Heredabilidad pérdida Flashcards
Heredabilidad pérdida
Proceso en el que un solo gen o variante genética encontrada en el GWAS no puede explicar la heredabilidad de una enfermedad
Implicación médica de la heredabilidad pérdida
La susceptibilidad de desarrollar enfermedad depende más de los genes de trasfondo que los genes indivudales
Los GWAS analizan los
SNPs de un individuo
GWAS ayudan a explicar la arquitectura genética de
Enfermedad complejas
Fallas en el proyecta del genoma humano
- Interaccion gen con gen
- Gen con proteínas (factores de transcripción)
- Falta de info de variantes estructurales
- Interaccion gen con ambiente
- Metagenoma
Solo se veía la secuencia lineal de nucleótidos
Las variantes más comunes individualmente o en combinación confieren incrementos relativamente pequeños en el riesgo (1.1–1.5 veces) y explican solo una pequeña proporción de heredabilidad: la porción de variación fenotípica
Verdadero
Al predecir la estatura, ¿sirve revisar la variación genética?
No, solo determina el 5% de la heredabilidad. Lo demás los vemos en los rasgos físicos
¿Por qué hay heredabilidad pérdida?
- Número mucho mayor de variantes de menor efecto aún por encontrar; variantes más raras presente en el 5% o más de la población-
- Variantes estructurales mal capturadas por arreglos existentes.
- Baja potencia para detectar interacción gen-gen
- Inadecuada cuantificación del entorno compartido entre parientes (ambiente)
MAF
Frecuencia de alelos poco comunes es decir que se encuentran entre el 0.5% y el 5% de la población
Alelos muy raros
Menos del 0.1% de la poblacion. Tiene un efecto del 50% en fisiologia (heredibilidad explicada) como enfermedades con patrón mendeliano como de metabolismo, hemofilia etc….
Deseventaja al dejar descendencia
Alelos raros
Menos del 0.5 % de la población,
Alelos comunes
+ del 5% de la población por los general no producen enfermedad
Los alelos de bafa frecuencia tiene efectos fisiológicos
Intermedios
Los MAF son limitación de GWAS?
Sí
Variaciones estructurales
Variantes de número de copia (CNV, como inserciones y deleciones) y variación neutra de copia (como inversiones y translocaciones).