Microbio 2 Flashcards
Entre la cellule procaryote et eucaryote, laquelle a un noyau?
Eucaryote
Est-ce qu’une bactérie est procaryote ou eucaryote?
Procaryote
Que comprend le domaine des BACTERIA?
Tous les procaryotes pathogènes, beaucoup de procaryotes non pathogènes présents dans le sol et dans l’eau ainsi que des procaryotes capables de photosynthèse
Si on dit Staphyloccocus aureus (en italique), qu’est-ce qui est le genre et l’espèce?
Staphyloccocus –> genre (toujours avec une majuscule, toujours un nom)
aureus –> espèce (minuscule, généralement un adjectif)
Qu’est-ce qu’une souche?
C’est un ensemble de cellules filles descendant toutes d’une même cellule mère.
Quelle est la différence entre les critères génotypiques et phénotypiques?
Génotypiques: désignent les caractéristiques génétiques des microbes
Phénotypiques: désignent les attributs découlant des critères génotypiques, qu’ils soient de nature morphologique, biochimique, physiologique
V/F: En pratique clinique, les techniques développées visent surtout la classification des microorganismes.
Faux, ils visent plutôt l’identification des microorganismes, soit la capacité de détecter quel microbe précis a causé l’infection chez un patient.
Que regroupe le terme microorganisme (ou microbe)?
Les bactéries, les virus, les mycètes (champignons) et les protozoaires (parasites)
Donnez quelques caractéristiques des microbes.
Organismes de très petite taille (besoin d’un microscope)
Omniprésence et abondance dans la nature
Unicellulaires (les mycètes incluent des unicellulaires et des pluricellulaires)
Niveau d’organisation relativement simple
Inclut des procaryotes et des eucaryotes
Disposent d’un potentiel métabolique (sauf les virus)
Capables de se reproduire de façon autonome (sauf les virus).
V/F: Les virus sont considérés vivants.
Faux, ils n’appartiennent à aucun des trois domaines ni des règnes. Ce sont des agents infectieux acellulaires, considérés non vivants.
V/F: Tous les microorganismes présentent une organisation dite cellulaire, à l’exception des virus.
Vrai.
V/F: Les procaryotes peuvent être soit unicellulaires ou pluricellulaires.
Faux, ils sont toujours unicellulaires.
Comment les virus se distinguent des eucaryotes et des procaryotes?
- Absence d’organisation cellulaire
- Absence de capacité de reproduction autonome
- Acellulaires
- Non-vivants
V/F: Il existe beaucoup plus d’espèces de microorganismes pathogènes que d’espèces inoffensives et utiles.
Faux, c’est le contraire.
Quel est le groupe le plus abondant de tous les êtres vivants?
Microorganismes
Combien de chromosomes et de noyau ont les bactéries?
Un seul chromosome libre dans le cytoplasme
Pas de noyau (procaryote)
Est-ce que les bactéries ont des organites?
Non
Comment se répliquent les bactéries?
De manière autonome, par fission binaire
V/F: Les bactéries peuvent uniquement vivre à l’intérieur des cellules de l’hôte qu’elles infectent.
Faux, elles peuvent aussi vivre à l’extérieur.
Qu’est-ce qui caractérise les virus quant à leur réplication?
Ils ne peuvent pas se répliquer de façon autonome, ce sont des parasites obligatoires ne pouvant se développer qu’au moment où il existe une cellule-hôte qu’ils peuvent infecter.
Qu’est-ce que la capside?
Une structure protéique chez les virus qui entoure le matériel génétique.
V/F: Le génome des virus est composé d’ADN et d’ARN.
Faux, uniquement un des deux, jamais les deux en même temps.
Est-ce que les mycètes peuvent causer des infections?
Oui, surtout chez les personnes souffrant d’un déficit immunitaire.
Quelles sont les deux grandes catégories des mycètes?
Levures
Moisissures
Comment se reproduisent les levures?
Par bourgeonnement
Entre les levures et les moisissures, lesquels sont multicellulaires?
Moisissures
Dans quelles industries les mycètes sont-ils largement utilisés?
Industrie alimentaire et pharmaceutique
Qu’est-ce qui distingue l’infestation de l’infection?
Infestation: se réfère aux parasites macroscopiques (vers, poux)
Infection: pour décrire les pathologies induites par des microorganismes invisibles à l’oeil nu
Les protozoaires sont unicellulaires ou pluricellulaires? Eucaryotes ou procaryotes?
Unicellulaires
Eucaryotes
Qu’est-ce que la capsule?
C’et une enveloppe visqueuse d’épaisseur variable produite à la surface de certaines bactéries.
C’est le constituant le plus externe de la bactérie.
V/F: La capsule est indispensable à la survie des bactéries.
Faux, elle n’existe que chez certaines bactéries.
Quel est le rôle de la capsule?
Elle joue un rôle essentiel dans la VIRULENCE, en empêchant la phagocytose par les cellules immunitaires et en favorisant l’adhérence des bactéries aux cellules épithéliales de l’hôte.
De quoi est généralement composée la capsule et comment est-elle appelée?
Généralement composée de polysaccharides
La capsule est appelée “Antigène K”
Quel terme est utilisé pour désigner les diverses souches de bactéries selon les caractéristiques capsulaires?
Sérotype
Qu’est-ce que le glycocalyx?
Le glycocalyx est un feutrage extracellulaire de fibres polysaccharidiques présentes à la surface de certaines bactéries dans leur milieu naturel.
Elle est l’équivalent de la capsule, mais elle établit des interconnections entre bactéries.
Qu’est-ce que la production de glycocalyx favorise?
L’adhésion de la bactérie à des matériaux comme les prothèses, les tuyaux, etc.
V/F: La capsule et le glycocalyx ont des compositions très différentes.
Faux, elle est pratiquement la même.
Quand utilise-t-on le terme glycocalyx ou le terme capsule?
On utilise le terme glycocalyx lorsque les bactéries sont reliées entre elles dans cette matrice extracellulaire, et le terme capsule lorsque les polysaccharides demeurent confinés à des bactéries individuelles.
Qu’est-ce que la paroi et quel est son rôle?
La paroi est une enveloppe semi-rigide donnant sa forme à la bactérie (sphère, bâtonnet, spirale).
Qu’est-ce que le peptidoglycan?
Il s’agit d’un polymère qu’on ne retrouve pas dans les cellules humaines et c’est pourquoi il peut servir de cible aux antibiotiques.
Qu’est-ce qui distingue la paroi des bactéries Gram + et Gram -?
Gram+: paroi constituée en majeure partie d’un épais peptidoglycan
Gram-: couche de peptidoglycan très mince recouverte d’une seconde couche appelée enveloppe externe, laquelle contient des lipopolysaccharides (LPS) appelés endotoxine (antigène O) ainsi que des canaux appelés porines par lesquels des substances nutritives peuvent pénétrer la cellule
La péniciline est-elle plus efficace contre les Gram positif ou négatif? Pourquoi?
Gram positif, car la présence de l’enveloppe externe supplémentaire chez les Gram - rend difficile l’accès au peptidoglycan par la péniciline.
V/F: La bactérie contient de nombreux ribosomes responsables de la traduction des ARNm en protéines.
Vrai
V/F: L’ADN de la bactérie est beaucoup plus long que la bactérie elle-même, soit environ 5 fois.
Faux, environ 1000 fois plus long.
Que sont les plasmides?
De petites molécules d’ADN circulaire douées de réplication autonome et transférables d’un microbe à l’autre.
V/F: Le nombre d’espèces bactériennes hébergeant des plasmides de résistance constitue un problème médical réel.
Vrai.
Que sont les appendices externes?
Des éléments facultatifs chez les bactéries, principalement des flagelles et des pili.
Qu’est-ce que les flagelles assurent?
La mobilité de la bactérie
Donnez les 4 types de nombre/disposition des flagelles.
Monotriche : un seul flagelle à une extrémité de la cellule
Lophotriche : plusieurs flagelles à une extrémité de la cellule
Amphitriche : un ou plusieurs flagelles aux deux extrémités de la cellule
Péritriche : des flagelles répartis sur toute la surface de la cellule
À quoi sert le pili?
À fixer les bactéries plutôt qu’à les faire avancer
Certains pili, dits sexuels, servent au transfert unilatéral de matériel génétique d’une bactérie à l’autre (conjugaison)
À quoi contribue la conjugaison?
À la dissémination de gènes de résistance par le transfert de plasmides
À quoi servent les endospores?
Les endospores sont des spores intracellulaires dans lesquelles certaines bactéries stockent leurs éléments vitaux dans des situations de survie, en se débarrassant du reste.
Quand est-ce que la bactérie enclenche le processus de sporulation et de germination?
Sporulation: quand les conditions environnementales deviennent défavorables
Germination: quand les conditions redeviennent favorables et que la bactérie reprend sa forme “végétative” active
V/F: Seule la forme sporulée de la bactérie peut être pathogène, et c’est souvent sous cette forme que la bactérie est contractée dans l’environnement.
Faux, c’est vrai que c’est souvent sous sa forme sporulée que la bactérie est contractée, mais seule la forme ACTIVE peut être pathogène.
Quelle est la différence entre les spores bactériennes et les spores des mycètes?
Spores bactériennes: mode de survie
Spores des mycètes: rôle de reproduction par leur dissémination
Est-ce que les spores bactériennes peuvent servir à l’identification des espèces? Pourquoi?
Oui, car le volume, la forme et la localisation de la spore bactérienne à l’intérieur de la bactérie sont des caractéristiques constantes pour une espèce donnée
Sur quoi repose la classification des bactéries?
Sur l’étude de caractères génotypiques et phénotypiques
Quelles sont les deux caractéristiques morphologiques lorsqu’on parle d’approches phénotypiques pour classer les bactéries?
- Morphologie bactérienne (taille, forme, arrangement spacial, autres composantes structurales comme la présence de flagelles, d’endospore, …)
- Morphologie coloniale (forme, élévation, bordure, surface, …)
Qu’est-ce que la coloration simple?
On emploie une solution aqueuse ou alcoolisée d’un seul colorant basique, le but étant de faire ressortir les cellules en entier.
Qu’est-ce que le mordant dans la coloration simple?
Un agent chimique utilisé pour intensifier la coloration
Quels sont les colorants simples les plus souvent utilisés?
Bleu de méthylène, fuchsine basique, violet de cristal, safranine
Qu’est-ce que la coloration différentielle?
C’est la coloration de Gram, qui permet de diviser les bactéries en deux grands groupes.
Expliquez le processus de coloration différentielle.
- Coloration primaire d’un frottis avec du CRISTAL-VIOLET, que toutes les bactéries absorbent, surtout en y ajoutant de l’IODE comme mordant –> bactéries deviennent violettes
- Lavage avec solution d’ÉTHANOL ou d’ACÉTONE –> décoloration de certaines espèces seulement, qui deviennent transparentes
- Utilisation de “contre-colorant”, la SAFRANINE, de couleur rosée –> seules les bactéries devenues transparentes l’absorbent
Bactéries Gram + : violettes
Bactéries Gram - : roses
Pourquoi les bactéries réagissent différemment lors du test de coloration de Gram?
Pour des raisons liées à la structure de leur paroi cellulaire.
Selon sa composition, celle-ci retient ou laisse échapper le mélange cristal-violet
Pourquoi la coloration de Gram a une grande utilité en microbiologie médicale?
Pour la sélection des antibiotiques à administrer, car ceux-ci dépendent en partie de la composition de la paroi bactérienne pour leur efficacité.
Quand utilise-t-on la coloration de Ziehl-Neelsen au lieu de la coloration de Gram?
Quand des bactéries, soit les mycobactéries, réagissent mal à la coloration de Gram, en raison de la composition cireuse de leur paroi.
Quel colorant primaire et contre-colorant est utilisé dans la coloration de Ziehl-Neelsen?
Colorant primaire: rouge (fuchsine basique)
Contre-colorant: bleu (bleu de méthylène)
–> mycobactéries demeurent rouges, car la fuchsine s’intègre aux lipides de leur paroi
Quelle est la façon de mettre la capsule en évidence?
Mélanger les bactéries qui en produisent à une suspension colloïdale d’encre de Chine. La capsule apparaît translucide autour de bactéries noires, d’où l’expression de coloration négative de la capsule.
Quels genres de bactéries à Gram positif sporulent?
Bacillus
Clostridium
Avec quoi colorer les endospores?
Colorant: vert de malachite
Contre-colorant: safranine
–> bactéries sporulées apparaissent rose avec une spore verte
Quel colorant est utilisé pour colorer les flagelles?
Fuchsine (rouge)
Quel type de microscopie est utilisé de façon courante en laboratoire?
Microscopie à fond clair –> le spécimen apparait foncé sur un fond lumineux brillant
À quoi sert la microscopie à fond noir?
À ce qu’on puisse voir un spécimen non coloré apparaitre clair sur un fond noir sans lumière
À observer des microbes vivants en suspension
Que permet la microscopie à contraste de phase?
À augmenter le contraste entre des structures d’épaisseurs variées qui ne sont pas visibles avec un microscope à fond clair
Pourquoi la microscopie à contraste de phase est-elle particulièrement utile?
Elle permet d’examiner en détail les structures internes de microorganismes vivants sans les déformer.
Qu’est-ce qui est particulier avec la microscopie à inversion?
Les objectifs approchent le spécimen par en-dessous, alors que la source lumineuse éclaire par le haut.
Qu’est-ce que l’immunofluorescence?
La microscopie à fluorescence fait usage de colorants appelés marqueurs fluorochromes qui s’attachent aux composantes structurales que l’on veut détecter. En fait, le plus souvent, le marqueur est couplé à un anticorps qui reconnaît spécifiquement la structure recherchée. On parle alors d’immunofluorescence.
V/F: La microscopie confocale fait usage de fluorochromes ainsi que de lasers qui traversent par plans successifs très étroits les échantillons à observer, procurant des images d’une clarté 40% supérieure à tout autre type de microscope optique.
Vrai.
V/F: Avec la microscopie confocale, des plaques de cultures cellulaires vivantes peuvent être filmées sur plusieurs jours pour suivre l’évolution d’un phénomène.
Vrai.
Quel est l’avantage de la microscopie électronique?
Pouvoir grossir beaucoup le spécimen à observer (utile pour les virus)
Que permet le microscope à force atomique?
À visualiser la topographie de la surface d’un échantillon
V/F: Le microscope à force atomique (AFM) donne une image bidimensionelle du matériau analysé.
Faux, image tridimensionnelle.
V/F: Le microscope électronique est beaucoup plus puissant que le microscope à force atomique.
Faux, c’est le contraire.
Quand est-ce que les épreuves biochimiques sont utilisées?
Pour identifier les bactéries une fois leur croissance en culture pure
Comment fonctionne en général le système API?
Des substrats déshydratés sont incorporés dans des languettes multi-puits.
L’addition de gouttes d’échantillon bactérien dans les puits, suivie d’une incubation de 4 à 24 heures, permet aux enzymes bactériens de réagir, en sorte de produire des couleurs finales caractéristiques d’une espèce particulière.
Que fait la technologie Micro-Scan?
Elle effectue des tests dans des microplaques de 96 puits contenant divers réactifs colorimétriques dont l’analyse automatisée est accomplie par ordinateur. Pour chaque rangée de tests, un pointage est attribué selon que la réponse est positive ou négative. Le cumul du pointage donne un résultat final à 8 chiffres qui correspond à une seule espèce bactérienne possible.
Pourquoi les tests sérologiques, comme le test d’agglutination sur lame, sont plus précis que les tests biochimiques?
Ils permettent de distinguer différentes souches d’une même espèce. Ces variantes s’appellent des “sérotypes”.
Comment fonctionne le test d’agglutination sur lame?
On ajoute un antisérum différent à chaque lame contenant une bactérie inconnue. Les bactéries s’agglutinent et forment des grumeaux lorsqu’elles correspondent aux anticorps d’un antisérum particulier, on peut donc savoir à quel sérotype on a affaire.
Que permet la méthode ELISA?
- Rechercher un antigène microbien dans un échantillon clinique donné
- Rechercher des anticorps qui ont été formés contre cet antigène
–> visualiser une combinaison antigène-anticorps
Que permet l’appareil Revogene commercialisé par GenePOC?
Il permet de rechercher la présence simultanée de plusieurs microbes potentiels dans un spécimen.
C’est un appareil de diagnostic rapide basé sur l’ADN.
Quel est un des buts des techniques de séquençage de l’ADN bactérien à haut débit?
Identifier, pour chaque espèce, des sections d’ADN qui lui sont propres, afin de développer des sondes capables de reconnaître précisément ces sections, et d’ainsi détecter la présence d’un microbe particulier dans un échantillon.
Quand devient-il possible de construire les outils génétiques capables de détecter une espèce dans un échantillon?
Quand une séquence génétique particulière a été identifiée dans une espèce bactérienne
Que sont les sondes génétiques?
De courts segments d’ADN complémentaires à la séquence présente chez le microbe, ce qui permet de détecter la bactérie recherchée.
