Lab 6 Flashcards

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1
Q

L’étiquette MAT contient quoi

A

Des histidines qui vont etre utilise pour purifié, va se lier a colonne IMAC

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Q

Emplacement de étiquette et pourquoi

A

N terminale, facile a etre reconnaitre, mieux qu’a l’intérieur d e la protéine

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3
Q

Comment IMAC fonctionne généralement

A

Nickel sont sur colonne et vont se lier a nickel

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4
Q

Qu’est ce qui maintient nickel au billes

A

Ni est attacher par de l’eau et IDA (2 groupements carboxyles et azote de l’IDA et 3 molécules d’eau

IDA s’attache a billes

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5
Q

Quel acide aminé a affinité pour Ni

A

pleins a.a surtout histidine

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6
Q

comment pratéine attacher a colonne

A

his de étiquette MAT (qui a 4 His par étiquette prend place de eau, donc BEAUCOUP d’affinité)

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7
Q

Comment élué les protéines voulue de la colonne

A

L’imidazole va competitionner avec l’histidine de MAT et prendre sa place.
- Petite concentration d’imidazole pour les protéine non mat attacher avec faible affinité
- Grande concentration pour enlevé MAT qui sera toute seul

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8
Q

Problème d’imidazole

A

Inhibe enzyme T7

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9
Q

Comment enlevé imidazole

A

Technique de dessalage par ultrafiltration (utilise un petit filtre)

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10
Q

Technique de dessalage

A

membrane poreuse filtré, laisse seulement passer plus petit que 50 kDa. TOute les contaminants passe

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11
Q

On veut remplacer quelles tampon

A

Tampon d’élution avec tampon de stockage (Tween 20 va faire en sorte que protéine garde sa forme)

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12
Q

SDS-Page( faite de quoi?)

A

faite de polyacrylmamide

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13
Q

La polymérisation nécessite

A

du persulfate d’allumium et un catalyseur TEMED

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14
Q

Gel % et pores

A

Un gel avec un plus grand % d’acrylamide a des pores plus petit

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15
Q

Comment sds-page gel de protéine focnctionnne

A

électrode - a anode +, migration proportionnelle a la taille, les protéine vont avoir une charge négatif. Petite protéine vont descendre plus rapidement

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16
Q

Pouruqoi les protéines sont négatif?

A

2 molécules du tampon de chargement donne protéines négatif:
- SDS: détergent, pertube intéractins polaires et hydrophobique de strture tertiaire. SDS est nég qui va rendre protéine NÉGATIVE! inépendante de la migration distance.
- B-mercaptoéthanol: Réduits les ponts disulfures dans la strucuture tertiaire de poréine, il dénature protéine

17
Q

Comment visualiser protéines

A

Coloré gel soit le bleu Coomassie - il se lit au groupement amino et carboxyl des protéines fortement et faiblement au gel.

On fait décoloration du colorant lié au gel toute en gardant colorant au protéine

Nous on utilise au lieu le GelCode Blue: débrasse coloration du gel juste sur protéine

18
Q

what does sds permit

A

trouver poids moléculaire de protéines

19
Q

quel sorte de liens se font entre IDA et avec les billes

A

liens covalents

20
Q

Quel types de liens se font entre les Mat-tag et les Nickel

A

Liens chélateur

21
Q

loi de beer lambert

A

A=coefficient d’extinction b C

C est en molarité (mol/L)

22
Q

demande pour concentration non dillué et comment faire conversion

A

x4 si concentration est une dillution x4

avec masse molaire

23
Q

Abondance relative de tyr et trp sont de 2,3% et 1,3%

1 tyr contribue a 1480 extinction globale

1 trp contribue a 5540 extinction globale

c’est quoi extinction globale de 350 a.a

A

2,3% de 350 =a

1,3% de 350 = b

a(1380)+b(5540)
= réponse

24
Q
A