génétique Flashcards
nommer les 2 grandes catégories de pathologies de l’hérédité? qu’est ce qui les différencie ?
- du a une mutation génique (gène) : vu par biochimie + biologie moléculaire
= maladies de surcharge - anomalie visible mophologiquement : vu par cytogénétique
présentement, le (x/x) des enfants hospitalisés le sont pour des problèmes génétique
le 1/3
qu’est ce qu’un génotype ?
ensemble de gènes d’un individu
un gène correspond à un segment d’(…) contenant une (…)
un gène correspond à un segment d’(ADN…) contenant une (information particulière …)
qu’est ce qu’un locus ?
l’endroit occupé physiquement par un gène sur un chromosome
Qu’est ce qu’un allèle ?
allèle des yeux bleus et sa localisation cest le locus
est ce qu’on peut avoir plus de deux allèles/gène a la fois pour un locus donné?
non , un allèle maternel sur un chromosome et un allèle paternel sur l’autre chromosome
est ce qu’un gène = un allèle ?
non car pour une fonction génique, il peut y avoir plusieurs allèles pour une population (polyallélie)
Exemple : gène qui code pour la couleur des cheveux : brun, roux, blond = allèles
as t-on besoin de l’hx familiale d’un individu pour connaitre son phénotype ?
non
qu’est ce qu’un syndrome ?
nbr important de modifications phénotypiques
Vrai ou faux : le phénotype est toujours une indication fidèle du génotype
faux : les étapes du développement peuvent produire des effets différents pour un même gène.
Exemple : enfants avec le même gène anormal affecte plus un enfant qu’un autre
qu’est ce que le pléiotropisme
gène peut avoir plusieurs effets
qu’est ce que l’hétérogénéité génique
plusieurs gènes peuvent avoir le même effet
qu’est ce que la phénocopie
des agents du milieu peuvent SIMULER les effets d’un gène
vrai ou faux : une maladie héréditaire est toujours une maladie congénitale
faux : elle peut apparaitre + tard dans la vie
Sy d’alcoolisation foetale : maladie congénitale et/ou héréditaire ?
Maladie congénital non héréditaire
Caractérisée par : retard mental, malformations cardiaque, insuffisance renale
Nommer une difféence entre les individus qui dépend uniquement des gènes (pas de l’environnement)
les groupes sanguins
Nommer une difféence entre les individus qui dépend des gènes ET de l’environnement
cancers (ex :de la peau)
infections
Nommer une difféence entre les individus qui dépend juste de l’environnement ?
brûlures
Tchernobyl
comment est-ce possible de distinguer les effets du milieu (environnement) VS les effets de l’hérédité
comparaison des jumeaux monozygotes qui ont les même gènes -> les différences se doivent d’être attribuées à l’action de l’environnement
Qu’est ce qu’un nucléotide ? de quoi est -il formé (3 choses)
baze azotée (G,C,A,T) + phosphate + sucre
qu’est ce qu’un nucléosome ?
Qu’est ce quil permet?
Segment d’ADN + protéine histone
Permet la condensation de l’ADN en chromatine
qu’est ce que l’euchromatine ?
ADN moins condensé : peut être retranscrit
qu’est ce que l’hétéro chromatine
ADN condensé : contient les gènes non transcrit , contient peu de gènes (télomères et centromères)
nommer 2 modification chimique des histones ?
acétylation : ajout d’un groupe acétyl qui augmente l’accessibilité au gène , réversible
méthylation : ajout de groupement méthyl, modifie la condensation des histones = gènes plus ou moins accessibles
qu’est ce qu’un complexe de remodelage ?
des protéines utilisant l’ATP et qui induit des changements dans la conformation du nucléosome (permet de condenser ou décondenser la structure )
=> Contrôle sur l’accessibilité des gènes au mécanisme de transcription
(protéines qui permettent l’acétylation et la méthylation)
replication de l’ADN dans quel sens ?
5’-3’
GÈNE ET TRANSCRIPTION DE L’ADN
étape de transcription
Gène à pré-ARN messager
Introns (intrus) ou pas ? Que se passe -t-il?
encore des introns
transcirption par complimentarité des bases
MATURATION / ÉPISSAGE
de quoi?
que se passe-til? résulte en quoi
maturation de l’ADN prémessager
= que des exons, plus d’introns = ARN messager
ou se fait la TRADUCTION?
ribosome
qu’est ce qu’un codon stop?
un triplet qui arrêt la transcription
couples de nucléotides possibles pour lADN ?
TCAG
couples de nucléotides possibles pour lARNm ?
UCAG
qui est responsable de la traduction des ARNm ?
les ribosomes
qu’est ce qui arrete la production dune protéine par un ribosome lors de la traduction de l’ARNm ?
le codon stop
MUTATIONS
Est ce que lors d’une délétion/insertion de multiples de 3 nucléotides, il y a respect du cadre de lecture ?
oui
MUTATIONS
lors d’une mutation frameshift (délétion / insertion de nucléotides d’un nombre qui n’est pas un multiple de 3) ….
1. est ce qu’il y a respect du cadre de lecture ?
2. qu’est ce qui se passe lorsque la protéine est tronquée ? (2 possibilités)
- non
- soit la protéine est instable et dégradée (donc perte de sa fonction)
ou soit la protéine a un gain de fonction (un nouveau lifestyle)
a chaque triplet de codon correspond un,.,..
acide aminé
La fonction de la protéine va souvent dépendre de sa ….
structure 3D (son repliement)
nommer 3 maladies qui sont causées par le mauvais repliement des protéines
Alzheimer
fibrose kystique
amylose
par quoi peut être altéré le repliement de la protéine ? (2)
mutation génique
facteurs environnementaux
qu’est ce que la drépanocytose ?
une maladie de déformation du globule rouge en faucille qui est causée par une substitution d’un nucléotide par un autre.
nommer deux sortes de mutation génétique qui peuvent causer une sous ou surexpression d’une protéine
- séquence
- régulation
nommer deux sortes de mutation génétique qui peuvent causer une protéine tronqué et donc un gain ou perte de fct?
arrêt de la traduction
maturation de l’ARNm
nommer une sorte de mutation génétique qui peut causer non pas une protéine tronquée, mais quand même une perte/gain de fonction?
changement d’un acide aminé
nommer une maladie des anti enzymes qui est du a une mutation sur un gène
DAAT : mutation sur le gène codant pour l’enzyme AAT
nommer une maladie du a une perte de fonction enzymatique ?
maladie de surcharge lysosomiale
Glycogénose
MAladie de Gaucher (glucocérébrosidase)
lors de déficit en AAT , il y a accumulation de celle ci dans le …
cytoplasme (stress ++ sur le RE)
nommer une maladie génétique (mais pas héréditaire) de protéine tronquée ?
progeria : vieillissement prématuré
protéine tronquée = progérine
- Mutation du gène qui code pour des protéines lamines (partciipe a la structure du noyau ..)
qu’est ce qu’un individu homozygote ?
porteur du même allèle à l’état double (parental et mère)
AA ou aa
comment appelle t-on un individu avec deux allèles différents pour un gène ?
hétérozygote (Aa)
qu’est ce qu’une personne hémizygote ?
porteur d’un seul exemplaire de la paire d’allèle …
= majorité des gènes chez tous les hommes pour le chromosome sexuel X et Y .
Sinon pour les autres paires de chromosome, cela est associé a une pathologie
un gène est (…) lorsqu’il s’EXPRIME à l’état hétérozygote ?
dominant
pour qu’un gène récessif s’exprime, il faut qu’il (…) ou qu’il (…)
- qu’il soit a l’état double (homozygote)
- qu’il soit seul (hémizygote)
comment appelle t-on le phénomène quand chacun des 2 allèles s’expriment chez l’hétérozygote ?
Donner un exemple
codominance ; groupe sanguin AB
la génétique mendélienne : la plupart des traits physiques et mentaux ne peut être expliqué seulement par l’hérédité mendélienne …les variation observées sont explicables seulement par…. (2 choses)
l’action combinée des gènes et du milieu (hérédité multifactorielle)
et aussi par la polylallélie (un gène comporte plus de deux allèles)
Transmission A. récessive (aa ou AA pour etre atteint):
X % des enfants atteints.
dans les enfants atteint X % sont des filles et X% sont des garçons
peut sauter des génération? oui ou non
Nommer un exemple de maladie
25% d’enfant atteint, 50% d’enfant porteur , 25% non affecté
Cosanguinité+++
Autant les filles que les gars peuvent etre atteints (acr gène situé sur un autosome)
Peut sauter des générations : les ascendants et descendants d’une personne atteintes sont souvent normaux (porteurs)
Albinos
Transmission A.dominante :
souvent un parent affecté et l’autre sain
X % des enfants atteints.
dans les enfants atteint X % sont des filles et X% sont des garçons
peut sauter des génération? oui ou non
Nommer 2 exemples de maladie
50% d’enfant atteint.
50% d’enfant sain.
Ne peut pas sauter de génération
Pas de cosanguinité
1. Le nanisme (mais souvent sporadique; nouvelle mutation dans la plupart des cas)
2. Maladie de Marfan
Autant les filles que les gars peuvent etre atteints (acr gène situé sur un autosome)
Transmission liée à l’X : (RÉCESSIF)
les enfants atteints : pourcentage ? gars ou fille?
ex de maladie ?
peut sauter des generation?
La mère est porteuse mais a un autre X pour la protéger
Toujours les hommes qui sont atteints : n’ont pas de deuxième X pour les protéger
25% des enfants atteints (gars)
25% fille porteuse
50% enfant sain
Leurs gars ont 50% de chance d’être atteint et leurs filles ont 50% de chance d’être porteuse.
Peut sauter des generations
Dystrophie de Duchenne
Transmission liée à l’X : (DOMINANT)
rare ++
le père transmet a qui ?
la mère transmet a qui?
le père transmet a toutes ses filles et aucun de ses garcons
la mère transmet a la moitié des garcons et la moitié des filles
qu’est ce que l’empreinte parentale ?
Dans quel cas elle cause des maladies ?
Quand un gène est sousmis a une empreinte, une seule des deux copies du gène est active , soit le gène chez la mère ou le gène chez le père (expression monoallélique )
Fait intervenir l’épigénétique
Maladie si…
- perte d’expression de l’allèle actif
- expression anormale de l’allèle normalement silencieux
quest ce que l’epigenetique
modification de QUOI
modifications chimique des histones réversible (methylation, acétylation) les rendant plus accessible ou moins accessible
qu,est ce qu’un avantage sélectif ?
cellules GR falciformes , MAIS protège contre la malaria (chez les personnes noires)
qu’est ce que la cytogénétique ?
étude la la génétique des chromosomes
qu’est ce qu’un caryotype ?
formule chromosomique caractéristique chez chaque personne , arrangement des chromosomes homologues (23 paires de chromosomes) , suivant sa TAILLE et sa FORME , numérotés selon une classification internationale
les anomalies chromosomiques sont une cause majeure d’échec de la (…) et d’anomalies congénitales et sont extrêmement fréquentes dans les (…)
- reproduction
- cancer
de quoi est composé la chromatine ? 2 types de chromatines
Qu’est ce qu’un chromosome
ADN + histone (nucléosome)
Hétérochromatine/euchromatine
un chromosome est un ADN linéaire condensé+++
chaque chromosome a deux …. reliées par un ….
deux chromatides reliées par un centromère
qu’est ce que la mitose ? abouti a quoi
phase de division cellulaire aboutissant a DEUX cellules filles diploides (2n)
qu’est ce que l’interphase ?
phase du cycle cellulaire sans division (réplication de l'ADN = phase S) phase G1 (preparation replication), S et G2 (preparation mitose)
qu’est ce que la méiose ? abouti a quoi
divison cellulaire en 2 temps abouttisant a 4 cellules filles haploides (1n)
le chromosome est composé de 2 (…) et de 2 (…)
lors de la morphologie (normale mais différente) des chromosomes nommée…
comment s’Apelle quand les bras court sont BCP plus petits que les bras longs ?
bras court (p)
bras long (q)
submétacentrique
acrocentrique
constitustion chromosomique
pour une femme ayant une constitution chromosomique normale ? po0ur un homme normal?
pour un trisomique garcon?
femme normale : 46 XX
Homme normal : 46 XY
triso gars : 47 XY +21 (indiquer le chromosome sur lequel il y en a un de trop)
quelles cellules sont haploides ?
combien ont ils de chromosomes ?
les gamètes : 23 chromosomes (pas 46)
1n = 1x23
les cellules somatiques ont combien de chromosomes ?
combien de paire de chromosomes sont autosomes ?
46 chromosomes (diploides) 22 paires autosomes, 1 paire chromosomes sexuels
combien de chromosome dans une cellule triploide ?
3x23 = 69 chromosomes (3n)
qu’est ce que l’aneuploidie ? nommer 2 maladies, et leur constitution chromosomique
contrairement à la triploidie par exemple, l’augemntation /diminution de nbr de chromosome est sur UNE SEULE PAIRE DE CHROMOSOME …
monosomie fille : 45, X (souvent sur le chromosome sexuel)
trisomie : 47, XY, +21
sauf pour le chromosome (…), les monosomies ne sont pas viables
chromosome X : 45Y n’existe pas
qu’est ce que signifie 46XX t(11;22)
46 chromosomes chez une fille avec une translocation entre le chromosome 11 et 22
nommer 2 type de translocation et leur implication
- translocation balancée réciproque : sans perte de matériel
- trans. fusion centrale : perte de matériel
qu’est ce qu’une inversion paracentrique vs péricentrique
para : reste du meme cote du centromere
peri : de chaque cote du centromère
lors des ring chromosomes est ce qu’il y a perte de matériel ?
deletion?
inversion ?
isochromosome ?
ring : oui
deletion : oui
inversion : non
isochromosome : non
nommer 3 types d’anomalies structurales du chromosome
- deletion
- translocation
- inversion
chez la femme, les chromosomes ont (..) formes différentes
Chez l’homme : (…) formes différentes
23 femme
24 hommes
Chacune des formes se retrouve pour 2 chromosome sauf pour le chromosome Y
le premier prérequis pour l’analyse cytogénétique est d’obtenir des cellules…
NOmmer 3 types de cellules et donner un exemple pour chaque
en division
- cells en divison spontanée et fréquente (cellules tumorales, cellules de la moelle osseuse)
- divison spontanée moins fréquente (fibroblastes, cellules tumorales, cellules embryonaires)
- normalement ne se divisent pas (lymphocytes sanguins)
nommer 3 limites des caryotipes
- pauvre resolution
- les bandes sur les chromosomes peuvent se ressembler
- nécessite d’obtenir des mitoses
qu’est ce que la cytogénétique moléculaire (FISH-CGH-SNParray)
Quand est ce qu’on l’utilise ?
dans les cas ou l’index mitotique des cellules etudié est trop faible
ou quand les anomalies sont infra microscopiques
qu’est ce que la cytogenetique FISH
- repose sur les propriétés de denaturation/ renaturation de la molécule d’ADN
- sonde marquée
- si anomalie pas là : la sonde ne s’accroche pas = pas de fluorescence
- lecture possible sur noyaux interphasiques !
comme des ti poissons qui s’Accrochent aux anomales de repliement des protéines
Sondes FISH
Nommer deux types bons pour les translocations?
sonde breakapart, peinture de tout le génome
sondes FISH
Nommer un type bon pour dénombrer les chromosomes
Centromérique
Nommer une limite des sondes FISH
exemple la peinture peut confirmer une trasnlocation, mais pas la région chromosomique impliquée si insertion
CGH : comparaison du nbr de molécules
Ratio d’une valeur de ? si nombre identique de molécules, ratio de ? si délétion, de ? si gain (trisomie )
normal : 1
perte : 0.5
gain : 1.5
Donc si trasnlocation équilibrée et réciproche, on ne perd rien on reste a un ratio normal de 1
On compare des qté : bon pour la trisomie
nommer un type de cytogénétique moléculaire bon pour :
- les anomalies de nombre
- les translocation
- les anomalies de nombre : FISH centromérique, CGH
- les translocation : FISH peinture ou Break Apart
cytogénétique moléculaire/limites du CGH : le CGH ne détecte pas…
- les anomalies génétiques
- les anomalies équilibrées (translocation, inversion)
- anomalies déséquilibéres dans moins de 10% des cellules (si tissu tumoral avec 5% de cellules tumorales ; pas bon)
nommer 5 raison de faire de la cytogénétique
- conseil génétique , dx prénatal
- retard mentaux familiaux
- problème d’avortement répétés
- problèmes de fertilité
- cancer
les problèmes de fertilité sont du a une anomalie impliquant les (…)
chromosomes sexuels
exemple monosomie 45X
l’analyse chromosomique dans les cancer aide a … (4)
- confirmer le dx
- pronostic
- classifier le type de tumeur
- orienter la therapie
FISH : complément du (…) pour détecter les (…)
- caryotype
- délétion
ce sont des manifestations de quelle maladie ?
fentes palpébrales obliques en haut et en dehors
grosse langue
pli palmaire median unique
hypotonie générale
retard de développement
malformations cardiaques
trisomie 21
ce sont des manifestations de quelle maladie ? petit poids a la naissance retard mental HYPERtonie dymorphie craniofaciale mains botes mort précoce
trisomie 18
ce sont des manifestations de quelle maladie ?
femmes
QI normal ou légèrement abaissé
taille petite
faible développement des caractères sexuels
infertilité
sy de turner (45X) monosomie !!!
ce sont des manifestations de quelle maladie ?
hommes
grande taille
faible développement des caractères sexuels
petites testicules = infertiles
ont des seins
sy de Klinefelter (47 XXY)