Proteiner Flashcards
Vilka funktioner kan proteiner ha i den mänskliga kroppen? Ge exempel.
- Rörelse
- Katalysera reaktion (Enzymer)
- Signalering (Hormoner)
- Styr bildning av andra molekyler (ex Triacylglycerol)
- Immunförsvar
- Transport (Hemoglobin)
- Strukturell funktion (ex Bindväv)
Vad definierar Primärstruktur i proteiner?
HUVUDDEFINITION: Avser den specifika sekvensen av aminosyror i en Polypeptidkedja
- Unik för varje protein
- Påverkar de större strukturerna
- Stabil men kan förändras genom mutation
Vad kännetecknar Sekundärstruktur i proteiner?
Detta avser hur Primärstrukturen bildar fält eller form.
Två vanliga former i Sekundärstrukturer är α-helix och β-flak
Vad kännetecknar α-helix i i proteiner?
- Ingår i Sekundärstrukturer
- Bildas en spiral som roterar runt sin egen axel, precis som DNA
- Stabiliseras med hjälp av vätebindningar mellan syret och vätet vid N-Terminal till C-Terminal
- Varje varv består av 3,6 aminosyror
Vad kännetecknar β-flak i proteiner?
- Ingår i sekundärstrukturer
- Stabiliseras av vätebindningar
- Kan gå i parallell eller anti-parallell riktning
Vilka egenskaper får β-flak med parallell riktning? Hur ser dem ut?
- Ligger som band intill varandra
- Går åt samma håll och staplas på varandra
- Lite mindre stabila än β-flak med anti-parallell riktning
Vilka egenskaper får β-flak med ANTI-parallell riktning? Hur ser dem ut?
- Banden ligger intill varandra men går i olika riktning
- Detta medför att avstånden minskar och banden ligger närmare varandra vilket gör strukturen mer stabil (fler vätebindningar verkar på varandra)
Vilken inverkan har Prolin på β-flak strukturen?
Svänger de raka kedjorna pågrund av sin ringformade molekyl-karaktär. Detta kallas även β-turns
Vilken del av Sekundärstrukturerna anses både tillhöra Tertiärstruktur och Sekundärstruktur? Varför?
- Disulfidbryggor (KOVALENT BINDNING)
- Aminosyran Cystein har en sulfhydrylgrupp (-SH) som bidrar till detta
- Detta stabiliserar proteinstrukturer och gör dem mer resistenta mot denaturering
- Sker mellan Cysteinets sulfhydrylgrupp och extracellulära proteiner
Vad kännetecknar Tertiärstruktur?
- Detta är en komplett 3D-struktur
- Uppbyggnaden beros på Primärstrukturens (sekvensen) och Sekundärstrukturens (grundstruktur) uppbyggnad
- Här har proteinet veckats där hydrofila delar vänts inåt och hydrofila vänts utåt
- Disulfidbryggor har uppstått
På bilden syns en Tertiärstruktur med kombination av α-helix och antiparallellt β-flak
Vad kännetecknar Kvartärstruktur i proteiner? Ge exempel
- Består av flera olika monomerer (ex Tertiärstrukturer och andra molekyler
- Flera polypeptidkedjor samverkar
- Hemoglobin är ett Globulärt protein med kvartärstruktur. Har fyra subenheter (2 st α-Globiner och 2 st β-Globiner)
Vid bildandet av kollagen krävs en viss modifiering av aminosyror. Vilken proteinstruktur har kollagen och vad krävs vid bildandet? Vad kan störa bildandet?
Kollagen har kvartärstruktur och bildar en trippelhelix som kallas ”Coiled Coil”.
10% av kollagenet består av en modifierad variant av aminosyran Prolin
Prolinet måste hydroxyleras (tillföras OH-grupp) och kräver Askorbinsyra (C-vitamin) som kofaktor
Hydroxyleringen möjliggörs med inverkan av enzymet Prolylhydroxylas. Detta gör att vätebindningarna binder starkare i kollagenet
C-vitaminbrist kan orsaka skörbjugg, sämre sårläkning och skörhet i blodkärl
Vilka krafter påverkar proteinstrukturer?
- Van der Waals-bindningar
- Vätebindningar
- Jonbindningar
- Hydrofoba Interaktioner
- Kovalenta bindningar (Disulfidbryggor ex..)
Vilka miljöfaktorer påverkar krafterna i proteinstrukturer?
- Temperatur
- Koncentration av salt/joner
- pH
Hur möjliggörs veckningen av proteiner?
- Sker stegvis, i ”bitar”
- Sker med hjälp av specifik omgivning (vatten exempelvis)
- Sker med hjälp av Chaperoner som är en typ av proteiner som deltar i veckningen
Vad är Amyloid?
Felveckade proteiner som bildar enorma aggregat. Detta leder till att cellen dör.
Ett exempel är proteinet Superoxiddismutas-1 som felveckas, bildar aggregat och sprider sig som en Prion (ALS)
Vad är Prioner?
Felveckade proteiner som ”tvingar” andra proteiner att felvecka sig i cellerna. Också smittsam vid intag. Leder till svåra sjukdomar som exempelvis sjukdomen Kuru
Vad är ett Domän?
- Funktionell peptidkedja som veckas oberoende av den resterande delen av peptidkedjan
- Har speciell funktion som att t.ex binda till Ligander i DNA
Vad är en Subenhet?
- Polypeptidkedja som kombineras för att bygga upp specifikt protein
- Hemoglobin består av fyra subenheter av två typer: α-Globiner och β-Globiner
Vad menas med begreppet Familj med hänsyn till proteiner?
- Evolutionärt besläktade proteiner
- Lika i sekvenser och liknande strukturer
- Exempel: β-Globin och δ-Globin tillhör familjen Globiner där strukturerna och sekvenserna liknar varandra
Vad menas med Translationell Modifiering?
- Proteiner som modifieras efter RNA-translationen (modifiering sker på de flesta proteiner)
- Kombineras ofta med annat än aminosyror, exempelvis Hemoglobin som binder till en Hemgrupp
Nämn några post-translationella modifieringar
- Fosforylering (tillförs fosfatgrupp)
- Hydroxylering (tillförs hydroxylgrupp -OH)
- Glykosylering (muciner = glykoprotein som ingår i slem)
- Klyvning (insulin = innan insulin bildas så heter den ProInsulin som är inaktivt. När den klyvs heter den Insulin och är det aktiva proteinet)
