Les mycoses Flashcards
Faites la différence entre les micromycètes et les macromycètes.
- Micromycètes: levures et moisissures (microscopique)
- Macromycètes: sporophores/condiophores visibles (macroscopique)
Donnez les caractéristiques de champignons/mycètes/fungi.
- Organismes eucaryotes
- Sans chlorophylle
- Porteurs de spore
- Nutrition par absorption et utilisent le carbone organique (Hétérotrophes)
- Reproduction asexuée souvent, rarement sexuée
- Leur paroi cellulaire contient typiquement de la chitine et des glucanes
- Elles sont pour la plupart saprophytiques; moins de 0,5 % sont reconnus pathogènes
Quelle est la définition des mycoses?
Infections fongiques touchant les animaux incluant l’Homme.
V/F: Les mycoses peuvent uniquement être superficielles ou profondes.
Faux, elles peuvent aussi être systémiques.
Qu’est-ce que la mycologie médicale?
Une discipline distincte de la microbiologie médicale qui consiste à isoler et à caractériser des champignons pathogènes dans le but de caractériser l’origine mycologique ou non d’une pathologie
Dans l’histoire de la mycologie médicale, qui avait identifié des sujets atteints du muguet (Candida albicans) il y a longtemps?
Hippocrates
V/F: La 2e guerre mondiale a mené à l’apparition de zones endémiques aux USA.
Vrai.
Le 20e siècle est considéré comme l’ère de la suppression immunitaire et des mycoses opportunistes nocosomiales. Donnez des exemples.
- Chimiothérapie (traitement du cancer)
- Maintenance des greffons (immunosuppression)
- VIH/SIDA (1981-)
- Maladies auto-immunitaires (arthrite, psoriasis, sclérose en plaques, …)
Quelle époque est considérée comme “l’âge d’or de la mycologie médicale”? Pourquoi?
- 21e siècle
- Développement des tests de diagnostiques
- Développement d’antifongiques
- Avancées dans la compréhension du pouvoir pathogène fongique
Pendant le 21e siècle, quels sont les tests diagnostiques qui ont été développés dans la mycologie médicale?
- Tests de mise en culture spécifiques
- Tests de susceptibilité aux agents antimicrobiens
- Identification moléculaire (séquençage de gènes ou de séquences d’ADN: ADN ribosomal et ITS)
Quels 2 antifongiques ont été développés pendant le 21e siècle?
Azoles et échinocandines
Nommez deux exemples d’avancées dans la compréhension du pouvoir pathogène fongique au 21e siècle.
- Fungal Genome Initiative: séquençage de plusieurs génomes de champignons pathogènes de l’Homme.
- Génomique fonctionnelle fongique: Analyse de transcriptomes, de proteomes, secrétomes …
Selon quels 3 critères sont classés les pathogènes fongiques?
- Critères morphologiques
- Taxonomie et phylogénie
- Manifestations cliniques (sites d’infection)
La classification morphologique se base sur la forme de la croissance végétative. Quels 3 types de morphologiques peut-on distinguer?
- Levures: forme levuriforme
- Moississures: champignons filamenteux
- Champignons dimorphiques: différencient à la fois des filaments et des levures
Quelle est la forme la plus simple des champignons?
Levures
Comment se multiplient les levures?
Par bourgeonnement ou par fission
Par quoi sont désignées les levures pathogènes pour les humains?
Blastoconidies
Comment les cellules filamenteuses et cylindrique souvent branchées sont nommées?
Hyphes
Comment appelle-t-on une masse de hyphes?
Mycélium?
Donnez un exemple de hyphe avec septum et une autre sans.
- Avec septum: aspergillus
- Sans septum: mucor
Quelle est la morphologie des pseudohyphes?
Morphologie associée aux levures et distincte de la forme levure et la forme hyphale
Cellules levuriformes allongées et attachées (en forme de collier)
Qu’est-ce que le dimorphisme? EXAM
Une caractéristique qui fait que le champignon est filamenteux à 25 degrés (dans l’environnement/sol) et sous forme de levure à 37 degrés (température corporelle)
Bref, un champignon filamenteux dans la nature et sous forme de levure chez l’homme
Nommez deux champignons dimorphiques qui sont pathogènes.
Blastomyces et Histoplasma
V/F: La morphogenèse (changement morphologique) est une caractéristique d’identification des champignons dimorphiques au laboratoire.
Vrai.
De quoi dépend la classification taxonomique actuelle?
Dépend de la présence/absence de reproduction sexuée (méiose) et des caractères morphologiques (présence de septum, cycle de vie et physiologie)
Qu’est-ce que la phylogénie?
L’étude des relations de parenté entre les êtres vivants
Sur quoi est basée la phylogénie moléculaire/génétique?
Sur la ressemblance des séquences d’ADN des champignons
Pourquoi la classification taxonomique est-elle importante pour un clinicien micobiologiste?
- Susceptibilité aux agents antifongiques
- Pouvoir pathogène et transmissibilité
Établissez les possibilités de classification taxonomique d’un champignon (voir diapos).
-Règne: fungi
-Sous-règne: dikarya si un seul noyau
-Division: dikarya en ascomycètes ou basidiomycètes. Si pas dikarya, glomeromycota
-Ordre: glomeromycota se divise en mucorale ou entomophtorale
Ensuite, il y a le genre (Candida, Aspergillus, Mucor,…)
Donnez les caractéristiques des ascomycètes.
- Représentent 75% des champignons connus
- Levures ou filamenteux
- Reproduction sexuée (ascospores) ou asexuée par bourgeonnement
(blastospores/levures) ou par production de spores (conidies)
Comment les ascomycètes sont-ils identifiés au laboratoire?
Identifiés aux laboratoires cliniques par leurs PROPAGULES ou par tests génétiques dans le cas d’espèces qui ont une croissance lente ou inexistante.
Nommez des exemples d’ascomycètes.
Candida albicans, Aspergillus fumigatus, Penicillium, Histoplasma, Blastomyces, …
Donnez les caractéristiques des basidiomycètes.
- Reproduction sexuée par formation des basidiospores (basidium) ou des conidies.
- Apparences: levures, filaments, capsules.
Nommez des exemples de basidiomycètes.
Cryptococcus neoformans, C. gattii, Schisophyllum commune, Trichosporon, Malassezia pachydermatis
Donnez les caractéristiques des mucorales.
- Forme primitive des champignons
- Cellules coenocytiques
- Formation de zygospores
Nommez des exemples de mucorales.
Mucor spp, Rhizopus, Lichtheimia, Apophysomyce
La classification des champignons est basée entre autres sur les sites d’infections primaires. Nommez ce qu’ils peuvent être. (5)
- Mycoses superficielles
- Mycoses cutanées
- Infections opportunistes systémiques
- Mycoses sous-cutanées
- Mycoses endémiques
Par quoi sont causées les mycoses superficielles?
Malassezia
V/F: Les mycoses superficielles sont majoritairement des problèmes cosmétiques.
Vrai.
Qu’est-ce que tinea versicolor?
Infection de la couche supérieure morte kératinisée de l’épiderme
Quelles parties du corps touchent les mycoses cutanées?
Peau, cheveux, ongles
Quels champignons causent les mycoses cutanées?
Les dermatophytes
- Trichophyton tonsurans > T. rubrum > T. interdigitale > Microsporum canis
Que sont les mycoses opportunistes systémiques?
- Infections de tous les organes par des champignons environnementaux (Aspergillus fumigatus), ou des endosymbiontes commensaux/Mycobiota (Candida albicans)
Les mycoses opportunistes systémiques touchent des patients dont le système immunitaire est compromis. Donnez des exemples.
- Porteurs de VIH
- Patients immunosupprimés: transplantation d’organes, Chimiothérapies …
- Nouveaux nés, femmes enceintes, …
V/F: Les mycoses opportunistes systémiques touchent uniquement des patients dont le système immunitaire est compromis.
Faux, touche aussi des personnes saines dans le cas de champignons dimorphiques.
Que sont les mycoses sous-cutanées? EXAM
- Mycoses d’implantations (suite à des piqûres ou des traumatismes transcutanés)
Par quoi sont causées les mycoses sous-cutanées?
Par des champignons mélanisés
Nommez des exemple de champignons causant des mycoses sous-cutanées.
Sporothrix schenckii et Madurella mycetomatis
Par quoi est causée une mycose endémique?
Par des champignons ayant une répartition géographique restreinte.
Que causent majoritairement les mycoses endémiques?
Causant majoritairement des infections pulmonaires qui peuvent évoluer en infections systémiques.
Donnez des exemples de mycoses endémiques.
- Histoplasmose: Histoplasma capsultum (USA centrale-River valleys)
- Blastomycoses: Blastomyces dermatitidis (même répartition que H. capsulatum mais aussi Canada-Québec)
- Coccidiomycose: Coccidioides immitis, C. posadasii (Californie et Arizona)
- Paracocciodomycoses: Paracoccidioides brasiliensis (Brésil et Colombie)
- Peniciliose: Penicillium marneffei (Asie sud-est)
- Sporotrichose: Sporothrix schenckii (plusieurs régions du monde)
- Cryptococcus gatii (Côtes ouest USA et Canada)
Quelles sont les caractéristiques cellulaires de la levure?
- Noyau avec membrane nucléaire
- Cytoplasme
- Mitochondrie
- Vacuole
- Réseau de transport vésiculaire : Réticulum endoplasmique et Golgi
- Membrane plasmique
- Paroi cellulaire
Quelles sont les caractéristiques cellulaire de l’hyphe? (voir image)
1- Septum avec le pore septal 2- Corps de Voronine (Woronin body) 3- Noyau avec nucléole 4- Réticulum endoplasmique 5- Mitochondrie 6- Membrane plasmique 7-Paroi cellulaire avec 3 couches: Interne (chitine), intermédiaire (glucane) et externe (mannane) 8- Vacuole 9- Golgi 10- Spitzenkorper
Comment est aussi nommé l’érgosterol, présent sur la membrane plasmique de la cellule fongique? Qu’est-ce que c’est?
- Le cholestérol fongique
- C’est un stérol spécifique des champignons et de certains protozoaires et absent chez les cellules animales
À quoi contribue l’érgosterol?
À la régulation de la fluidité de la cellule fongique
Nommez les 3 couches de la paroi cellulaire et leurs composantes.
- Couche externe: mannanes et protéines pariétales (bcp de protéines importantes pour la virulence du champignon dans cette couche)
- Couche intermédiaire: glucane
- Couche interne: chitine
V/F: Il y a présence de mélanine sur la paroi cellulaire certains champignons filamenteux.
Vrai.
Caractérisez la chitine, présente dans la couche interne de la paroi cellulaire.
2% et 6% de la masse de la paroi des levures et champignons filamenteux
Microfibres insoluble du poly ß-(1→ 4)-N -acetylglucosamine polymère associés aux glucanes.
Quel pourcentage de la masse de la paroi cellulaire les glucanes représentent-elles?
58–60% de la masse de la paroi
Caractérisez les mannanes, présentes sur la couche externe de la paroi cellulaire.
Hémi-cellulose
Composants majeurs des protéines pariétales (38–40% de la masse de la paroi)
Les mannanes sont un antigène majeur de quel champignon?
Candida albicans
Quelle sont les 2 fonctions des protéines pariétales sur la couche externe de la paroi cellulaire (protéines GPI)?
- Adhésines (attachement à l’hôte) –> virulence
- Biogenèse de la paroi
Quel type de champignon est responsable du plus haut taux de mortalité?
Candida
Quels peuvent être les effets de Aspergillus sp?
- Aspergillomes pulmonaire et cérébrale
- Aspergilloses pulmonaires chroniques
- Infections superficielles : Sinus, otomycose (oreille), onychomycosis (ongles)
- Allergies
Quel champignon cause des lésions cérébrales et pulmonaires et des méningites tant chez les sujets sains que chez les sujets immunosupprimés?
Cryptococcus gattii
Que cause Blastomyces dermatitidis?
- Infection fatale
- Infections pulmonaires, lésions dermiques et ostéomyélite
Quels champignons causent des infections pulmonaires et un enflement des ganglions lymphatiques?
Paracoccidioides sp
Quel type de Candida sp est responsable d’environ 95% des cas d’infections causées par ce genre de champignon?
Candida albicans
Quelle forme a Candida albicans lorsqu’il est invasif et lorsqu’il ne l’est pas?
- Invasif: filamenteux
- Pas invasif: levure
- *donc pas exactement comme la définition de dimorphique**
Quelle est la 4ème maladie nocosomiale la plus commune? Elle est une cause fréquente de morbidité et de mortalité chez qui?
- Candidose à Candida albicans
- Cause fréquente de morbidité et de mortalité chez les patients immunosupprimés
À quoi la virulence de Candida albicans est-elle associée?
-Associée à son dimorphisme: hyphes (filamenteux) dédiés à l’invasion et la colonisation des organes et levures associées à la dissémination de C. albicans.
Qu’est-ce que la forme commensale de Candida albicans et où est-elle retrouvée?
C’est une forme opportuniste qui entre en forme commensale (GUT) et qui peut infecter quand les défenses s’abaissent
Comment diagnostiquer les mycoses?
- Caractéristiques morphologiques : Apparence en milieu de culture
- Examen microscopique: Patho-histologie
- Diagnostique moléculaire: ADN, PCR, séquençage
- Diagnostique sérologique: Anticorps
Quelles sont les 3 thérapies antifongiques possibles?
- Chimique
- Immuno-modulation: vaccination
- Immunothérapie (stimulation des défenses immunitaires contre les pathogènes fongiques)
Quelles sont les trois grandes classes de molécules utilisées dans la thérapie antifongique chimique?
- Azoles
- Échinochandines
- Polyènes
Quels sont les antifongiques les plus utilisés?
Azoles (fongistatiques)
Contre quoi sont utilisés les azoles?
Contre des infections systémiques et superficielles
Quelles sont les différentes sous-classes d’azoles?
- 1,2,3-Triazoles (Fluconazoles, itraconazole)
- Imidazole (ketoconazole, Clotrimazole)
Pourquoi est utilisé le clotrimazole?
Infections vaginales
Quel azole est le plus utilisé en clinique?
Fluconazole
Quelles sont les 2 cibles des azoles?
- Cible CELLULAIRE: membrane plasmique
- Cible MOLÉCULAIRE: azoles inhibent la biosynthèse de l’ergostérol
Pourquoi l’ergostérol est une bonne cible pour l’azole et quelle conséquence cellulaire l’inhibition de la biosynthèse d’ergostérol aura-t-elle?
- Bonne cible prcq pas le même cholestérol que l’humain (on va s’attaquer aux bonnes cellules)
- Fragilise la membrane du fungi
Comment sont administrés les échinocandines (fongidides) et contre quoi sont-ils utilisés?
- Administration IV
- Utilisés contre des infections systémiques graves
Nommez différentes molécules d’échinocandines.
- Caspofungin (Cancidas-Merck): Contre C. albicans, Aspergillus
- Micafungin (Mycamine, Astellas Pharma): Contre C. albicans
- Anidulafungin (Eraxis, Pfizer): Contre C. albicans
Quelles sont les 2 cibles des échinocandines?
- Cible cellulaire: Paroi cellulaire
- Cible moléculaire: Inhibent la biosynthèse des
glucanes.
Que sont les glucanes et que se passera-t-il si on inhibe la synthèse des glucanes?
- Enzymes responsables de la biosynthèse de la paroi
- Si on inhibe la synthèse de glucanes, alors on prive le champignon de sa paroi cellulaire
Que sont les polyènes - amphotéricine B?
Antifongiques administrés par intraveineuse ou par voie orale.
Ils sont concentration dépendante (fongistatiques/fongicides)
Quelle est la différence entre un fongistatique et un fongicide?
- Fongistatique: se contente de limiter les champignons ou d’empêcher leur croissance
- Fongicide: agent toxique qui tue les champignons
V/F: Les polyènes sont toxiques, mais la formulation sous forme de liposome (AmBisome) réduit sa toxicité.
Vrai.
Le spectre antifongique des polyènes est large. Nommez quelques champignons sur lesquels ils peuvent agir.
- Aspergillus fumigatus
- Candida albicsans, C. glabrata, C. krusei, C. lusitaniae
- Cryptococcus neoformans
- Fusarium oxysporum
Quelles sont les 2 cibles des polyènes?
- Cible cellulaire: membrane plasmique
- Cible moléculaire: Les polyènes inhibent la biosynthèse
de l’Ergosterol et forment des pores qui fragilisent la membrane
V/F: Il y a une perte d’efficacité des thérapies antifongiques dans certaines niches acides (vagin et abcès).
Vrai.
Pourquoi la nature fongistatique de certaines molécules, comme les azoles, est une limite des thérapies antifongiques?
Car ça occasionne un problème de récurrence et de résistance –> si on ne tue pas le champignon, on lui donne une chance de développer de la résistance.
V/F: Les échinochandines sont insolubles, ce qui est une limite des thérapies antifongiques.
Vrai.
Nommez des exemples de champignons qui ne sont pas sensibles aux antifongiques.
Candida krusei et C. auris (à tout), C. glabrata (azoles)
V/F: Le biofilm constitue une résistance naturelle aux antifongiques.
Vrai.
Quelles sont les résistances cliniques aux antifongiques?
- Altération de la cible (modifications génétiques)
- Altération de transport
- Aneuploïdies (perte ou gain d’un chromosome/fragment de chromosome)
