Lemay Ch14

Question 1

Qu’est-ce que la permissivité cellulaire?

Answer 1

la capacité d’une cellule à permettre la multiplication d’un virus donné avec la production de nouvelles particules virales infectieuses

Question 2

Quel “problème” au niveau de la fixation et de l’entrée du virus peut-il rendre une cellule non permissive?

Answer 2

Lorsque la cellule est dépourvue du récepteur adéquat, elle est même “non susceptible”

Question 3

Quel “problèmes” au niveau de la décapsidation du virus peut-il rendre une cellule non permissive? (2)

Answer 3

1. Exemple classique des Réoviridae: pénétration par endocytose, mais que les étapes suivantes de décapsidation ne puissent être effectuer normalement
2. Exemple de certains virus enveloppés nécessitant un clivage protéolytique nécessaire à la fusion, dû, par exemple, à l’absence des enzymes protéolytiques cellulaire appropriées.

Question 4

Quel “problème” au niveau de la transcription du virus peut-il rendre une cellule non permissive?

Answer 4

1. Non reconnaissance des séquences par l’ARN polymérase en tant que telle
2. Absence de facteurs de transcription qui ne sont pas présents dans tous les types cellulaire: rétrovirus dans les cellules embryonnaires.

Question 5

Quel “problème” au niveau de la réplication du génome du virus peut-il rendre une cellule non permissive? (4)

Answer 5

1. Blocage en phase précoce avec transformation cellulaire dans le cas de l’infection de cellules murines par les Papovavirus simiens et vice versa.
2. BLocage en cycline T pour la réplication du virus d’immunodéficience humaine
3. Le blocage de l’intégration du génome viral (provirus) au génome cellulaire dans des cellules en arrêt de division.
4. Certains gènes cellulaires, souvent dérivés de séquences virales intégrées sous forme dites “endogènes”, peuvent aussi bloquer l’intégration de manière spécifique à certains virus.

Question 6

Quel “problème” au niveau de l’assemblage du virus peut-il rendre une cellule non permissive?

Answer 6

Virus VIH: qui ne peut s’assembler correctement dans les cellules murines car certains facteurs cellulaires pourraient être absents.

Question 7

Quel “problème” au niveau de la maturation finale du virus peut-il rendre une cellule non permissive?

Answer 7

Virus influenza qi nécessite le clivage de sa glycoprotéine d’enveloppe pour la rendre fonctionnelle lorsque produit dans des cellules qui ne possèdent pas l’enzyme protéolytique appropriée.

Question 8

Qu’est-ce que la persistance virale au niveau de l’interaction virus-cellule, mise en évidence en culture cellulaire?

Answer 8

Production de manière permanente, sans que ne soient lysées les cellules, de virus par certaines lignées cellulaires suite à ;leur infection par réovirus. La production virale demeure plus limitée que lors d’une infection “aigu”.

Question 9

Comment se nomme le virus relâché des cellules à infection persistante?

Answer 9

Virus p. i. (Persistant Infection)

Question 10

Comment est-ce que la coévolution virus-cellules est démontrée suite à la guérison d’une infection persistante?

Answer 10

Les cellules guéries sont résistantes à l’infection par un virus de type sauvage, mais sont sensible au virus p.i.
Les cellules de la lignées originale avant infection sont sensibles au deux virus.

Question 11

À quoi est dû l’acquisition de résistance chez les cellules guéries?

Answer 11

Réside dans le fait que ces cellules ont évolué de manière à exprimer de plus bas taux des enzymes responsables de la décapsidation des réovirus (cathepsines des lysosomes).

Question 12

Chez quel groupe de virus est-ce que les ARN messagers sont généralement polycistroniques et portent des séquences de fixation aux ribosomes similaires à celles des ARN messagers bactériens?

Answer 12

Les bactériophages

Question 13

Chez quel groupe de virus est-ce que les ARN messager ont la structure coiffe permettant leur fixation aux ribosomes par son interaction avec des protéines cellulaires jouant le rôle de facteurs d’initiation?

Answer 13

Les virus des eucaryotes

Question 14

Comment se dote de coiffe les ARN messagers des virus à réplication nucléaire?

Answer 14

Puisque les enzymes cellulaires impliquées dans la synthèse de la coiffe sont accessibles, ils peuvent donc être utilisé pour la modification post-traductionnelle des ARN viraux.

Question 15

Pourquoi le cas des ARN messagers des Orthomyxoviridae est-il particulier?

Answer 15

Puisque ce virus ARN à réplication nucléaire n’utilise pas directement les enzymes cellulaires, mais tire avantage de la présence de petits ARN cellulaires portant la structure coiffe en les utilisant comme amorces.

Question 16

Comment le cas des Bunyaviriaea diffère-t-il dans l’utilisation des amorces, comme le font les Orthomyxoviridae?

Answer 16

Ils produisent plutôt les amorces par coupure d’ARN messagers cellulaires dans le cytoplasme des cellules infectées

Question 17

Quels sont les deux virus à réplication cytoplasmique qui ont constitué le premier exemple de virus codant pour les enzymes de synthèse de la coiffe?

Answer 17

Les Reoviridae et les Poxviridae

Question 18

Quel est le mécanisme général de synthèse des enzymes de synthèse de la coiffe chez les Reoviridae et Poxviridae?

Answer 18

1. une triphosphatase enlève le phosphate en 5’ de l’ARN
2. la guanylyltransférase permet par la suite de former le lien inhabituel 5’-5’ entre le GMP et l’extrémité 5’-diphosphate de l’ARN
3. finalement, des groupements méthyl seront ajoutés à la structure coiffe ainsi formée.

Question 19

Trois types de traduction non conventionnelle des virus?

Answer 19

1. Une séquence nommé Kozacs permet la traduction d’AUG plus en aval comparativement à un AUG en amont n’étant pas dans cette séquence.
2. mécanisme interne IRES rendant inutile la présence des protéines de reconnaissance de la coiffe et peut jouer un rôle dans la régulation de la synthèse protéique lors de l’infection virale.
3. déphasage ou glissement (frameshift) permettant de déplacer le cadre de lecture dans les séquence à nucléotides répétitives.

Question 20

Comment a été découvert les ARNm?

Answer 20

Par l’étude des Poxviridae et les Réoviridae.

Question 21

Quelle famille de virus n’ont simplement pas de structure coiffe. Ils ont une protéine à l’extrémité 5’ de l’ARN qui va bloquer le 5’ contre la dégradation.

Answer 21

Les Picornaviridae

Question 22

Qu’est-ce que la séquence de Kozacs?

Answer 22

Une séquence où le AUG est suivit d’un G et le 3e a.a. en amont est une purine. Le plus important est le G suivant l’AUG.

Question 23

Que permet la séquence de Kozacs dans le contexte des virus eucaryotes?

Answer 23

Il permet au virus de synthétiser des protéines différentes à partir du même matériel génétique.

Question 24

Que permet la séquence IRES dans le contexte des virus eucaryotes?

Answer 24

Cette séquence permet de fixer directement le ribosome sans passer par l’étape de balayage, donc ces ARNm n’ont pas besoin de structure coiffe.

Question 25

Un exemple “historique” de principe de protéine impliquées dans la résistance à l’infection virale

Answer 25

Le produit protéique confère la résistance à l’infection par certains rétrovirus; dans ce cas, la protéine cellulaire ressemble à une protéine virale et compétitionne avec celles-ci bien qu’elle ne possède pas la fonction associée à la protéine virale. Il s’agit simplement d’interférence homologue.

Question 26

Pourquoi un virus N-trope ne peut-il infecter une cellule Balb et à l’inverse, pourquoi le virus B-trope ne peut-il pas infecter les cellules NIH?

Answer 26

Les cellules NIH ne peuvent pas être infectées par les virus B-trope car la protéine endogène d’origine virale NIH compétitionne avec les protéine virales B-trope.
Les cellules Balb ne peuvent pas être infectées par les virus N-trope car la protéine endogène d’origine virale Balb compétitionne avec les protéine virales N-trope

Question 27

Pourquoi un interféron, qui agit comme une cytokine par une interaction avec un récepteur cellulaire, produit par une espèce animale ne peut-il être actif sur les cellules d’une autre espèce?

Answer 27

Principalement due à la divergence du récepteur.

Question 28

Quel termes sont utilisés par plusieurs virologistes pour décrire la résistance à l’infection virale reliée à l’action de l’interféron?

Answer 28

1. mécanisme de résistance intracellulaire
2. immunité intrinsèque
3. immunité inné est de plus en plus utilisé

Question 29

La production d’interféron peut être considérée comme un exemple particulier de?

Answer 29

d’interférence virale hétérologue.

Question 30

Quelle est le nom des chercheurs dont l’expérience, en 1959, utilisait un virus inactivé et démontrait la sécrétion par les cellules d’une substance pouvant protéger d’autres cellules en interférant avec la réplication virale, d’où le nom d’interféron?

Answer 30

Isaac et Lindenmann

Question 31

Quelles sont les trois grandes étapes du mécanisme menant à l’effet antiviral de l’interféron?

Answer 31

1. Induction de la production d’interféron
2. signalisation menant à l’induction des produits antiviraux
3. action des protéines antivirales

Question 32

Qu’est-ce qu’est l’induction de la production d’interféron, la première grande étape du mécanisme menant à l’effet antiviral de l’interféron?

Answer 32

Certaines protéines, souvent transmembranaire associées aux endosomes ou des protéines cytoplasmique, agissent à titre de récepteurs pour la reconnaissance de structures moléculaire étrangères (PAMPs) ou des l’ARN bicaténaire servant à la réplication virale, etc, entraine une cascade menant à l’induction de de la transcriptions des gènes codant les différents interférons de type I et sa sécrétion.

Question 33

Qu’est-ce qu’est la signalisation menant à l’induction des produits antiviraux, la deuxième étape du mécanisme menant à l’effet antiviral de l’interféron?

Answer 33

Après sa sécrétion, l’interféron s’attache à son récepteur à la surface d’une cellule, la même (autocrine) ou une voisine (paracrine) et cette interaction entraîne une nouvelle cascade qui stimulera davantage de production d’interféron, effet d’amplification.
De plus, selon le type cellulaire interagissant avec l’interféron, la cascade entraînera la transcription de plusieurs gènes, dont la protéine PKR, un facteur antiviral important.

Question 34

Qu’est-ce que l’action des protéines antivirales, la troisième étape du mécanisme menant à l’effet de l’interféron?

Answer 34

La protéine PKR, entre autre, agit au niveau de la synthèse protéique.
D’autres protéines agissent toutefois en bloquant l’entrée, la décapsidation, en dégradant l’ARN viral, etc.

Question 35

Que signifie PKR?

Answer 35

Protéine Kinase dépendante de l’aRn.

Question 36

Quels mécanismes ont développé les virus afin de contrecarrer l’effet de phosphorylation bloquant la synthèse protéique des ARN bicaténaire viraux de la protéine PKR?

Answer 36

1. (Compétiteur) La surproduction de protéines ayant de l’affinité pour l’ARN bicaténaire et compétitionnant ainsi avec PKR
2. (Imposteur) La production de protéines ressemblant suffisamment à elF2 pour servir de leurre à l’activité phosphorylante de PKR
3. (Dégradeurs) Des enzymes protéolytiques qui dégradent spécifiquement PKR
4. (Inactiveur) La surproduction de courts ARN bicaténaires pouvant s’attacher à PKR, mais étant apparemment trop courts pour entraîner la dimérisation et l’activation de l’enzyme.