Microbiologie - Épidémiologie et diagnostic Flashcards
Quelle est la définition « actualisée» de l’épidémiologie?
Branche de la médecine qui étudie les différents facteurs intervenant dans l’apparition ou l’évolution des maladies, que ces facteurs dépendent de l’individu ou du milieu qui l’entoure.
Des agents infectieux pouvant être à l’origine d’épidémie sont des bactéries, des mycobactéries, des virus, des parasites. Nommez-en 3 autre.
Tréponèmes
Rickettsies
Chlamydia
Quelle est l’utilité principale de l’épidémiologie?
Relier un agent infectieux à une maladie.
Que signifie BK?
Bacille de Koch puisque le Dr Koch est celui qui a mis en évidence le Mycobacterium tuberculosis.
Quels sont les 3 postulats de Henle et de Koch? (1840 et 1890)
- Le germe est présent dans tous les cas de maladie en question et sa présence peut expliquer ces changements pathologiques et cliniques attribués à l’infection.
- Ne se retrouve pas dans aucune autre maladie de façon fortuite ou non pathogène.
- Une fois l’agent isolé et cultivé in vitro, l’injection du germe à un individu entraîne la maladie.
Lequel des postulats de Henle et de Koch n’est pas essentiel et pourquoi?
Le troisième puisque ce ne sont pas toutes les maladies qui se cultivent en laboratoire et parce qu’il est aujourd’hui interdit d’injecter du matériel infectieux chez des individus sains à titre informatif.
Quelle est l’intention derrière les postulats de Rivers?
Harmoniser les postulats de Henle et de Koch pour être plus inclusif avec les infections VIRALES (pas un seul agent viral infectieux, virus croît difficilement en laboratoire, reconnaissance de porteurs sains complexe).
Quels sont les postulats de Rivers? (1937)
- Un virus particulier doit être RÉGULIÈREMENT associé à une maladie.
- Le virus se retrouve chez l’individu malade et cause l’infection.
3a. Transmission de l’infection se fait régulièrement à des individus susceptibles lorsqu’ils y a inoculation de matériel biologique provenant d’un patient malade.
3b. Études immunologiques démontrent que le virus n’était pas présent chez le sujet à qui on a inoculé le matériel biologique.
Quels sont les postulats de Rivers adaptés (à jour) en 1973?
Absence d’anticorps au début de la maladie
Apparition d’anticorps durant la maladie ou après
Production d’anticorps (à la suite d’un vaccin) prévient la maladie
En quoi résulte la plupart des infections?
L’absence d’infection ou une Infection asymptomatique subclinique ou sans symptôme
Quel facteur déterminé qui fera une infection et qui fera une maladie après l’acquisition d’un germe?
RÉPONSE IMMUNITAIRE DE L’HÔTE
Quel est un facteur déterminant dans la présentation clinique d’une maladie (si maladie il y a)?
ÂGE
Quelles sont les caractéristiques importantes des maladies à déclaration obligatoire (MADO)?
Elles sont contagieuses d’un individu à l’autre.
Elles peuvent être transmises à plusieurs individus à partir d’une source commune.
Quelle est l’utilité de déclaré les MADO?
Si un nombre de cas importants semblent être répertoriés, une enquête peut être initiée et des correctifs peuvent être apportés.
Donnez la définition de nosologie.
Étude des caractères distinctifs qui permettent de définir les maladies et de les classer.
Quel est le but des définitions nosologiques?
De ne pas surestimerai sous-estimer le nombre de cas dans les statistiques et déclarer qu’il y a épidémie quand il n’y en a pas ou rassurer la population quand il y a un problème.
Quels sont les 2 types de cas des définitions nosologiques?
Cas clinique : critères recueillis au questionnaire et à l’examen du patient par le médecin.
Cas confirmés : critères de laboratoire ou signes cliniques avec un lien épidémiologique recueilli.
Qu’est-ce qui compose la phase pré-analytique du cheminement diagnostic en infectiologie?
Patient consulte avec des Sx/signes d’une mx infectieuse
Dx clinique tentatif
Prescription de prélèvement de culture
Prélèvements identifiés acheminés au laboratoire
Réception des prélèvements au laboratoire
Qu’est-ce qui compose la phase analytique du cheminement diagnostic en infectiologie?
Examen direct sur le prélèvement Rapport partiel au MD (interprétation) Mise en culture du prélèvement Incubation des milieux ensemencés Lecture des milieux (LENDEMAIN) Identification bactérienne Rapport partiel 2 Finalisation de l'identification
Qu’est-ce qui compose la phase post-analytique du cheminement diagnostic en infectiologie?
Émission du rapport final
Interprétation finale du MD
Quelles sont les raisons pour effectuer un examen direct sur un prélèvement infectieux?
Quantifier les globules blancs (réponse inflammatoire et purulence)
Exprimer en valeur relative la quantité de polynucléaires présents.
Qu’est-il important de faire avant de procéder à l’examen direct?
Évaluer la qualité du prélèvement pour décider si le résultat final sera fiable.
(contamination ou non)
Quels sont les examens directs (SANS COLORATION) possible?
Sérum physiologique
Hydroxyde de potassium (KOH)
Iode
Fond noir
En quoi consiste l’examen direct de sérum physiologique?
Observer mobilité de certains microorganismes
Évaluer rapidement les microorganismes ayant une forme particulière
En quoi consiste l’examen direct de KOH?
Utile pour dx les éléments mycéliens (champignons) à partir de prélèvements d’ongles, de peau et de cheveux.
En quoi consiste l’examen direct d’iode?
Colore les noyaux et organelles cytoplasmiques
Utile pour colorer rapidement les selle et dx la présence de protozoaires (AMIBES)
En quoi consiste l’examen direct de fond noir?
Mettre en évidence des microorganismes mal visualisés en microscopie optique standard et qui se colore difficilement.
Quels sont les examens directs (AVEC COLORATION)?
Coloration de Gram
Coloration de Ziehl-Neelsen
Quel est le principe de la coloration de Gram?
Le spadois pauvres en lipides retiennent plus le colorant cristal violet (Gram positif, bleu).
Quand la paroi est riche en lipides, le cristal violet ne s’imprègne pas de façon permanente (déloge) (Gram négatif, rose).
Quelle est la technique avec la coloration de Gram?
Étaler prélèvement sur une lame en couche mince Fixer à la chaleur Cristal violet (1 min.) Laver Safranine (1 min.) Laver, assécher Lire au microscope
Quelles sont les utilités de la coloration de Gram?
Reconnaissance rapide de pathogènes
Reconnaissance flore normale et anormale
Évaluation réponse inflammatoire
Quantifier les polynucléaires vs mononucléés
Quel est le principe de la coloration Zielh-Neelsen?
La paroi de certains microorganismes est épaisse et cireuse et ne se colore pas facilement. Une fois les parois colorées, elle résistent par contre à la décoloration par solvant tel l’acide-alcool (bacilles acido-alcoolo résistants ou BAAR, rose).
Quelle est la technique avec la coloration de Ziehl-Neelson?
Préparer une lame à partir du prélèvement comme la coloration Gram Carbol fuchsin Laver Acide-acool Bleu de méthylène Laver, assécher Lire au microscope
Quels sont les utilités de la coloration Ziehl-Neelson?
Identifier (présomptivement) des mycobactéries sans identifier l’espèce
Identification des BAAR (Nocardia)
Quel sont les site de prélèvement normalement stériles?
Sang
LCR
Liquide synovial
Liquide pleural
Comment interpréter un rapport fait à partir d’un prélèvement normalement stérile?
Connaître les pathogènes classiques pour demander un deuxième prélèvement en cas d’infection improbable.
Quels sont les sites connus pour leur flore normale?
Bouche
Vagin
Peau
Rectum ou selles
Comment interpréter les résultats de culture obtenus à partir de sites non stériles?
Connaître la flore normale de ces sites pour porter attention aux bactéries ne faisant pas partie de cette flore ou qui sont connus pour causer des infections.
Nommer deux méthodes de diagnostic rapide.
Détection rapide d’antigènes
Méthode moléculaire (amplification et détection, soit PCR)
Qu’est-ce que la sérologie?
La détection de la présence d’anticorps spécifiques produits par le patient colonisé ou infecté par un germe.
Pour quelle maladie est-il plus utile d’utiliser la sérologie comme méthode de détection?
VIH Hépatite A, B, C Rougeole Rubéole Varicelle
Quels sont les 2 types d’anticorps recherchés en sérologie?
IgM (actuel ou récent)
IgG (après)
Comment se nomme le passage des IgG de négatif à positif?
Séroconversion
