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SF3 > Les grands groupes de microorganismes > Flashcards

Les grands groupes de microorganismes Flashcards

1
Q

quel est la hierarchie taxonomique

A

domaine -> regne -> embranchement -> classe -> ordre -> famille -> genre -> espece

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2
Q

deux types de cellule

sertt a quoi

A

procaryote et eucaryote

classifer en dex domaines

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3
Q

procaryote decrit

A

simple, pas de mebrane nucléaire = pas de noyau, un seul chromosome libre ds cytoplamse,

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4
Q

vrai ou faux le procaryote est bacterie

A

vrai

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5
Q

eucaryote decrit

A

cellule complexe, noyau, pls chromosome ds le noyau,

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6
Q

eucaryote inclus differente sorte de cellule lesquelles

A

humaines, animales, végétales et microorganismes complexes

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7
Q

qu,a ton decouvert sur les ribosome procaryote il y a 35 ans

A

distinction significtive dans les ribosomes des cellules procaryotes

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8
Q

qua entraine la decouverte dune distinction significtive dans les ribosomes des cellules procaryotes

A

3eme domaine= archéobactéries

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9
Q

archeobacterie caractéristique

A

caracteristique particuliere pour survivre en conditions extremes

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10
Q

quels sont les 3 domaines

A

bacteria, archaea, eucarya

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11
Q

que constitue domaine bacteria

A

procaryote pathogene (maladie homme), bcp procaryote non pathogène ds sol et eau et des procaryote capable de photosynthese (cyanobacteries)

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12
Q

ou sont procaryote non patho du domaine bacteria

A

eau et sol

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13
Q

archeae regroupe quoi

A

procaryote dont la paroi cellulaire contient pas de peptidoglycane, ds des conditions extremees

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14
Q

les procaryote archaea sont siege de quoi

A

de processus metabolique exceptionnel

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15
Q

inclut quelles bacterie ds archaea

A

méthanogène (productrice de methane), halophile extreme (vit uniquement ds milieux tres sale), thermophile extrem (croitre ds source chaude sulfureuse et acide)

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16
Q

eucarya regroupe quoi

A

organisme uni ou pluri, de celleule eucariote

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17
Q

les eucaryote sont plus ou moins complexes que les procaryote bacterie et archeobacterie

A

plus complexe

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18
Q

en quoi est divise le domaine eurariote

A

regne: protiste, animal, vegetal, mycete

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19
Q

procaryote comprend quoi

A

bacterier et archeobacterie

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20
Q

quele est regne des procaryote

A

aucun regne specifique, mais le reste oui

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21
Q

comment on designe un organisme

A

2 mots= genre + espece (italique et souligne)

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22
Q

quel mot majuscule et quel mot a minuscule ds nomenlature

A

majuscule = genre, le nom
minuscule= espece, l’adjectif
ex: Rhizopus nigricans= racine noire =moisissure du pain

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23
Q

quelle nomenclature est utilisee

A

nomenclature binomiale

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24
Q

en quelle langue sont les mots de la nomenclature et quelle est origine

A

latin

origne de pls langues, en fct de personnalité, specificité relatives a ce dernier

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25
Q

dou provient Staphylococcus aureus quest ce que ca signifie

A

petites spheres en grappes procurant une couleur dorée en culture

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26
Q

comment on designe les bacteries les plus isole en labo

A

diminutif comme pneumocoque pour Streptococcus pneumoniae

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27
Q

les bacteries ds une culture pure qui contient une seule espece sont identique vrai ou faux

A

faux= pas tjr completement identique

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28
Q

pk utilise le terme souche et quest ce quil signifie

A

les bacteries ds une culture pure qui contient une seule espece sont pas tjr completement identique alors le terme souche utilise pour chaque isolat

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29
Q

quest ce quune souche

A

ensemble de cellule fille descendant toutes d’une meme cellule mere

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30
Q

comment on identifie une souche

A

par un numéro, une lettre ou un nom ex: Escherichia coli O157:H7

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31
Q

e. coli est respo de quoi

A

agent responsable de diarrhée associee a maladie du hamburger

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32
Q

age dor pour quel domaine et pour quoi ajd

A

bactériologie, mycologie et parasitologie= age d’Or de la classification

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33
Q

grace a quoi l’age d’or de classification

A

grace aux progres recent en génomique, qui permet aux scientifiques de mieux situer les organisme les uns par rapport aux autres et parfois de les reclasser

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34
Q

quest ce que la genomique

A

etude de l’ensemble des genes des organismes

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35
Q

que designe les critere genotypique

A

caracteristique genetiques des microbes (ex: difference dans la sequence nucléotidique des genes entre especes de microbes

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36
Q

que designe les criteres phénotypique

A

les attributs, quils soient de nature morphologique, biochimique, physiologique ou autre

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37
Q

tests de labo permettent quoi

A

classifer et identifier les microbes de nature phénotypique (pour plupart comme avant encore)

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38
Q

la classification microorganisme est elle complexe

synonyme de classification

A

taxonomie,, oui tres complexe

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39
Q

que visent les techniques developpe en pratique clinique

A

identification des microorganisme, cest a dire la capcait de deceller quel microbe precis a causer l’infection

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40
Q

quy a t il ds livre de bacteriologye

A

details sur les specificité des bactéries connues et patho potentielle

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41
Q

que regroupe le terme microorganisme en pratique clinique et synonyme

A

microbe

bacteri, virus, mycete et protozoaire

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42
Q

quelles sont les caractéristique communes des microorganisme

A
  • tres petites taille (besoin microscope)
  • omniprésent et abondance ds la nature
  • unicellulaire (mycete incluent uni et pluri)
  • niveau organisation simple
  • inclus les procaryote et eucaryote
  • ont potentiel metabolique sauf les virus
  • capable reproduire de facon autonome (sauf virus)
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43
Q

quel regne et quel domaine pour virus

A

aucun

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44
Q

definition dun virus

A

agent infectieux acellulaire (non vivant)

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45
Q

quel regne/domaine structure infectieuse simple

A

aucun

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46
Q

structure infectieuse simple sont vivante ?

A

non , acellulaire comme virus

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47
Q

exemple de structure infectieuse simple

A

viroide et prions

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48
Q

quest ce qun viroide

A

ARN infectieux pour le plantes

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49
Q

quest ce quun prion

A

proteine infectious ONly particule

porteine anormale qui affecte le systeme nerveux des animaux (maladie de la vache folle et tramblante du mouton) et des hommes (maladie de Creutzfeldt-Jakob)

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50
Q

omment se difereicie microorganisme des autres etre vivants

A

certain nb de propriete strcuturale et fonctionnelle (type organisation cellulaire, unicellularité, taille, potentiel metabolique, omnipresence (ubiquité) et abondance

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51
Q

quel est le type dorganisation cellulaire des microorgansime

A

organisation cellulaire sauf virus

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52
Q

quest ce quune cellule

A

unité fonctionnelle de tout etre vivant capable de fonctionner de maniere autonome

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53
Q

combien de degre de complexité de l’org cell des micro org et c,est quoi

A

2 simples ou complexes

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54
Q

quù,est ce que les 2 degré de complexité de org cell des micro org pernet de distinguer

A

micro org procariote ou eucariote

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55
Q

eurcariot pluricellulaire ou uni

A

parfois uni ou parfois pluri

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56
Q

procaritoe uni ou pluri

A

uni tjrs

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57
Q

comment se distingue les virus des eucaryote et des procaryote

A

par absence d’organisation cellulaire et de capacité de reproduction autonome et sont acellulaire et non-vivant

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58
Q

quelle taille les microorganisme

A

petites tailles= max depasse pas qq centaines de micrometres

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59
Q

les procaryote sont ils visible a oeil nu

A

invisible a oeil nu

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60
Q

lequel est plus gros= procaryote ou eucaryote

A

procaryote est bcp plus petit que eucaryote

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61
Q

microorganisme ont ils potentiel metabolique et repoduction considérable

A

oui

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62
Q

sur quoi ce developpe les microorganisme

A

selon espece, matière minerale ou a partir d’une tres grande variété de substrats organiques ds nature

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63
Q

comment les microorganismes se procurent l’énergie necessair epour activité vitales

A

respiration, fermentation, photosynthese, en degradanr des produits organiques comme substrat énergétique et source de carbone

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64
Q

les microorganisme ont ils besoin oxygene

A

non peut etre en presence ou absence d’oxygène

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65
Q

est ce que microorganisme vivent ds conditions extreme

A

certains peuvent (pH tres acide, temperature autour 100 degre Celsius, salinité élevée)

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66
Q

quelle caracteirstique permet de se retrouve ds pls milieux

A

ubiquité (omniprésenc ds nature) et abondance

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67
Q

où on retrouve les microorganismes

A

eau, air, sol, tissus animaux et vegetaux

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68
Q

est ce que tous les microorganismes sont dangereux

A

non

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69
Q

plus de microorganisme patho ou inofensive

A

bcp plus de innoffensive et utile que de patho

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70
Q

microbe ont fct importantes dans les quoi

A

ecosysteme

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71
Q

comment importance des microbes ds les ecosysteme

A

par participation aux cycles biogéochimiques favorisant le recyclage des matières organiques et des éléments minéraux et gazeux

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72
Q

quel est le groupe le plus abondant de tous etre vivant

A

les microorganisme

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73
Q

cb de microorganisme ds 1 gramme de sol ferrtile/vase de fond de marécage ou de lac

A

plus d’un milliard

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74
Q

cb de microorganisme dans tube digestif des animaux et des humains par millilitre

A

milliard de microorganisme

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75
Q

quelle est masse de tous micororganisme

A

dpasse tous les autres etres vivants

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76
Q

cb de cellule ds etre humains et humain porte cb de microorganisme

A

10^13 cellule humaine

10^14 microorganisme

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77
Q

les bacterie sont elles des organisme procaryote

A

oui= c-a-d pas de noyau

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78
Q

comment est le materiel genetique des bacteires

A

un seul chromosome, libre ds le cytoplasme

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79
Q

les bactéries ont elles des organelles

A

non

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80
Q

les eucaryotes ont ils des organelles

A

oui,

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81
Q

eucaryote ou procaryote sont plus complexe

A

eucaryote plus complexe

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82
Q

exemple d’eucaryote

A

protozoaire, mycète, cellules végétales, animales ou humaines

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83
Q

les bacteries possedent elle de ADN ou de ARN

A

oui les 2

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84
Q

comment se replique les bacteries, quel type de division

A

de faacon autonome, par division binaire

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85
Q

quelles sont les dimensions des bacteries

A

diametre moyen de 1um, longueur de environ 5um

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86
Q

les bacteries sont elle visible et comment

A

visible en microscopie optique (grossissemetn 400X-1000X)

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87
Q

est ce que les bacteries vivent a int ou a ext des cellules de l’hote infecte

A

a exterieur ou a interieur des cellules de l,hote

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88
Q

est ce que les bacteries peuvent se developper de facon autonome et sont elles cultivable

A

majorite peuvent se developper de facon autonome et sont cultivables sur milieu artificiel en labo

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89
Q

est ce que les bacteries ont tous leurs metabolites necessaire

A

certains manquent de metabolite essentiels quils peuvent pas synthetyser= donc agit comme parasite intracellulaire obligatoire

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90
Q

comment etudier les bacteries parasite intracellulaire obligatoire

A

sur des cultures de cellules eucaryotess infectées

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91
Q

virus peuvent ils etre visualisé

A

trop petit (0,1 um) poru etre visualise en microscopie optique= besoin microscope electronique

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92
Q

les virus sont ils vivant? font partie de procaryote ou de eucaryote

A

non pas vivant

aucun des 2

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93
Q

est ce que les virus peuvent se repliquer de facon autonome = comment s’appelele

A

non alors ce sont des parasites obligatoires

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94
Q

a quel moment se developpe les parasite obligatoire

A

au moment ou il existe une cellule-hôte quils peuvent infecter

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95
Q

genome de virus a ADN ou ARN

A

les 2 sont possibles mais pas en meme temps

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96
Q

virus ont structure proteique vrai ou faux

A

vrai

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97
Q

comment se nomme la structure proteique des virus et que fait-elle

A

capside, entoure le materiel genetique

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98
Q

que se passe t il lors infection a virus

A

l’ADN ou l’ARN est injecté à la cellule infectée, et les gènes viraux donnent des ordres pour la construction de nouvelles particules virales en détournant à leurs fins le matériel de la cellule-hôte (acides aminés, nucléotides, etc.). Les composantes virales sont assemblées puis les virions sont libérés, souvent au coût de la mort de la cellule parasitée

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99
Q

quarrive t il a cellule infecte une fois que virion libere

A

souvent mort

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100
Q

taille de mycete

A

plus grand que bacterie

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101
Q

synonyme mycet=

A

champignon

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102
Q

la structure cellulaire des mycete est elle plus complexe que celle des bacterie

A

oui

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103
Q

mycete eucaryote ou procaryte

A

eucaryote

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104
Q

quelle forme ds la nature les mycete et quest ce que cela entraine

A

saprophyte environnementaux = tirent les substances qui leur sont necessires de matiere organique en decomposition sans necessairement etre pathogene pour homme

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105
Q

les mycete peuvent ils causer des infections chez hommes

A

chez personne avec deficit immunitaire

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106
Q

quelles sont les grandes catégories de mycete

A

levure et moisissure

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107
Q

levure uni ou pluri

A

unicellulaire

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108
Q

comment se reproduisent les levure

A

par bourgeonnement

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109
Q

les levures ont place essentielle ds quoi

A

industrie alimentaire (biere, vin, pain sont fermente par Saccharomyces cerevisiae) et contribuent a la revalorisation des dechets agricoles et industriels

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110
Q

est ce que levure peuvent causer infections chez humaine

A

parfois= vaginite (Candida albicans)

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111
Q

definition de moisissure

A

champignon multicellulaire

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112
Q

quelle forme la moississure

A

filamenteuse ou dimorphe

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113
Q

a quoi correspond la forme filamenteuse des moisissure

A

hyphe formant un mycélium visible, avec production de spores reproductives volatiles

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114
Q

a quoi correspond la forme dimorphe

A

filamenteux dans la nature mais ayant une forme ressemblant aux levures dans l’hote infecté

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115
Q

que font les moisissure

A

deteriore les aliments

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116
Q

moisissure sont elle toxique

A

non, mais certains mycete peuvent liberer toxines dangereuse et etre invasif en cas de blessure

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117
Q

où sont utile les mycete

A

industrie alimentaire et pharmaceutique (fromage et pénicilline)

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118
Q

parasite veut dire qoui

A

utilisé au sens large pour décrire une variété org macro ou micro pouvant induire des maladies

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119
Q

quoi est inclus ds parasite

A

petit arthropode porteur de microbe implique dans les infections contracté au contact des animaux (zoonose), helminthes (vers intestinaux) et protozoaires

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120
Q

infestation veut dire qoui

A

se refere au parasite macroscopique (vers et pou)

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121
Q

infection veut dire quoi

A

utilisé pour décrire les pathologie induite par des micro org invisible a l’oeil

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122
Q

qu’est qu’in protozaire

A

euraryotes unicellulaire (protiste) causant des infections

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123
Q

ou vivent les protozoaires

A

dans l’eau, sol humide ou ds organisme

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124
Q

quel forme ont les protozoraires

A

formes variées

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125
Q

quel entité les protozoaires

A

automone ou parasitaire

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126
Q

qule maladie sont causé par protozoaire

A

toxoplasmose, malaria, dysentérie

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127
Q

les infecttions parasitaires sont ils un probleme et ou

A

oui, probleme sanitaire et écono majeur ds pays voie développememt

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128
Q

protozoaires ont il un cycle de vie complexw

A

oui, implique plus d’une espece ds leur dév (passer d’n insecte a humain sous forme diff selon hote)

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129
Q

que sont les enveloppes

A

les diff structures qui entourent les cell bactérienne

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130
Q

de quoi sont constitué les enveloppe

A

capsule (ou du glycocalyx) paroi et membrane cytoplasmique

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131
Q

qu’est que la capsule

A

enveloppe visqueuse d’épaisseur variable produite a surface de certaine bactérie

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132
Q

est ce que la capsule est un constituant plus interne ou externe

A

externe

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133
Q

capsule visible?

A

pas en microscopie optique par les tech de coloration usuelle

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134
Q

comment remdre la capsule visible

A

en mélangeant la suspension bact avec le l’encre de chine: capsule forme un halo clair détectable autour de la bactérie

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135
Q

capsule essentiel chez la bactérie pour survivre?

A

certaine bact en on une mais elle n’est pas indispensable

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136
Q

capsule jour role essentiel ds quoi

A

dans la virulence: empeche la phagocytose par les cellules immunitaire et favorise l’adhérence des bact au cell épithéliale de l’hote

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137
Q

qule pouvoir la capsule confere a la bact

A

pouvoir pathogene que la bact non capsulé ne possede pas

138
Q

de quoi est compose la capsule et permet quoi

A

en general de polysaccharide variee permettant la classification par sérotype

139
Q

ccommen on appelle la capsule

A

antigene K

140
Q

que désigne le terme sérotype concernant la capsuel

A

les diverse souche selon les caractéristique capsulaire

141
Q

combien de sérotype pour S.pneumoniae

A

83

142
Q

le glycocalyx c’est quoi

A

un feutrage extracell de fibre polysaccharidique présente a la surface de certaine bact ds leur milieu naturel

143
Q

la glycocalyx est équivalent a la capsule?

A

oui mais elle établie des interconnexion entre les bact

144
Q

est ce que pour certaine espece des quantité imp de glycocalyx sont synthétisé

A

oui

145
Q

quel espece synthétise des quantités imp de glycoclayx

A

pseudomonas aeruginosa, streptococcus mutans

146
Q

quel terme sont utilisé quand on parle de glycocalyx

A

de exopolymere, de biofilrm, de slime (visqueux et gluant)

147
Q

que favorise la production de glyccoalyx

A

favorise l’adhésion de la bact a des matériaux comme les prothese, les tuyaux, etc

148
Q

est ce que la composition du glycocalyx differe de celle de la capsule

A

non quasi pareil

149
Q

qund on utlise le terme glycocalyx

A

quand les bact sont reliee entre elle ds cette matrice extra cell

150
Q

quand on ultilise le terme capsule

A

quand les polysaccharide demeure confiné a des bact individuelle

151
Q

quest ce que la paroi

A

enveloppe semi-rigide qui donne sa forme a la bact (sphere, batonnet, spirale)

152
Q

cb de structure de paroi diff sont observees

A

2, qui ont permei delaborer le test de Gram

153
Q

quel est le constitaunt communs de sgram + et des gram -

A

peptidoglycan, mais qui varie grandement en epaisseur

154
Q

quest ce quun peptidoglycan

A

polymère

155
Q

retrouve t on le polyme peptidoglycan ds cellule humaine

A

non alors le polymere peut servir de cible aux antibiotique

156
Q

que fait la pénicilline

A

interfere avec la synthese de peptidoglycan en se liant a des proteines nommées : proteines liant la pénicilline (penicillin binding protein PBP)

157
Q

de quoi est constitué la paroi des bactérie gram +

A

en majeure partie d’un epais peptidoglycan

158
Q

de quoi est compose la paroi des gram -

A

paroi plus complexe: couche de peptidoglycan tres mince mais recouvert dune seconde couche appele enveloppe externe

159
Q

que compose l’envleoppe externe

A

lipopolysaccharide LPS appele endotoxine (Antigène O) et des canauxx appele porine par lesquels des substances nutritives peuvent pénétrer la cellule

160
Q

est ce que lacces au peptidoglycan des gram - est difficile pour la penicilline et pk

A

oui difficle a cause de enveloppe suplementaire

161
Q

penicilline plus efficace chez gram + ou -

A

gram +

162
Q

quest ce que la membrane cytoplasmique

A

strucutre mince , souple et resistante qui setend sous la paroi cellulaire et qui enveloppe et retient cytoplasme

163
Q

de qoi est faite la membrane cytoplasmique

A

de proteines mobiles au milieu d’une bicouche de phospholipide

164
Q

que forme la bicouche de phospholipide

A

barriere osmotique regulant la concentration d’ions et de substances nutritives intracellulaire versus extracellualire

165
Q

la memebran cytoplasmique contient elle des syteme de transprot

A

oui

166
Q

quel sont les systemes de transport de la membrane cytoplasmique et a quoi servent ils

A

les permeases qui assurent la penetration selective des certaines substances (sucre, aa, ions mineraux), meme contre un gradient de densité qui ne favorise pas l’accumulation intracellulaire de ces substances

167
Q

quels sont les constituants internes

A

cytoplasme, ribosomes, matériel génétique constitué d’ADN sous forme libre mais aussi sous forme de plasmide (petit fragment d’ADN extra-chromosomique)

168
Q

quest ce que le cytoplasme

A

fluide qui contient + de 95% eau et ds lequel retourve grande qte substances dissoutes

169
Q

que contient le cytoplasme

A

bcp de ribosomes

170
Q

de quoi les ribosomes sont responsable

A

de la traduction des ARNm en proteines

171
Q

quelles sont les sous-unite des des ribosomes bacteriens

A

50S et 30S (indice de sédimmentation)

172
Q

quel est la divergence des ribosome bact vs ribosome humaine et queste ce que ca entraine

A

les sous unités= donc exploitable par antibiotherapie

173
Q

comment on peut mette en evidence le chromosome bacterien

A

par microscopie optique ou elctronique

174
Q

sous quelle forme apparait adn de bacterie au microscope et pk

A

forme pelotonnée car il est 1000 fois plus long que la bact

175
Q

quest ce quun plasmide

A

petites molecules d’ADN circulaire douée de replication autonome, transférable dun microbe a lautres, chz pls bacterie en + de leur chromosome

176
Q

les plasmide sont mediateurs de quoi

A

de nombreuses propriétés, dont le fait de porter les genes de resistance aux antibio

177
Q

est ce quil y a bcp de espece bacterienne qui portent des plasmides de resistance et quoi ca entraine

A

oui nb considérable= prbleme medical

178
Q

les plasmide sont aussi porteur de gene comment en plus des genes de resistance aux antibio

A

porteurs de gense conferant des propritétés pathogene aux bacteire les posssedant

179
Q

quelle est lorgine de pls entérotoxine irritantes pour l,intestin

A

origine plasmidique

180
Q

les appendices externe sont ils essentiels chez bact

A

non= facultatifs

181
Q

quels sont les types de appendices externes

A

flagelle et pili (aussi appele fimbriae)

182
Q

qu’assurent les flagelles

A

mobilité de la bactérie

183
Q

les flagelles sont ils visibles

A

juste en uitlisant une coloration speciale

184
Q

les flagelles sont ils antigéniques

A

oui, appele Antigène H

185
Q

quel est le nb et la disposition des flagelle

A

depend des espece

186
Q

que signifie des flagelle monotriche

A

un seul flagelle a une extremiete de la cellule

187
Q

que signifie des flagelles lophotriche

A

pls flagelles a une extremité de la cellule

188
Q

que signifie des flagelles amphitriche

A

un ou pls flagelles aux deux extrémités de la cellule

189
Q

que signifie des flagelles péritriche

A

des flagelles répartis sur toute la surface de la cellule

190
Q

quelles baceire possedent des poils et qcomment ca sappelle

A

bcp de gram -, des pilis (pilus au singulier)

191
Q

lequel est le plus court= pili ou flagelle

A

pili

192
Q

a quoi servent les pili

A

a fixer les bateires

193
Q

a quoi servent les pilis sexuels

A

au transfert unilatérale de materiel génétique dune bactérie a lautre= conjugaison

194
Q

a quoi contribue la conjugaison

A

a la dissémination de gene de résistance par le transfert de plasmide

195
Q

les pili sexuel sont ils nombreux

A

non peu nombreux

196
Q

certaines bacterie peuvent former des spores intracellulaire vrai ou faux

A

vrai, cest des endospore

197
Q

a quoi servent les endospore

A

stocker les elements vitaux dans les situations de survie , en se debarassant du reste

198
Q

quelle est la duree de vie dune endospore

A

sous forme endospore= peut résister de longues annees sans eau ni nourriture, aux temperature extreme et deviennent insensibles a action de composés chimiques tels les antibiotiques

199
Q

quarrie t il lorsqu les conditions environnementales deviennet defavoralble a la bact

A

le processus de sporulation senclenche

200
Q

que se passe t il lors que les condition environnementales sredviennent favorables au bacteries

A

la bacterie reprend sa forme vegetative active par un processus appele germination

201
Q

quelle forme de bact est pathogene

A

la forme active

202
Q

sous quelle forme est souvent contractée la bact ds lenvrionnement

A

souvent contractée dans lenvironnement sous sa forme sporulée

203
Q

quelles bacteries ont la capavite de former des endospore

A

les bacilles gram + des genre Bacillus et Clostridium

204
Q

que constituen les spore bacteriennes

A

un mode de survie

205
Q

que constitue les spores des mycetes

A

jouent un role de reproduction par leur dissémination

206
Q

le volume, la forme et la localisation de la spore bact a int de bacterie sont elles des caractéristique aleatoires

A

non constantes pour une espece donne= servent a identification des especes

207
Q

les spores sont importantes ds quoi

A

dissémiination de la gangrène gazeuse (Clostridium perfringens), du tétanos (C. tetani), du botulisme (C. botulinum) et de l’anthrax (Bacillus anthracis)

208
Q

la classification des bact repose sur quoi

A

étude de caractere génotypiques et phénotypique

209
Q

c’est quoi le génotype

A

le contenu en matériel génétique d’un microbe

210
Q

c’est quoi le phénotype

A

ensemble des caractéristique découlant du génotype (morphologie ou fonctions cellulaire

211
Q

sur quoi repose les outils pour identifier et classifier les bact

A

sur analyse des genes et exploitation des caract. phénotypiques

212
Q

taille d’une bactérie

A

0,5 a 1 um de diametre et 2 a 5 um de longueur

213
Q

forme d’une bactérie

A

batonnnet (bacilles), spheres (cocci), entre-deux (coccobacilles), virgules (vibrio), (spirale(spirochetes), variable (pléiomorphe)

214
Q

arrangements spatial d’une bactérie

A

isolée ou de paires (diplocoque), chainette (streptocoque), en cubes (sarcina), d’amas désorganisée )staphylocoque)

215
Q

composantes structurales d’une bactérie serve a qoui

A

classifier (présence de llagelle locomoteur, endospore, capsule, autres)

216
Q

2 types de morphologie

A

bactérienne et coloniale

217
Q

que compose l,approche phenotypique

A

caractéristique morphologique, test colorimétrique, observation microscopique, test biochimique, test sérologique

218
Q

quand bact croit sur gelose nutrivive en boite de pétri, comment est leur apparence colonnial

A

apparance colonial typique de l,espece

219
Q

la morpholigie colonie est classé selon quoi

A

forme, élévation. bordure, surface, opacité, pigmentatio

220
Q

quelles sont les formes possible de colonie

A

circulaire, irréguliere, filamenteuse, rhizoide,

221
Q

quelles sont les élévation possiable de colonie

A

éleve, convexe, plate, pointue, cratériforme

222
Q

quelle sont les bordures possible de colonie

A

entiere, ondulee, filiforme, frise. lobbé

223
Q

quelle sont les surfaces possible de colonie

A

lisse, luisante, cremeuse, rugueuse, mate

224
Q

quelle sont les types possible d’une colonie

A

transparente, opaque, translucide, iridescente

225
Q

quelle sont les pigmentation possible d’une colonie

A

divers couleur

226
Q

que mette a profit les diverse coloration des test colorimétrique

A

les caractéristiques structurale et biochimiuque des bact

227
Q

comment se fait le test colorimétrique en générla

A

fixation préalable du specimen sur lame nécessaie
application colorant basique ou acide
coloration

228
Q

quels sont les type de coloraiton

A

simple, différentiel, coloration de structure spécifique

229
Q

comment on fait colration simple

A

solution aqueuse ou alcoolisée d’un seul colorant basique

on ajoute parfois,agnet chimique (mordant) pour intensifier la coloration

230
Q

but de la coloration simple

A

faire resortir les cellules en entier

231
Q

quels sont les colorants simples les + utilisé

A

bleu de méthylene, fuchsine basique, violet de cristal, safranine

232
Q

quel est la coloration différentiel

A

la coloration de gram

233
Q

qui a mis au point la coloration de gram et en quelle année

A

christian gram en 1884

234
Q

que permet la coloration de gram

A

diviser les bact en 2 groupes, (gram + ou gram -)

235
Q

comment on fait la coloration de gram

A

1 - coloration primaire d’un frotti avec du cristal violet absorbé par toutes bact surtout en ajoutant de iode cmme mordant = toutes bact sont violettes
2 - lave avec solution ethanol ou acétone = décolore certaine espece = les bact ayant perdu cristal violet sont transparente
3 - soumet le frotti a un secon colorant - contre colorant (safranine) couleur rosee, seule les décoloré vont absorbé le contre colorant

236
Q

quel est le résultant final de la coloration gram

A

donne bact violet = gram +

dontte bact rose = gram -

237
Q

pourquoi le gram = ET - ne réagissent pas pareil

A

a cause de leur paroi cellulaire qui retient ou laisse échapper le mélange de cristal violet et iode

238
Q

utilité de la coloration de gram

A

imp en microbiologie médicale pour la sélection des antibio a admin pcq les antibio dépende de la composition de la paroi bactérienne pour leur efficacité

239
Q

quel bact réagisse mal a la coloration de gram et pk

A

les mycobactérie responsable de la tuberculose et de la lepre en autres pcq de la composition cireuse de la paroi

240
Q

qullle coloration on utilise pour les micobactéries qui réagiise mal a la coloration de gram

A

la coloration de ziehi-neelsen

241
Q

comment fonctionne la coloration de ziehl-neelsen

A

usage d’n colorant primaire rouge = fuchsine basique et d’un contre colorant bleu = de méthylen
les mycobactérium (acido-alcoolo-résistant) ne décolore pas, demeure rouge car la fuchsine s’integre au lipide de leur paroi

242
Q

quelless ont les 3 types de coloration de structures specifique

A

capsule, endospore, flagelle

243
Q

quest ce que la coloration négative de la capsule et sert a quoi

A

coloration de structure specifique pou la capsule

mettre ne évidence la capsule

244
Q

comment faire la coloration négative de la capsule

A

melanger les bacteries qui en produisent à une suspension colloidale dencre de chine= alors la capsule apparait translucide autour de bacterie noire

245
Q

existe t il bcp de genre de bact qui sporule

A

non= juste qq genre de bactérie gram += les Bacillus et les Clostridium

246
Q

quel coloration es utilise pour mettre en evidence les endospore

A

le vert de malachite est utilise pour colorer et la safranine contre colore le reste de la bacterie= les bacteries sporulées apparaissent roses avec une spore verte

247
Q

les flagelles ont ils besoin d’une coloration pour etre visible et pk

A

oui, car se sont des structures de locomotion trop fine pour etre vues sans coloration

248
Q

quelle coloration est utilisée pour rendre les flagelles visibles

A

la fuchsine, dans un procédé fastidieux

249
Q

quelles sont les sortes d’observation microscopique

A

microscopie optique, microscopie confocale, microscopie électronique, microscopie à force atomique et à sonde à effet tunnel

250
Q

les diverse adaptations du microscope optique permettent quoi

A

mettre en evidence des composante microbienne autrement difficilement visibles

251
Q

quels sont les diverses possibilités que nous offre levolution de la microscopie

A

microscopie a fond clair, a fond noir, a contraste de phase, a inversion, a fluorescence

252
Q

quel type de microscopie est utilisee de facon courante en labo

A

microscopie a fond clair

253
Q

comment apparait le specimen sur une microscopie a fond clair

A

il apparait foncé surun fond lumineux brillant

254
Q

quest ce qu’on examine avec une microscopie a fond clair

A

des tissus soumis a une coloration specifique ou des frottis de microorganismes inertes et colorés

255
Q

quels microbes sont observer en microscopie a fond noir

A

certains microbes qui peuvent difficilement etre colore et des microbes vivants en suspension comme Treponema (agent de la syphilis)

256
Q

comment fonctionne la microscopie à fond noir

A

un condensateur particulier est utilise pour que seule la lumiere traversant le microbe puisse penetrer l’objectif= en sorte que le specimen non coloré apparait clair sur un fond noir sans lumiere

257
Q

que permet la microscopie a constraste de phase

A

augmenter le contraste entre des strucutres d’épaisseurs variées non visible avec un microscope a fond clair

258
Q

pk la microscopie a contraste de phase est utile

A

permet dexaminer en détail les structures internes de microorganismes vivants sans les déformer

259
Q

comment fonctionne la microscopie à contraste de phase

A

les composantes du microscope convertissent les differences d’indice de réfraction des strucutres cellulaires en différences d’intensité lumineuse, ce qui rend les structure cellulaires visible meme si elles ne sont pas colorées, car les procédés necessaire pour la coloration pourraient les abimer

260
Q

que permet la culture cellulaire

A

etudier le comportemen des cellules face a divers stimuli

261
Q

comment se fait la corissance des cellules en culture

A

en microplaque ou en bouteille contenant les nutriments appropriés

262
Q

de quelle facon se fait l’observation des cellules adhere aux parois en culture

A

avec un microscope inversé

263
Q

la microscopie a inversion se fait de quelle facon

A

avec des microscope inversés, soit dont les objectifs aprochent le specimen per en dessous, alors que la source lumineuse eclaire par le haut

264
Q

quest ce que la propriété de fluorescence

A

la capacité de certaines substances d’absorber la lumiere a des longueurs d’onde courtes (lumiere ultraviolette) et a emettre de la lumiere a des longueurs d’onde longues (lumiere visible)

265
Q

quel approche utilise la microscopie a fluorescence

A

exploite la propriété de fluorescence

266
Q

quels colorants sont utilise en microscopie a fluorescence

A

marqueur fluorochrome

267
Q

que fait le marquers fluorochrome ds la microscopie a fluorescence

A

s’attache aux composantes structurales que l’on veut detecter

268
Q

quest ce que l’immunofluorescence

A

le marqueur de la microscopie à fluorescence est le plus souvent couplé à un anticorps qui reconnait spcifiquement la strucutre recherchée

269
Q

quest ce que la microscopie confocale utilise

A

fait usage de fluorochrome et de laser qui traversent par plans successifs tres etroits les echantillon a observer

270
Q

que peut on dire au sujet de la clarte des images obtenues avec une microscopie confocale

A

image ont une clarté 40% supérieure a tout autre type de microscope optique

271
Q

cb de laser dans une microscopie confocale

A

nb de laser peut etre multiple

272
Q

que permettent les laser ds la microscopie confocale

A

utilisation simultannée de pls fluorochrome rattaché a differentes structure recherchée sur le specimen

273
Q

quel image obtient on avec la microscopie confocale et pk

A

couple a un ordinateur qui reconstitue en 3D lensemble du specimen observe pour analyser sous différents angles les composates internes

274
Q

que sont filme et pendant cb de tps ds une microscopie confocale et pk

A

des plaques de culture cellulaire vivante, possible sur pls jours pour suivre evolution dun phenomene

275
Q

que fait on avec les cellules pertinentes sur une microscopie confocale

A

peuvent etre recupere avec une micro-aiguille et transfere ds une autre plaque de culture (cell cancer parmi cell saine)

276
Q

en quoi consiste la microscopie electronique

A

consiste à faire traverser l’échantillon à observer par un faisceau d’électrons libres, émis par un canon à électrons, qui se déplacent sous la forme d’ondes, lesquelles sont focalisées au moyen d’aimants électromagnétiques servant de ‘lentilles’. Les électrons traversant les échantillons ultra-minces déposés sur une grille de cuivre forment une image d’une grande résolution sur une plaque fluorescente

277
Q

est ce que les electrons son bcp penetrants ds microscopie elctronique

A

non peu pénétrants

278
Q

comment doivent etre les coupes du specimen ds la microscopie electronqiue

A

tres mince, donc préalablement coupées avec un ultramicrotome

279
Q

comment sont les images formees par le microscope electronique

A

soit en deux dimensions (microscopie électronique à transmission, 10,000- 100,000X) ou en 3D (microscopie électronique à balayage, 1,000-10,000X)

280
Q

quel est l’avantage de la microscopie electronique

A

pouvoir grossir beaucoup le specimen a observer (utile pour les virus)

281
Q

quel est le type de microscope de la microscopie a force atomique

A

microscope a sonde locales

282
Q

que permet le microscope a force atomique

A

visualiser la topographie de la surface dun echantillon

de visualiser avec une résolution nanométrique la morphologie tridimensionnelle de la surface d’un matériau, et de cartographier certaines de ses propriétés (adhésives, mécaniques, magnétiques, électriques, etc.)

283
Q

e quelle annee a ete inventé le microscope a force atomique

A

1985

284
Q

sur quoi se base le microscope a force atomique

A

essentiellement base sur l’analyse dun objet point par point au moyen dun balayage via une sonde locale, assimilable à une pointe effilée

285
Q

que permet le mode d’observation de la microscopie a force atomique

A

permet de réaliser la cartographie locale des grandeurs physiques caractéristiques de l’objet sondé, mais aussi de travailler dans des environnements particuliers tels que les milieux sous vide, liquides ou ambiants.

286
Q

sur quoi se base le principe de l’AFM

A

sur interaction entre la surface de l’échantillon à analyser et une pointe sonde nanométrique, fixée sous un micro-levier

287
Q

que fait la pointe ds le microscope a force anatomique et quel image ca donne

A

balaye la surface et suit la topographie de l’échantillon, donnant une image tridimensionnelle du matériau analysé

288
Q

la resolution ultime du microscope a force anatomique est de quel ordre

A

de l’ordre du dixième de nanomètre, ce qui signifie un dixième de milliardième de mètre

289
Q

le micrsocope a force atomique est moins puissante que le microscope electronique vrai

A

faux, il s’agit d’un microscope beaucoup plus puissant que le microscope électronique, permettant d’analyser les molécules de surface des cellules

290
Q

ds quel domaine le microscope a force atomique est il utile

A

en recherche medicale

291
Q

en quelle annee fut inventé le microscope a effet tunnel, par qui et prix nobel?

A

fut inventé en 1981 par des chercheurs d’IBM, Gerd Binnig et Heinrich Rohrer, qui reçurent en 1986 le prix Nobel de physique pour cette invention

292
Q

quel type de champs pour le microscope a effet tunnel

A

champs proche

293
Q

quutilise le microscope a effet tunnel pour faire quoi

A

utilise un phenomène quantique, l’effet tunnel, pour determiner la morphologie et la densité d’états electroniques de surfaces conductrices ou semi conductrices avec une resolution spatiale pouvant etre egale ou inferieure a la taille des atomes

294
Q

le microscope a effet tunnel est le pere de quoi

A

de tous les autres microscopes en champ proche

295
Q

quest ce qui a ete developpe à suite microscope effet tunnel

A

le microscope à force atomique (AFM) et le microscope optique en champ proche qui tirent profit d’autres interactions à l’échelle atomique

296
Q

qua permis la mise au point des microscopes en champ proche

A

pas decisif pour ds le developpement des nanotechnologies dans la mesure où ils permirent d’observer et même de manipuler de manière assez simple et pour un coût relativement modeste des objets de taille nanométrique

297
Q

a quoi correspond une taille nanométrique

A

taille inferieure aux longueurs d,onde de la lumiere visible , de 400 à 800 nm

298
Q

qua permis de faire le microscope a effet tunel en 1990

A

permis à des chercheurs d’IBM d’écrire les premières lettres de l’histoire des nanotechnologies en disposant 35 atomes de xénon sur une surface de nickel, ces 35 atomes dessinant les trois lettres IBM.

299
Q

que permettent les epreuves biochimique

A

identifier les bacteries une fois leur croissance obtneue en culture pure

300
Q

quest ce que les epreuves biochimiques exploitent

A

une panoplie de propriétés bactériennes, incluant la capacité pour certaines de croître en absence d’oxygène, ou en présence d’antibiotiques ou de fortes concentrations de sel, ou encore de métaboliser par voie de fermentation une vaste gamme de glucides.

301
Q

certaines bactéries de quel type peuvent fermenter le lactose et quels sont les produits

A

bactéries entérique

production de gaz et d’acide lactique détectable par un indicateur colorimétrique de pH

302
Q

est ce que toutes le sbacterie enterique fermentent le sucre=lactose

A

non

303
Q

que sont capable de faire les outils miniaturisés

A

pls tests biochimiques simultanément

304
Q

en quoi consiste le systeme API/galerie API

A

consistant en languettes multi-puits dans lesquels des substrats déshydratés sont déjà incorporés. L’addition de gouttes d’échantillon bactérien dans les puits, suivie d’une incubation de 4 à 24 heures, permet aux enzymes bactériens de réagir, en sorte de produire des couleurs finales caractéristiques d’une espèce particulière.

305
Q

quelle a ete la premiere galerie API ds monde de la microbiologie

A

galerie API 20E pour identifier des entérobactéries = puis toute une gamme est apparu

306
Q

comment a t on obetnu des syteme robotises performants

A

les systeme didentification ont ete reduits en taille et accrus en capacité

307
Q

quest c que les labo de bactériologie clinqiue utilise pour les test biochimique maintenant

A

la technologie Micro-Scan, qui effectue les tests dans des microplaques de 96 puits contenant divers réactifs colorimétriques dont l’analyse automatisée est accomplie par ordinateur. Pour chaque rangée de tests, un pointage est attribué selon que la réponse est positive ou négative. Le cumul du pointage donne un résultat final à 8 chiffres qui correspond à une seule espèce bactérienne possible

308
Q

quel est l’avantage de l’appareil micro-scan

A

possede l’avantage de vérifier le degré de sensibilité d’une souche envers différents antibiotiques incorporés dans certains puits de la plaque.

309
Q

en quoi consiste le test d’agglutination sur lame avec antisérum

A

consiste à incorporer des échantillons d’une bactérie inconnue dans des gouttes de solution saline placées sur différentes lames.
On ajoute ensuite un antisérum différent à chaque lame. Les bactéries s’agglutinent et forment des grumeaux lorsqu’elles correspondent aux anticorps d’un antisérum particulier

310
Q

le test d’agglutination sur lame avec antisérum est il complexe

A

non: procedure simple

311
Q

lequel est le plus precis entre test serologique et test biochimique et pk

A

serologique sont plus precis que biochimique car ils permettent de distinguer differentes souches dune meme espece

312
Q

comment se nomme les variantes dune espece

A

les sérotypes

313
Q

cb de sérotype de Streptococcus pneumoniae

A

80

314
Q

que permettent les tests d’agglutination par anticorps specifiques

A

savoir a quel sérotype on a affaire

315
Q

quest ce que la technique ELISA et quest ce que ca utilise

A

technique didentification faisant usage d’anticorps spécifiques (dits monoclonaux), placés dans des plaques de 96 puits

316
Q

que permet la methode ELISA

A

soit de rechercher un antigène microbien dans un échantillon clinique donné (ex. le virus VIH dans le sang) ou de rechercher des anticorps qui ont été formés contre cet antigène (ex. anticorps anti-VIH dans le sang d’un patient)

317
Q

comment fonctionne la methode ELISA

A

onsiste à fixer, dans le fond d’une plaque, un anticorps (ou un antigène) qui réagira spécifiquement avec l’antigène (ou l’anticorps) recherché dans le spécimen clinique qu’on répand ensuite dans la plaque. Si l’antigène (ou l’anticorps) recherché est présent, il se fixera à son tour à l’anticorps (ou l’antigène) déjà adhéré

318
Q

comment visualiser la combinaison antigène-anticorps qui vient detre forme ds la plaque ds la methode ELISA

A

en ajoutant un element révélateur

319
Q

que peut etre l’agent révélateur ds la methode ELISA

A

un second anticorps (ou antigène) à notre disposition, préalablement marqué avec une substance fluorescente ou une enzyme provoquant une réaction colorimétrique.

320
Q

comment se fait la lecture finale ds la methode ELISA

A

se fait a l’aide dun lecteur de fluorescence ou d’un spectromètre

321
Q

que se trouve t il ds les kits de reactifs pour la methode ELISA et qui les vend

A

vendus par diverses compagnies, faisant usage d’une gamme d’anticorps ou d’antigènes, selon l’élément que l’on veut détecter ou doser dans un spécimen clinique

322
Q

ELISA est il qualitatif ou quantitatif

A

un ou lautre

323
Q

que sont les types d’ELISA et selon quoi

A

ÉLISA direct ou indirect ou ÉLISA sandwich selon l’approche préconisée et le nombre de réactifs impliqués, car il en existe plusieurs variantes.

324
Q

quest ce que la methode ELISA sandwich implique

A

implique que l’élément recherché (supposons un antigène protéique du virus VIH dans le sérum d’un patient) se retrouvera imbriqué entre deux anticorps (fournis par la compagnie) utilisés dans le test, le premier étant adhéré au fond de la plaque servant au test, le second venant recouvrir l’antigène qui aura adhéré au premier anticorps

325
Q

quels sont les types de tests serologique

A

test d’agglutination sur lame et methode ELISA

326
Q

quels sont les types d’approches genotypiques

A

sequençage de ADN et diagnostic moleculaire

327
Q

cb de chromosome ds la grande majorité des bacteries

A

1 seul

328
Q

cb de gene ds un chomosome bactérien

A

entre 1000-5000

329
Q

cb de nucleotide par gene

A

environ 1000 nucleotide

330
Q

cb de nucléotide a sequencer par espèce bactérienne

A

1-5 millions

331
Q

quelle technique permet de faciliter la tache de sequençage

A

techniques de sequençage à haut débit

332
Q

but du séquençage systématique des microbes

A

d’identifier, pour chaque espèce, des sections d’ADN qui lui sont propres, afin de développer des sondes capables de reconnaître précisément ces sections et d’ainsi détecter la présence d’un microbe particulier dans un échantillon

333
Q

que peut etre fait une fois qu’une sequence genetique particuliere a ete identifie ds une espece bactérienne

A

possible de construire les outils génétiques capables de détecter cette espèce dans un échantillon puis on utilise des sondes genetique

334
Q

quest ce quune sonde genetique

A

de courts segments d’ADN complémentaires à la séquence présente chez le microbe = oligonucléotide

335
Q

ou se trouve les oligonucleotide

A

sont incorporés dans des trousses commerciales de détection de la bactérie recherchée

336
Q

cb y a t il de trousses comerciales sur le marche permettant de détecter la presence de quoi

A

au moins 5

  • Streptocoques du groupe B chez la femme enceinte et l’enfant à la naissance;
  • Staphylocoques résistants ou non à la méticilline;
  • Clostridium difficile donnant des diarrhées difficiles à traiter;
  • Entérocoques résistants à la vancomycine.
337
Q

que doivent se procurer les cliniques qui veulent faire usage de ces trousses commerciales pour la detection de bactérie

A

doivent se procurer les appareils permettant de faire une amplification du matériel génétique dans les échantillons, soit des cycleurs thermiques dans lesquels agit une enzyme polymérase, technique appelée PCR, pour ‘polymerase chain reaction’.

338
Q

les trousses diagnostiques peuvent identifer cb de microbes

A

un seul microbe spécifiquement recherché dans un spécimen clinique donné (ex. salive, sang, urine)

339
Q

est que ils existe des appareils et technologies permettant de rechercher la présence simultanée de plusieurs microbes potentiels dans un spécimen

A

oui, l’appareil Revogene de diagnostic rapide basé sur l’ADN

340
Q

ou et en quel annee a ete developpe l’appareil Revogene

A

commercialisé en 2018 par la compagnie GenePOC, selon les résultats de recherches effectuées au Centre de recherche en infectiologie de l’Université Laval, localisé au CHUL à Québec.

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