Lección 18: Taxonomía y filogenia de los procariotas. Flashcards
Filogenia
Relación evolutiva de las especies
Establecer las relaciones evolutivas (filogenéticas) de los seres vivos
Cronómetro evolutivos
Taxonomía bacteriana
Ciencia que se encarga de describir los grupos de organismos y sus
relaciones, así como de establecer los límites entre ellos.
* Clasificación
* Nomenclatura
* Identificación
Clasificación
Ordena los organismos en grupos taxonómicos (taxa) en base a sus semejanzas y relaciones. La unidad taxonómica básica es la ESPECIE
Nomenclatura
Asigna nombres a los grupos taxonómicos conforme a normas internacionales
Identificación
Incluye un determinado microorganismo en un grupo taxonómico previamente establecid
Modelo IKEA
Cajones, calcetines, camisas, pantalón
Jerarquía taxonómica
Categorías
1.Dominio
2.Phylum
3.Clase
4.Orden
5.Familia
6.Género
7.Especie
8.Subespecie
Árbol filogenético universal
*Basado en las secuencias géneticas, RNA.
*Resultado del análisis filogénico molecular del RNA 18s de distintas especies.
*La raíz representa un punto en el tiempo en que toda la vida existente en la tierra compartía una antepasado común. (LUCA)
Tipo de nomenclatura
*Sigue el sistema binominal (nombre de género + epíteto-adjetivo de la especie)
*Debe seguir las normas internacionales
**Ej : Legionella pnennoptila .
Clase : Alpha proteobacteria ; orden : Legionellalos, familia : Legionella ceae
Clasificación fenotípica
-Morfológicas : forma , asociaciones , tipo Gram , movilidad
-Fisiológicas : requerimiento de oxígeno , temperatura de crecimiento -Bioquímicas : fuente de carbono y energía, tipo de metabolismo ,
actividad enzimática . ..
-Quimiotaxonomía : Composición química del perfil de ácidos grasos,
-Serología, fagotipica : establecimiento de categorías subespecíficas
Concepto de especie bacteriana
*Concepto evolutivo: Trayectoria evolutiva (más teórico)
*Concepto fenético: Grado semejanza (más pragmático)
*Concepto filogenético: Grupos monofiléticos (teórico?)
@Conjunto de cepas que presentan muchas propiedades en común y que
difieren lo suficientemente de otros conjuntos de cepas como para
asegurar su reconocimiento como unidad taxonómica básica.
@Una especie consta de la cepa tipo y todas aquellas cepas que sean
consideradas suficientemente similares a ella como para justificar su
inclusión en la misma especie.
Sistemas de clasifiación
*Artificiales –> Semmejanzas fenéticas
*Naturales –>Relaciones evolutivas o filogenéticas
**La suma de ambas es la taxonomía polifásica
Especie polifásica
*Conjunto de cepas que presentan un ancestro común .
*Muestran cierto grado de consistencia fenotípica :
>Grado de significación de homología ADN-ADN ( hibridación >= 70% )
>Porcentaje de identidad en la tenencia del ARNr 16s >= 97% .
*En una especie de un mismo género la homología en la secuencia del
ARNr 16s debe ser >=90%
CLASIFICACIÓN DE LOS PROCARIOTAS:
IDENTIFICACIÓN
@Reino Procaryotae
*División Gracilicutes (gracilis: fina; cutis: piel) –> Gram -
>Clase Scotobacteria
>Clase Anoxyphotobacteria
>Clase Oxyphotobacteria
*División Firmicutes (firmus: fuerte, resistente) –> Gram +
>Clase Firmibacteria
>Clase Thallobacteria
*División Tenericutes (tener: blando) –> sin pared
>Clase Mollicutes
*División Mendosicutes (mendosus: con defectos) –> Archea
>Clase Archaeobacteria
Ventajas de la nomenclatura
-Uniformidad : Concepto más uniforme de especie
-Estabilidad : Clasificacion no sujeta a cambios frecuentes .
-Sencillez :
genera esquemas mas sencillos al estar basado en menos
Caracteres .
-Obtener información filogenética ( Solo la tenencia del ARNr 16s )
Clasificación genotípica
*Comparación de las secuencias de ADN y ARN
1. Filogenia Molecular: comparación de secuencias genéticas el ARNr 16S
2.Análisis de ADN: ADN fingerprinting o reacción en cadena de la polimerasa (PCR)
3.Genómica comparativa
4.Metagenómica: estudio del material genético presente en muestras
