Notions de base en microbiologie Flashcards
Bactéries aérobes obligatoires
Besoin d’oxygène, métabolisme par respiration.
Bactéries anaérobes
Inhibées ou tuées par l’oxygène, métabolisme par fermentation.
Bactéries aérobies facultatives
Se développent bien dans les deux conditions, donc métabolisme par respiration (si oxygène disponible) et fermentation.
Bactéries microaérophiles
Se situent au milieu, nécessitent 5-10% d’oxygène pour une croissance optimale.
Bactéries anaérobes aérotolérante
N’utilise pas l’oxygène pour son métabolisme mais sa présence n’est pas toxique. Donc, fermentation même si oxygène disponible.
Croissance bactérienne
Lors de la première inoculation, les cultures liquides de bactéries présentent généralement une période de latence suivie d’une phase de doublement cellulaire constant et maximal, appelée croissance exponentielle ou logarithmique. À mesure que les nutriments s’épuisent et que les déchets s’accumulent, la croissance devient progressivement limitée (phase stationnaire) et finit par s’arrêter (décès).
Staphylococcus
Espèce : aureus, epidermidis
Gram +
Aérobie
Extracellulaire
Streptococcus
Espèce : sp. (pyogènes et pneumoniae)
Gram +
Aérobie
Extracellulaire
Enterococcus
Espèce : sp. (faecalis, faecium)
Gram +
Aérobie
Extracellulaire
Listeria
Espèce : monocytogenes
Gram +
Aérobie
Intracellulaire facultatif
Bactéries Gram + aérobie
Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Listeria
Bactéries intracellulaire
Facultatif : Listeria, Legionella, Mycobacterium, Mycoplasma, (Salmonella?)
Obligatoire : Chlamydia
Clostridioides
Espèce : sp.
Gram +
Anaérobie
Extracellulaire
Peptostreptococcus
Espèce : sp.
Gram +
Anaérobie
Bactéroides
Espèce : fragilis
Gram -
Anaérobie
Bactéries anaérobie
Clostridioides, Peptostreptococcus, Bactéroides
Chlamydia
Espèce : trachomatis
Gram -
Aérobie
Intracellulaire obligatoire
Enterobacter
Espèce : cloacae
Gram -
Aérobie
Extracellulaire
Escherichia
Espèce : coli
Gram -
Aérobie
Extracellulaire
Hemophilus
Espèce : influenzae
Gram -
Aérobie
Extracellulaire
Klebsiella
Espèce : pneumoniae
Gram -
Aérobie
Extracellulaire
Legionella
Espèce : pneumophila
Gram -
Aérobie
Intracellulaire facultatif
Mycobacterium
Espèce : tuberculosis
Gram -, acid-fast
Aérobie
Intracellulaire facultatif
Mycoplasma
Espèce : pneumoniae
Gram -
Aérobie
Intracellulaire facultatif
Neisseria
Espèce : meningitidis
Gram -
Aérobie
Extracellulaire
Proteus
Espèce : mirabilis
Gram -
Aérobie
Extracellulaire
Pseudomonas
Espèce : aeruginosa
Gram -
Aérobie
Extracellulaire
Salmonella
Espèce : enterica
Gram -
Aérobie
Extracellulaire (+ intracellulaire obligatoire?)
Serratia
Espèce : marcescents
Gram -
Aérobie
Extracellulaire
Bactéries Gram +
Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Listeria, Clostridioides, Peptostreptococcus
Bactéries Gram -
Chlamydia, Enterobacter, Escherichia, Hemophilus, Klebsiella, Legionella, Mycobacterium, Mycoplasma, Neisseria, Proteus, Pseudomonas, Salmonella, Serratia, Bacteroides
Bactéries Gram - aérobie
Chlamydia, Enterobacter, Escherichia, Hemophilus, Klebsiella, Legionella, Mycobacterium, Mycoplasma, Neisseria, Proteus, Pseudomonas, Salmonella, Serratia
Bactéries Gram + anaérobie
Clostridioides, Peptostreptococcus
Bactéries Gram - anaérobie
Bacteroides
Bactéries gram - multirésistantes
S: Serratia marcescens
P: Pseudomonas aeruginosa
A: Acinetobacter spp. (Acinetobacter baumanii)
C: Citrobacter spp. (Citrobacter freundii)
E: Enterobacter spp. (Enterobacter cloacae)
Pathogènes potentiels au niveau du sang
Aucun
Pathogènes potentiels au niveau des tissus
Aucun
Pathogènes potentiels au niveau de la peau
Staphylococcus aureus
Pathogènes potentiels au niveau de la bouche
Candida albicans
Pathogènes potentiels au niveau du nasopharynx
Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, Streptococcus du groupe A, Staphylococcus aureus
Pathogènes potentiels au niveau de l’estomac
Aucun
Pathogènes potentiels au niveau du petit intestin
Aucun
Pathogènes potentiels au niveau du côlon
Bacteroides fragilis, E. coli, Candida, Clostridium (C. perfringens, C. difficile)
Pathogènes potentiels au niveau du vagin
Candida albicans
En âge de procréer : Streptococcus de groupe B
Pathogènes résidents au niveau du sang
Aucun
Pathogènes résidents au niveau des tissus
Aucun
Pathogènes résidents au niveau de la peau
Propionibacterium, Corynebacterium (diphtéroids), staphylococcus négatif à la coagulase
Pathogènes résidents au niveau de la bouche
Neisseria spp., streptococcus veridians, Moraxella, Peptostreptococcus
Pathogènes résidents au niveau du nasopharynx
Neisseria spp., streptococcus veridians, Moraxella, Peptostreptococcus
Pathogènes résidents au niveau de l’estomac
Streptococcus, Peptostreptococcus. autres provenant de la bouche
Pathogènes résidents au niveau du petit intestin
Variable
Pathogènes résidents au niveau du côlon
Eubacterium, Lactobacillus, Bacteroides, Fusobacterium, Enterobacteriaceae, Enterococcus, Clostridium
Pathogènes résidents au niveau du vagin
Prépuberté et post-ménopause : Diphtéroïdes, staphylocoques, Enterobacteriaceae
En âge de procréer : Lactobacillus, streptocoques
Signes et symptômes d’infection
Signes locaux d’inflammation : rougeur, chaleur, douleur, oedème, purulence. Les cellules polymorphonucléaires peuvent endommager les tissus par le relâchement d’enzymes (collagénase, élastase).
Signes systémiques non spécifiques : fièvre (médiateurs = interleukine 1 (IL-1) et facteur de nécrose tumorale alpha (TNF-α)), frissons, fatigue.
Signes spécifiques selon le site atteint : SNC = photophobie, photophobie, maux de tête, désorientation, confusion, convulsions, etc.
Signes et symptômes chez la personne âgée
Manifestations cliniques peuvent être atypiques et non spécifiques (delirium, agitation, léthargie, baisse d’autonomie, confusion,…); elles peuvent même être inexistantes chez les sujets très âgées et débilités. La fièvre peut même être absente.
Conséquences de la résistance bactérienne
Échecs thérapeutiques, taux accrus de morbidité et de mortalité et augmentation des coûts des soins de santé (hospitalisation + longue et médicaments plus chers et plus toxiques).
Bactéries résistantes Gram +
Staphylococcus résistant à la méthicilline (SARM);
Streptococcus pneumoniae résistants aux bêta-lactamines et aux macrolides;
Entérocoques résistants à la vancomycine (ERV).
Bactéries résistantes à Gram -
Klebsiella pneumoniae et Escherichia coli producteurs de bêta-lactamases à spectre étendu (bêta-LSE);
Espèces d’Entérobacter et de Citrobacter et autres bacilles à Gram - producteurs de bêta-lactamases de type ampC résistants aux céphalosporines de 3e génération;
P. Aeruginosa et Acinetobacter multirésistants;
Entérobactéries qui produisent des carbapénèmases.
Infections associées au Staphylococcus aureus et epidermidis
Très large inventaire! Infections de la peau, tissus mous, méningite, endocardite, pneumonie, bactériémie et sepsis, ostéomyélite, arthrite septique, …)
Infections des cathéters et septicémie surtout
Infections associées au Streptococcus pneumoniae
Infections des voies respiratoires (otite, sinusite, bronchite)
Infections associées à Enterococcus sp.
Septicémies, infections urinaires, ou abdominales d’origine intestinale, et de manière souvent nosocomiale.
Infections associées à la Listeria monocytogenes
Maladie de nourriture contaminée, symptômes gastriques surtout et possibilité de symptômes généralisés chez patients plus graves
Infections associées à la Chlamydia trachomatis
Infections transmises sexuellement et par le sang (ITSS), conjonctivite
Infections associées à l’Enterobactérie cloacae
Infections nosocomiales (surtout pneumonie)
Infections associées à l’Escherichia coli
Infections urinaires (et nosocomiales, intra-abdominales)
Infections associées à l’Hemophilus influenzae
Infections des voies respiratoires
Infections associées au Klebsiella pneumoniae
Infections des voies respiratoires (nosocomiales) (pneumonie lobaire)
Infections associées au Legionella pneumophila
Infections des voies respiratoires
Infections associées au Mycobacterium tuberculosis
Infections des voies respiratoires (population indigène)
Infections associées au Mycoplasma pneumoniae
Infections des voies respiratoires (bronchite)
Infections associées à Neisseria meningitidis
Méningite (ne pas confondre avec N. gonnorhea)
Infections associées à Proteus mirabilis
Infections urinaires
Infections associées à Pseudomonas aeruginosa
Nosocomiale (pneumonie, pied diabétique, infection urinaire)
Infections associées à Salmonella enterica
Gastroentérite
Infections associées à Serratia marcesens
Infections nosocomiales
Infections associées à Clostridioides difficile
Diarrhée associée à l’usage des antibiotiques
Infections associées au Peptostreptococcus sp.
Infections dentaires (flore buccale)
Infections associées à Bacteroides fragilis
Infections gastro-intestinales
