physiologie bactérienne Flashcards
quest ce que la croissance microbienne
multiplication des cellules et non a leur taille
culture
se réfèere au fait de faire croître des cellules in vitro dans des conditions physico-chimiques déterminées afin de faciliter leur identification, l’étude de leur métabolisme voire leur utilisation à des fins médicales ou industrielles
de quoi ont besoin les microbes pour vivre
une source d’énergie + nutriments
quelles sont les potentielles source d’énergie des microbes
peut etre aussi simple que de la lumière (bactérie phototrophes), mais le plus souvent elle provient de composés chimiques (bactéries chimiotrophes)
quelle bactérie ont comme source d’énergie la lumière
bactéries phototrophes
quelles bacteries ont comme source d’énergie des composés chimiques
bactéries chimiotrophes
que procurent les nutriments aux microbes
ils procurent une source de carbone ainsi que d’électrons et de protons nécessaires au fonctionnement métabolique et physiologique du microbe
quelle est la source de carbone des bactéries autotrophes
se suffisent du CO2
quelle est la source de carbone des bactéries hétérotrophes
requièrent des composés organiques plus complexes comme le sucre
quelles est la source d’électrons des bactéries lithotrophe
source inorganique d’électron (NH3, H2S)
quelle est la source d’électrons des bactéries organotrophes
source organique d’électron (sucre)
quelles sont les sources d’électrons possible
inorganique ou organique
le métabolisme bactérien est il plus rapide que celui de l’homme
oui, 10-100 fois plus rapide que celui de l’humain
en cb de temps peuvent se diviser les bactéries dans les meilleures conditions
en 20 minutes
les substrats nutritifs des bactéries sont ils variés
oui, varié (ex:pétrole)
est ce que certaines bactéries peuvent vivre sans oxygène
oui, certaines peuvent vivre en l’absence d’oxygène
les bactéries peuvent elles vivre ds des conditions environnementales extrêmes
oui, certaines peuvent
a quel moment sont mises à profit les propriétés des bactéries
lors de leur culture et croissance en laboratoire
quest ce qu’un milieu de culture
une préparation nutritive destinée à la croissance microbienne
comment nomme t on les milieux liquides et à quoi servent ils
les bouillons de culture, qui favorisent la croissance rapide et abondante de microbes en suspension
quest ce quun inoculum
l’échantillon microbien inoculé dans un milieu de culture
que doit contenir le milieu de culture idéal
il doit contenir les éléments nutritifs appropriés aux activités métaboliques des microbes (nutriments et facteurs de croissance) et être placé dans des conditions de croissance optimales (température, oxygène, pH)
est ce que toutes les bactéries se développent bien ds tous les milieux
non, Certaines bactéries se développent bien dans presque tous les milieux, tandis que d’autres ont des exigences nutritionnelles fastidieuses
de quoi sont composés les milieux chimiques et a quoi servent ils
composition chimique strictement connue et contrôlée, peuvent être préparés pour étudier les exigences nutritionnelles de certains microbes et le rôle de certaines molécules
quels milieux sont davantage utilisé par les microbiologistes et pk
en générale, les microbiologistes utilise plutot des milieux complexes de contenu indéfini dans l,espoir de simplement favoriser la croissance de tout microbe potentiellement présent dans un échantillon
quest ce qu’un milieux complexes et de quoi est il composé
généralement des poudres achetées auprès de compagnies telles Difco) , contiennent des extraits de levures, de viande macérée ou de plantes et sont donc riches en protéines, minéraux et vitamines
comment obtient - on de la gélose
L’ajout d’un agent gélifiant à un bouillon de culture, tel l’agar (un extrait d’algues marines), permet d’obtenir des milieux solides appelés géloses,
quest ce que l’agar
un extrait de algue marine
ds quoi sont coulées les géloses
dans des plaques circulaires nommées boites de Pétri
comment est ce qu’on transfert une bactérie d’un milieu liquide à une gélose (methode utilisée)
se fait au moyen d’un fil à boucle, et on applique la méthode des stries (épuisement progressif) afin d’obtenir diverses concentrations bactériennes sur les plaques
que forme la croissance sur gélose
des colonies composées de milliards de cellules provenant théoriquement d,une seule bactérie initiale
en pratique, la colonie sur gélose provient de quoi parfois
de certaines bactéries qui sont parfois rattachées quelques-unes ensemble, si bien qu’on parle d’une ‘unité’ de départ formant ensuite une colonie, d’où l’expression ‘d’unité formant colonie’ ou, en anglais, ‘colony-forming unit’, d’où l’expression CFU dans le décompte bactérien sur gélose.
l’apparence morphologique des colonies est elle tjr similaire
non, elle est propre à l’espèce, donc similaire à chaque fois pour la même espèce sur une gélose spécifique et différente d’une espèce à l’autre.
quest ce qui va apparaitre si le bouillon de culture contenait un mélange de bactéries
une culture mixte constituée de colonies d’apparences diverses apparaît
comment obtenir une culture pure a partir dune culture mixte
Il s’agit alors de sélectionner une colonie distincte dans la culture mixte et de la repiquer sur une seconde boîte de Pétri pour obtenir une culture pure
quest ce qu’une culture pure
une culture constituée d’une seule et même espèce microbienne
a quoi servent les substances qui sont ajoutées au milieu de base et donner exemples
elles favorisent la sélection de microorganismes particuliers, comme du sang (gélose sang) ou du sang cuit libérant l’hémoglobine (gélose dite ‘chocolat’ par sa couleur brune)
comment se nomme la gélose contenant du sang cuit
gélose chocolat par sa couleur brune
a quoi sert l’hémoglobine libérée par le sang cuit dans une gélose chocolat
l’hémoglobine libérée sert de facteur de croissance (ex. pour Haemophilus)
quels sont les subdivisions des milieux de culture complexes
- milieux enrichis
- milieux sélectifs
- milieux différentiels
- milieux de transport
quest ce qu’un milieu enrichis (composition et pk)
Les milieux enrichis sont ainsi appelés parce qu’on a ajouté des produits (ex. sang, sérum, extraits de levure) pour favoriser les microbes qui croissent lentement et dont la culture est fastidieuse.
a quoi servent les milieux sélectifs
sont conçus pour inhiber la croissance de bactéries indésirables et stimuler celle des microbes recherchés, comme par exemple la recherche d’une bactérie pathogène dans les selles contenant une flore microbienne abondante et variée
quels sont les inhibiteurs possibles ajoutés dans un milieu sélectifs
un antibiotique,
un sel,
un colorant ou
un composé chimique particulier
quest ce que la gélose Chapman et à quoi sert elle
il s’agit de la gélose au mannitol et au sel servant servant à isoler le Staphylocoque qui peut croître à 7.5% de NaCl, contrairement à la plupart des autres microbes qui sont inhibés par une telle concentration saline
quest ce que le mannitol et a quoi sert il
un alcool hypertonique au pouvoir sucrant, permet de différencier les bactéries qui fermentent ou non le mannitol
quel indicateur de changement de pH est utilisé dans la gélose chapman et a quoi sert il
le rouge phénol, qui montre la production d’acide par la fermentation de mannitol, ce qui modifie le pH et donc la couleur
la gélose chapman est un milieux sélectif pour quoi
pour bactéries halophiles par sa forte concentration en sel.
a quoi servent les milieux différentiels
sont conçus pour distinguer entre colonies qui croissent sur la même boîte de Pétri, souvent à partir de souches apparentées.
que permet l’addition de sang (gélose sang) dans un milieux différentiels
permet de distinguer entre les souches de streptocoques qui sécrètent ou pas de l’hémolysine
comment se traduit la sécrétion de l’hémolysine
se traduit par l’apparition de zones d’inhibition plus (hémolyse) ou moins claires autour des zones de croissance des colonies, à cause de l’éclatement des érythrocytes dans la gélose sang
quels sont les souches pouvant etre distinguer par la sécrétions d’hémolysine
souches beta-hémolytiques (hémolytique!), alpha-hémolytiques (un peu hémolytiques) ou gamma-hémolytiques (non hémolytiques)
a quoi sert l’addition de sucres divers ainsi que d’un indicateur de pH comme le rouge neutre dans un milieux différentiels
afin de départager les souches en fonction de leurs capacités fermentaires et de produire des acides ou du gaz
en pratique, un milieu de culture peut il posséder une combinaison des propriétés
oui, une gélose peut donc à la fois être enrichie, sélective et différentielle.
dans quelle catégorie de milieux se situe la gélose Chapman et pk
gélose Chapman est sélective grâce au sel mais elle est aussi différentielle car elle permet de vérifier la fermentation du mannitol en produits acides (le rouge phénol tourne au jaune lors de la diminution du pH), discriminant ainsi entre diverses souches apparentées
dans quelle catégorie de milieux se situe la gélose MacConkey et pk
la gélose MacConkey inhibe les Gram+ par l’addition de sels biliaires et de crystal violet (aspect sélectif) mais différencie aussi entre les coliformes Gram- selon leur capacité (ou pas) de fermenter le lactose.
dans quelle catégorie de milieux se situe la gélose éosine- bleu de méthylène
même chose que la gélose MacConkey, est utilisée pour favoriser et identifier les membres de la famille des Enterobacteriaceae
a quel moment est il recommandé d’utiliser un milieu de transport
Si le spécimen ne peut être ensemencé immédiatement, comme lors de son transfert d’un centre de prélèvement à un milieu hospitalier
que permet le milieu de transport et pk
il est suffisamment pauvre pour limiter la croissance, mais capable de préserver contre la dessiccation, les modifications de pH ou la présence d’oxygène (bactéries anaérobies strictes)
de quoi dépend la croissance bactérienne
dépendantes des réactions chimiques, elle meme régule par la temperature
est ce que chaque espèce croit dans un intervalle prédéfini de témpérature
oui!
quelle est l’intervalle de température pour les bactéries psychrophiles
-10 degre Celsius à 25 degré Celsius
quelle est la température optimale de croissance des psychrophile
environ 15 degré Celsius
vrai ou faux
la majorité des membres du groupe des psychrophile sont tellement sensibles à la chaleur qu’ils ne croissent plus dans une pièce modérément chaude
vrai
où se retrouvent les psychrophiles
surtout dans les grands fonds marins ou dans certaines régions polaires
quelles sont les bactéries qui sont la cause, la plupart du temps, de la détérioration des aliments gardés au réfrigérateur à 4°C
les psychrophile
quel est l’intervalle de température pour les bactéries mésophiles
20 à 50 degré Celsius
quelle est la température préférentielle des organismes pathogènes ou constitutifs de la flore normale humaine
37 degré Celsius
quel sont les types de microbes
psychrophile, mésophiles, thermophiles
quel est le type le plus abondant de microbe
mésophile
Les organismes pathogènes ou constitutifs de la flore normale humaine font partie de quelle catégorie
mésophile
a quel type de température se développent les thermophile
température élevée
quel est l’intervalle de température optimale pour les bactéries thermophile
compris entre 50 et 80 degrés Celsius= environ la température de l’eau qui coule d’un robinet d’eau chaude
existe t il des thermophiles capables de vivre dans des conditions avoisinant les 100 degré Celsius
oui, les hyperthermophiles
quels sont les principaux gaz affectant la croissance bactérienne
oxygène et CO2
que reflete le besoin/la tolérance à l’oxygène
reflète le type de mécanisme utilisé par la bactérie pour se procurer de l’énergie, selon un mode respiratoire
quels sont les modes respiratoires
mode respiratoire aérobie, respiratoire anaérobie ou fermentaire
qu’entraine le métabolisme en présence d’oxygène
ntraîne généralement la formation de radicaux oxygénés toxiques, que sont entre autres l’ion superoxyde (O2-) et le peroxyde d’hydrogène (H2O2)
quelles bactéries peuvent éliminer ces radicaux oxygénés toxiques
la majorité des bactéries
comment les bactéries peuvent éliminer les radicaux oxygénés toxiques
elles possèdent des enzymes de détoxification telles que la superoxyde dismutase (contre O2-) et la catalase (contre H2O2)
pk les bactéries anaérobies strictes ne tolèrent pas l’oxygène
es bactéries anaérobies strictes sont dépourvues de ces enzymes, si bien que l’oxygène leur est toxique et qu’elles ne peuvent croître en sa présence
comment nomme t on Les microorganismes qui ont obligatoirement besoin d’oxygène pour vivre
microorganismes aérobies stricts
a quoi sert l’oxygène chez les aérobies stricts
La molécule d’oxygène leur sert de capteur d’électrons et de protons H+ qui sont libérés lors du processus respiratoire par lequel la bactérie métabolise les sucres pour s’en approprier l’énergie.
qu’arrive t il au aérobies stricts en absence oxygène
elles ne peuvent pas se développer
quelles microbes peuvent croître en présence ou absence d’oxygène
les anaérobies facultatifs
quel mode de respiration est utilisé par les anaérobies facultatifs
des modes de respiration aérobie, de respiration anaérobie ou de fermentation selon le cas
dans quelles circonstances la croissance des anaérobies facultatif est elle optimale
en présence d’oxygène
les anaérobies facultatifs possèdent des enzymes de détoxification des radicaux oxygène vrai ou faux
vrai
comment se nomme les microbes qui sont incapables d’utiliser, ni même de tolérer le O2
anaérobies stricts
quel mécanisme est généralement utilisé par les anaérobies strictes
fermentaire
est ce que les anaérobies stricts ont des enzymes nécessaires à l’élimination des radicaux oxygénés toxique produits en mode respiratoire
nonn
la présence de oxygène est fatale au anaérobies stricts= ils cessent de croître vrai ou faux
vrai
où retrouve t on les anaérobies stricts
entre autres dans le sol et dans l’intestin
comment les anaérobies stricts sont ils traités en laboratoire
ils doivent être cultivés en incubateur exempt d’oxygène, dit ‘chambre anaérobie’ et être transportés dans des jarres anaérobies contenant un composé éliminant l’oxygène
quelle est la croissance des aérotolérants
croissance anaérobie seulement
la croissance des aérotolérants est elle inhibée par la présence d’oxygène et pk
non, car ils possèdent au moins une enzyme de détoxification des radicaux oxygène
quelle est le type de croissance des microaérophiles et pk
croissance aérobie seulement, car ils ont un besoin essentiel d’oxygène à faible concentration
ds quel milieu se développent les microaérophiles
en milieu où la concentration d’O2 est inférieure à celle de l’air
selon les conditions de besoin en oxygène, ou du niveau de tolérance ou d’intolérance à ce dernier, la croissance des microbes en tubes contenant un bouillon de culture se vérifiera comment
par la répartition de la turbidité reflétant la localisation des microbes
où croissent les microbes dans le tube
- aérobie stricts?
- anaérobies stricts?
- anaérobies facultatifs?
- microaérophiles?
Les aérobies stricts croîtront en surface seulement,
les anaérobies stricts croîtront au fond uniquement,
les anaérobies facultatifs se répartiront uniformément dans le tube,
les microaérophiles se tiendront légèrement sous la surface à proximité de l’air,
La majorité des bactéries ont une croissance optimale dans quel intervalle de pH
un intervalle de pH étroit et voisin de la neutralité, soit entre 6,5 et 7,5
existe t il des bactéries qui se développent dans un milieu de pH acide inférieur à 4
oui, mais très peu
pourquoi un certain nombre d’aliments acides se conservent bien, comme la choucroute, les cornichons et certains fromages produisant des acides par fermentation
pcq il existe très peu de bactéries se développent dans un milieu de pH acide inférieur à 4
quels sont les trois types de bactéries en fct de leur pH optimal de croissance et quel ph?
- Acidophiles (pH < 5.5),
- Neutrophiles (pH 5 à 8)
- Alcalophiles (pH > 8.5).
quest ce quun facteur de croissance
un métabolite essentiel à la croissance d’un microorganisme, lequel est pourtant incapable d’en faire la biosynthèse. Il s’agit de petites molécules organiques indispensables à
son métabolisme, mais qu’il doit s’approprier d’une source extérieure
que doit on faire lorsque la croissance d’une bactérie ne peut être obtenue dans un milieu de culture simple
celui-ci doit être additionné d’un extrait complexe contenant ces facteurs de croissance
qu’est ajouté à certains milieux de culture pour obtenir la croissance des microbes dont la croissance ne peut être obtenue dans un milieu de culture simple
des bouillons nutritifs contenant des acides aminés, des bases puriques et pyrimidiques, des vitamines, sont ajoutés
quelle est la méthode la plus courante de quantification d’une population bactérienne
dénombrer les colonies après croissance sur gélose
que suppose la méthode de dénombrement sur gélose
que chaque bactérie initiale donne naissance à une colonie
est il possible qu’une colonie résulte d’une courte chaînette ou d’une grappe de bactéries puisque certaines bactéries se tiennent en chaînettes ou en grappes
oui, d’où un décompte exprimé en termes de CFU,
un dénombrement de 10 colonies sur une gélose sera interprété comme résultant de la croissance de 10 CFU au lieu de dire ‘10 bactéries’
cb de colonies par pétri dans le dénombrement sur gélose
50
que faire pour le dénombrement sur gélose vu que le nombre initial de bactéries dans un échantillon donné est souvent élevé
on procédera à une dilution en série en tubes avant de les déposer sur Pétri, de façon à obtenir un compte d’environ 50 colonies par Pétri
Un calcul simple permettra d’exprimer le compte en quoi
en CFU/mL d’échantillon initial
Un calcul simple permettra d’exprimer le compte en CFU/mL d’échantillon initial, ou quoi?
d’estimer le nombre de microbes par gramme de tissu dans une biopsie.
qu’observe t on si on ensemence un bouillon de culture et qu’on prélève des échantillons à différents temps
on observe une courbe de croissance puis de décroissance
quels sont les phases de la courbe de croissance et de décroissance des microbes
latence, accélération, exponentielle, ralentissement, stationnaire, décroissance (ceci suppose qu’il n’y a pas d’ajout de milieu de culture pendant le processus et qu’on est donc en ‘circuit fermé’)
la plupart des gens considèrent cb de phases essentielles dans la courbe de croissance/décroissance
4
de quoi sont entrecoupées les phases essentielles de la courbe de croissance/décroissance
de brèves phases intermédiaires utiles aux études physiologiques plus précises
pk la compréhension des mécanismes métaboliques en cause dans chacune des phases est importante
pour l’étude des propriétés pathogènes des microbes, mais également pour l’industrie pharmaceutique, alimentaire ou chimique qui voit dans les propriétés métaboliques des microbes l’occasion de leur faire produire différents composés avec le plus d’efficacité que possible
grace a quoi le rendement des différents composés peut etre accrue
râce à des modifications génétiques que les chercheurs induisent à ces petites usines biochimiques vivantes qui peuvent être utilisées dans des bio-fermenteurs industriels
a quoi correspond la phase de latence dans la courbe de croissance
période comprise entre l’ensemencement du bouillon et le moment où les bactéries commencent à se multiplier
correspond au délai nécessaire pour la synthèse d’enzymes qui doivent être élaborées avant que les bactéries puissent métaboliser les nutriments contenus dans le milieu de culture
a quoi correspond la phase d’accélération
les bactéries commencent à se diviser à vitesse croissante
a quoi correspond la phase (de croissance) exponentielle
période pendant laquelle la population bactérienne croît à une vitesse optimale : la production d’énergie, de protéines ou de produits de fermentation est maximale, alors que le temps de division cellulaire est minimal
c’est lors de quelle période que des bactéries pathogènes sécrètent activement des ‘exotoxines
phase exponentielle (de croissance)
quest qu’une exotoxine
des déchets métaboliques pour les bactéries pathogènes mais qui s’avèrent dans certains cas toxiques pour nous