nucléotides Flashcards
Quels sont les rôles biologique des nucléotides?
- composantes des acides nucléiques ADN et ARN
- stockent et fournissent ATP
- régulent des processus cellulaires ( signalisation intracellulaire: AMPcyclique - AMPc)
- implication dans le transport d’électrons
Quels sont les trois ensembles distincts qui composent un nucléotide ?
- bases azotées
- pentose
- groupements de phosphate
De quoi est constitué une baze azotée?
- pyrimidine (cycle de 6 atomes avec 2N) ou purine (cycle 6 atomes avec 2N + cycle 5 atomes collé avec 2N)
- groupement carbonyle, méthyl, ou amine
Qu’est-ce qui confère la spécificité lors de l’appariement des bases?
groupements de carbonyle, méthyle ou amine.
Quelles sont les cinq principales bases azotées ?
Adénine, Guanine, Uracil, Cytosine, Thymine.
Comment peut-on décrire la purine?
pyrimidine fusionné à un cycle imidazole (cycle à cinq atomes contenant trois atomes de carbone et deux atomes d’azote en position 1 et 3.)
Dites à quels groupes (purines ou pyrimidine) appartiennent les bases azotées?
Purine: Adénine, Guanine
Pyrimidine: Cytosine, Uracile, Thymine
Quels sont les groupements sur les bases azotées?
Adénine: amine
Guanine: carbonyl + amine
Cytosine: carbonyl + amine
Uracile: 2 carbonyl
Thymine: 2 carbonyl + methyl
Quelles bases azotées se trouvent à la fois dans l’ADN et l’ARN ?
Adénine, Guanine, Cytosine.
Quelle base azotée se trouve uniquement dans l’ARN ?
Uracile.
Quelle base azotée se trouve uniquement dans l’ADN ?
Thymine
Quel type de liaison se produit entre les bases azotées ?
Liaison hydrogène.
Quelle est la règle d’appariement des bases dans l’ADN ?
A-T et G-C
Quel est le pentose utilisé pour l’ARN ?
Le b-D-ribose.
Quel est le pentose utilisé pour l’ADN ?
Le b-D-2’-désoxyribose.
Quelle est la différence entre la structure des pentoses de l’ADN et l’ARN?
- b-D-ribose : groupement OH sur le C2
-b-D-2’-désoxyribose: pas de groupement OH sur le C2
Combien de phosphates peuvent former le groupement phosphate d’un nucléotide ?
1 à 3
Comment les azotes des purines et des pyrimidines se relient-ils au pentose ?
N9 purine/N1 pyrimidines avec le carbone C1 (1’) du ribose. par un lien N-glycosidique
Qu’est-ce qu’un nucléoside ?
une base azotée est liée à un pentose (ribose ou désoxyribose). —> pas de phosphate
Qu’est-ce qu’un nucléotide ?
Un nucléotide est un nucléoside auquel on a ajouté au moins un groupe phosphate sur le ribose. (nucléotides mono-,di-,tri-phosphate)
Donner des exemples de nucléotides.
AMP, ADP et ATP
Dessiner les composants de désoxyadénosine monophosphate
ppt nucléotide p.14
Comment lit-on une séquence de plusieurs nucléotides ?
extrémité 5’ vers 3’
Que désigne 5’ et 3’ ?
bouts libres, non relié
Comment sont reliés les différents nucléotides ?
liaison phosphodiester (provenant du groupement phosphate)
Qu’est-ce que FAD(H), NADH, NADPH ?
coenzymes qui permettent le transport d’électrons ordonnées et qui sont impliqué dans des réactions redox.
Nom de NAD+ et NADH
Nicotinamide adénine dinucléotide
Nom de NADP+ et NADPH
Nicotinamide adénine dinucléotide phosphate
Nom de FAD(H)
Flavine adénine nucléotide
Quel est le rôle de l’ATP dans les réactions chimiques physiologiques ?
Il fournit l’énergie nécessaire. tous les domaines (metabolisme, cycle cellulaire ou mouvement)
Quel est le rôle du GDP/GTP dans la signalisation intracellulaire ?
Cofacteur: il lie des protéines cytosoliques et coordonne leur activité dans le temps.
À quoi sert l’AMPc ?
C’est un messager second dans des cascades de signalisation intracellulaire.
Comment est synthétisé AMPc ?
enzyme: adenylate cyclase
Combien de codons encodent Trp et Met ?
1
Quel est le codon de start de la traduction ?
codon de Met.’
Combien y a-t-il de codons stop ?
trois codons stop.
À partir de quel codon la traduction peut-elle théoriquement commencer ?
La traduction peut théoriquement commencer à n’importe quel codon AUG (ou ATG en langage ADN) qui code pour la méthionine.’
Qu’est-ce qu’un cadre de lecture ouvert?
sans codon stop: indique la présence d’un gène traduit
Les cadres de lecture peuvent-ils être sur les deux brins d’ADN ?
Oui, les cadres de lecture peuvent être sur les deux brins d’ADN et chevaucher dans différents cadres de lecture.’
Quels sont les différents types de liaisons que l’on peut trouver dans les nucléotides ?
- liaisons phosphodiester entre les nucléotides,
- liaisons hydrogène entre les bases azotées complémentaires,
- liaisons covalentes entre les groupements phosphate et les sucres.’
Qu’est-ce que le lien N-glycosidique dans les nucléotides ?
lien entre la base azotée et le sucre.
Qu’est-ce que le lien phosphodiester dans les polynucléotides ?
lien entre deux nucléotides adjacents, formé par une liaison entre le groupe phosphate d’un nucléotide et le sucre d’un autre nucléotide.
Qu’est-ce que le sens de synthèse dans le code génétique ?
direction dans laquelle l’ARNm est synthétisé, de 5’ à 3’.
Qu’est-ce qu’un triplet/codon dans le code génétique ?
séquence de trois nucléotides dans l’ARNm qui code pour un acide aminé spécifique.
Expliquer la nomenclature des nucléotides avec la base Adénine.
- ribose ; adénosine (A) ; AMP, ADP, ATP (mono, di, tri- phosphate)
- désoxyribose ; désoxyadénosine (dA); dAMP, dADP, dATP
Expliquer la nomenclature des nucléotides avec la base Guanine.
- ribose: guanosine (G); GMP, GDP, GTP (mono, di, tri- phosphate)
-désoxyribose ; désoxyguanosine (dG); dGMP, dGDP, dGTP
Expliquer la nomenclature des nucléotides avec la base Cytosine.
- ribose: cytidine (C); CMP, CDP, CTP (mono, di, tri- phosphate)
-désoxyribose ; désoxycytidine (dC); dCMP, dCDP, dCTP
Expliquer la nomenclature des nucléotides avec la base Thymine.
- ribose: thymidine (T); TMP, TDP, TTP (mono, di, tri- phosphate)
-désoxyribose ; désoxythymidine (dT); dTMP, dTDP, dTTP
Expliquer la nomenclature des nucléotides avec la base Uracile.
- ribose: uridine (U); UMP, UDP, UTP (mono, di, tri- phosphate)
-désoxyribose ; désoxyuridine (dU); dUMP, dUDP, dUTP