Microbiologie final Flashcards
1
Q
Quels sont les deux types d’immunité?
A
immunité innée, immunité adaptative
2
Q
Qu’est-ce que l’immunité adaptative?
A
-Réponse tardive au premier contact
- Induite
-spécifique à l’antigène
-Mémoire immunologique (réponse plus rapide au 2e contact)
3
Q
Qu’est-ce que l’immunité innée?
A
-Réponse immédiate au premier contact
-Induite
-Non spécifique à l’antigène
-Pas de mémoire immunologique
-Toujours présente
4
Q
Quels sont les acteurs de l’immunité innée?
A
-Barrière épithéliale
-molécules sécrétées (enzymes, peptides antimicrobiens, anticorps)
-Cellules phagocytaires et lymphocytaires (NK cells)
-Système du complément
-Cellules dendritiques
5
Q
Quelles sont les cellules immunitaires polymorphonucléaires?
A
neutrophiles
éosinophiles
basophiles
6
Q
Quelles sont les caractéristiques des cellules immunitaires polymorphonucléaires?
A
noyau polylobé
granules
7
Q
Quelles sont les cellules immunitaires mononucléaires?
A
monocytes/macrophages
cellules dendritiques
8
Q
Quelles cellules immunitaires sont des cellules phagocytaires?
A
neutrophiles, monocytes/macrophage, cellules dendritiques
9
Q
Quelles sont les étapes de la phagocytose
A
- Plusieurs molécules aident à la chimiotaxie
- Reconnaissance du pathogène et adhérence
- Ingestion
- Digestion
10
Q
Quelles sont les molécules qui aident à la chimiotaxie?
A
- chimiokines (famille de cytokines)
- produits de pathogènes
- composants dérivés du complément
- peptides antimicrobiens
11
Q
Quelles sont les deux méthodes de reconnaissance du pathogène?
A
directe : récepteurs de la cellule
indirecte : indirecte avec opsonisation
12
Q
Quelles sont les deux composantes de la reconnaissance directe des pathogènes?
A
-Récepteurs de reconnaissance de motifs moléculaires (PRR), sur la cellule
-pathogen-associated molecular patterns, sur le pathogène
13
Q
Quelles structures peuvent participer à la reconnaissance indirecte du pathogène (opsonisation)?
A
-complément
-anticorps
14
Q
Quelles sont les étapes de l’ingestion et digestion dans la phagocytose?
A
- Chimiotaxie et adhérence du pathogène sur la cellule phagocytaire
- Ingestion du pathogène par la cellule phagocytaire
- Formation du phagosome
- Fusion du phagosome avec un lysosome = formation du phagolysosome
- Digestion du pathogène par les enzymes
- Formation du corps résiduel contenant le matériel non digestible
- excrétion du corps résiduel
15
Q
Quelles sont les caractéristiques du système du complément?
A
-Cascade non spécifique
30 protéines plasmatiques impliquées
-Chez toutes les espèces animales
-Protéines nommées par ordre de découverte
16
Q
Quelles sont les 2 voies d’activation du système complément?
A
Classique et alternative
17
Q
Qu’est-ce que l’activation classique du système complément?
A
Liaison directe de C1 sur la surface du pathogène ou indirecte via les anticorps ou autres protéines
Initiation par des lectines qui vont se lier sur la surface du pathogène (mannose binding lectin, ficolins)
18
Q
Qu’est-ce que l’activation alternative du système de complément?
A
19
Q
Quels sont les end effects du système complément?
A
- lyse de la cellule
- inflammation
- opsonisation
- interaction avec other pathways (??)
20
Q
À quoi servent les composants dérivés du complément autre que le MAC?
A
servent à la chimiotaxie des cellules phagocytaires et à l’opsonisation du pathogène pour faciliter son adhérence à la cellule phagocytaire et donc, sa phagocytose et destruction
21
Q
Qu’est-ce que la voie terminale du système complément (MAC)?
A
les molécules de C9 se posent sur le pathogène, forme un pore sur la bactérie, entrée de l’eau par osmose (perte de l’équilibre osmotique) = mort mécanique de la cible
22
Q
Qu’est-ce les cellules natural killer (NK)?
A
cellules lymphocytaires spécialisées
23
Q
quelles sont les 3 fonctions des cellules NK?
A
- Cytotoxicité
- Antibody-dependant cellular cytotoxicity (ADCC)
- Production de cytokines
24
Q
Contre quelles cellules fonctionnent les cellules NK?
A
cellules tumorales et cellules infectées par virus
25
Qu'y a-t-il sur la membrane cellulaire des cellules NK?
récepteurs activateurs ou inhibiteurs
26
Lorsqu'une cellule NK rencontre une autre cellule, la lyse de cette cellule ne se produira que si ...
les signaux d'activation surpassent les signaux d'inhibition
27
outre les signaux activateurs et inhibiteurs, comment les cellules NK reconnaissent les cellules cibles potentielles?
Elles exposent des antigènes contre lesquels le système immunitaire a développé une réponse anticorps
28
Pourquoi les cellules NK peuvent se lier aux anticorps qui se lient aux antigènes des cellules cibles?
les cellules NK expriment le CD16 (récepteur Fc) qui est un récepteur membranaire pour l'extrémité Fc des anticorps
29
Comment les cellules NK détruisent la cellule cible?
1.Relâche de perforines qui font un pore dans la cellule cible
2. Entrée des granzymes de la cellule NK dans la cellule cible
3. Apoptose de la cellule cible
4. Digestion de la cellule cible par les macrophages
30
Lors de la reconnaissance de l'antigène ou du pathogène, les cellules NK vont s'activer et produire des ...
cytokines
31
32
33
Quelles sont les caractéristiques des cytokines?
-Protéines solubles de faible poids moléculaire
-Chaque cytokine lie son récepteur spécifique
-Très efficace et actives
-Plusieurs cytokines peuvent agir en même temps sur la même cellule
34
Quel est le rôle des cytokines?
messager chimiques entre toutes les cellules
35
Vrai ou faux? seules quelques cellules peuvent produire les cytokines
faux, toutes
36
Quelles sont les familles de cytokines?
interleukines
« tumor necrosis factor »
interférons
« colony sitmulating factors »
« transforming growth factors »
chimiokines
37
Quels sont les modes d'action des cytokines?
autocrine (agit sur elle-même)
paracrine (agit sur cellule proche)
endocrine (agit sur cellule loin)
38
Quelle est la conséquence de la réponse immunitaire innée?
inflammation
39
Quelles sont les trois caractéristiques de l'inflammation?
vasodilatation
chimioattractant
dégranulation et contraction
40
À quoi sert la vasodilatation dans l'inflammation?
-rend l'endothélium perméable
-permet le passage de fluides et de cellules du système immunitaire vers le site d'inflammation
41
À quoi sert la caractéristique chimioattractant?
guide les cellules du système immunitaire vers les indésirables grâce à un gradient de concentration
42
À quoi servent la dégranulation et contraction dans l'inflammation?
Augmentent les effets de la réponse inflammatoire
43
vrai ou faux? la dégranulation et la contraction peuvent devenir pathologiques si non contrôlés
Vrai
44
les monocytes/macrophages et les cellules dendritiques sont des cellules phagocytaires, mais elles sont aussi...
des cellules présentatrices de l'antigène (CPA)
45
À qui les CPA présentent les antigènes?
aux cellules T de l'immunité adaptative
46
pourquoi les CPA présentent l'antigène aux cellules T?
Pour activation : les cellules T vont acquérir des fonctions effectrices
47
Quelle est une des fonctions effectrices des cellules T?
aider les cellules B à produire des anticorps
48
Les CPA impliquent quoi?
recirculation vasculaire
49
Le processus de phagocytose, en plus d'aider à éliminer et détruire le pathogène, sert à ... dérivés du pathogène pour être associés aux molécules du ... et ensuite présentés aux ...
générer de «petits morceaux », CMH (complexe majeur d'histocompatibilité), lymphocytes T
50
Comment le complexe majeur d'histocompatibilité et présentation d'antigène fonctionne pour les antigènes exogènes?
-Sont pris par phagocytose
-Sont fragmentés par des protéases dans le phagolysosome, qui contient de fortes concentrations en molécules CMH-II
-Les peptides antigéniques sont « loadés » sur les molécules CMH-II
-Exportation à la surface cellulaire et
-Liaison aux récepteurs des cellules T CD4+
51
Comment le complexe majeur d'histocompatibilité et présentation d'antigène fonctionne pour les antigènes endogènes?
-Protéines synthétisées intra-cellulairement (ex. virus)
-Dégradés dans le cytosol
-Fragments peptidiques transportés dans le réticulum endoplasmique
-Les peptides antigéniques sont « loadés » sur les molécules CMH-I
-Exportation à la surface cellulaire et -Liaison aux récepteurs des cellules T CD8+
52
Les T CD8+ sont prédestinés à être ...
cytotoxiques
53
Que font les T CD8+ une fois activés par une CPA?
prolifèrent, acquièrent des fonctions effectrices et migration vers les lieux infectés pour éliminer les cellules infectées de façon antigène-spécifique
54
Les cellules T cytotoxiques matures font ... pour aller en action, mais certains se différencient en ...
expansion clonale, cellules mémoires
55
quel est l'autre nom des lymphocytes T CD4+?
helper
56
comment appelle-t-on l'immunité produite par les anticorps?
humorale
57
À quoi servent les cellules T CD4+?
orienter le type d'anticorps que la cellule B sécrétera….selon les cytokines secrétées par les T CD4+
58
Qu'est-ce qu'un anticorps?
substance produite par les lymphocytes B suite à l'interaction
entre ces derniers et l'antigène.
59
À quoi est spécifique l'anticorps?
à l'antigène qui a induit sa production
60
les anticorps constituent ... principale du sang
l'immunoglobuline
61
dans quelle partie du sang sont retrouvés les anticorps
sérum
62
de quoi sont faits les anticorps?
4 chaines de protéines glycosylées (2 chaines lourdes et 2 chaines légères)
63
Par quoi sont liées les chaines des anticorps?
ponts disulfure
64
quelles sont les deux portions des chaines d'anticorps?
portion variable (N-terminale)
portion constante (C-terminale)
65
À quoi sert la portion N-terminale de l'anticorps?
responsable de la reconnaissance des épitopes
66
À quoi sert la portion C-terminale de l'anticorps?
aussi nommée Fc, responsable de la fonction
67
Quelles sont les fonctions des anticorps
neutralisation, agglutination des microbes, précipitation des antigènes dissous, activation du système complément
68
neutralisation, agglutination des microbes, précipitation des antigènes dissous par les anticorps amplifient quoi?
phagocytose
69
L'activation du système du complément par les anticorps mène à quoi?
lyse de la cellule
70
Comment sont nommées les classes des anticorps?
isotypes
71
qu'est-ce qui détermine la classe de l'anticorps?
forme de la chaine lourde
72
quelles sont les classes d'immunoglobulines?
* Alpha (IgA)
* Delta (IgD)
* Epsilon (IgE)
* Gamma (IgG)
* Mu (IgM)
73
chez quels immunoglobulines y a-t-il des sous-classes?
IgG et IgA
74
combien y a-t-il de sous-classes d'IgG chez l'homme et le chien? le cheval?
* Humain et chien : 4 IgG
* Cheval : 7 IgG
75
combien y a-t-il d'IgA chez l'humain? le lapin? le chien et le chat?
* Humain: 2 IgA
* Lapin : 13 IgA
* Chien et chat : 1 IgA
76
Chez le poulet, il n'y a pas d'IgG, mais des ...
IgY
77
quelle est la forme des IgG?
monomère
78
Quelles sont les fonctions des IgG?
-Fixe le complément, initiation de la cascade
-Lie le récepteur Fc, opsonisation
-neutralisation de toxines bactériennes
79
quelle est la forme des IgM?
pentamère
80
À quoi sert les IgM
fixe le complément
81
quelle est la forme des IgA?
monomère ou dimère, mais surtout dimères
82
Quel est le rôle principal des IgA?
neutralisation (empêche le lien pathogène-cellule de la muqueuse)
83
À quoi servent les IgE
défense contre les infections parasitaires, allergie
84
quelle est la forme des IgE?
monomère
85
Quels anticorps sont les meilleurs pour l'agglutination?
IgM
86
Quels anticorps sont les anticorps sécrétoires des muqueuses
IgA (sous forme de dimère)
87
Vrai ou faux? chaque site possède son propre microbiote
vrai
88
Le microbiote est-il plein?
oui, prend toute la place disponible
89
L'analyse du microbiote permet de voir quoi?
photo à un moment donné, zoom sur une portion de l'environnement analysé
90
Vrai ou faux? les microbiotes sont formés d'un seul type de bactéries
faux, différents types de microorganismes
91
Le microbiote est formé de la même quantité de chaque microorganisme
Faux, quantités différentes
92
Vrai ou faux? il est difficile de bien caractériser un microbiote et ça nécessite beaucoup d'expérience
vrai
93
Dans une environnement plus précis, le microbiote est (différent/pareil)
différent
94
peut-il y a voir des bactéries présentes dans le microbiote de quelqu'un, mais absent du microbiote de l'autre?
oui
95
96
97
98
99
100
101
Pourquoi ne peut-on pas rajouter des miroorganismes au microbiote?
Les ressources du milieu définissent le capacité maximale du microbiote et quel microorganisme s'installe
102
quelques fois, les microorganismes sont différents, mais remplissent la même ...
fonction
103
qu'est-ce que ça prendrait pour changer drastiquement le microbiote?
les évènements extrêmes modifient de manière durable le microbiote
104
Vrai ou faux, s'il est malade, le microbiote est faible et changeant
faux, stable et robuste même si « malade »
105
Le microbiote de qui est plus fragile et modulable?
microbiote en transition (animaux jeunes)
106
Pour changer le microbiote drastiquement, besoin de méthodes drastiques, donc influencer lorsqu'il est stable. Que doit-on utiliser pour ce faire?
utiliser des microorganismes qui ont un fort impact, mais qui peuvent soit s'insérer entre 2 assiette ou avoir une action transitoire
107
Le microbiote (évolue/n'évolue pas) dans le temps et plusieurs ... peuvent le faire varier
évolue, facteurs externes
108
Qu'est-ce qu'un microbiote :
communauté microbienne
109
Qu'est-ce qu'un microbiome?
gènes de cette même communauté microbienne
110
Quels sont les facteurs qui affectent la composition du microbiote?
* Diète et nutriments disponibles
* Antimicrobiens (peptides antimicrobiens, biles, bactériocines)
* Caractéristiques de la niche écologique (pH, niveaux d’oxygène disponibles, eau libre, etc.)
* Phages
* Immunomodulation de l’hôte
* Stress
* Environnement de vie (source de bactérie!)
111
Quelles sont les grandes fonctions du microbiote intestinal?
protection
structure
métabolique
112
Qu'est-ce que la fonction de protection du microbiote intestinal?
-Protection contre la colonisation par d'autres bactéries : compétition pour les nutriments, production de molécules antibactériennes
- Aide à la maturation du système immunitaire
-Induction de la réponse immunitaire
113
Qu'est-ce que la fonction de structure du microbiote intestinal?
-Maturation de l'épithélium intestinal
-Vascularisation des villosités
-Renforcement des jonctions cellulaires
114
Qu'est-ce que la fonction métabolique du microbiote intestinal?
-Production de vitamine
-Synthèse d'Acides aminés
-Absorption des ions
-Fermentation des substrats non digérés par l'homme
-Production d'Acides gras à courte chaîne
115
Qu'est-ce que l'homéostasie du milieu intstinal?
équilibre entre les différents groupes bactériens, le tissu épithélial et le système immunitaire
116
Vrai ou faux? le microbiote intestinal affecte le cerveau
vrai
117
Comment le microbiote intestinal peut être un facteur clé pour la santé de l'hôte?
la diversité et composition du microbiote agissent en stimulant les systèmes immunitaires innés et acquis pour maintenir l'homéostasie
118
Qu'est-ce que les fonges?
règne d'organismes eucaryotes appelés communément champignons
119
quel est l'autre nom des fonges (pas champignons)
mycètes
120
Qu'est-ce que les mycètes?
groupe très diversifié comprenant les champignons , les moisissures et les levures
121
combien d'espèce de mycètes sont des pathogènes pour les humains et animaux?
300
122
Comment les mycètes se divisent?
bourgeons
123
VRai ou faux? les mycètes sont eucaryotes
vrai
124
Pourquoi les mycètes ressemblent aux plantes?
non-mobiles, paroi cellulaire semblable
125
Pourquoi les mycètes sont différents des plantes?
dépourvus de chlorophylle, pas de pigment photosynthétique
126
Les mycètes sont plus proches phylogénétiquement des (animaux/plantes) que des (animaux/plantes)
animaux, plantes
127
Quels mycètes sont unicellulaires?
levures
128
Quelles mycètes forment des colonies multicellulaires?
moisissures et champignons
129
130
131
132
133
134
135
Les mycètes sont (autotrophe/hétérotrophe)
hétérotrophe
136
Qu'est-ce qu'être hétérotrophe signifie?
doivent tirer leur énergie des composés organiques puisés dans le milieu extérieur
137
Parce qu'ils sont hétérotrophes, comment doivent vivre les mycètes
saprophytes
parasites
commensal
symbiose mutualiste
138
Qu'est-ce que les parasites?
obtiennent des nutriments à partir des tissus d'autres organismes
139
Qu'est-ce que les saprophytes?
digèrent les matières organiques mortes et les déchets organiques
140
qu'est-ce qu'être commensal?
s'il tire profit de son hôte sans nuire à ce dernier (il s'en sert par exemple comme support)
141
Qu'est-ce qu'être en symbiose mutualiste?
les champignons peuvent vivre en symbiose avec d'autres êtres vivants autotrophes (ex : lichens sont des associations de champignons)
142
Les mycètes sont-ils absorbotrophes?
oui
143
Qu'est-ce qu'un être absorbotrophe?
nutrition absorptive : ils digèrent la matière organique et absorbent ensuite les éléments nutritifs solubles
144
Comment les absorbotrophes participent au recyclage des matières organiques?
* jouent un rôle central dans beaucoup d’écosystèmes
* décomposeurs bouclant le cycle du carbone et de nombreux éléments
145
où sont présent les absorbotrophes?
Présents dans presque tous les compartiments de l'environnement terrestre: ils abondent dans le sol, sur la végétation et dans l'eau
146
**REVENIR SUR LA SLIDE BEAUCOUP DE DIVERSITÉ
147
Comment s'appelle le corps d'un mycète et qu'est-ce que c'est?
thalle : tissu végétal composé de cellules non différenciées
148
De quoi est constitué le thalle de la plupart des champignons multicellulaires?
composé d'un mycélium, une masse peu organisée de structures filiformes appelées hyphes
149
Que contient la paroi cellulaire de la plupart des champignons?
chitine
150
Les cellules hyphales de la plupart des champignons possèdent quoi?
un ou deux noyaux et sont séparées par des parois transversales appelées septa (septum au singulier)
151
Les pores des septa permettent quoi?
permettent au cytoplasme et aux noyaux de passer d'une cellule à l'autre
152
Qu'est-ce que l'élément principal de la forme végétative d'une moisissure?
hyphe
153
De quoi a l'air l'hyphe
structure tubulaire d'environ 5 à 10 micromètres de diamètre qui renferme le cytoplasme
154
Comment se fait la croissance de l'hyphe?
Par élongation de son extrémité (croissance apicale) et par production de branches latérales
155
Quels peuvent être les différentes apparences des hyphes?
156
L'ensemble des hyphes forme quoi?
le mycélium
157
quels sont les deux types de mycélium?
* Les hyphes pénétrant le milieu de culture pour absorber les éléments nutritifs, c'est le mycélium végétatif
* Les hyphes situés au-dessus du milieu de culture c'est le mycélium aérien. Celui-ci comprend souvent des cellules reproductrices ou des spores. On parle alors de mycélium fructifère ou reproductif
158
Quels mycètes sont unicellulaires?
levures
159
Quels mycètes sont pluricellulaire ou unicellulaire
dimorphiques
160
Quels mycètes sont pluricellulaires?
moisissures (hyphes filamentés) et champignons (hyphes charnus)
161
Quel type de mycète est une forme de vie près des bactéries?
levures
162
pourquoi les levures ressemblent aux bactéries?
exigences nutritives similaires
forment des colonies sur milieu solide
163
Quelles sont les caractéristiques de croissance des levures?
anaérobies facultatifs
pH optimal : 3,5
température optimale : entre 20 et 30°C
164
Quelle est la forme des levures?
en général : pléiomorphique (peut changer de forme), mais souvent plutôt ovoides.
165
Quel est le diamètre des levures? leur longueur?
diamètre : 1 à 5 µm
longueur : 5 à 30 µm
166
Les levures sont (non-motiles/motiles)
non-motiles
167
Que peuvent former les levures?
pseudo-hyphes
168
Certaines levures possèdent quoi?
capsule de nature polysaccharidique
169
Les levures sont généralement (haploide/diploide), mais le cycle sexuel peut alterner entre les stades haploides et diploides
haploides
170
Qu'est-ce qu'un pseudo-hyphe?
courte chaîne de cellules fongiques qui se forme parce que les cellules filles ne se sont pas séparées après le bourgeonnement
171
Comment les pseudo-hyphes se distinguent des vrais hyphes?
méthode de croissance, fragilité relative et absence de relation cytoplasmique entre les cellules
172
Qu'est-ce que le dimorphisme?
capacité d'un organisme à modifier sa structure lorsqu'il change d'habitat/de condition
173
Nommez des champignons à hyphes charnus
agaricus bisporus (champignon de paris)
amanita muscaria (amanite tue-mouche)
174
Quelles sont les caractéristiques du agaricus bisporus (champignon de paris)
comestible
175
Quelles sont les carctéristique de l'amanita muscaria (amanite tue-mouche)
-toxique; rarement mortelle (15 chapeaux)
- psychotropes : le muscimole et l'acide iboténique
176
Les mycètes sont classés en fonction de quoi?
la nature du stade sexuel de leur cycle de vie
177
La classification des mycètes est compliquée par deux problèmes. Quels sont-ils?
1. aucune cycle sexuel n'a été observé pour certains mycètes
2. Il est souvent difficile de faire correspondre les stades sexuels et asexués de certains mycètes
178
de nombreux mycètes ont un aspect différent selon quoi?
qu'ils se développent dans des tissus (à la manière d'une levure) ou dans leur habitat naturel (filamenteux)
179
Quelles sont les 4 embranchements importants des mycètes
-zygomycètes
-ascomycètes
-basidiomycètes
-deuteromycètes
180
Les zygomycètes forment quoi?
zygospores (méioses de zygotes diploides)
181
Comment sont aussi appelés les zygospores?
champignons conjugués
Moisissures du pain
182
le mycélium des zygospores et formé de quoi?
mycélium complexe formé d'hyphes (Sans septum)
183
Les zygomycètes sont-ils pathogènes?
habituellement non pathogènes pour l'humain et les animaux (peut être opportuniste - rhizopus)
184
Quel est le nom commun des ascomycètes?
sac fungi
185
que produisent les ascomycètes lors de la reproduction sexuée?
produit des asques (sorte de sac ou poche) et des ascospores durant la reproduction sexuée (8 ascospores/asque)
186
Les ascomycètes sont (peu/très) diversifiés
très
187
Le mycélium des ascomycètes est composé de quoi?
mycélium composé d'hyphe avec septa avec pore central
188
Les ascomycètes sont-ils pathogènes?
plusieurs pathogènes humains et animales
189
Quels ascomycètes sont pathogènes?
Candida albicans, Aspergillus, Blastomyces
190
Les Saccharomyces (types d'ascomycètes) font quoi?
fermentation : pain, bière, vin
191
Quel est le nom commun des basidiomycètes?
club fungi
192
Que comprennent les basidiomycètes?
les champignons de la langue courante
193
le mycélium des basidiomycètes est composé de quoi?
composé d'hyphes agrégés avec septum
194
Les champignons à massue (club fongi) ont quoi?
des structures microscopiques sexuelles en forme de massue appelées baside (4 basides = 1 basidospore)
195
Quel basidiomycète cause des infections respiratoires opportunistes?
Cryptococcus
196
Avec près de 600 espèces sur la planète, parmi lesquelles les plus toxiques côtoient les comestibles les plus réputés, le genre ... est le plus important à savoir reconnaître parmi les champignons
amanite
197
Vrai ou faux? l'amanite est un basidiomycète
vrai
198
Quel est le nom commun des deutéromycètes?
fungi imperfecti
199
Quelle est la caractéristique des deutéromycètes?
sans information sur leur cycle sexuel, ils ne peuvent pas être assignés à un groupe taxonomique
200
Donnez des exemples de deutéromycètes
organismes du sol, pathogènes humains
201
Les exigences nutritives des moisissures et des champignons sont (pareilles/différentes) de celles qui sont optimales pour les bactéries
différentes
202
La plupart des mycètes sont (aérobie/anaérobie), mais quelques uns sont ...
aérobie, anaérobie facultatifs
203
où peuvent croitre les moisissures et les champignons?
milieux en aérobiose contenant une concentration élevée de sucres (ex. confiture) ou une concentration élevée de sel (milieu hypertonique)
204
quel est le pH optimal des moisissures et champignons?
5.6, mais peuvent tolérer des pH très acides (ex pH2)
205
Comment les moisissures et les champignons résistent à la déshydratation?
sporulation
206
quelle est la température optimale de croissance des moisissures et champignons?
20-30°C
207
Comment se fait la croissance des moisissures et champignons?
apicale et par embranchement
Croissance radiale
208
qu'est-ce que la teigne?
une mycose très contagieuse, qui peut atteindre les chiens, chats, rongeurs domestiques et l'humain
209
Quelles sont les espèces de teigne les plus fréquentes?
Microsporum canis et Trichophyton mentagrophytes (ascomycètes)
210
Comment se fait la transmission de la teigne?
contact direct, ou indirectement par l'intermédiaire de tissus
211
comment se fait le diagnostic de la teigne?
mise en évidence directe du champignon sous le microscope ou par mise en culture
212
213
Comment se fait le traitement de la teigne?
par voie locale (pommade, lotions) et générale (comprimés). Il peut être nécessaire de traiter également l'environnement (la maison)
214
Vrai ou faux? il faut consulter un médecin si on a une lésion de la teigne
vrai
215
Le syndrome du nez blanc a affecté quelle espèce?
chauves-souris
216
quel champignon cause le syndrome du nez blanc?
champignon ascomycètes : Geomyces destructans
217
Quel champignon cause la blastomycose?
blastomyces dermatitidis
218
Sous quelles forme existe le blastomyces dermatitidis
Mycète dimorphique existant :
sous forme mycélienne dans l'environnement ou à 25°C
Sous forme de levure dans les tissus humains/animales ou à 37°C
219
Quand survient l'infection au blastomycose?
l'infection survient le plus souvent après l'inhalation de spores (forme mycélienne) provenant d'un sol contaminé
220
où y a-t-il de la blastomycose?
distribution relativement large en Amérique du Nord
221
par quoi se traduit le blastomycose?
Infection respiratoire
222
Selon quoi agissent les anti-fongiques?
selon la localisation de la mycose
selon la cible sur les champignons
selon la nature chimique
223
Comment agissent les antifongiques selon la localisation de la mycose
topiques
systmiques
224
Comment agissent les antifongiques selon la cible sur les champignons?
Paroi
membrane
noyau (ADN, ARN)
225
Comment agissent les antifongiques selon la nature chimique?
amphotéricine B
triazolés
5 flucytosine
candines
226
Comment les antifongiques agissent sur la paroi?
agissent sur la synthèse des glycans
227
Quels antifongiques agissent sur la paroi?
échinocandines : capsofungine, micafungine
228
Comment les antifongiques agissent sur la membrane?
agissent sur l'ergosterol et sa synthèse
229
comment les polyènes (fungizone, AmBisome) agissent contre la membrane?
liaison avec l'ergostérol, formation d'un pore transmembranaire
230
comment les azoles (fluconazole, itraconazole) et les allylamines agissent contre la membrane?
inhibition de la synthèse de l'ergostérol
231
Comment les antifongiques agissent contre le noyau
agissent sur les synthèse des acides nucléiques
232
Les mycotoxines ont un poids moléculaire (faible/élevé)
faible
233
les mycotoxines sont le plus souvent ... en milieu non aqueux
thermostable
234
Le fait que les mycotoxines soient difficilment dégradable permet quoi?
elles peuvent subsister dans les denrées même après l'élimination des moisissures
235
Comment peut-on s'intoxiquer avec une mycotoxine?
issue d'un aliment moisi ou souillé par des champignons microscopiques
236
Qu'est-ce que l'ergot du siègle?
claviceps purpurea : mycète vénéneux du groupe des ascomycètes - parasite du siègle
237
Que contient l'ergot du siègle?
des alcaloïdes responsables de l'ergotisme, en particulier l'acide lysergique dont est dérivé le LSD
238
Quels sont les symptômes de l'ergot du siègle?
hallucinations passagères
239
L'intoxication par l'Ergot est l'une des explications médicale de certains cas de quoi6
sorcellerie ou possession démoniaque
240
Vrai ou faux? L'ergotisme humain a disparu, mais reste une maladie dévastatrice dans le domaine vétérinaire
vrai
241
comment se reproduisent les mycètent?
en plus de la croissance apicale et par embranchement latéral, les mycètes peuvent faire de la reproduction sexuée et/ou asexuée
242
Vrai ou faux? la majorité des mycètes pathogènes pour les animaux possèdent un cycle sexuel
faux (n'en possèdent pas ou cycle sexuel inconnu)
243
Quels sont les deux modes de reproduction asexuée des mycètes?
1. Bourgeonnement (levures)
2. Formation asexuelle de spores
244
Comment sont produites les spores asexuées?
ces spores sont produites à partir du mycélium végétatif ou soit à l'extrémité des hyphes reproductifs ou fructifères
245
dans quoi sont contenues les spores asexuées?
elles sont contenues dans des organes de fructification de structure plus ou moins complexe et d'aspect variables selon les espèces
246
Qu'est-ce qu'une spore?
chaque spore est une cellule contenant un noyau et du cytoplasme déshydraté. Ces spores peuvent résister aux conditions défavorables car la membrane cytoplasmique est protégée par une enveloppe extérieure
247
Qu'est-ce qui est un caractère taxonomique important pour les spores asexuées?
le type d'organes dans lesquels se forment les spores asexuées
248
Qu'est-ce qui donne la couleur spécifique aux spores asexuées?
pigments
249
Quels sont les types de spores asexuées?
chlamydospores
sporangiospores
conidiospores
arthrospores
blastospores
250
Caractéristiques de chlamydospores et exemple?
spores à paroi épaisse, capables de survivre à des conditions défavorables
Cryptococcus neoformans
251
par quoi sont produites les sporangiospores et donnez un exemple
par une sporange
Mucor circinelloides
252
par quoi sont produites les conidiospores et donnez un exemple
conidiophore
Histoplasma capsulatum
253
Comment sont produites les arthrospores et donnez un exemple
formée par la fragmentation d'u filament mycélien au niveau des septa
Coccidioides
254
Comment sont produites les blastospores et donnez un exemple
produites par bourgeonnement
Candida
255
Par l'intermédiaire de quoi se fait la reproduction sexuée des mycètes?
cellules spécialisées haploides (gamètes) ou spores sexuées)
256
257
258
Les spores (sexuées/asexuées) sont produites moins souvent et en moins grande quantité que les spores (sexuées/asexuées)
sexuées, asexuées
259
Pourquoi sont produites les spores sexuées?
pour l'adaptation aux nouvelles conditions environnementales
260
Comment les organismes haploides peuvent se maintenir?
bourgeonnement ou spores asexuées
261
Comment fonctionne la reproduction sexuée des mycètes?
1. Les gamètes haploïdes fusionnent et leur cytoplasme se mélange dans le cadre d'un processus appelé plasmogamie.
2. Finalement, les noyaux fusionnent dans un processus appelé caryogamie pour produire une cellule diploïde. Ces cellules ou leur descendance produisent ensuite de nouvelles cellules haploïdes
262
que se passe-t-il si les noyaux ne fusionnent pas dans la reproduction sexuée des mycètes?
Toutefois, si les noyaux ne
s'unissent pas, une cellule dicaryote se forme ; elle peut persister pendant plusieurs divisions cellulaires.
263
Remplir le cycle vital d'une levure
264
Qu'est-ce qui est à l'origine des champignons conjugués?
Parfois, de courtes ramifications d'hyphes de deux souches différentes, appelées souches plus (+) et moins (-), se développent ensemble. Cette jonction d'hyphes est à l'origine du nom de champignons conjugués
265
quel est ce champignon?
* s'étend sur près de 40 acres de sol dans une forêt près de CrystalFalls, dans la partie supérieure du Michigan
* pèse environ 100 tonnes (plus qu'une baleine bleue)
* entre 1 500 et 10 000 ans
* Le champignon se développe principalement sous le sol, de sorte qu'il n'est généralement pas visible pour l'observateur occasionnel
* L'analyse de l'ADN de structures fructifères de l'organisme et de ses structures colonisatrices souterraines a révélé que l'énorme champignon était un clone géant
Armalliria bulbosa
266
Qu'est-ce que la pathogénèse?
étude des mécanismes qui mènent au développement d'une maladie ou un état pathologique
267
Qu'est-ce que la pathogénicité
capacité d'une bactérie de produire une maladie
268
Qu'est-ce que la virulence
degré d'intensité du pouvoir pathogène (pouvoir invasif, infectieux, toxinogène)
269
Qu'est-ce qui est présent dans une bactérie pathogène?
Présence de facteurs de virulence
présence de gènes de survie (« fitness »)
270
À quoi servent les facteurs de virulence et donnez des exemples?
permets aux bactéries de produire une maladie ou un état pathologique
Facteur d'adhésion, de multiplication, toxines, dissémination
271
À quoi servent les gènes de survie et donnez des exemples?
permettre aux bactéries de survivre et persister dans un environnement
Résistance aux antimicrobien ou désinfectants
272
Qu'est-ce qu'une infection?
invasion et multiplication des bactéries dans l'hôte
273
Qu'est-ce qu'une maladie?
manifestation des signes cliniques à la suite d'une infection
274
Quelle est la formule du pouvoir pathogène?
pouvoir pathogène : (pouvoir invasif + pouvoir toxique) / résistance de l'organisme
275
Quelles sont les relations hôte-pathogène d'êtres vivant indépendamment d'autres organismes vivants?
autotrophes
saprophytes
276
Quelles sont les relations hôte-pathogène d'êtres vivant sur ou fans un autre organisme vivant nommé hôtes : symbiotes (parasites au sens large)
commensaux
mutualistes (symbiotes au sens strict)
pathogènes (parasites au sens strict)
277
Qu'est-ce qu'une relation autotrophe?
complètement indépendants, ne consommant que des matières minérales
278
Qu'est-ce qu'une relation saprophyte?
consommant de la matière organique en décomposition
279
Qu'est-ce qu'une relation commensale?
vivant ensemble en bonne intelligence
280
Qu'est-ce qu'une relation mutualiste?
fournissant une association à bénéfices mutuels importants
281
Qu'est-ce qu'une relation pathogène?
causant des dommages à l'hôte
282
Une bactérie peut être ...
commensale
pathogène
opportuniste
283
Qu'est-ce qu'une bactérie opportuniste
se développe si milieu adéquat (peut être pathogène), ne se développe pas si milieu non adéquat (non pathogène)
284
Selon quoi une bactérie présente dans le microbiote normal peut devenir pathogène?
selon les facteurs de virulence, selon les caractéristiques de l'hôte
285
Chez quelle espèce le E. Coli O157:H7 est-il commensale? pathogène?
Commensale : bovins
pathogènes : humains
286
Quelles sont les 5 étapes de la pathogénèse bactérienne?
1- Attachement - Colonisation - Entrée de la bactérie dans l’hôte
2- Évasion des défenses de l’hôte
3- Dissémination à d’autres sites
4- Dommage à l’hôte
5- Transmission de l’animal infecté à d’autres animaux susceptibles
287
Vrai ou faux, tous les organismes pathogènes suivent les postulats de Koch
faux, c'est pourquoi ils ont été modifiés
288
selon les postulats de Koch, un micro-organisme est à l'origine d'une maladie si :
(i) il est présent et il est possible d'isoler l'organisme chez tous les animaux souffrant de la maladie, mais pas chez les animaux sains ;
(ii) la maladie peut être recréée chez un autre animal après isolement et culture ;
(iii) l'animal infecté expérimentalement présente la même maladie et il est possible de réisoler l'organisme
289
quels sont les postulats de Koch modifiés?
1. Le phénotype ou la propriété ne doit être associé qu'aux membres pathogènes d'un genre ou aux souches d'une espèce.
2. L'inactivation spécifique du (des) gène(s) associé(s) au trait de virulence présumé doit conduire à une perte mesurable de la virulence
3. La réversion ou le remplacement allélique du gène muté doit conduire à la restauration de la pathogénicité
290
Remplir la chronologie de l'infection
291
La première étape du processus infectieux correspond à quoi?
implantation des bactéries sur le revêtement cutanéo-muqueux
292
comment nomme-t-on l'implantation des bactéries sur le revêtement cutanéo-muqueux
colonisation
293
de quoi est dépendante la colonisation?
d'une capacité essentielle du pouvoir pathogène : c'est l'adhésion bactérienne
294
Comment le E. Coli entérotoxinogène (ETEC) adhère aux cellules épithéliales de l'intestin
via des fimbriae
295
Les ETEC colonisent la muqueuse et produisent quoi?
des toxines
296
Les E. coli entéropathogènes adhèrent à quoi? causent quoi?
adhèrent aux cellules épithéliales et causent des lésions d'attachement/effacement
297
quelles sont les étapes de l'invasion des cellules épithéliales par les EPEC?
1. attachement intime des bactéries et effacement
2. Effacement des microvillosités à côté des bactéries
3. Piédestal sous la bactérie
4. Internalisation des bactérie
298
Quels sont les rôles du microbiote?
-Colonisation des muqueuses
-Contact entre les bactéries pathogènes et les cellules de l'hôte
-Présence (bactéries commensales, associées aux muqueuses, protection contre les bactéries pathogènes)
299
comment y a-t-il contact entre les bactéries pathogènes et les cellules de l'hôte
fimbriae (ou autres adhésines)
récepteurs cellulaires spécifiques
300
quelles bactéries y a-t-il de façon normale sur la peau des chiens (entre autre)?
staphylocoques et entérocoques
301
quelle bactérie est l'envahisseur plus fréquent de la peau?
staphylocoques
302
quelle maladie causent les staphylocoques
abcès
303
quelle maladie causent les streptocoques
impétigo
304
vrai ou faux? le microbiote intestinal se modifie lors de la diarrhée chez le porc
vrai
305
quels sont les facteurs d'adhérence majeurs utilisés pour faciliter l'attachement de pathogènes aux tissus hôtes
glycocalyx
protéines d'adhérence
acide lipoteichoique
fimbriae
306
Le glycocalyx facilite l'attachement des pathogènes où?
surface des dents
307
Les protéines d'adhérence facilitent l'attachement des pathogènes où?
muqueuses respiratoires
308
L'acide lipoteichoique facilite l'attachement des pathogènes où?
muqueuses respiratoire
309
Les fimbriae facilitent l'attachement des pathogènes où?
Pili de neisseria gonorrhoeae : épithélium urogénitaux
type I : intestin grêle
ETEC : intestin grêle
310
La plupart des sites récepteurs sur les tissus hôtes sont quoi?
glycoprotéines ou complexes lipidiques (gangliosides, globosides)
311
Quels sont les sites d'infection des bactéries dans l'hôte?
peau
muqueuses
tractus intestinal
tractus urogénital
tractus respiratoire
312
quels sont les 4 types d'infection microbienne?
313
pourquoi est-il peu probable que S. suis soit directement absorbé par les macrophages et entre dans la circulation sanguine à l'intérieur des cellules circulantes?
S. suis est très résistant à la phagocytose
314
Autre que les voies respiratoires, quelles sont les autres fois d'entrée de S. suis
abrasions cutanées, contamination orale suivie d'une translocation dans le tractus intestinal
315
Que se passe-t-il avec S. suis une fois dans la circulation sanguine?
Une fois dans la circulation sanguine, les souches de S. suis bien encapsulées sont capables de résister à la phagocytose et à la destruction médiées par le complément.
316
comment se fait le déplacement de S. suis dans le sang?
il a été démontré que S. suis encapsulé était largement attaché aux macrophages, mais pas ingéré par eux. Ainsi, le déplacement des bactéries dans le sang se ferait principalement sous forme de bactéries libre
317
quelles sont les deux types de défense contre les pathogènes?
innées et adapatative
318
quelles sont les défenses innées?
319
quelles sont les défenses adaptatives?
320
Comment les pathogènes peuvent s'évader de la réponse immunitaire innée?
Peptides
Appareil muco-ciliaire
Barriere épithéliale
Complément
Phagocytose
321
Les peptides antimicrobiens sont une (petite/large) famille de peptides
large
322
par quoi sont produit les peptides antimicrobiens?
cellules du système immunitaire (neutrophiles, macrophages, ...)
323
Vrai ou faux, il existe des mécanismes pour contrer ces polypeptides
vrai
324
quelle bactérie peut contrer les peptides antimicrobiens?
S. aureus
325
Comment bordetella pertussis échappe à la clairance trachéale?
Bordetella pertussis sécrète de la cytotoxine trachéale (TCT), qui induit la production d'oxyde nitrique dans les cellules épithéliales de la trachée, ce qui nuit à leur capacité d'éliminer le mucus.
326
La TCT induit quoi?
La TCT, seule ou en combinaison avec le LPS, induit une rupture des jonctions serrées et la nécrose des cellules épithéliales.
327
Qu'est-ce qui est la première ligne de défense de la réponse immunitaire innée?
barrière épithéliale
328
Comment Sdc1 fait une invasion et pénétration à travers la barrière épithéliale?
Sdc1 en tant que récepteur d'adhésion et d'internalisation : fixation de pathogènes bactériens (par exemple N. gonorrhoeae) à la surface des cellules Sdc1 déclenche une signalisation intracellulaire qui conduit à l'internalisation de la bactérie
329
Quels sont les rôles du complément?
Favorise la phagocytose
Génère des molécules pro- inflammatoires
Forme des pores dans les parois des pathogènes
330
Comment S. aureus échappe au complément?
Protéine A de S. aureus, se lie à la région Fc de l'IgG, empêchant la liaison par C1q et bloquant l'activation du complément par la voie classique.
331
Pourquoi les Gram + sont plus résistants au MAC (barrières physiques)?
couche de peptydoglycanes
332
Comment les pathogènes échappes à l'étape 1 de la phagocytose (chimiotaxie)?
Réduction de la chimiotaxie des neutrophiles
atteinte à la migration des cellules
333
Comment les pathogènes échappes à l'étape 2 de la phagocytose (signaux des récepteurs et ingestion)?
interfèrent avec les récepteurs, incluant l'opsonisation
334
Comment les pathogènes échappes à l'étape 3 de la phagocytose (formation du phagosome)?
s'échappe du phagosome dans le cytosol, puis pénètre cellule à cellule
335
Comment les pathogènes échappes à l'étape 4 de la phagocytose (formation du phagolysosome)?
inhibe la formation du phagolysosome
336
Comment les pathogènes échappes à l'étape 5 de la phagocytose (destruction et digestion)?
inhibe les processus oxydatif et la destruction microbienne
337
quelles sont les autres façons que les pathogènes échappes à la phagocytose?
Relâche des toxines cytolytiques : lyse des cellules phagocytaires
Persistance et réplication dans le phagosome, blocage de l'apoptose : persistance intracellulaire
338
Comment le biofilm permet aux pathogènes de s'évader de la phagocytose?
Les bactéries présentes dans les biofilms échappent aux défenses immunitaires en sécrétant des pores et des protéines.
339
Quels sont les autres rôles du biofilm?
1. Protection contre les agents antimicrobiens
2. Favoriser l'adhésion aux surfaces
3. Faciliter les interactions intercellulaires
4. promouvoir la résistance génétique
5. Favoriser la persistance de l'infection
340
comment les pathogènes s'échappent de la réponse immunitaire acquise?
341
Comment les pathogènes peuvent être disséminer vers d'autres sites
Par le système lymphatique, le sang ou dissémination directe
342
Que transportent les vaisseaux lymphatiques (autre que la lymphe)
déchets, microbes et cellules endommagées
343
qu'y a-t-il dans les ganglions?
cellules immunitaires qui attaquent les pathogènes
344
Quand la capacité de filtration des ganglions peut être altérée?
-Augmentation du flux (inflammation)
- Concentration des pathogènes élevée
-Mécanismes d'évitement du système immunitaire par les bactéries
345
Lorsque qu'une bactérie atteint la circulation sanguine, l'évènement le plus probable est que...
elle soit éliminée par l'organisme.
346
que se passe-t-il quand on se brosse les dents?
bactériémie transitoire
347
Lorsque qu'une bactérie atteint la circulation sanguine, quels sont les deux autres évènement possibles?
Deuxième possibilité : la bactérie se multiplie dans le sang et mène a un sepsis sévère et la plupart du temps la mort
Troisième possibilité : la bactérie utilise le sang comme un véhicule et va se loger dans d'autres organes.
348
quand y a-t-il de la dissémination directe?
Lorsque les deux autres moyens ont échoué, la bactérie peut aussi se disséminer de manière directe.
349
la dissémination directe est à une échelle...
locale
350
Quelle bactérie peut avoir dissémination directe très sévère?
Streptocoques groupe A
351
Quels sont les façons que les pathogènes créent des dommages à l'hôte?
-Infection sans dommage
-Dommage direct par le microorganisme
-Les toxines
-Dommage indirect (Inflammation, Réponse immunitaire, Autre)
352
vrai ou faux, de nombreux agents pathogènes causent peu ou pas de dommage.
vrai
353
Quand la plupart des bactéries intracellulaires vont causer des dommages ?
lors de la réplication à l’intérieur de la cellule.
354
Qu'est-ce qu'une toxine?
Les toxines bactériennes sont des facteurs de virulence. Elles créent des dommages cellulaires directs ou s'attaquent au système immunitaire.
355
Quels sont les deux types de toxines?
Endotoxines : LPS
Exotoxines = principalement protéique
356
quand sont libérés les endotoxines?
libérées lors de la lyse de la cellule bactérienne
357
Quels sont les types d'Exotoxines?
type I
Type II
type III
358
LEs exotoxines de type I activent quoi?
voies intracellulaires
359
Que font les superantigènes?
activent le système immunitaire de manière excessive
360
Que font les exotoxines de type 2?
toxines qui détruisent la membrane cellulaire (production de canaux)
361
quelles sont les caractéristiques des exotoxines de type 3
Entrent et sont actives dans la cellule
Souvent des toxines de deux composants (type AB)
362
donnez des exemples d'Exotoxines de type 3
ADP transférases (LT de E. coli)
Cyclases adenylées (B. bronchiseptica)
Metalloendoprotéases
Neurotoxines des Clostridia
363
quel est l'autre nom des endotoxines bactériennes?
LPS (lipopolysaccharide)
364
quel type de bactéries ont le plus de LPS?
gram -
365
À quoi servent les LPS?
intégrité structurelle de la bactérie
366
les LPS représentent environ ...% de la masse totale de sa membrane externe, et environ ...% de sa surface totale.
50%, 75%
367
Comment se nomment les cellules qui participent à l'inflammation (y'a rien d'écrit sur la slide c'est pas clair)
cytokines
368
qu'est-ce qui régule la réponse inflammatoire?
La signalisation par les TLR active des cascades de signalisation intracellulaire qui conduisent à la translocation nucléaire de AP-1 et NF-κB ou IRF3, qui régulent la réponse inflammatoire.
369
Quelles sont les conséquences d'une inflammation sur le foie?
Une inflammation excessive peut mener à une perte importante d'hépatocytes, à des lésions d'ischémie-reperfusion, à des altérations métaboliques et, finalement, à des lésions permanentes. L'inflammation peut détruire les cellules parenchymateuses
370
Quelles sont les conséquences d'une inflammation sur les poumons?
Les maladies inflammatoires du poumon impliquent des interactions complexes entre les cellules structurelles et immunitaires. L'inflammation pulmonaire résulte principalement de l'exposition des tissus à des pathogènes bactériens et viraux, et/ou ou à des polluants environnementaux. Une inflammation aiguë excessive et les lésions pulmonaires qui s'ensuivent peuvent provoquer une fibrose pulmonaire et altérer les échanges gazeux.
371
Quelles sont les conséquences d'une inflammation sur le cerveau?
Les réponses inflammatoires dans le cerveau peuvent augmenter l'excitabilité neuronale, endommager les cellules et augmenter la perméabilité de la barrière hémato-encéphalique à diverses molécules.
372
L'inflammation peut faire quoi au système immunitaire?
réponse exagérée
373
Quels sont les deux moyens de transmission des pathogènes?
transmission horizontale ou verticale
374
Comment se fait la transmission horizontale des pathogènes?
375
À travers quoi peut se faire le transfert vertical de pathogènes?
La transmission peut se produire à travers le placenta, dans le lait maternel ou par une transmission par contact direct pendant ou après la naissance
376
Quels types de pathogènes peuvent pousser sur un milieu artificiel? Ne peuvent pas?
peuvent pousser : Intracellulaires facultatifs, majoritairement extracellulaires
ne peuvent pas : intracellulaires obligatoires
377
Quelle doit être la caractéristique des antibiotiques pour les bactéries intracellulaires obligatoires?
antibio qui diffuse dans les cellules
378
Quels sont les problèmes émergents en bactériologie?
Résistances aux antibiotiques
Infections zoonotiques
Infections nosocomiales
Approche Une Seule Santé.
379
Qu'est-ce que la taxonomie
science de la classification
➢ Fournit une base ordonnée pour la dénomination des organismes (e.g. bactéries) et pour leur classement dans une catégorie, ou taxon.
380
QU'Est-ce que la nomeclature?
Une branche de la taxonomie qui s’occupe de l’attribution
de noms aux groupes taxonomiques
➢ Les règles pour nommer les organismes
381
Qu'est-ce la classification?
Classification: Classement des organismes en groupes basé sur leur similarité mutuelle ou leur parenté évolutive
382
Qu'est-ce qu'une espèce bactérienne?
regroupement d’individus (e.g., souches bactériennes) qui partagent un haut niveau de similarité phénotypique et génotypique
383
Qu'est-ce qu'une souche bactérienne?
une population d’organismes issue d’un seul organisme ou d’une culture pure
384
Par quoi se différencient les bactéries d'une même souche?
sérovar: différent par leurs propriétés antigéniques
385
À quoi sert la taxonomie?
Organiser les connaissances sur les êtres vivants et établir des noms normalisés pour les organismes afin de pouvoir communiquer à leur sujet
386
Quelles sont les trois fonctions de la taxonomie
387
Vrai ou faux, notre connaissance de l'histoire évolutive des organismes est complète.
faux
388
Quels sont les taxons du plus large au plus précis?
domaine ou règne
embranchement
Sous-embr.
classe
ordre
famille
genre
espèce
souche
389
Quelle est l'unité de base de la taxonomie?
espèce
390
La description de l'espèce comporte quelles caractéristiques?
phénotypiques et génotypiques
391
Quelles sont les caractéristiques phénotypiques
Morphologie
biochimie
physiologie
écologie
392
quelles sont les caractéristiques génotypiques?
composition de l'ADN (% G+C)
Hybridation de l'ADN (% d'homologie)
Séquence de l'ADN
393
dans le système binominal de nomenclature, le premier mot indique quoi le deuxième?
1er : genre
2e : espèce
394
Le nom complet (genre+espèce) en ..., et le genre
commence par une ...
italique, majuscule
395
Le nom d'un organisme dit souvent quelque chose à son sujet, comme ...
sa forme, l'endroit où il se trouve, les nutriments qu'il utilise, qui l'a découvert ou la maladie qu'il provoque
396
QU'est-ce que la taxonomie numérique?
Elle consiste à assigner une valeur à chacun des phénotypiques caractères et à calculer mathématiquement le coefficient de similarité entre différentes souches bactériennes
397
quel est le but de la taxonomie numérique?
Son but est de créer une taxonomie en utilisant des algorithmes et des méthodes numériques comme le partitionnement de données
398
que montre un dendrogramme?
Montre le degré de similarité phénotypique entre différentes souches bactériennes nommées
399
À quoi sert le dendrogramme?
Identifier des groupes de souches étroitement apparentées
400
quelle est la différence entre la classification et l'identification en taxonomie numérique?
Classification (groupe) = beaucoup de tests
identification (espèce) = peu de tests (phénotypiques/génotypiques)
* rapidité et rentabilité (algorithmes)
401
Le développement de la biologie moléculaire a fourni quoi?
de nouvelles façons de caractériser les bactérie
402
la biologie moléculaire apportent des renseignements ... en plus des
informations phénotypiques dont on disposait déjà
génotypiques
403
Le rapport guanine + cytosine (G+C) / adénine + thymine (A+T) (varie/est semblable) d’une espèce bactérienne à l’autre
varie
404
Chez quel type d'organisme le % G+C varie beaucoup? varie peu?
Varie beaucoup : procaryotes
varie peu : eucaryotes
405
Si le % G+C est différent, les bactéries sont
différentes
406
si le % G+C est similaire, les bactéries pourraient être différentes si...
la séquence d'ADN est différente
407
Comment fait-on l'hybridation de l'ADN de deux microrganismes différents?
* L’ADN simple brin (dénaturé par la chaleur) va reformer une
molécule double brin lorsque placé dans des conditions idéales.
* On peut réassocier de l’ADN d’une bactérie avec l’ADN d’une
autre marqué avec un radioisotope.
* On obtient une molécule hybride
408
l'hybridation de l'ADN de deux microorganismes différents permet de déterminer quoi?
degré d'homologie entre les deux bactéries
409
Deux souches bactériennes doivent obligatoirement avoir plus de
...% d’homologie pour appartenir à la même espèce
70%
410
Vrai ou faux? La composition (%G+C) et le % d’homologie ne permettent pas d’établir l’ordre des bases puriques et pyrimidiques.
vrai
411
la séquence d'ADN donne quoi?
donne la similarité entre les deux organismes et fournit des renseignements supplémentaires (e.g. identification de gènes, d’opérons, de régions régulatrices, mutations…)
412
que permet l'ARNr 16S
Permet l’identification de bactéries difficilement cultivable (e.g. anaérobes)
413
Comment le séquençage de l'ARNr 16S permet d'identifier les bactéries?
On utilise les variations dans l'ARN 16S pour identifier les bactéries
414
quand l'homologie de l'ARN 16S est trop grand, que faut-il faire?
observations phénotypiues
415
La diversité bactérienne a explosée suite à l’obtention de quoi? comment?
l’obtention de séquences de bactéries « non cultivables »
* par le séquençage de génomes et de métagénomes
416
à quoi servent les profils protéiques?
Les profils protéiques, qui fournissent une « empreinte digitale » des protéines présentes dans des cellules particulières, peuvent être utilisés pour comparer différentes bactéries afin de déterminer leur degré de parenté
417
Vrai ou faux, il existe une classification officielle des bactéries?
faux
418
Donnez des exemples de classification des bactéries
Système de classification à 5 règnes (monera/procaryotes)
caractéristiques phénotypiques (Gram, sporulation, coque/bâtonnets, O2)
419
remplir
420
Le fait que les mycoplasmes n'ont pas de paroi cellulaire permet quoi?
résistance aux antibiotiques ciblant le peptidoglycane
421
Par quoi sont transmis les rickettsies
arthropodes (puces, tiques)
422
que signifie gen. nov
l'abréviation de "genus novum", qui signifie "nouveau genre”
423
que signifie comb. nov
"combination nova" ou "nouvelle combinaison”
424
Vrai ou faux? il y a une mise à jour régulière de la taxonomie
vrai
425
Quelle bactérie est fréquemment liée au cancer colorectal et à l'endocardite?
S. bovis biotype I
426
Quelle est la relation entre E. Coli et shigella?
En raison de leur degré de parenté et de la similitude de leur ADN, E. coli et les 4 espèces de Shigella constituent une même espèce
En fait, les quatre espèces de Shigella sont imbriquées dans les souches d'E. coli
427
Pourquoi E. Coli et shigella sont maintenus en tant u'entités distinctes?
dans l'intérêt de l'épidémiologie et de la médecine clinique
428
Le neobacillus driskii a des gènes responsables de quoi?
Gènes responsables de la production de peptides lasso, qui sont essentiels à la défense
antimicrobienne, à la communication et à l'inhibition des enzymes
429
Quelles sont les première préoccupation du microbiologiste?
* l’isolement et l’identification rapide de l’agent étiologique de l’infection
* on peut aussi vouloir déterminer sa sensibilité aux antibiotiques (antibiogramme)
* l’identification par des méthodes ne nécessitant pas la culture (e.g. ELISA pour détecter un antigène, PCR)
430
L'identification rapide peut se faire dans la plupart des cas après quoi?
isolement du mciroorgansime en culture pure
431
qu'est-ce qu'on utilise pour l'identification rapide de microorganismes?
* l’origine du spécimen
* la morphologie de la cellule
* la coloration de Gram
* l’aspect des colonies
* les besoins nutritifs de la bactérie
* certaines caractéristiques biochimiques
432
quels sont les différents types d'identification?
Identification avec des milieux de culture usuels
Identification à l’aide de systèmes miniaturisés
Identification à l’aide de la spectrométrie de masse MALDI-TOF
Identification à l’aide d’un système automatisé de séquençage de l’ARNr 16S
433
quel type d'identification permet l'utilisation d'un minimum de tests?
identification avec milieux de cultures usuels
434
comment se nomme l'identification à l’aide de systèmes miniaturisé
Galerie API
435
Advenant le cas où la même espèce bactérienne est isolée de plusieurs animaux d’un même troupeau ou de plusieurs troupeaux différents, une méthode de typage peut permettre:
* de comparer les souches bactériennes
* d’effectuer des études épidémiologiques
* de retracer l’origine (la source) de l’infection
* de prédire l’efficacité d’un vaccin
436
quelles sont les méthodes de typage?
biotypage
sérotypage
lysotipie
typage moléculaire
436
avec quoi se fait chaque type de typage?
biotypage : selon les besoins nutritifs
sérotypage : avec anticorps
lysotipie : avec bactériophages
typage moléculaire : plusieurs méthodes
437
Quelles sont les méthodes de typage moléculaire?
* Détection par PCR de gènes codant pour des facteurs de virulence ou de résistance aux antibiotiques
* Digestion du génome avec enzymes de restriction
* Multilocus sequencetyping (MLST)
* Analyse de séquences répétées (10 – 100 pb)
438
À partir de quoi sont déterminées les relation phylogénétiques?
à partir de séquençage de génome
439
Par quoi est déterminée l'antibiorésistance?
Antibiorésistance déterminée avec des tests phénotypiques traditionnels
