Les virus des bacteria et des archées Flashcards
Importance industrielle et médicale
1-Importance industrielle: Virus qui attaquent les germes responsables de la fermentation lactique dans l’industrie du lait fermenté. 2-Importance médicale: virus qui augmentent la virulence de souches bactériennes a) Streptococcus pyogenes Staphylococcus aureus Corynébacterium diphteriae Vibrio cholerae E. Coli 0157:H7 Salmonelle enteritica
b) Traitement de maladies bactériennes par des virus y compris les bactéries antibiorésistantes
I- La classification des virus de bactéries et d’archées
- Comité international de Taxonomie des virus (CITV). Près de 2000 espèces classifiées comme étant des virus de bactéries et d’eucaryotes.
- Pour les archées: on a identifié 40.
- Mais tout cela est en train de changer avec la meilleure connaissance des Archaea
17. 1
Croissance d’un virus archéen en absence d’hôte
- Virus sont des entités ou formes acellulaires car ne peuvent se x sans infecter une cellule hôte. Ce ne sont pas des cellules.
- Virus bi-caudal d’Acidianus two tailed virus (ATV): qui infecte une bactérie hyperthermophile Acidianus comvivator (pH: 1,5, 85-93oC) dans des sources acides chaudes en Italie. En forme de citron. Développent des queues uniquement quand elles sont à l’extérieur en présence de forte température. Straégie de survie.
Les phages virulents à ADN à double brin
1- Expérience du cycle unique (fig.17.2 et 17.3)
2- Adsorption et pénétration
3- Assemblage des particules de phages
4- Libération des particules de phage
La courbe de cycle unique
- 2
- phase éclipse- partie initiale de la période de latence, cellule hôte ne contient aucun vision complet infectieux
- le reste du phase de latence les virus sont présent mais ne sont pas relâchés
- phase de latence termine lorsque la cellule lyse et les virions sont relâchés
Cycle infectieux du phage T4
17.3
Adsorption et injection de l’ADN du phage T4
17.4
Fixation et pénétration du phage PRD1 dans la cellule hôte
17.5
tégie de réplication utilisée par les virus à ADNdb
17.6
5-OH méthyl cytosine
17.7
Permet de distinguer l’ADN virale de l’ADN de l’hôte
-remplace cytosine dans T4,
-glycosylé avec glucose pour le protégé contre endonucléases
Assemblage de bactériophages
17.8
Liberation des phages par lyse cellulaire
-Libération du phage après accumulation de 150 particules.
Participation de 2 protéines:
- Lysozyme de T4: attaque le peptidoglycane de la paroi de la cellule
-Holine: crée des trous dans la membrane et permet au lysozyme de se déplacer vers la paroi et de l’attaquer
III- Les phages à ADN à simple brin
- Attachement à l’extérieur. Capside à l’extérieur.
- ADN sb injecté.
- ADN + doit être converti en double brin: forme réplicative (FR) grâce à une ADN polymérase bactérienne.
- Libération non pas par une enzyme (Lysozyme) comme avec T4, ici, le virus libère produit une enzyme E qui bloque la synthèse de peptidoglycane en inhibant l’activité d’une protéine MraY qui catalyse le transfert des précurseurs de muréines aux transporteurs lipidiques (fig.10.12).
- PG bloqué, fragilisation et donc lyse cellulaire.
17. 9
Phage fd
- ADN sb positif et circulaire
- Infecte les cellules F+, Hfr, F’ de E. coli.
- Le virus s’attache au pilus. L’ADN est injecté le long ou à travers le pilus sexuel.
- Synthèse du FR de l’ADN puis transcription comme avec le précédent.
- Une des protéines virales aide à la réplication de l’ADN du phage (cercle roulant).
- Différence avec les précédents: fd et les phages filamenteux ne tuent pas les cellules hôtes. Les nouveaux virions sont libérés de manière progressive par un processus sécrétoire.
processus sécrétoire
La cellule ne meurt pas, mais il va être plus fragile
IV- Les phages à ARN
-ARN sb: MS2 et Qbéta (Leviviridae).
-Icosaèdres sans queue, ARN+
-Se fixent sur le côté du pilus F de E. coli. Seul le génome rentre et agit comme un ARNm pour diriger les synthèses du phages:
- ARN réplicase (ARN
polymérase ARN dépendante)
17.10
Libération de MS2 et Qbéta
-Libération par lyse
Qbéta produit une protéine inhibitrice de la MuA (synthèse d’un précurseur de la synthèse de PG).
Phages à ARN à double brin (ARN db) de Pseudomonas syringae
-Très particulier:
-A une membrane
-A une ARN polymérase ARN
dépendante et 3 fragments
d’ARNdb
-Pénétration par endocytose de la nucléocapside dirigée par des protéines virales.
-Via un pilus qui s’attache à une
prot de sa memb
-Un prot digère PG pour laisser
entrer la nucléocapside
-L’ARN polymérase viral agira
-comme une transcriptase pour
former des ARNm à partir de
l’ARNdb viral.
-comme une réplicase pour
synthétiser des ARN+
-La nucléocapside s’entoure de son enveloppe (membrane cytoplasmique) dans le cytoplasme et non en sortant.
Phages tempérés
vit dans l’hôte sans le tuer (intègrent leur ADN)
Lysogénie
relation entre un phage tempéré et la cellule hôte
Prophage
forme de virus qui reste intégré dans l’ADN de l’hôte (time bomb(
Bactérie lysogène
Héberge un ADN viral dans son génome (a un prophage)
-peut avoir des caractères spéciales- conversion lysogénique
État de surinfection
immunité contre la surinfection contre un même phage
-un bactérie lysogène ne peut pas être reinfecté par le même virus
Induction
conditions qui initient le processus du cycle lytique
Conversion lysogénique
résultat de la lysogénie. La phage induit des changements phénotypiques chez l’hôte et altère les caractéristiques antagoniques de l’hôte donc peut augmenter son pouvoir pathogène
- salmonella avec phage epsilon
- corynebactérium avec phage bêta
Pourquoi la lysogénie?
Avantages:
- Permet au virus de rester viable dans une celle dormante (carence alimentaire)
- En cas d’excès de virus par rapport aux cellules hôtes
- Comment faire le choix entre
- la lysogénie: intervention de gènes cI
- le cycle lytique: intervention de gènes Cro
Cascade de réactions conduisant à la lysogénie ou au cycle lytique
-Deux protéines régulatrices en compétition.
-L’un peut l’emporter sur l’autre.
1- Répresseur de lambda (produit du gène cI)
- favorise la lysogénie.
- empêche la transcription de gènes viraux
- Cro est inhibé
2- Protéine Cro (produit du gène Cro): inhibe cI.
- favorise le cycle lytique (expression de gènes viraux)
Voie lytique vs lysogénie
17.11
Intégration et excision du phage lamda
- 12
- après la circularisation
a) le site pp s’aligne sur le séquence bactérien
b) le chromosome virale s’intègre entre les opérons gal et bio pour former le prophage
c) le chromosome circulaire de lambda peut être restaurer en faisant les étapes à l’envers
