Nutrition et culture des cellules bactériennes Flashcards
Quels critères permettent la classification des bactéries ?
- Exigence alimentaire;
- Croissance en présence de O2;
- Température de croissance.
Qu’est ce qui constitue 95% de la matière organique ?
C, O, H, N, S et P (éléments majeurs).
Quels sont les autres éléments majeurs ?
K, Mg, Ca, Fe, Na et Cl.
Quel est le rôle du Cl ?
Principal anion inorganique, intégrité électrostatique.
Quel élément permet le transport membranaire ?
Na.
Quel est le rôle du Fe ?
Cytochrome et autres protéines impliquées dans la bioénergétique.
Quel est le rôle du Ca ?
Cofacteur enzymatique, protéases, amylases, dipicolinate de Ca.
Quel est le principal cation inorganique ?
Le K.
Quel est le rôle du Mg ?
Cofacteur enzymatique, présent chez chlorophylle et bactériophylle, intégrité membranaire.
Quel élément forme les nucléotides et phospholipides ?
Le P.
Quel est le rôle du S ?
Acides aminés, vitamines, protéines (bioénergétique).
Quels sont les éléments mineurs (oligoéléments) ?
Zn, Mn, Mo, Se, Co, Cu, Ni et W.
Vrai ou faux : il est important pour la cellule d’ajouter des oligoéléments car elle risque d’en manquer ?
Faux, pas à ajouter, il y en a suffisamment dans : l’eau, la verrerie et les milieux de culture ou la nature.
Quel est le rôle du Zn ?
Polymérases (duplication matériel génétique) à ADN et ARN.
Quel est le rôle du Mn ?
Photosynthèse et superoxyde (O2-) dismutase (SOD).
Quel élément permet la fixation de l’azote, nitrogénase ?
Le Mo.
Quel est le rôle du Cu ?
Superoxyde dismutase, bioénergétique.
Quel élément est responsable de la biosynthèse des acides aminés ?
Le Se.
Quel est le rôle du Co ?
Biosynthèse des acides aminés (glu), vitamine B12 (cofacteur d’enzymes).
Quels éléments sont des cofacteurs de déshydrogénase ?
Le Ni et le W.
Sous quelles formes chimiques ces éléments sont-ils assimilés (pour la majorité) ? Et quels sont les exceptions ?
Forme : Sels inorganique.
Exceptions : S, N, C, H, O.
Exception assimilation : soufre.
Archaebactéries méthanogènes (CH4), utilisent le H2S.
Exception assimilation : azote.
Les bactéries fixatrices d’azote (exception importante), N2 –> NH3
Exception assimilation : carbone, oxygène, azote et hydrogène.
- Matière organique + H2O
- Tous composés organiques naturels : dégradés par des microorganismes.
- Les exceptions sont classées selon leur source de carbone (autotrophe : fixe le CO2, fournisse leur propre carbone)
En quoi sont transformés les éléments nutritifs ?
Matériel cellulaire (croissance de la cellule) et énergie.
Composition de la cellule bactérienne : macromolécules
96% du poids sec
- Protéines
- Polysaccharides
- Lipides
- ADN, ARN
Qu’est ce qui compose le 4% restant du poids sec de la cellule bactérienne ?
Monomères totaux (3%) et ions inorganiques (1%).
Quels sont les polysaccharides pour les gram + et gram - ?
Gram - : peptidoglycane et lipopolysaccharides
Gram + : peptidoglycane (encore plus), sucre et alcool.
Vrai ou faux : les protéines vont jouer un très grand nombre de rôles différents ?
Vrai (diversité moléculaire tend vers 1100).
Qu’est ce que le catabolisme ?
Réaction de dégradation, transforme les nutriments en métabolites intermédiaires (précurseurs) de nombre restreint et qui sont communs à tous les organismes. Au cours de la transformation, la cellule produit de l’énergie (ATP, NADH, NADPH).
Qu’est ce que l’anabolisme ?
Intermédiaires + énergie –> biosynthèse des macromolécules –> matériel cellulaire
Comment l’énergie est-elle utilisée ?
- Biosynthèse et polymérisation;
- Transport actif;
- Motilité;
- Maintien de la balance osmotique.
Comment se fait le transport actif ?
- Concentration des nutriments dans la cellule (à l’encontre d’un gradient de concentration);
- Élimination des déchets métaboliques.
Comment se produit la motilité ?
- Déplacement vers nutriments;
- Éloignement des répulsifs.
Comment se maintient la balance osmotique ?
[K+] intérieur»_space; extérieur;
[H+] intérieur «_space;extérieur.
Selon quoi les types trophiques sont définies ?
- Source d’énergie
- Source de carbone (type de nourriture va fournir le carbone pour l’organisme bactérien)
Quelles sont les différentes sources d’énergie ?
- Lumière (phototrophes);
- Chimique (chimiotrophes, va récupérer l’énergie qui va être produite par l’électron).
Quelles sont les différentes sources de carbone ?
- CO2 (autotrophes)
- Matière organique (hétérotrophe, organotrophe)
Comment se produit la croissance en présence d’O2 ?
- Le substrat va être oxydé (enlève des électrons), ils von passer dans une cascade d’oxydoréduction;
- L’oxygène va capter les électrons et va produire molécules d’eau;
- Les électrons vont réussir, suite à la cascade d’oxydoréduction, à produire de l’énergie sous forme d’ATP, NADH et NADPH.
Qu’est ce que l’aérobie stricte ?
Pas de croissance en absence de O2, respiration aérobie exclusivement
accepteur final d’électrons : O2.
Qu’est ce que l’anaérobie stricte ?
Pas de croissance en présence de O2
Accepteur final d’électrons : produit final de fermentation.
Quelle est la forme toxique de l’O2 ?
O2- (ion du peroxyde)
Anaérobies strictes : superoxydase dismutase (SOD), catalase, peroxidase
Pas capable de détoxifier ces formes d’O donc anaérobie
Accumulation de peroxyde et d’ions peroxyde jusqu’à ce que la croissance arrête.
Quelle est la limite, même pour aérobie ? et pourquoi ?
La croissance diminue si [O2] > 20%
Car peroxyde dismutase, catalase, etc. n’arrive plus à faire leur travail.
Qu’est ce que l’anaérobie facultative ?
Croissance en présence ou absence d’O2;
Respiration ou fermentation (métabolisme le plus rentable)