Övningstenta - avel 2019 Flashcards
Arvbarheten för klinisk mastit hos mjölkkor har skattats till <0,1 medan arvbarheten för
höftledsdysplasi hos hundar har skattats till 0,4. Varför behöver vi skatta arvbarheter?
Diskutera konsekvenserna av låg och hög arvbarhet för egenskaper som ingår i avelsprogram
(max 5 meningar).
För att förutsäga möjligheterna att kunna förändra en egenskap genom avel, och designa
avelsprogram.
Om arvbarheten är låg är det svårare och tar längre tid. Man behöver samla
information från många släktingar för att få säkrare avelsvärden.
Är arvbarheten hög är det lättare att få säkra avelsvärden, och man kan lägga mer vikt vid individens egen prestation i urvalet.
Varför behöver vi skatta arvbarheter?
För att förutsäga möjligheterna att kunna förändra en egenskap genom avel, och designa
avelsprogram.
Diskutera konsekvenserna av låg och hög arvbarhet för egenskaper som ingår i avelsprogram
(max 5 meningar).
Om arvbarheten är låg är det svårare och tar längre tid. Man behöver samla
information från många släktingar för att få säkrare avelsvärden.
Är arvbarheten hög är det lättare att få säkra avelsvärden, och man kan lägga mer vikt vid individens egen prestation i urvalet.
I ett selektionsexperiment på Lövsta selekterades hönslinjen N för många ägg och linjen E för
tunga ägg. Båda linjerna kom från en gemensam baspopulation. I tabellen nedan ser du
linjernas medelvärde i dessa egenskaper efter 4 generationers selektion, som avvikelser från
baspopulationens resultat.
Linje Antal ägg Äggvikt, g
N +6.92 -0.33
E -1.20 +1.75
a) Vad drar du för slutsats om dessa två egenskaper? (2 p)
Att egenskaperna är genetiskt korrelerade (negativ korrelation).
Den genetiska korrelationen är negativ och ogynnsam
I ett selektionsexperiment på Lövsta selekterades hönslinjen N för många ägg och linjen E för
tunga ägg. Båda linjerna kom från en gemensam baspopulation. I tabellen nedan ser du
linjernas medelvärde i dessa egenskaper efter 4 generationers selektion, som avvikelser från
baspopulationens resultat.
Linje Antal ägg Äggvikt, g
N +6.92 -0.33
E -1.20 +1.75
b) Vad blir konsekvenserna för utformningen av avelsprogram för värphöns i
kommersiell produktion - hur kan egenskaperna hanteras i avelsarbetet? (2 p)
Om man selekterar för den ena egenskapen kommer den andra att ändras också, och
korrelationen är negativ (om ena egenskapen ökar så minskar den andra) och
ogynnsam (man vill ha både många ägg och stora ägg).
För att inte få oönskade
effekter av selektionen så behöver man inkludera båda egenskaperna i sitt avelsmål
I ett selektionsexperiment på Lövsta selekterades hönslinjen N för många ägg och linjen E för
tunga ägg. Båda linjerna kom från en gemensam baspopulation. I tabellen nedan ser du
linjernas medelvärde i dessa egenskaper efter 4 generationers selektion, som avvikelser från
baspopulationens resultat.
Linje Antal ägg Äggvikt, g
N +6.92 -0.33
E -1.20 +1.75
c) Vilka biologiska mekanismer kan ligga bakom ett resultat som det ovan? (2 p)
Korrelationer orsakas av:
Genetisk koppling - alleler nära varandra på kromosomen (två gener nära varandra på samma kromosom)
och/eller
pleiotropi - ett anlag påverkar flera egenskaper; samma biologiska bakgrund till resultat i flera egenskaper (en gen styr flera egenskaper, eller en fysiologisk kedja av egenskaper)
Fråga 4)
Långhåriga colliehundar visar en hög grad av rädslor jämfört med andra hundraser. Du får i
uppgift att hjälpa Svenska Collieklubben att starta igång ett avelsprogram för förbättrad mentalitet hos collie. Avelsprogrammet baseras på beteendebeskrivningen
”Mentalbeskrivning Hund” (MH). C:a 4000 colliehundar har beskrivits av 250 olika beskrivare. Hundarna beskrivs året runt. SKK tillhandahåller även information om hundarnas
identitet, kön och härstamning.
a) Skriv en lämplig statistisk djurmodell som beskriver hundarnas MH-resultat. Ange
vilka effekter i modellen som är fixa och vilka som är slumpmässiga. (2 p)
y = my + kön + beskrivningsår + beskrivningssäsong + beskrivare + ålder + djur + e
- my är rasmedel
- y är observationsvärdet för N/O.
- Djur och residualen är
slumpmässiga - resten kan hanteras som fixa
Fråga 4)
Långhåriga colliehundar visar en hög grad av rädslor jämfört med andra hundraser. Du får i
uppgift att hjälpa Svenska Collieklubben att starta igång ett avelsprogram för förbättrad mentalitet hos collie. Avelsprogrammet baseras på beteendebeskrivningen
”Mentalbeskrivning Hund” (MH). C:a 4000 colliehundar har beskrivits av 250 olika beskrivare. Hundarna beskrivs året runt. SKK tillhandahåller även information om hundarnas
identitet, kön och härstamning.
c) För att validera att beteendebeskrivningen MH verkligen ger information om hundens vardagsbeteende låter du ägare beskriva sina hundars beteende i en enkät. Ägarna får bland annat gradera hundens rädsla för fyrverkerier på en skala 1 (orädd) till 5 (mycket
rädd). Du skattar den genetiska kovariansen mellan nyfikenhet/orädsla och rädsla för fyrverkerier till 0,13. σ2A för fyrverkerirädsla skattas till 0,23. Räkna ut den genetiska
korrelationen mellan egenskaperna.
På vilket sätt påverkar resultatet förutsättningarna för att bedriva ett avelsarbete för minskad fyrverkerirädsla hos colliehundar? (2 p)
σA1A2 = 0,13
σA1^2 = 0,23
σA2^2 = 0,11
rg = σA1A2 / (σA1^2 x σA2^2)^0,5 = 0,13 / (0,23x0,11)^0,5 = 0,82
Korrelationen är stark och positiv, dvs ogynnsam: Om man selekterar för
nyfikenhet/orädsla på MH skulle det alltså ge en korrelerad respons i mer
fyrverkerirädda hundar. MH är inte något effektivt verktyg för att minska
fyrverkerirädsla enligt detta (påhittade) exempel.
Fråga 4)
Långhåriga colliehundar visar en hög grad av rädslor jämfört med andra hundraser. Du får i
uppgift att hjälpa Svenska Collieklubben att starta igång ett avelsprogram för förbättrad mentalitet hos collie. Avelsprogrammet baseras på beteendebeskrivningen
”Mentalbeskrivning Hund” (MH). C:a 4000 colliehundar har beskrivits av 250 olika beskrivare. Hundarna beskrivs året runt. SKK tillhandahåller även information om hundarnas
identitet, kön och härstamning.
d) Ganska snart får uppfödare av korthåriga colliehundar nys om det nya avelsprogrammet för mentalitet på långhårig collie. En representant för korthårscollie ringer upp dig och frågar om man kan använda de genetiska parametrar (genetiska varianser och arvbarheter) som du skattat för långhårig collie för att beräkna avelsvärden även för de korthåriga. Vad svarar du? (2 p)
Genetiska varianser och arvbarheter beror på allelfrekvensen i populationen och är bara giltiga för den population de är skattade i. Därför behöver man skatta de
genetiska parametrarna separat för korthårig collie
Korsningsavel är vanligt förekommande inom flera produktionsdjurslag, t.ex. grisar och höns. Ett motiv till att systematiskt korsa raser är att man utnyttjar den så kallade heterosiseffekten
eller korsningseffekten.
a) För vilken typ av egenskaper är det vanligast att man ser tydliga heterosiseffekter? (1 p)
Egenskaper som påverkas av dominans eller icke-additivt arv, t.ex. fruktsamhet, överlevnad och hälsa
Korsningsavel är vanligt förekommande inom flera produktionsdjurslag, t.ex. grisar och höns. Ett motiv till att systematiskt korsa raser är att man utnyttjar den så kallade heterosiseffekten
eller korsningseffekten.
b) Nämn två andra motiv till att man kan vilja korsa raser på ett systematiskt sätt. (2 p)
Kombinera egenskaper, byte (up-grading) av ras, skydda investering (avelsföretag, t.ex.
fjäderfä), ny variation i en liten ras
Fråga 7)
Katja avelsvärderar colliehundar för temperament med BLUP-metoden. Avelsvärderingen
baseras på data från beteendebeskrivningen MH (Mentalbeskrivning Hund). Skottberördhet
mäts på MH på en skala 1-5 där 1 betyder att hunden är oberörd och 5 är att hunden är rädd (t.ex. försöker fly). Avelsvärdet uttrycks på en skala där medel är 100 och ett värde över 100 är önskvärt (orädd hund). I modellen ingår korrigeringar för hundens kön, testmånad och år, hundens ålder, platsen MH-beskrivningen utfördes på, domare och hundens födelsekull.
Hunduppfödare är inte så vana vid BLUP-avelsvärden som uppfödare av produktionsdjur. Hjälp Katja att svara på följande (helt verklighetsbaserade) frågor från hunduppfödare:
a) Min hund fick först ett avelsvärde på 110 för skotträdsla. Förra veckan kom resultaten från den senaste avelsvärderingen och då hade min hunds avelsvärde plötsligt sjunkit till 108. Hur kommer det sig? Svara hundägaren (max 5 meningar). (2p)
Ett djurs avelsvärde är en färskvara – det påverkas av informationsmängden som finns om djuret och djurets släktingar.
Kanske har fler släktingar prövats i MH sedan förra gången avelsvärdet skattades, t.ex. fler kullsyskon eller att hunden fått avkommor som gjort MH.
De fixa effekterna skattas också om varje gång avelsvärden beräknas och det kan påverka skattningarna lite
Fråga 7)
Katja avelsvärderar colliehundar för temperament med BLUP-metoden. Avelsvärderingen
baseras på data från beteendebeskrivningen MH (Mentalbeskrivning Hund). Skottberördhet
mäts på MH på en skala 1-5 där 1 betyder att hunden är oberörd och 5 är att hunden är rädd (t.ex. försöker fly). Avelsvärdet uttrycks på en skala där medel är 100 och ett värde över 100 är önskvärt (orädd hund). I modellen ingår korrigeringar för hundens kön, testmånad och år, hundens ålder, platsen MH-beskrivningen utfördes på, domare och hundens födelsekull.
Hunduppfödare är inte så vana vid BLUP-avelsvärden som uppfödare av produktionsdjur. Hjälp Katja att svara på följande (helt verklighetsbaserade) frågor från hunduppfödare:
b) En uppfödare har fött upp följande fyra kullsyskon (helsyskon). (se tabell i uppgiften)
Uppfödaren skriver i sitt e-mail: ”Hundarna är helsyskon och alla har ju samma
resultat på skottestet. Ingen av dem har egna avkommor. Hur kommer det sig att de får
olika BLUP-avelsvärden?”. Svara uppfödaren (max 5 meningar). (2p)
Girl, Blomma och Tom är MH-beskrivna samma dag – där förklaras skillnaden mellan Tom och de andra med att kön ingår i modellen och Tom är hanhund. Skillnaden mellan Tom och Blue förklaras med att de är beskrivna vid olika tillfällen
Fråga 7)
Katja avelsvärderar colliehundar för temperament med BLUP-metoden. Avelsvärderingen
baseras på data från beteendebeskrivningen MH (Mentalbeskrivning Hund). Skottberördhet
mäts på MH på en skala 1-5 där 1 betyder att hunden är oberörd och 5 är att hunden är rädd (t.ex. försöker fly). Avelsvärdet uttrycks på en skala där medel är 100 och ett värde över 100 är önskvärt (orädd hund). I modellen ingår korrigeringar för hundens kön, testmånad och år, hundens ålder, platsen MH-beskrivningen utfördes på, domare och hundens födelsekull.
Hunduppfödare är inte så vana vid BLUP-avelsvärden som uppfödare av produktionsdjur. Hjälp Katja att svara på följande (helt verklighetsbaserade) frågor från hunduppfödare:
c) En lite arg uppfödare skriver: ”Min hund har 1:a på skott och fick ett avelsvärde på 102. Jag ser i listan att en hund från en annan uppfödare bara fick en 3:a på skottestet, men trots det hade den ett bättre avelsvärde på 110. Hur kan det komma sig??”. Svara
den upprörda uppfödaren (max 5 meningar). (2 p)
Hundarnas avelsvärde baseras inte bara på egen prestation utan också på släktingars.
Uppfödarens hund är kanske en ensam lysande stjärna i en ganska medioker familj, medan hunden som fick en 3:a på skott förmodligen kommer från en familj där de flesta presterar mycket bättre.
Fråga 7)
Katja avelsvärderar colliehundar för temperament med BLUP-metoden. Avelsvärderingen
baseras på data från beteendebeskrivningen MH (Mentalbeskrivning Hund). Skottberördhet
mäts på MH på en skala 1-5 där 1 betyder att hunden är oberörd och 5 är att hunden är rädd (t.ex. försöker fly). Avelsvärdet uttrycks på en skala där medel är 100 och ett värde över 100 är önskvärt (orädd hund). I modellen ingår korrigeringar för hundens kön, testmånad och år, hundens ålder, platsen MH-beskrivningen utfördes på, domare och hundens födelsekull.
Hunduppfödare är inte så vana vid BLUP-avelsvärden som uppfödare av produktionsdjur. Hjälp Katja att svara på följande (helt verklighetsbaserade) frågor från hunduppfödare:
d) Några uppfödare i rasklubben menar att om de ska hålla på med sån här statistisk avelsvärdering så verkar genomisk selektion mycket modernare än BLUP! Men de är osäkra på fördelarna och vill gärna ha en kort förklaring.
Okej, den här sista var inte en verklighetsbaserad fråga från Collieklubben, men förklara ändå kort vad skillnaden är mellan genomisk avelsvärdering och BLUP-
avelsvärdering, och för vilken typ av egenskaper har man mest att vinna på genomisk
selektion? (3p)
I BLUP-avelsvärdering skattar man avelsvärden baserat på fenotyper, släktskap och
genetiska parametrar. Man skattar ett avelsvärde på individnivå, medan man med genomisk avelsvärdering skattar man ”avelsvärden” för kromosomsegment (alleler) som finns i populationen. Utifrån det kan man räkna ut ett avelsvärde för varje djur, genom att summera värdet för de kromosomsegmenter (alleler) det aktuella djuret har.
Mest nytta med genomisk selektion för egenskaper som är svåra att förbättra: svåra att mäta och låg arvbarhet
