Microbiologie & Infectiologie - Virus Flashcards
Qu’est-ce qu’un virus ?
Agent qui peut être filtré
Parasite intracellulaire obligatoire
→ Dépend de la machinerie biochimique de la cellule hôte pour la réplication (Ne se reproduit pas par division cellulaire)
Le virus doit pouvoir _________ la cellule hôte
entrer dans
Types de virus ADN en ordre croissant de grandeur
Parvovirus
Papovavirus
Adenovirus
Herpesvirus
Poxvirus
Types de virus ARN en ordre croissant de grandeur
Picornavirus
Reovirus
Togavirus
Coronavirus
Orthomyxovirus
Rhabdovirus
Paramyxovirus
Les virus sont ________ au microscope optique
INVISIBLES
Un virion est composé de ….
Génome (acide nucléique) + Capside (protéines) = Nucléocapside
+/- enveloppe
Un virus à ADN peut être à _________ brin et peut être __________
Un virus à ADN peut être à simple ou double brin et peut être linéaire ou circulaire
Un virus à ARN peut être à _________ brin et peut être __________
Un virus à ARN peut être à simple ou double brin et peut être segmenté ou non
Polarité d’un virus ARN simple brin
positive comme ARNm ou négative
Polarité virus ARN double brin
+/- ou double sens
Couche la plus externe d’un virus ?
Capside ou enveloppe
La couche externe d’un virus constitue la ________ , la _________ et le __________ du virus
La couche externe d’un virus constitue la structure , la protection et le véhicule de transmission du virus
PAV
Protéine d’Attachement Viral
→ Structures présentes à la surface de la capside ou de l’enveloppe permettent l’interaction entre le virus et la cellule hôte via une PAV ou autre structure
Comment inactiver un virus ?
Détruire la couche la plus externe
Capside
- Protéines
- Structure rigide capable de résister à des conditions environnementales difficiles
- Symétrique (icosaédrique, hélicoïdale) ou asymétrique (complexe)
Les virus nus sont généralement …….
Résistants…
→ Sécheresse
→ Acidité
→ Détergents
Capside icosaédrique
Sous-unités protéiques virales s’unissent → Protomères
5 Protomères → Capsomère (Penton)
→ Gros virus : Pentons + Hexons
Capside hélicoïdale
Sous-unités protéiques interagissent entre elles et avec l’acide nucléique pour former une structure qui ressemble à un bâtonnet
Enveloppe
- Membrane
- Lipides
- Protéines
- Glycoprotéines
- Structure similaire aux membranes cellulaires
- Glycoprotéines virales ancrées sur l’enveloppe et se projettent hors de la surface du virion, comme des spicules (SPIKE)
- Certaines agissent comme PAV, capables de se lier à des cellules cibles
- Ag majeurs pouvant éliciter une immunité protectrice
- Autres fonctions possibles
Caractéristiques virus enveloppés
FACILEMENT INACTIVÉS
→ Sécheresse
→ Détergent
→ Acidité
→ Solvants
DOIVENT RESTER MOUILLÉS
→ Transmis par les fluides
Les virus sont classifiés principalement selon __________________
Nature du génome
→ ADN / ARN
→ Simple / double brin
→ Segmenté ou non
→ Linéaire / circulaire
Structure
→ Symétrie de la nucléocapside
→ Enveloppé ou non
→ Nombre de capsomères
-virales
Ordre
-viridae
Famille
-virinae
Sous-famille
-virus
Genre
Tous les virus à ARN simple brin négatif sont ______
Enveloppés
Virus de la variole : Famille ?
Poxviridae
Virus Herpes simplex Types 1 et 2 : Famille ?
Herpesviridae
Virus de l’hépatite B : Famille ?
Hepadnaviridae
Virus de la rougeole, oreillons : Famille ?
Paramyxoviridae
Virus de l’influenza A et B : Famille ?
Orthomyxoviridae
Étapes de la réplication virale
- Reconnaissance de la cellule cible
- Attachement
- Entrée dans cellule a/t membrane plasmique
- Décapsidation
-
Synthèse des constituants viraux (multiplication virale)
- Synthèse de l’ARNm précoce et protéines non-structurales
- Réplication du génome
- Synthèse d’ARNm tardif et protéines structurales
- Modification post-traduction
- Assemblage du virus
- Bourgeonnement des virus enveloppés
- Relâchement du virus hors de la cellule hôte
La reconnaissance et la liaison à la cellule cible est spécifique au ________ et parfois spécifique à _______
La reconnaissance et la liaison à la cellule cible est spécifique au type de cellule et parfois spécifique à l’hôte
Exemples de virus pneumotropes
Influenza
Adénovirus
Rhinovirus
Virus respiratoire syncytial
Exemples virus dermotropes
Variole
Rougeole
Rubéole
Varicelle
Zona
Exemples virus viscérotropes
Hépatite
Fièvre jaune
Gastro-entérite
VIH
Mononucléose
Exemple virus neurotropes
Rage
Encéphalite et polyomyélite
Exemples de PAV
gp120 (Glycoprotéine 120) → VIH
HA gp (Hémagglutinine) du virus Influenza A
Exemples de récepteurs sur la cellule hôte
CD4 et co-récepteur chemokine sur les Lymphocytes T pour le VIH
Acide sialique des cellules épithéliales pour Influenza A
Entrée dans la cellule - Virus non enveloppés
Endocytose médiée par un récepteur
Entrée dans la cellule - Virus enveloppés
Fusion des membranes du virus et de la cellule cible (précédée ou non d’endocytose)
Nucléocapside ou génome viral ensuite relâché dans le cytoplasme
Le génome d’ADN est habituellement transporté au ____
Noyau
Le génome d’ARN est habituellement transporté au ____
Cytoplasme
La plupart des virus à ADN utilisent _________ pour synthétiser l’ARNm dans le noyau
les polymérases de la cellule hôte
Plus d’erreurs sont faites par les virus à ____
ARN
Polymérases des cellules hôtes plus efficaces contre les erreurs
La plupart des virus à ARN sortent de la cellule par ______
Bourgeonnement de la membrane plasmique sans tuer la cellule
Modes de transmission des virus
Aérosols
Fécale - orale
Fomites
Contact direct avec les sécrétions (gouttelettes)
Contact sexuel
Sang contaminé / Transplantation d’organes
Zoonoses
Transmission verticale
Les virus nus sont souvent transmis par voie …
💩👅
Méthode Dx de choix
PCR
(Détection du matériel génétique viral)
Méthodes Dx virus
Culture virale sur cellules dérivées de tissus humains en couche monocellulaire (MOINS UTILISÉ)
Ac spécifiques chez l’hôte (Sérologie)
PCR
Microscopie électronique
Contrôle des infections virales
Hygiène (lavage des mains, EPI, distanciation, …)
Vaccination
Tx antiviral (POUR CERTAINS VIRUS SEULEMENT)
Comment inhiber l’attachement du virus à la cellule ?
Ac neutralisants
Antagonistes de récepteurs spécifiques
(Analogues PAV)
Comment inhiber l’entrée dans la cellule et la décapsidation ?
Pour virus qui entrent par vésicule endocytique : neutraliser le pH
→ Amantadine et rimantadine
→ Eufuvirtide bloque l’entrée et la décapsidation du VIH en inhibant la protéine de fusion gp41
Pourquoi l’ARNm n’est pas une bonne cible ?
Inhibe aussi la cellule hôte
Inhibiteurs de la réplication du génome
Antiviral efficace !
- Plupart des antiviraux sont des analogues des nucléosides
- ADN polymérase virale du HSV et transcriptase inverse du VIH par exemple
- Analogues nucléosidiques se lient facilement à la polymérase virale et inhibe réplication virale par arrêt de l’élongation
- Analogues non nucléosidiques de la polymérase se lient de façon non compétitive à l’enzyme des sites autres que celui du substrat pour inhiber la polymérase
Quelles étapes sont ciblées par les antiviraux ?
Attachement
Entrée & Décapsidation
Réplication
Assemblage & Relâchement
Comment inhiber l’assemblage et le relâchement du virus ?
Inhiber les enzymes responsables
→ Inhibiteurs de la protéase du VIH (Assemblage et production de virions)
→ Inhibiteurs de la neuraminidase de l’influenza A et B (libération)
