Model organisms Flashcards
Beschrijf kort de mitose van een gistcel
Rustfase (G1) verlaten –> binnenkomen synthese-fase (S) –> DNA-replicatie en budformatie –> vorming mitotische spindle –> elongate M-fase –> bud laat los om een nieuwe gistcel te vormen
Wanneer zullen gistcellen a.d.h.v. meiose delen en wat ontstaat er dan?
Wanneer de cel zich onder barre omstandigheden bevindt. Er ontstaan dan 4 sporen uit een diploïde gistcel.
Welke vorm kan een spoor aannemen en waardoor wordt deze vorm bepaalt?
A of alfa, wordt bepaald door de MAT-locus op het derde chromosoom.
Welke DNA-elementen zijn nodig voor de vorming van een gistplasmide? Welk derde element wordt vaak nog toegevoegd?
ARS en CEN. Soms wordt een gen toegevoegd zodat je kan selecteren op basis van positieve selectie.
Waarom zijn gistcellen geschikt voor forward genetics?
Omdat ze zich snel kunnen delen.
Wat is forward genetics?
Het zoeken naar een gen die verantwoordelijk is voor een bepaald fenotype/functie.
Hoe kan je forward genetics toepassen op een gistcel?
Door random mutaties aan te brengen in gistcellen op kweek. De gistcellen isoleren die defect zijn, die kloneren en identificeren voor hun functie.
Hoe kan je het probleem van gemuteerde cellen omzeilen bij het onderzoek naar de celcyclus van gistcellen?
Door gebruik te maken van temperatuur gevoelige mutaties. Waarbij mutaties pas voor een defect zorgen bij een hogere temperatuur.
Wanneer spreek je van genetische interactie?
Wanneer beide genen moeten samenwerken om dezelfde functie te voltooien.
Hoe kan je genetische interactie testen m.b.v. gistcellen?
Door twee gemuteerde genen met elkaar laten ‘paren’. Als het fenotype hierdoor veranderd is er sprake van genetische ineractie.
Wanneer spreek je van synthetic lethality?
Als de combinatie van gemuteerde gistcellen bij onderzoek naar genetische interactie dodelijk is.
Wat is yeast two-hybrid screening en wat is het doel?
Een techniek om eiwit interactors te identificeren, het doel is om nieuwe eiwitten te vinden die interactie aangaan met jouw specifieke eiwit.
Welke twee ‘moleculen’ heb je nodig voor yeast two-hybrid screening?
Een reportergen om het selectieproces zeker te maken. De expressie van een transcriptiefactor als twee domeinen.
Leg kort de stappen uit van yeast two-hybrid screening.
Je bekende eiwit fuseer je met het DNA-bindend domein en wordt het lokaas genoemd. Het eiwit dat fuseert met het transcriptie-activatiedomein wordt het prooi. Als de prooi met het lokaas tot interactie gaat, zullen de cellen die dit coderen de selectie overleven.