
Quelles sont les étapes de l’invasion des brins par RecA?
- RecA se lie à un bout d’ADNsb par polarité
- Recherche d’homologie
- Formation d’un complexe stable entre les 2 molécules d’ADN
