Infections Flashcards
Virus
Capsule d’information génétique
Molécules d’adhérence, dépend des cellules de l’hôte infectés
Influenza
Virus à génome d’ARN
Enveloppe protéique de 2 protéines (M1 et M2) et distinguent 3 familles: A, B, C
Influenza A
Responsable des épidémies et pandémies
Protéine de surface: Hémagglutinies (adhésion) + neuraminidase (détachent)
Influenza B
Atteintes gastro-intestinal, ressemble au A
Influenza C
Syndrome infectieux mineurs des voies aériennes supérieurs chez les jeunes
Cycle de vie du virus
A) Adhésion du virus par hémagglutinies B) Invagination du virus C) Matériel génétique vers le noyau pour répliquer D) ARN produit vers ribosome E) Libération virions infectieux
Dérive génétique
Mutation lente et limitées.
Survie d’un vison avec matériel génétique incorrectement reproduit (compatible avec le cycle de vie virale).
Nouvelle souche vitale.
Réarrangement génétique
Produit des souches entièrement nouvelles.
Croisement en un hôte de 2 souches virales (humain + aviaire). Origine des grande pandémie.
Nomenclature
A | Puerto Rico | 8 | 1934 (H1N1)
Gène viral, site de l’isolation, numéro de souche, année de découverte, H (hémagglutinie), N (neuraminidase)
Endémie
maladie active de façon constante ou régulièrement dans une population
Ex: grippe pour toutes population
Épidémie
Accroissement de la maladie dans une population délimité géographiquement et temporellement
Ex: grippe chaque hiver pour nous
Pandémie
Accroissement de la maladie dans une population sans restriction géographiquement
Ex: H1N1
Histoire influenza, grandes pandémies
Grippe espagnole (H1N1) Grippe asiatique (H2N2) Grippe de Hong Kong (H3N2) Grippe 2009 (H1N1)
Facteurs de l’épidémiologie
1) Nouveau virus
2) Capacité à infecter l’homme
3) Infections sévères: morbidité, mortalité
4) Transmission inter humaine
Stades épidémiologiques de l’OMS
Interpendémie: stade 1 (aucun), 2 (virus animal), 3 (infection humaine)
Alerte pandémique: stade 4 (transmission interhumaine), 5 (transmission humaine en grappes)
Pandémie: stade 6 (transmission soutenue à la population générale)
Protéine d’influenza
Hémagglutinines (15 sous-types): attachement
Neuraminidase (9 sous-types): séparation
Population à risque de complications
- jeunes enfants
- personnes âgées
- femmes enceintes
- immunosupprimés ou immuno-naïfs
- maladies cardio-pulmonaires sous-jacentes
TRANMISSION virus respiratoires
1) Gouttelettes respiratoires: en toussant ou éternuant, retombe à 2 m
2) Contact: contamination surface, touche muqueuse
3) Transmission aériennes: particules restent en circulation dans l’air plusieurs heures
Présentation clinique
- Température
- Toux
- Myalgies
- Anorexie et nausées
- Céphalée
- Rhinite et conjonctivite
L’incubation de la maladie va de 1 à 5 jours et elle se résout en 6 à 7 jours.
DX
Analyse des sécrétions nasopharyngées
- PCR
- Test à détection d’antigène (faible sensibilité, faux neg)
Non spécifique:
- Lymphopénie (diminution lymphocytes)
- Thrombocytopénie (diminution plaquettes)
- Transaminasémie (augmentation AST / ALT)
Absence de complications
RX pulmonaire
Complications
- Pneumonie virale
- Surinfection bactérienne
- ARDS (syndrome de détresse respiratoire de l’adulte)
- Otite moyenne
- Méningo-encéphalite
Morbidité et mortalité
mortalité = liée à des complications
90% décès + 65 ans
3% mort en centre de vieux
Thérapie
Mesures de support général (oxygénation, intubation)
pas d’attention médicale
Sévère: agents antiviraux
Agents antiviraux
2 catégories:
1) Inhibiteur M2: mal toléré, effets secondaires
2) Inhibiteur des neuraminidase: baisse la libération des virions nouvellement formé par influenza A et B
Thérapie de l’infection active
Inhibiteur des neuraminidase: moins de complications chez les gens à risques. traitement commencé max 48h après le début des symptôme
Prophylaxie
Inhibiteurs des neuraminidases sont parfois utilisés en prophylaxie secondaire
- les personnes à haut risque de morbidité et de mortalité qui ont reçu le vaccin - les personnes en contact avec les patients à haut risque qui n’ont pas été
Vaccinées
- les patients immunosupprimés chez qui le vaccin pourrait ne pas avoir été
efficace
- les patients qui ne peuvent recevoir le vaccin.
Vaccination
Annuellement, développement à partir de plusieurs souche virales
Entre mois d’octobre à novembre
Efficacité 60 à 80%
Risque 1% anaphylaxie
Coronavirus
Virus de la famille Coronaviridae
4 souches différentes de coronavirus dans la communauté cause rhume
SARS
2003, Chine: Syndrome respiratoire aigu sévère causé par un nouveau coronavirus = SARS-CoV
Transmissibilité importante
MERS-CoV
2012: Virus nommé le coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV), venant du dromadaire
Moins grande transmissibilité
Mortalité élevée (30%)
SARS-CoV-2
2019, Chine: Éclosion de pneumonies virales atypique
Propagation rapide
2 genres de coronavirus
Alphacoronavirus : 229E et NL63
Betacoronavirus : HKU-1, OC43, SARS-CoV, MERS-CoV, SARS-CoV-2
- Infectent les mammifères
- 2 autres infection les oiseaux
Les hôtes naturels des coronavirus humains
chauve-souris
dromadaire
certains rongeurs
Cause SARS-CoV-2
Virus présent chez des chauves-souris aurait infecté des pangolins comme hôtes intermédiaires. Le virus a par la suite acquis des mutations le rendant pathogène chez l’humain.
Structure SARS-CoV-2
Virus à ARN à simple brin de sens positif
Capsule hélicoïdale
Enveloppe lipidique
Un des plus gros génomes parmi les virus à ARN.
Protéine S (liaison), E, M sur la surface
Transmission SARS-CoV-2
Début: marchés d’animaux
Contagineux avant les symptômes
Transmission jusqu’à 7 à 10 jours après les symptômes
Asymptomatique peuvent transmettent
Présentation clinique SARS-CoV-2
Asymptomatique = 10 à 30% Période incubation = 1 à 14 jours (moyenne 5 jours) • Toux (50%) • Fièvre (43%) • Myalgie (36%) • Céphalée (34%) • Dyspnée (29%) • Mal de gorge (20%) • Diarrhée (19%) • Nausée et/ou vomissement (12%) • Anosmie / Perte de goût (10 à 50%) • Douleur abdominale (<10%) • Rhinorrhée (<10%)
Diagnostique covid
PCR (prélèvement nasopharyngé) - rare faux positif, faux négatif si - 24h après début symptôme
Détecte la présence d’ARN viral (actif ou non)
Complications
Pneumonie = insuffisance respiratoire hypoxémique
10 à 20% nécessite oxygénothérapie
Facteurs de risque
- Âge avancé*** • Maladie coronarienne athérosclérotique • Obésité • Hypertension artérielle • Diabète • Tabagisme • Néoplasie • Maladie respiratoire chronique
Complications en labo
- Lymphopénie (diminution lymphocytes)
- Thrombocytopénie (diminution plaquettes)
- Augmentation enzymes hépatiques
- Augmentation marqueurs inflammatoires (CRP , ferritine)
- Augmentation D-dimères
- Augmentation troponines
Pneumonie après covid
5 à 10 jours après symptômes
- Insuffisance respiratoire hypoxémique pure
- Tolérance à une hypoxie.mie profonde (
Traitement
Corticostéroïde: anti-inflammatoire, bénéfique sur la mortalité pour les patients hospitalisé hypoxémique
Remdesivir: antiviral
