Övningstenta - avel 2023 Flashcards
Säkerhet är viktigt i avelsarbetet - nämn två faktorer som påverkar säkerheten, och hur
Arvbarheten: ju högre arvbarhet, desto högre säkerhet (1p)
Mängden information: ju mer information om individen själv och om släktingar, desto högre säkerhet. (1p)
Beskriv hur avelsvärdering grundad på genomisk selektion går till. Vad är annorlunda jämfört med en vanlig BLUP-avelsvärdering? (4 st)
Man väljer djur till sin referenspopulation, och dessa har både information om fenotyper och genomisk information.
I referenspopulationen skattar man effekten av olika markörer på fenotyperna.
Selektionskandidaterna kan sedan avelsvärderas endast på markörinformation,
innan man har hunnit samla information om fenotypisk prestation.
Istället för att avelsvärdera individer så avelsvärderar man SNP-markörer, och individen får sitt avelsvärde
baserat på vilka markörer individen har. (4p)
Selektion/avelsurval är det viktigaste redskapet för ett framgångsrikt avelsarbete. Det genetiska framsteget per år kan ökas genom att förändra de faktorer som påverkar framsteget. Ange om och hur (i vilken riktning) de olika komponenterna i formeln, och det totala genetiska framsteget per år, påverkas av:
a) ökat antal testade djur (dvs antal djur som man kan selektera bland)
Ökar selektionsintensiteten, och därmed det totala genetiska framsteget. De resterande faktorerna påverkas inte avsevärt
Selektion/avelsurval är det viktigaste redskapet för ett framgångsrikt avelsarbete. Det genetiska framsteget per år kan ökas genom att förändra de faktorer som påverkar framsteget. Ange om och hur (i vilken riktning) de olika komponenterna i formeln, och det totala genetiska framsteget per år, påverkas av:
b) ökat antal avkommor till en individ i avkommebedömning, eller fler observationer per individ vid individprövning
ökar säkerheten, och därmed det totala genetiska framsteget
vid stationsprövning (där platserna tar slut) kommer i minska (om platserna inte tar slut bör inte i påverkas), L kan gå upp men beror på situation
Selektion/avelsurval är det viktigaste redskapet för ett framgångsrikt avelsarbete. Det genetiska framsteget per år kan ökas genom att förändra de faktorer som påverkar framsteget. Ange om och hur (i vilken riktning) de olika komponenterna i formeln, och det totala genetiska framsteget per år, påverkas av:
c) användning av individprövning istället för avkommebedömning
minskar säkerheten och generationsintervallet, och ökar intensiteten – troligen ett högre genetiskt framsteg totalt eftersom det blir två gynnsamma förbättringar (i och L), och en som
är mindre gynnsam (minskad säkerhet)
Blixten och Snabbe Sören är två kapplöpningshingstar. Blixtens avelsvärde (genetiska
värde) för tid på tävling är -8 sekunder. Han blev anmärkningsvärt väl tränad, och effekten av träningen (miljöeffekt) är -6 sekunder. Snabbe Sörens avelsvärde är -12 sekunder, medan hans träningseffekt är +2 sekunder.
a) Vilken av de två hingstarna har bäst förutsättningar att vinna ett lopp? Varför?
P = G + E
Blixten: P = -8+-6= -14
Snabbe Sören: P = -12+2 = -10
a) Blixtens förväntade fenotypiska värde är 14 sekunder snabbare än
genomsnittshästen, medan Snabbe Sören bara är 10 sekunder snabbare. Blixten har bäst förutsättningar att vinna loppet (0,5p)
Blixten och Snabbe Sören är två kapplöpningshingstar. Blixtens avelsvärde (genetiska
värde) för tid på tävling är -8 sekunder. Han blev anmärkningsvärt väl tränad, och effekten av träningen (miljöeffekt) är -6 sekunder. Snabbe Sörens avelsvärde är -12 sekunder, medan hans träningseffekt är +2 sekunder.
b) Vilken av de två hingstarna skulle du betäcka ditt avelssto med? Varför?
Snabbe Sören vore det bättre valet som avelshingst eftersom hans genetiska värde är bättre.
Apropå kapplöpning – föreställ dig att du, efter att ha läst den här kursen, kommer på
att du ska börja föda upp kaniner för kapplöpning. Du slår dig ihop med en kurskamrat
och startar med en stor population av rasen holländsk kanin som ni föder upp i en lada
utanför Uppsala.
Egenskap:
Tid per 100 m (h^2 = 0,25)
Vinstsumma under en livstid (h^2 = 0,04)
b) Tror du att egenskapen vinstsumma under en livstid svarar bra på selektion?
Varför, eller varför inte?
Nej. Arvbarheten är nära 0 och då är det en stor utmaning att få ett genetiskt
framsteg – det kräver stora dataset och information från många släktningar.
En ung hankanin, Jolly Roger, sprang 100 meter 8 sekunder snabbare än genomsnittet. Hur snabbt förväntas hans avkommor springa, om honorna han paras med i genomsnitt motsvarar genomsnittet i populationen.
Föräldrarna är i genomsnitt 4 sekunder snabbare än medel (hanen är 8 s snabbare och
honorna ligger på medel, (8+0)/2=4).
Av denna förväntas 25 % överföras till avkommorna (arvbarheten=0,25), dvs avkommorna förväntas vara 1 sekund snabbare. (1p)
Du och din kompanjon är verkliga perfektionister i ert avelsarbete. Ni har
standardiserat skötsel och träning av kaninerna så att den miljömässiga variationen efter några år bara är 6 sek^2 för tid per 100 m. Vad blir nu
arvbarheten för egenskapen?
Att det kan bli skillnader i arvbarhet på det här sättet - vilken betydelse har det för avelsarbete generellt i olika populationer
h^2 = 4 / (4+6) = 0,4
Standardiserad miljö och minskad variation som beror på slumpmässiga miljöeffekter ger högre arvbarhet eftersom den fenotypska variationen minskar. Det är viktigt att
mäta egenskaper på ett så standardiserat sätt som möjligt.
Rasföreningen för svensk bråkig boskap är bekymrad över den genetiska trenden för temperament, framförallt under mjölkning. De undrar om urval av tjurar baserat på
avkommeprövning eller baserat på genomiska avelsvärden kommer att ge störst framsteg för denna egenskap. Vilken komponent i formeln för förväntat genetiskt framsteg per år av skulle påverkas mest i valet mellan avkommeprövning och genomisk selektion?
Generationsintervallet (L)
En viktig del i avelsprogrammets uppbyggnad är att bestämma om selektion inom ras ska kombineras med korsningsavel.
a) Vilka huvudsakliga motiv finns det för att använda korsningsavel?
heterosis och att kombinera egenskaper
En viktig del i avelsprogrammets uppbyggnad är att bestämma om selektion inom ras ska kombineras med korsningsavel.
Varför ska korsningsavel alltid kombineras med selektion inom ras?
eftersom det genetiska framsteget sker vid selektion inom ras, och heterosis kan
aldrig kompensera för om man korsar raser som inte är genetiskt konkurrenskraftiga.
Katjas kandidatexjobbare Annika har just redovisat sina genetiska analyser av rädsla
hos colliehundar. Bland annat har hon med hjälp av en enkät kunnat analysera
hundarnas rädsla för olika underlag och trånga utrymmer, t.ex. då hunden går på hala golv, i trappor, åker hiss eller rulltrappa. Annika skattade arvbarheten för egenskapen ”underlagsrädsla” till 0,4. En collieuppfödare vill nu ha hjälp att BLUP-avelsvärdera
sina hundar för den här nya egenskapen, och eftersom Annika är alltför upptagen med att kela med sin nya valp så får du rycka in. Du har tillgång till följande information: id, kön och poäng (1-5)
a) Ge den statistiska modellen för avelsvärderingen av underlagsrädsla, baserat på den information du har tillgång till.
underlagsrädsla = my + kön + djur + residual
eller
yij = ⲙ + köni + aij + eij
Katjas kandidatexjobbare Annika har just redovisat sina genetiska analyser av rädsla
hos colliehundar. Bland annat har hon med hjälp av en enkät kunnat analysera
hundarnas rädsla för olika underlag och trånga utrymmer, t.ex. då hunden går på hala golv, i trappor, åker hiss eller rulltrappa. Annika skattade arvbarheten för egenskapen ”underlagsrädsla” till 0,4. En collieuppfödare vill nu ha hjälp att BLUP-avelsvärdera
sina hundar för den här nya egenskapen, och eftersom Annika är alltför upptagen med att kela med sin nya valp så får du rycka in. Du har tillgång till följande information: id, kön och poäng (1-5)
b) Är det någon annan information du tycker att man borde registrera, för att förbättra modellen och därmed precisionen i avelsvärderingen?
Ytterligare fixa effekter som rimligen kan påverka rädsla, t.ex. djurets ålder, vem som
bedömer beteendetestet etc.
