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Genomica Y Proteomica > Quiz 2 > Flashcards

Quiz 2 Flashcards

1
Q

Concepto de los elementos funcionales y repetidos del genoma

A

Distintas proteinas (isoformas) pueden venir del mismo gen, por el splicing alternativo

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Q

Modificaciones post transcripcionales
Para que sirven? y Cuales son?

A

Para no degradar el ARN
- Cap: protege
- Cola de PoliA: protege
- Splicing: Mecanismo de producción de diferentes isoformas.
Deja pasar al exon, y corta al intron

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3
Q

Que necesitas hacer para traducir el ARN?

A

Quitarle la Cap y la cola de PoliA.
Que se una la ligasa para juntar los exones

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4
Q

Tipos de ARN.
Cuales son? A que pol estan unidos?

A

m: POL II (lleva el codon)
t: POL III (anticodon)
r: POL I (60s + 40s) (complejos proteicos + rARN)

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5
Q

Modificaciones post traduccionales
Para que sirven? y Cuales son?

A

ARN —> proteínas
- Acetilacion: afloja la cadena (mejor lectura)
- Metilacion: enreda la cadena (más difícil la lectura)
- Ubiquitinacion: para que el proteosoma la ubique

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6
Q

Tipos de Degradacion de ARN

A
  • Independiente: una exonucleasa quita el 5’cap (decaping)
  • Dependiente: una exonucleasa corta la cola de PoliA
  • Endonucleotica: una endonucleasa corta todo el ARN
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7
Q

Pasos de la Maduración de tRNA

A
  1. Elimina intron de 14 nucleotidos
  2. RNAasa elimina los primeros nucleotidos de 5’
  3. El residuo UU en 3’ se cambia por ACC
  4. Modificaciones de pb
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8
Q

Que hay en rio arriba (-)?

A
  • Enhacers
  • Islas CpG
  • TATA
  • Factores de transcripción
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9
Q

mRNA

A

Lineal

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10
Q

tRNA

A

Unico para cada aminoacido

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11
Q

rRNA

A

Subunidades

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12
Q

siRNA

A

Silenciamiento genico
Degrada el mRNA

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13
Q

snRNA

A

Spliceosoma
Esta en el nucleo
U1-U6

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14
Q

mtRNA

A

Mitocondrial
Mujeres

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15
Q

miRNA

A

Bloquea unión mRNA

Monocatenario = activo
Experimento flores

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16
Q

hnRNA

A

Esta en el núcleo
Es el preRNA
Sin modifcaciones

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17
Q

lncRNA

A

Incorpora

18
Q

Estruturas del RNA

A

Secundaria: Hairpins (5-10 nt)
Stemloops (1000s nt)
Terciaria: Pseudoknot (2 stem, 2 loops)

19
Q

Pasos de la maduración del miRNA

A
  1. DROSHA: corta la forma bicatenaria
  2. Sale del núcleo
  3. DICER: corta el loop
  4. Argonauta-RISC: exonucleasa corta extremos
  5. Se une a la cadena blanco (a la que no quieres que se traduzca)
  6. Inhibir traducción
20
Q

Fase piloto del proyecto ENCODE

A
  • Estrategias y uso de tecnologías
  • Hibridación CHIP chip
  • Regiones ortológicas (vienen del mismo ancestro)
21
Q

Fase 2 del proyecto ENCODE

A
  • Metodología
  • Caracterización de RNAs no codificantes
22
Q

Definición gen

A

Secuencia de nucleotidos para sintetizar una proteína

23
Q

Concepto de pseudogen

A

No produce proteínas por mutaciones en codones.

24
Q

Definición de pseudogen

A

Secuencia de DNA derivadas de duplicación o retroposición de genes funcionales en selección natural adquieren nuevas funciones reguladoras o variabilidad.

25
Q

A que se deben los paros prematuros en los pseudogenes?

A
  • Secuencias duplicadas
  • Mutaciones en marco de lectura
  • Adhesiones y deleciones
26
Q

Tipos de pseudogenes

A
  • Procesado: No intrones, deriva de mRNA maduro, tiene cola de PoliA (RETROTRANSCRIPCION)
  • No procesado: Tiene intrones, deriva de DNA duplicado en tandem (DUPLICADO)
  • Unitary: no tiene gen parental
  • Segregating: una misma especie
27
Q

Que es un retrogen?

A

No tiene intrones y deriva de un pseudogen

28
Q

Que es el splicing alternativo?

A

Mecanismo de producción de diferentes isoformas

29
Q

Concepto duplicaciones segmentales

A

Pueden generar duplicaciones o deleciones

30
Q

Short tandem repeat

A
  • Repetición de 2 o más pares de bases
  • No codificante
  • Marcador genético
31
Q

Low copy repeat

A

1-300 kb

32
Q

Tipos de low copy repeat

A
  • Pericentromericos: generados por duplicación intercromosomal
  • Subtelomericos: En bloques, y da variabilidad genetica
  • Intersticiales: Duplicaciones intracromosomicas, y son los más grandes
33
Q

En el low copy repeat la heterocromatina es _________ y la región genica es _______

A

Neutro
Riesgo

34
Q

snoRNA

A

rRNA
Splicing

35
Q

XIST

A

Regula la inactivación del cromosoma X

36
Q

H19

A

Imprinting

37
Q

Trasposones

A
  • Genes saltarines
  • Se pueden replicar e insertar en diferentes localizaciones
38
Q

Retrotrasposones

A
  • Clase I
  • En duplicación o desplazamiento a RNA
  • En bandas G
  • Autonomos
39
Q

Retrotrasposones LTRs

A

Largas ( 100 pb a 5 kb )
En el extremo de los cromosomas

40
Q

Retrotrasposones no LTR

A

LINES: 20% del genoma
SINES: 13% del genoma

41
Q

DNA trasposones

A

Saltan directamente

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