Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

BMA032, Medicinsk biokemi > Intracellulär sortering av proteiner > Flashcards

Intracellulär sortering av proteiner Flashcards

1
Q

Vad avgör ett proteins slutdestination?

A

De specifika aminosyrasekvenserna i proteinet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Var sker translationen i cellen?

A

Antingen sker allt i cytoplasman eller så fäster proteinkedjan, efter en stund, till ER

Translationen sker på fria ribosomer eller membranbundna sådana

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vilka är de två olika mekanismerna för translation, beroende på proteinets destination?

A

Cotranslational import - proteiner importeras här om slutdesitnationen är sekretoriska vesiklar, lysosomer eller plasmamembran

Posttranslational import - proteiner importeras här om de ska stanna kvar i cytosolen eller om slutdesitnationen är nukleus, mitokondrien, kloroplast eller peroxisomer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vilka proteiner går via den sekretoriska passagen?

A

Sekretoriska passagen = cotranslational import

Proteiner med en signalpeptid :)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vilka är de gemensamma kännetecken för signalpeptider?

A
  • 13 - 36 AA lång
  • Innehåller en cleavage site
  • Sekvens av 10 - 15 hydrofoba AA
  • Minst 1 positivt laddad AA (basisk) nära aminoänden
  • AA med polär kedja för cleaveage site (ofta Ala)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Beskriv hur identifiering och lokalisering av membranproteiner, till ER, sker?

A
  1. SRP (signal recognition particle) kopplas till ER signalsekvens och blockerar translationen
  2. SRP binder till en SRP-receptor - ribosomen dockar på ER-membranet
  3. GTP binder till SRP-receptorn och en nybildad polypeptid förflyttas in till ett porprotein
  4. GTP hydrolyseras och SRP frisätts
  5. Polypeptiden förlängs och translokeras in till ER lumen
  6. Polypeptiden görs klart och klyvs av signal peptidas, vilket frisätter den från membranet - mRNA och olika subenheter lämnar hela komplexet och blir fria för en ny translation
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Smooth ER och rough ER gör olika saker. Vilka?

A

Smooth ER - lipidsyntes

Rough ER - proteinsyntes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vad ingår i strukturen av rough ER och vad händer där?

A
  • ER membran med dockade ribosomer

Här sker modifiering av proteiner (veckning, disulfidbindningar, glykolysering)

  • Syntes av membranproteiner - styr transport av proteiner till det korrekta membranet
  • Syntes av proteiner som skall utsöndras fråncellen
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q
A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vad innebär N-länkad glykolysering?

A

Glykolysering genom kväve

  • Oligosackarider (14 monosackarider) sätts på asparagin när proteiner passerat ER-membranet
  • Sockret sitter först på en lipid (dolichol) i ER-membranet, och överförs sedan från dolichol till proteinet med hjälp av enzymet oligosaccharyl transferase
  • Underlättar veckning av proteiner i ER
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vad sker med proteiner i Golgi-apparaten?

A

Här sorteras och modifieras proteiner

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vilka två former av transport mellan diskarna i Golgi-apparaten finns?

A
  • Anterograd transport - framåt, från CIS till TRANS
  • Retrograd transport - bakåt, från TRANS till CIS
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vilka är de olika delarna av Golgi?

A
  • Cis Golgi
  • Medial Golgi
  • Trans Golgi
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vissa proteiner ska sorteras till lysosomer. Hur går detta till?

A
  • Proteiner binder till N-acetylglukosamin fosfotransferas (GlcNAc fosfotransferas) som fäster mannos-6-fosfat på dem
  • Mannos-6-fosfat binder till en receptor som styr lysosomala proteiner till särskilda vesiklar

Lysosomala proteiners “signal patch” (komplex igenkännings-sekvens) låter dem interagera med enzymet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Ge exempel på tre olika coat-proteiner som används vid den intracellulära vesikeltrafiken?

A
  • Clathrin
  • COPI
  • COPII
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vad används coat-proteinet Clathrin till?

A

Används främst vid endocytos

17
Q

Vad används SNARE-proteiner till och vilka två typer finns?

A
  • Specifika interkationer mellan SNARE molekyler på vesikeln (v-SNARE) och på målmembranet (t-SNARE) ger specificitet
  • SNARE proteiner används även vid utsöndring av neurotransmittorer
18
Q

Hur går vesikelfunktion till?

A
  1. GTP binder in till en GTPase, som är fäst i vesikeln. Detta får v-SNARE och t-SNARE att bilda en dimer
  2. En av fosfaterna hoppar av GTP (⇒ GDP)
  3. Tillkommer SNAPs (t-SNARE-protein) och NSF (en N-ethylmaleimide senstive factor), som fäster till GDP
  4. Energi, i form av ATP, används (blir till ADP + Pi) - dimeren släpper och innehållet lämnar vesikeln. GDP, SNAPs och NSF frigörs för att återanvändas
19
Q

Vilken funktion har mitokondrien och vilka är dess speciella egenskaper?

A

Funktion

  • Energimetabolism

Speciella egenskaper

  • Bakteriellt ursprung
  • Innehåller eget DNA och translationsmaskineri, och kan tillverka vissa proteiner
  • Andra proteiner importeras från cytosolen där de bildats av fria ribosomer
  • Dubbla membransystem
20
Q

Vad betyder TOM och TIM?

A
  • TOM - translocase of outer membrane
  • TIM - translocase of inner membrane
21
Q

Vilka är stegen för transport av polypeptider in till det mitokondriella matrixet?

A
  1. Chaperone-molekyler binder till polypeptiden i cytosolen
  2. Transportsekvensen binder till en TOM-receptor på mitokondrien
  3. En cytosolisk chaperone-molekyl kopplas av från polypeptiden med ATP-hydrolys. Detta sker samtidigt som polypeptiden rör sig genom TOM och TIM
  4. Mitokondriella chaperone-molekyler binder till och frisätter polypeptiden när den kommer in i mitokondriens matrix
  5. Chaperone-molekyl kopplas av från polypeptiden med ATP-hydrolys
  6. Polypeptiden veckas
22
Q

Vad är den generella regeln för transport in/ut ur cellkärnor?

A

Proteiner in, RNA ut

23
Q

Ge exempel på proteiner som importeras till cellkärnan?

A
  • RNA och DNA polymeraser
  • Histoner
  • Transkriptionsfaktorer
24
Q

Vad exporteras från cellkärnan?

A

Ribosomala proteiner (sätts ihop med rRNA i kärnan och exporteras igen som ribosomala subenheter)

25
Q

Vad möjliggör transport mellan cellkärna och cytoplasma?

A

Nuclear Pore Complex (NPCs)

Importin A och B fungerar som solubla receptorer, som binder till NLS (Nuclear Localisation Sequence)

26
Q

Vad är NLS och vad gör de?

A

NLS = Nuclear Localisation Sequence

Strukturer som kan finnas vart som helst på ett protein, och fungerar som en “signalpeptid” för kärnan, men klyvs ALDRIG av

Består av 4-8 aminosyror, där flera är basiska (Lys, Arg) och binder till importin

För proteinexport används nukleära export signaler och Ran-GTP komplex

27
Q

Vilka ämnen kan diffundera fritt över kärnporer?

A

Proteiner och RNA mindre än 20 - 40 kDa

28
Q

Vad gör lokaliseringssignalerna i peroxisomer?

A
  • Importerar lösliga proteiner från cytosolen, C-terminal SKL-motif eller N-terminal nonpeptid
  • Membranproteiner kan även bildas i ER och exporteras till peroxisomer

BMA032, Medicinsk biokemi (16 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions