BLAST Flashcards
1
Q
BLAST
A
- Herramienta de búsqueda de alineación local básica + utilizada búsqueda de secuencias en bases de datos.
2
Q
¿Qué hace BLAST?
A
- Encuentra una región de similitud local (secuencia conservada) entre una secuencia de “consulta” de aminoácidos que conforman una proteína o la secuencia de nucleótidos del ADN frente a una base de datos de referencia
3
Q
Objetivo final de BLAST
A
- Inferir las relaciones evolutivas y funcionales entre dos secuencias de ADN o proteínas.
4
Q
BLASTN
A
Una secuencia de nucleótidos es contrastada contra otra secuencia de nucleótidos de referencia
5
Q
BLASTP
A
Una secuencia proteínica es contrastada contra otra secuencia proteínica de referencia
6
Q
BLASTX
A
- Todos los marcos de lectura de una secuencia de nucleótidos se contrastan contra una secuencia de proteínas de referencia.
7
Q
TBLASTN
A
- Una secuencia proteínica es contrastada contra todos los marcos de lectura de secuencias de nucleótidos de referencia.
8
Q
TBLASTX
A
- Las traducciones de 6 marcos de la secuencia de nucleótidos se buscan 6 marcos traducciones de una base de datos de secuencias de nucleótidos
9
Q
MEGABLAST
A
- Adecuado para encontrar alineación entre secuencias estrechamente relacionadas
*
*
10
Q
PSI-BLAST
A
- Adecuado para buscar homólogos remotos o miembros de una familia de proteínas
11
Q
PHI-BLAST
A
Adecuado para encontrar secuencias de proteínas con un patrón específico en la base de datos
