acide aminé

Question 1

De quoi est composé un a.a ?

Answer 1

• fonction acide - carboxyl (COOH),
• fonction amine (NH2)
• chaine latérale variable (R= « reste »)
• carbone central (ici en noir)

Question 2

Qu’est-ce qui se passe à un pH physiologique pour les fonctions de aa ?

Answer 2

ionisation

Question 3

Comment est caractérisé le carbone central d’un aa ?

Answer 3

centre chiral → énantiomère D ou L

Question 4

Quelle est la forme de l’énantiomère le plus courant ?

Answer 4

L

Question 5

Comment fonctionne la classification des énantiomères selon la convention de Fischer ?

Answer 5

• forme L : Co-R- N
• forme D : Co-N-R
  avec H qui sort du plan.

Question 6

Est-ce que les énantiomère D jouent des rôles dans la nature ?

Answer 6

Oui

Question 7

Que veut dire aa protéinogéniques ?

Answer 7

aa qui font des protéines

Question 8

Donnez des exemples de aa qui ne font pas de protéines mais qui sont aussi important.

Answer 8

• Thyroxine ( hormone thyroïdienne )
• GABA (gamma-amino-butyric acid: neurotransmetteur; le groupe amino sur le carbone C γ gamma)

Question 9

Quels sont les carbones qui utilise l’alphabet grec ?

Answer 9

• C chiral
• C chaine latérale

Question 10

Que confère les chaines latérales au aa ?

Answer 10

R donne un caractère spécifique.

Question 11

Quelles sont les deux fonctions ionisables d’un acide aminé?

Answer 11

• fonction carboxyle
• fonction amine.

Question 12

Qu’est-ce qu’un Zwitterion?

Answer 12

un ion dipolaire: car une fonction donne facilement son proton – à pH faible, et une difficilement – à pH basique

Question 13

Combien de constantes de dissociation ont les acides aminés?

Answer 13

• Les acides aminés ont au moins deux constantes de dissociation, une pour chaque fonction ionisable.
• K1: carboxyl et K2: amine

Question 14

Qu’est-ce que le point isolélectrique (ISO)?

Answer 14

• Le point isolélectrique est le pH auquel un acide aminé a une charge nette de zéro.
• charge équilibré

Question 15

Quelles sont les trois formes possibles d’un acide aminé en fonction du pH?

Answer 15

Les trois formes possibles d’un acide aminé en fonction du pH sont: chargée positivement, neutre (net), et chargée négativement.

Question 16

Qu’est-ce qui détermine la forme majorité de aa ?

Answer 16

le pH

Question 17

À quoi sert l’équation de Henderson-Hasselbalch ?

Answer 17

déterminer le ratio des formes ioniques de l’acide aminé d’intérêt à un pH donné

Question 18

Comment trouver le point isoéléctrique d’une chaine latérale non-chargée ?

Answer 18

• moyenne du pK1 et pK2
• méthode: écrire la cascade d’ionisation et déterminer la charge globale (nette); identifier la forme de aa avec une charge nette nulle; faire la moyenne des pKa se situant de part et d’autre de la forme neutre.

Question 19

Comment trouver le point isoéléctrique d’une chaine latérale chargée?

Answer 19

• prendre en considération le pKR
• méthode: écrire la cascade d’ionisation et déterminer la charge globale (nette); identifier la forme de aa avec une charge nette nulle; faire la moyenne des pK se situant de part et d’autre de la forme neutre.

Question 20

Comment trouver le point isoéléctrique d’une chaine latérale basique?

Answer 20

écrire la cascade d’ionisation et déterminer la charge globale (nette); identifier la forme de aa avec une charge nette nulle; faire la moyenne des pK se situant de part et d’autre de la forme neutre.

Question 21

Que représente le pK1, pK2, pKR ?

Answer 21

• pK1 : COOH
• pK2 : NH3
• pKR : chaîne latérale

Question 22

Donnez des exemples de modifications de chaine latérale.

Answer 22

• N-formylation = ajout d’un groupe formyl- à la méthionine N-terminale (au début d’une protéine) – fréquent chez les bactéries
• Hydroxylation – ajout d’Un hydroxyle sur proline ou lysine – par exemple dans la collagène
• Phosphorylation = ajout d’un phosphate sur les fonctions hydroxyle de Ser, Thr, Tyr
• Méthylation = ajout d’un méthyl sur lysine ou arginine (amoindrit leur charge!)