HC. 6 van DNA via RNA naar eiwit

Question 1

Beschrijf DNA

Answer 1

DNA is een deoxyribose fosfaat met een base daaraan gekoppeld. Het is dubbelstrengs waarbij de 2 strengen antiparallel om elkaar draaien. Alle genetische informatie ligt in DNA opgeslagen.

Question 2

Functie DNA

Answer 2

Blauwdruk voor goede replicatie maar ook voor goede overerving zowel in de ouder als overgedragen op kind.

Question 3

RNA wordt altijd gesynthetiseerd in de … richting

Answer 3

5’—> 3’

Question 4

centrale dogma in biologie

Answer 4

DNA –> transcriptie –> RNA –> translatie –> eiwit

Question 5

Centrale dogma is niet alles omvattend want …

Answer 5

DNA kan ook coderen voor rRNA rn tRNA. Deze soorten RNA worden niet omgezet tot eiwitten.

Question 6

Wat is het genoom

Answer 6

Totaal aan aantal genetische informatie, die voor elke cel hetzelfde is.

Question 7

Wat is het transcriptoom

Answer 7

Totale samenbundeling RNA die in een bepaalde cel onder bepaalde omstandigheden tot uiting komen.

Question 8

Wat is het Proteoom

Answer 8

Dit is de verzameling van alle eiwitten van een cel of organisme.

Question 9

Wat vormt samen het fenotype

Answer 9

Het proteoom en transcriptoom

Question 10

Waar zegt de transcriptionele regulatie is over?

Answer 10

Zegt iets over waar en wanneer iets tot expressie komt.

Question 11

Waar vindt eiwitsynthese plaats

Answer 11

Op ribosomen in de cytosol

Question 12

In welke richting worden eiwitten afgelezen

Answer 12

N-terminus richting de C-terminus

Question 13

Er zijn 3 mogelijke leesramen, deze wordt bepaald door het..

Answer 13

startcodon

Question 14

Hoe weet je welke AUG het startcodon is

Answer 14

Het startcodon wordt gevonden door de TATAA-box. Dit is de markering voor waar de RNA-polymerase moet beginnen met aflezen

Question 15

functie tRNA

Answer 15

Met behulp van complemenair anticodon (3’ naar 5’) herkent een tRNA een tripletcode in een mRNA. Een mRNA wordt dan van 5 naar 3 gesynthetiseerd.

Question 16

Hoe ziet tRNA eruit

Answer 16

Het is onderdeel van ribosoom, het tRNA zwemt los in de cel en bevat aan de ene zijde een triplet base code (anticodon) en aan de andere kant een aminozuur.

Question 17

Een ribosoom bestaat uit..

Answer 17

grote en kleine subunit en zijn opgebouwd uit eiwitten en rRNA’s die om de eiwitten heen is gedrapperd.

Question 18

In de kleine subunit

Answer 18

Die herkent het 5’-uiteinde van RNA: er onstaat zo een codon-anticodon interactie.

Question 19

In de grote subunit

Answer 19

Hierin wordt het tRNA en dus worden hier de aminozuren aan elkaar geregen

Question 20

Er zijn 3 sites in de kleine subunit + hun functie”

A-site

Answer 20

1. A-site: hierop komt een nieuw tRNA molecuul, als het anticodon past op de codon in het mRNA wordt de peptideketen aan het nieuwe tRNA

Question 21

Er zijn 3 sites in de kleine subunit + hun functie”

P-site

Answer 21

Vervolgens verplaatst tRNA zich naar p-site, hier vindt polymerisatie plaats dmv peptidyl transferase.

Question 22

Peptidyl transferase houdt in dat…

Answer 22

De verbinding tussen het aminozuur en de tRNA op de E-site wordt verbroken. Deze verbinding komt namelijk tussen op de P-site

Question 23

Wanneer polymerisatie is beeindigt:

Answer 23

Dan verplaatst tRNA zich naar de Esite, daar wordt tRNA losgelaten.

Question 24

Wat katalyseert de peptidyl transferase

Answer 24

het rRNA.

Question 25

Voordat peptideketen een functioneel eiwit kan worden vinden er 3 stappen plaats:

Answer 25

1. Vouwing van eiwit
2. post-translationele modificaties
3. eiwitsortering

Question 26

Transcriptie in het kort:

Answer 26

DNA helicase trekt de 2 strengen DNA uit elkaar. RNA-polymerase leest de matrijsstreng of templatestreng af. De RNA synthese vind dus plaats in de 5’–> 3’ richting. En de template streng wordt dus afgelezen van 3 naar 5.

Question 27

De template streng bevat vanwege complementariteit dezelfde code als …

Answer 27

de coderende streng.

Question 28

Wat is de initiatie fase

Answer 28

De fase waarin het RNA-polymerase bindt aan de promotor

Question 29

mRNA moet naar het cytosol getransporteerd worden maar hier zijn RNAses die dit proberen af te breken om dit te voorkomen vindt er…

Answer 29

RNA-processing plaats

Question 30

3 stappen RNA-processing

Answer 30

1. 5 uiteinde krijgt een cap
2. 3 einde krijgt een poly A staart. RNAse kan het molecuul aan het einde afbreken zonder dat het coderende RNA beschadigt.
3. RNA-splicing –> intronen (niet coderend DNA) wordt verwijderd. Altijd 1 exon meer dan intron.

Question 31

Na knippen van intronen blijven….

Answer 31

Exon-junction complex achter

Question 32

Waarom is het zo dat splicing zorgt voor meer translatie

Answer 32

1. bij verwijdering intronen blijft EJ complex achter op het mRNA molecuul.
2. Bij eerste ronde translatie worden deze verwijderd.
3. Waardoor de cap en poly A staart door een ander eiwit bij elkaar kunnen worden gebracht
4. Hierdoor is de herkenning van de cap door de 40S subunit sterk verhoogd en wordt de translatie van het mRNA veel vaker gestart.

Question 33

Wat is bulktranslatie

Answer 33

Meerdere ribosomen alles aflezen

Question 34

Wat doen de enhancers

Answer 34

Zeggen wanneer de transcriptie van start gaat. (Zitten overal behalve op de promotor).

Question 35

Defenitie enhancers

Answer 35

Kort gebied DNA, dat door activatoren de kans kan vergroten dat de transcriptie van een bepaald gen kan plaatsvinden.

Question 36

Functies 5 cap en poly A staart

Answer 36

• bescherming
• aanhechting ribosomen
• verlenging levensduur
• herkenning kleine subunit
• kwaliteitscheck
• bepalen in de mate hoeveel getransleerd wordt voordat RNA wordt afgebroken.