Heredabilidad pérdida Flashcards

1
Q

Heredabilidad pérdida

A

Proceso en el que un solo gen o variante genética encontrada en el GWAS no puede explicar la heredabilidad de una enfermedad

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2
Q

Implicación médica de la heredabilidad pérdida

A

La susceptibilidad de desarrollar enfermedad depende más de los genes de trasfondo que los genes indivudales

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3
Q

Los GWAS analizan los

A

SNPs de un individuo

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4
Q

GWAS ayudan a explicar la arquitectura genética de

A

Enfermedad complejas

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5
Q

Fallas en el proyecta del genoma humano

A
  • Interaccion gen con gen
  • Gen con proteínas (factores de transcripción)
  • Falta de info de variantes estructurales
  • Interaccion gen con ambiente
  • Metagenoma

Solo se veía la secuencia lineal de nucleótidos

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6
Q

Las variantes más comunes individualmente o en combinación confieren incrementos relativamente pequeños en el riesgo (1.1–1.5 veces) y explican solo una pequeña proporción de heredabilidad: la porción de variación fenotípica

A

Verdadero

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7
Q

Al predecir la estatura, ¿sirve revisar la variación genética?

A

No, solo determina el 5% de la heredabilidad. Lo demás los vemos en los rasgos físicos

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8
Q

¿Por qué hay heredabilidad pérdida?

A
  • Número mucho mayor de variantes de menor efecto aún por encontrar; variantes más raras presente en el 5% o más de la población-
  • Variantes estructurales mal capturadas por arreglos existentes.
  • Baja potencia para detectar interacción gen-gen
  • Inadecuada cuantificación del entorno compartido entre parientes (ambiente)
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9
Q

MAF

A

Frecuencia de alelos poco comunes es decir que se encuentran entre el 0.5% y el 5% de la población

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10
Q

Alelos muy raros

A

Menos del 0.1% de la poblacion. Tiene un efecto del 50% en fisiologia (heredibilidad explicada) como enfermedades con patrón mendeliano como de metabolismo, hemofilia etc….

Deseventaja al dejar descendencia

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11
Q

Alelos raros

A

Menos del 0.5 % de la población,

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12
Q

Alelos comunes

A

+ del 5% de la población por los general no producen enfermedad

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13
Q

Los alelos de bafa frecuencia tiene efectos fisiológicos

A

Intermedios

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14
Q

Los MAF son limitación de GWAS?

A

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15
Q

Variaciones estructurales

A

Variantes de número de copia (CNV, como inserciones y deleciones) y variación neutra de copia (como inversiones y translocaciones).

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16
Q

💡 Variante de 0.0003% presente en la población que heramienta utilizarias

a) GWAS.
B)Citogenético FISH
c)Árbolo genealógico

</aside>

A

B)

Variantes RARAS se pueden ver con el test de FISH, donde se marcan sondas fluorescentes de ADN, para reconocer el sitio específico de la variante, y marca fluorescencia detectable fácilmente. Deleciones se utiliza FISH

17
Q

¿Qué herramienta utilizarías para detectar variantes de degeneración macular?

A

GWAS

18
Q

Posibles mejoras al estudio de GWAS

A
    • disponibilidad de datos de estudio
    • número de muestra y diversidad de nacionalidades
  • enfermedades de acuerdo a poblaciones
  • mejor elección de fenotipos
  • interacciones gen con gen
  • tomar en cuenta epistasis
  • Tomar en cuenta variantes de numero de copia y polimorficas estructurales
  • categorizar enfermedades por datos clinicos: como complicaciones menos frecuentes de diabetes
    *
19
Q

Epistasis

A

Condición en la que un estímulo ambiental desecadena la activación génica de una proteína, la cual tiene otro efecto en los genes

Glucosa += + insulina= vía inhibie expresión de genes de beta oxidación

20
Q
A