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SF3 > Génétique bactérienne > Flashcards

Génétique bactérienne Flashcards

1
Q

quel est le dogme de la biologie moléculaire

A

réplication, transcription, traduction et protéine

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2
Q

quels sont les modes de résistance et cibles des antibiotiques

A

a - altération de la perméabilité
b - modif ou destruction de l’antibio
c - modif ou changement de la cible

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3
Q

les bactéries possedes un noyau?

A

non

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4
Q

chez la bactérie, comment un appelle la structure qui assure un empaquetage compact du matériel génétique

A

nucléoide

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5
Q

les bactéries ont combien de chromosome circulaire

A

un seul

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6
Q

quel est la taille du chromosome escherichia coli

A

4639 kilo paire de base

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7
Q

quel est la taille du chromosome vibrio cholerae

A

2961 et 1072 kilo paires de base

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8
Q

quel est la taille du chromosome haemophilus influenzae

A

1830 kilo paires de base

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9
Q

quel est la taille du chromosome mycoplasma pneumoniae

A

816 kilo paires de base

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10
Q

le génome humain contient combien de paire de base et de genes

A

soit 3 milliard de paire de base et 22000 genes

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11
Q

combien de gene a la bactérie E coli

A

4300 genes dispersés sur un chromosome de 1.4mm

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12
Q

qu’est ce qu’un plasmide chez la bactérie

A

ce sont des elements extra chromosomiques (molécule circulaire bihélicales) capable de se répliquer de facon indépendante par rapport au chromosome principal

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13
Q

le plasmide est plus petit ou plus grand que le chromosome bactérien

A

plus petit (1 a 1000 kilo paire de base)

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14
Q

est ce que les plasmides code des fonctions essentiels a la cellule

A

non

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15
Q

quel avantage le plasmide apporte a la bactérie hote

A

de l’info portant sur

  • la résistance aux antibio
  • capacité métabolique suppl
  • facteur favorisant l’infection
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16
Q

les bactéries se divisent de quelle facon

A

par fission binaire

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17
Q

quel est le tps de génération de E coli dans des conditions optimales

A

20 min

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18
Q

ADN est le support de quoi

A

de l’info génétique

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19
Q

a quoi a trait le concept fondamental en génétique bactérienne

A

le mécanisme de base de régulation

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20
Q

pk la bactérie n’active le sys que si elle en a besoin

A

pour minimiser ses dépenses énergétiques

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21
Q

que fait la bactérie en l’absence de substrat

A

elle évite de produire des enzymes mais elle est tjrs prete a en produire si nécessaire

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22
Q

quels sont les types de régulation

A

1- changement ds la séquence ADN
2- changement ds le nb de transcrit (transcriptionnelle)
3- changement ds la quantité de produit de gene actif (post-transcriptionnelle)

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23
Q

les changements ds la séquence dADN engendre quoi

A

amplification de gene

réarrangement de gene (mutation)

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24
Q

les changements ds le nb de transcrit engendre quoi

A

des activateurs

des répresseurs

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25
Q

les changements ds la quantité de produit de gene actif engendre quoi

A

ajout de cofacteur ou groupe prostétique
clivage protéolytique
intéractions avec d’autres macromolécules

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26
Q

sous quoi est le controle du gene tetB et a quoi sert il

A

sous le controle du gene répresseur tetR

peremt aux bactérie des résister à la tétracycline (un antibio)

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27
Q

quel gène est précédé d’un promoteur dans lexxemple de tet B, tetR

A

tetB et tetR

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28
Q

comment son positionne les gene tetB et tetR lun par rapport a lautre

A

le tetR est situé sur le gene complementaire qui va en direction oppose

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29
Q

que se passe -t-il en l’absence de trétracycline

A

la protéine du répresseur (R) est produite et vient bloquer le promoteur de tetB et son propre promoteur = empeche la transcription des 2 genes

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30
Q

que se passe- t-il en présence de trétracycline

A

l’antibio vient se complexer a la protéine du répresseur la rendant ainsi incapable de bloquer le promoteur de tetB = permet la transcription et la traduction qui permettra la production de la protéine tetB responsable de la résistance a la tétracycline

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31
Q

quelle est la condition pour une régulation négative dans les gene de résistance

A

présence d’un répresseur

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32
Q

en quelle mode est le répresseur par défaut et pk

A

en mode ON pour l’attachement a l’ADN dans la région du promoteur/opérateur

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33
Q

que fait le répresseur seulement en présence de tétracycline

A

ne peut plus s’attacher a ADN pour bloquer la région du promoteur/opérateur et donc réprimer la transcription

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34
Q

le répresseur peut il exercer son action de répresseur en présence de tétracycline

A

non alors la transcription devient possible et cela va permettre la production de la pompe tetB et de la protéine répresseur tetR

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35
Q

la production de tetB et tetR est inductible par la présence de quoi

A

la tétracycline

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36
Q

pour que la régulation et l’autorégulation des genes se fasse, il faut que la cellule soit ds un état métabolique acitf vrai ou faux

A

vrai

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37
Q

dans quelle de ses phases, la régulation sera la plus rapide
1- croissance exponentielle
2- latente ou de plateau
3- décroissance

A

1

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38
Q

la régulation est un processus comprenant des boucles de controle vrai ou faux

A

vrai

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39
Q

quelles stratégies ont développées les bactéries pour controler l’activation ou l’inactivation de leur genes

A

1- régulation transcriptionnelle (négatif=répresseur et positif= activateur, les 2 pouvant etre inductible et répressible
2- regroupement des genes adjacents ds un opéron
3- controle de plrs genes non contigus ds un régulon (m protéine régulatrice)
4- controle de plrs genes non contigus ds un stimulon (m stimulus)
5- régulation au niveau traductionnel

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40
Q

c’est quoi une mutation

A

modif de la séquence des nucléotides de ADN

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41
Q

les modif de la mutation sont transmises a quelle cellule

A

cellule fille

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42
Q

les mutations peuvent etre de quel type

A

spontanée ou induite

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43
Q

les mutations spontanée sont causées par quoi

A

par l’action des radiations naturelles (rayons cosmiques) ou etre le résultat d’erreur survenues lors de la réplication

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44
Q

les erreurs survenues lors de la réplication sont elles fréquentes dans les mutations spontanées

A

non, 10^-7 a 10^-11 par paire de base durant une ronde de réplication bactérienne

45
Q

quelle est la polymérase la moins fidele lors d’une réolication

A

celle du rétrovirus VIH avec une fréquence d’erreur de 10^-4 par paire de base par ronde de rétrotranscription

46
Q

les altérations de ADN causés par les mutations peuvent etre de diff nature

A

1- délétion ou insertion de nucléotide

2- substitution de nucléotide (silencieuse, mauvais sens et non sens

47
Q

ou retrouve ton les modif provoqué par les mutations

A

dans le génome de la descendance du mutant

48
Q

quel est le terme employe pour décrire la séquence nucléotidique précise du génome

A

le génotype

49
Q

le phénotype est formé par quoi

A

par les propriétés des mutants

50
Q

exemple de phénotype

A

une mutation occasionnant une imperméabilité a un antibio, l’altération de cet antibio ou de sa cilbe, provoque un phenotype de résistance aux antibio

51
Q

que peut affecter le phénotype

A 
1- la mobilité
2- la présence d'une capsule
3- l'apparence des colonies
4- les éléments nutritionnels requis
5- résistance aux antibio
52
Q

nomme 2 caractéristiques des phénotypes

A

observable et sélectionnables

53
Q

quel est l’avantage pour la bactérie d’etre sélectionnables

A

dans un env avec condition sélective, ces bactéries pourront croitre plus rapidement que les parents et ainsi les remplacer pour former la majorité de la population (ex: phénotype de résistance aux antibio)

54
Q

vrai ou faux, la pression sélective cré la mutation

A

faux. la mutation est créé au hasard et existait avant que le pression sélective ne s’exerce

55
Q

les mutations des bactéries sont elle tjrs bénéfiques pour elle

A

non, elles entrainent souvent des effets néfastes

56
Q

comment les effets néfastes des mutations bactérielles sont elles minimisées

A

par l”utilisation de systeme de réparation ( essentiel a la survie des bactéries)

57
Q

nomme 5 groupes de sys de réparation pour ADN bactérien

A

1- réparation direct de ADN
2- réparation par excision
3- réparation par recombinaison
4- réponse SOS (simule transfert des genes)
5- réparation sujette a erreur (induit des mutations)

58
Q

est ce que les bactéries on t des reproduction sexuéé

A

non. elle échange info génétique entre les cellules = transfert horizontal

59
Q

nomme 3 mécanismes d’échange de gene chez la bactérie

A

1- transformation
2- conjugaison
3- transduction

60
Q

la transformation a été décrite pour la premiere fois en quelle année et quelle espece

A

en 1926 chez les pneumocoques

61
Q

les bactéries avec capsule formant des colonies avec morphologie smooth(S) sur gélose tuent les souris infectéés?

A

oui

62
Q

les bactéries sans capsule formant des colonies avec morphologie rought(r) sur gélose tuent les souris infectéés?

A

non

63
Q

qu’a ton découvert en mélangeant les (S) mortes avec (R) vivante?/

A

les (R) ont été transformés en bactérie (S) et que le principe transformant était dans ADN libéré par les bactéries (S) tuées

64
Q

comment se nomme la capacité d’une cellule a etre transformé par de ADN externe

A

la compétence

65
Q

de quelle facon est acquise la compétence

A

1- exposition a des agents chimiques (CaCl2)
2- exposition a des agents physique (décharge électrique)
3- de facon naturelle chez certaines especes

66
Q

nomme 4 bactéries ou la compétence se fait de facon naturelle

A

1- bacillus sp
2- haemophilus influenzae
3- neisseria sp (gonocoque, méningocoque)
4- streptococcus pneumoniae (pneumocoque)

67
Q

la transformation est plus efficace entre bactéries de meme espece ou d’espece différente

A

meme espece

68
Q

qu’est ce que la conjugaison

A

c’est l’échange de matériel génétique qui ressemble le plus a un échange de type sexuel chez les bactéries

69
Q

comment se fait la conjugaison

A

requiert des contacts cellule-cellule, de facon unidirectionnel, soit de cellule male a femelle

70
Q

en général, les genes nécessaires a la conjugaison sont codés par de gros plasmides que l,on nomme

A

plasmides conjugatifs

71
Q

comment se nomme le + connu des plasmides conjugatifs

A

le facteur de fertilité F de E coli

72
Q

les plasmides conjugatifs de type R sont présents autant chez les bactéries a Gram négatif que positif (streptococcus vs clostridium)?

A

oui

73
Q

comment se fait la conjugaison chez les bactéries Gram + et -

A

utilisation d’un mécanisme distinct du pli sexuel afin d’assurer le rapprochement entre les cellules donatrice et réceptrice

74
Q

comment se nomme le mécanisme ou les plasmides conjugatifs sont transférés en meme tps que les plasmides non conjugatifs

A

mécanisme appele la mobilisation

75
Q

le transfert des genes par transduction est fait par qui

A

les bactériophages (virus)

76
Q

comment se passe la transduction

A

les bactériophages parasite seulement les bactéries et utilisent la machinerie cellulaire de leur hôte pour faire reproduire leur env protéique (capside) et leur matériel génétique (ADN ou ARN du phage)

77
Q

le cycle de vie des bactériophages sont de 3 types

A

1- lytique et/ou
2- lysogénique et/ou
3- chronique

78
Q

que se passe t-il pendant le cycle lysogénique

A

le matériel génétique du phage s’intèg

re dans le chromosome de la bactérie et y est répliqué en meme tps que le chromosome sans affecter l’hôte

79
Q

comment se passe le cycle lytique

A

ADN du phage s’excise du chromosome de l’hote et les nouvelles particules de phage sont produites et libérés entrainant la lyse cellulaire et la mort de la bactérie

80
Q

comment se nomme un phage uniquement capable d’un cycle de croissance lytique

A

phage virulent ou strictement lytique

81
Q

autre nom donné a un phage lysogene

A

phage tempéré

82
Q

comment se fait le cycle chronique

A

certains bactériophages sont capables de sortir de la cellule bactérienne sans la lyser, mais elle les infectent de maniere chronique

83
Q

il y a 2 types de transduction

A

spécialisée et généralisee

84
Q

comment se fait la transduction spécialisée

A

un génome hybride phage-bacterie est créé quand le génome du prophage est improprement excisé du génome de l’hote. ces bactériophages hybrides peuvent se propager

85
Q

comment se fait la transduction généralisé

A

c’est le résultat de l’empaquetage accidentel de fragments de ADN de l’hote a l’intérieur d’une capside de phage. Ne peut pas se propager

86
Q

nomme des genes transférés par transductioh

A

la toxine de corynebacterium diphteriae
l’entérotoxine de certaines souches de E coli
la toxine du streptocoque (respo de la scarlatine)
certaine toxines de clostridium botulinum
certains genes de résistance aux beta lactamines

87
Q

la transposition implique et requiet quoi

A

elle implique un mouvement de segment ADN a l’intérieur d’une meme cellule et requiere une certaine proximité physique entre les endroits ou a lieu le transfert

88
Q

3 classes de transposons

A

1- les séquences d’insertion (IS)
2- les transposons complexes (IS + autres genes)
3- phages transposables

89
Q

pk la transposons complexe ont une imp médicale considérable

A

pcq ils peuvent encoder a l’intérieur de leur région centrale, des genes de toxine ou de résistance aux antibio

90
Q

qu’est ce qu’un intégrons

A

ce sont des éléments génétiques qui recrutent des genes de résistance et les integrent les uns a la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples genes simultanément

91
Q

ou peut on retrouver des intégrons

A

a l’intérieur des transposons complexes ainsi que sur des plasmides

92
Q

les mécanismes d’échange on un contrepoids qui permet quoi aux bactéries

A

conserver leur specificité génétique

93
Q

nomme 2 sys qui protege les bactéries contre l’invasion ADN étranger

A

le sys de restriction-modification de classe II et le CRISPR/Cas

94
Q

quels sont les 2 composantes du sys de restriction-modification de calsse II

A

la méthylase et la nucléase de restriction

95
Q

quel est le role de la méthylase

A

c’est une enzyme qui va modifier l’ADN de l’hote a certaines séquences spécifiques pour le protéger d’une digestion éventuelle par la nucléase de restriction

96
Q

que détruit la nucléase

A

ADN étranger non méthylé, restreignant l’entree du nouveau matériel génétique

97
Q

comment fonctionne le CRISPR/C

A

quand un nouveau phage infecte une bact, le CRISPR de la bact incorpore une courte séquence dérivée du génome du phage, conservant une mémoire spécifique des infections passées

98
Q

a quoi on compare le CRISPR/C

A

a un sys immunitaire bactérien ie que les séquences CRISPR sont transcrites et traitées pour générer de courtes molécules d’ARN CRISPR qui patrouillent l’intérieur de la bactérie a la recherche de séquence de phages qui pourrait infecter la bact

99
Q

que fait ARN CRISPS si elle trouve un envahisseur

A

elle guide la protéine Cas qui sert a couper ADN étranger prévenant l’infection

100
Q

combien espece bactérienne vivent ds le corps humain

A

entre 500 a plus de 1000 especes

101
Q

la microflore remplit des fonctions essentiels a quel niveau

A

au niveau digestif et au niveau du sys immunitaire (stimulant la réponse de l’hôte ou tout simplement en occupant une niche écologique qui autrement pourrait être envahie par des espèces pathogènes)

102
Q

est ce qu’il y a + de cell bactérienne ou humaines nuclées ds le corps

A

10 fois plus de bactériennes

103
Q

est ce qu’il y a plus de genes associés au microbiome humain ou de gene humains

A

un humain pour 150 microbes

104
Q

qu’est ce qui peut perturber l’équilibre de la flore

A

la prise d’antibio et de facon répétée favorise la sélection de souche résistante dans l’humain et son environnement

105
Q

qu’est ce qui influence la nature de l’écosysteme microbien

A

antibio ds alimentation animale et humaine

106
Q

les connaissances ds le domaine génétique microbienne ont permis de développer quoi

A

des techniques de génie génétique capable de produire des quantités de toute une panoplie de protéines ayant intéret thérapeutique

107
Q

produit pharnaceutique sur le marché (combinant bact, micro org et cell eucary;otes

A 
hormone de croissance humaine
insuline humaine
alpha-1 antitrypsine humaine
DNase humaine
activateur du plasminogene humaine
vaccin contr hépatitie B
anticorps monoclonaux humanisés
108
Q

combien de tps pour identifier une bactérie a partir de tech basee sur critere morphologique, biochimique et métabolique

A

2 a 3 jours

109
Q

combien de tps pour identifier une bactérie a partir de tech génétique (amplificateion en chaine par ls polymérase (PCR))

A

qqe heures

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