Murray 36 - Viral classification, structure and replication Flashcards
Hvad kendetegner en virus?
En virus kan kun replikeres inde i en celle
Hvad er suffixet til :
virus-orden?
virus-familie?
- virales
- viridae
Hvordan klassificeres virus?
- Kemisk sammensætning
- Morfologi
- Replikation
- ”Samlingssted” / tropisme
- Værtsspecificitet / tropisme
Beskriv opbygningen af virus
- Genetisk materiale: Enten DNA eller RNA
- Proteinkappe + nucleinsyrer = “skal” = capsid
- Evt en envelope = lipidholdig kappe
Beskriv hvordan de forskellige dele af virus bliver syntetiseret
• Genetisk materiale(RNA eller DNA) : virus
• Capsid proteiner : virus
• Matrixproteiner : virus
• Envelope:
-lipidholdig kappe : værtscellen
-sukkerstrukturer : til dels værtscellen
-visse overfladeproteiner : værtscellen
-glycoproteiner : virus
Hvor stor er en typisk virus?
100 nm - til sammenligning er en typisk bakterie 5000 nm!
Beskriv DNA-virus overordnede karakteristika
Oftest dobbeltstrengede (ds). Kan dog også være enkeltstrengede (es)
Også et eksempel på delvist dobbeltstrengede og enkelstrengede (hepadnavirus).
De bringer ofte ikke enzymer med ind i cellen, og bruger altså cellens eget maskineri. Store DNA-virus koder for egen replikase, mens små bruger værtscellens værtpolymerase.
Oftest replikation i cellekernen.
Angiv de forskellige typer RNA virus baseret på deres genom og give eksempler på disse
RNA ss+ streng (fungerer som mRNA, infektiøs):
- Ikke segmenteret: picorna, corona, toga, flavivirus
- Retrovirus: 2 molekyler + revers transkriptase
RNA ss- streng (skal medbringe enzym, ikke infektiøs):
- Segmenteret: influenza, bunyavirus
- Ikke segmenteret: filo, morbilli, parotitis, RSV
RNA ambisense: arenavirus
RNA ds+ streng segmenteret: reovirus (rotavirus)
Hvor tager vira, der har membran, membranen fra?
Enten fra cellenkernen, cytoplasma, eller selve overflademembranen. Membranerne kommer dog til at indeholde virale glykoproteiner (giver ‘spikes’ på overfladen) og matrixproteiner (forbinder lipidkappe og capsid).
Nævn 11 virusfamilier med envelope og eksempler inden for hver familie
Bunyaviridae : Puumalavirus Coronaviridae : SARS Filoviridae : ebolavirus Flaviviridae : denguevirus; HCV Herpesviridae : HSV; EBV; CMV Orthomyxoviridae : influenzavirus Paramyxoviridae : morbillivirus Poxviridae: koppevirus Retroviridae : HIV Rhabdoviridae : rabiesvirus Togaviridae : rubellavirus
Nævn 11 virusfamilier uden envelope og eksempler inden for hver familie
Adenoviridae : adenovirus Caliciviridae : norovirus Hepadnaviridae : HBV Papovaviridae : papillomavirus Parvoviridae : B19 Picornaviridae : rhinovirus Reoviridae : rotavirus
Hvor tager vira, der har membran, membranen fra?
Enten fra:
•cellenkernen
•cytoplasma
•selve overflademembranen
Membranerne kommer dog til at indeholde virale glykoproteiner (giver ‘spikes’ på overfladen) og matrixproteiner (forbinder lipidkappe og capsid).
Hvad betyder knopskydning? (budding på engelsk)
Knopskydning er når virus forlader cellen og i processen tager noget af cellemembranen med, og det er derfor (som oftest) vira med en membran, som gør dette.
Beskriv de vigtigste antivirale kemoterapier
For hæmning af viruskodet polymerase (replikation):
•HAART(Highly Active AntiRetroviral Therapy):
Kombination af 3 eller 4 terapeutika:
-RT hæmmere
-protease-hæmmere (PI)
-integrase-hæmmere
-fusionshæmmere
For hæmning virus-kodede proteiner (adsorption, uncoating, replikation):
•Tamiflu: influenza A (neuraminidase)
•Relenza: Influenza A (+B?) (neuraminidase)
Beskriv kemoterapien HAART(Highly Active AntiRetroviral Therapy)
Kombination af 3 eller 4 terapeutika: RT hæmmere protease-hæmmere (PI) integrase-hæmmere fusionshæmmere
Hvad er specielt for virus?
- Obligat intracellulære parasitter
- Genom enten DNA eller RNA
- DNA virus replikerer i cellekernen
- RNA virus replikerer i cytoplasma
- Virus med envelope er sarte
- Nøgne virus er robuste
- Antibiotika virker ikke på virusinfektioner
Hvad betyder tropisme (ift. virus)?
” tropism refers to the way in which different viruses/pathogens have evolved to preferentially target specific host species, specific tissue, or specific cell types within those species.” - fra wikipedia om tropisme. Med andre ord er det en virus specificitet for fx et væv, celletype eller art (fx mennesket).
Hvad afgør om en virus udviser tropisme for et væv?
VAP (viral adhesion protein) på virussen + receptor på værtscellen. Hvis disse binder til hinanden forekommer adsorption.
Hvad sker der, når en virus med envelope og uden envelope penetrerer en celle?
Med envelope: Fusionerer med cellemembranen og capsidet kommer frit ud i cytoplasma.
Uden envelope: Der sker endocytose, og capsidet befinder sig i vesikler i cytoplasma, som fx kan blive nedbrudt.
Hvad betyder knopskydning? (budding på engelsk)
Knopskydning er når virus forlader cellen og i processen tager noget af cellemembranen med, og det er derfor (som oftest) vira med en membran, som gør dette.
Hvordan dannes virus overordnede i cellen?
Samling af virions (viruspartikler), modning og frigørelse fra værtcellen.
