Module 3 Flashcards
Donnez la définition de la biodiversité.
Diversité du vivant à plusieurs échelles
- Écosystème : Diversité écologique
- Espèce : Diversité systémique
- Gènes : Diversité génétique
Donnez les définitions d’espèce biologique et d’espèce évolutive.
Espèce biologique : Groupe d’individus ayant la faculté potentielle ou réelle de se reproduire, isolément des autres groupes. Lié au fait que les descendants sont féconds
Espèces évolutives: Lignage de populations (Populations ancestrales et descendantes) évoluant séparément des autres
Concept qui évolue au lieu de se fonder sur l’idée de ressemblance, il va se fonder sur l’idée de descendance. Inclus les bactéries et procaryotes
Représentez les quatre modes de spéciation.
Allopatrique : isolement physique
Péripatrique : Colonisation d’une nouvelle niche isolée
Parapatrique : Colonisation d’une nouvelle niche collée à l’ancienne
Sympatrique : Polymorphisme génétique, à l’intérieur de la population
Donnez deux limites aux méthodes de taxonomies traditionnelles
Complexité des clés de détermination Nécessite : - L’organisme en entier - La saison de floraison adéquate - Une grande expertise - Caractères stables (non influencé par la plasticité) Manipulation délicate de l’organisme
Donnez deux utilités de la taxonomie
Biologie de la conservation :
- Reconnaître des espèces en danger ou protégées
- Détecter l’arrivée d’espèces envahissantes
Agriculture :
- Identifier les espèces nuisibles (bio-agresseurs)
Santé publique :
- Lutter contre la fraude alimentaire
Donnez la définition du barcoding
Méthode permettant d’identifier les espèces décrites à l’aide d’un ou de quelques courts segments standardisés d’ADN (nommés codes-barre génétique)
Donnez les deux prémisses sous-jacent la théorie du barcoding
- Les codes-barres de chaque espèce sont différents de ceux des autres espèces
- La divergence interspécifique est plus grande que la divergence intraspécifique
Donnez les trois étapes d’une réaction PCR
- Dénaturation (simple brin)
- Hybridation (amorces)
- Polymérisation (extension)
Donnez trois avantages de la technique de barcoding par rapport aux méthodes traditionnelles de taxonomie
- Méthode standardisée et rapide
o Amorces universelles - Ne nécessite pas directement de connaissances approfondies en taxonomie
o Disposition d’une base de données en ligne - Assignation à l’espèce quelque soit le matériel biologique disponible, son état de conservation et le stade de développement de l’organisme
o Échantillonnage non invasif en toutes circonstances
Donnez au moins deux domaines d’application du barcoding
- Biologie de la conservation o Protection de la biodiversité - Taxonomie o Améliorer l’encyclopédie du vivant - Sciences forensiques o Lutter contre le braconnage, la fraude alimentaire - Écologie o Comprendre les réseaux trophiques
Expliquez les travaux sur l’effet des lions de mer sur les stocks de saumons en structurant votre énoncé en : hypothèse nulle, hypothèse alternative, prédiction, méthodes, résultats.
Hypothèse nulle : Les populations de lion de mer n’ont pas d’influence sur les stocks de saumons
Hypothèse alternative : Les populations de lion de mer ont une influence sur les stocks de saumons
Méthode : Identification par barcoding des espèces de saumons pacifiques trouvés dans les estomacs des phoques
Résultats : De 18.4% à 1.8% de chaque espèce dans les contenus stomacaux
Potentiellement explique l’effondrement des stocks de certains saumons pacifiques. Ceux se trouvant en plus grande quantité dans l’estomac des phoques sont ceux dont les stocks sont les moins grands
Indiquer trois inconvénients de l’approche de barcoding
- Protistes et champignons sous-représentés
- Nécessite de l’expertise en taxonomie pour
construire la base de données - Le barcoding gap ne semble pas être une
technique fiable pour des cas de spéciation
récente ou d’hybridation - Pas de barcode moléculaire universel
