Fosforylacja oksydacyjna Flashcards
Cykl Krebsa Transport elektronów
Związki bogate w energię- glikoliza
1,3- bisfosfoglicerynian
Fosfoenolopirogronian
Wykorzystywanie energii
Biosynteza makromolekuł Praca mechaniczna Tworzenie gradientów stężeń i potencjałów Wytwarzanie ciepła Luminescencja
Wzór na ładunek energii
[ATP] + 1/2 [ADP] / [ATP] + [ADP] + [AMP]
Duży spadek potencjału termodynamicznego procesu hydrolizy bezwodników wynika z…
- Elektrostatycznego odpychania
- Stabilizacji produktów hydrolizy przez:
- odpychanie ładunków
- rezonans
Związki wysokoenergetyczne
1,3- bisfosfoglicerynian
Fosfoenolopirogronian
Fosfokreatyna
Związki niskoenergetyczne
Glukozo-6-fosforan
3-fosfoglicerol
Ile elektronów potrzeba na zredukowanie NAD+?
2
Kompleks I
Oksydoreduktaza NADH-CoQ
25 polipeptydów
FMN, centra Fe-S
Czego pochodną jest FMN
Ryboflawiny
FMN- forma utleniona- barwa
Żółta
FMN- forma zredukowana- barwa
Bezbarwna
FMN- niebieska barwa
Forma semichinonowa
Uprotonowana
FMN- czerwona barwa
Forma semichinonowa
Wolny rodnik
Kompleks II
Oksydoreduktaza FADH2-CoQ
4 polipeptydy
Fe-S
Jaki aminokwas zawierają centra żelazo-siarkowe?
Cysteina
Postacie CoQ
Utleniona CoQ
Semichinonowa CoQH
Zredukowana CoQH2
Kompleks III
Oksydoreduktaza CoQ-CytC
9-10 polipeptydów
Cytochromy b, Fe-S, cytochrom c1
Cytochromy b
Zawierają CH2=CH
Cytochromy c
Zawierają siarkę i cysteinę
Które cytochromy mają wyższą absorbancję?
Zredukowane
Kompleks IV
Oksydaza cytochromowa
13 polipeptydów
Cu2+, cytochromy a i a3
NADH- ile jonów H+ wypompowanych
10
FADH2- ile jonó H+ wypompowanych
6
Do syntezy 1 ATP ile potrzeba wypompowanych H+?
4
P/O
x ATP/ (1/2O2)
Czynniki rozprzęgające
2,4-dinitrofenol (DNP)
FCCP
Czynniki rozprzęgające- charakterystyka
- Rozpuszczalne w lipidach i wodzie
2. Wymieniają proton (przenoszą i oddysocjowują)
Podjednostki F1
3(alfa,beta), delta, epsilon, gamma
3 stany konformacyjne F1
Pusty- O
ADP- L
ATP- P
Które podjednostki rotują?
Gamma, epsilon
Hamowanie dehydrogenazy NADH (FMN)
Rotenon
Amytal
Co hamuje antymycyna a?
Przejście elektronów cyt b –> Fe-S
Co hamuje oksydazę cytochromową?
CN-
CO
N3-
Reaktywne formy tlenu- azot
Tlenek azotu (II)
Tlenek azotu (IV)
Nadtlenoazotyn
Kwas natlenoazotawy
Gdzie znajduje się oksydaza NADPH?
Monocyty
Makrofagi
Neutrofile
Co powstaje w reakcji oksydazy NADPH?
Anionorodnik ponadtlenkowy
Dysmutaza ponadtlenkowa
Anionorodnik ponadtlenkowy –> H2O2
Mieloperoksydaza
H2O2 –> HOCL
Podchloryn
HOCL –> OCL-
Powstawanie RFT
- Oksydaza NADPH
- Oksydaza ksantynowa
- Łańcuch transportu elektronów
- Hb (Fe2+) (reduktaza met-Hb)
- Cyt P450
SOD
Dysmutaza ponadtlenkowa
Co zawiera wewnątrzkomórkowa SOD?
Cu/Zn
Co zawiera mitochondrialna SOD?
Mn
Źródła nadtlenku wodoru
- Dysmutaza ponadtlenkowa (SOD)
- Oksydazy
- ksantynowa
- aminokwasów (FMN, FAD)
Źródła rodnika wodorotlenowego
- Promieniowanie jonizujące
- Reakcja Fentona
H2O2 + O2* –> O2 + OH- + OH*
Wewntrzkomórkowe systemy ochrony przed RFT
- SOD
- Katalaza
- Peroksydaza glutationowa
Zewnątrzkomórkowe systemy ochrony przed RFT
- Albumina
- Pozakomórkowa SOD
- Moczan
- Witamina C
- Witamina E
- Bilirubina
Dehydrogenaza pirogronianowa
Pirogronian + NAD+ + CoA
–>Acetylo-CoA + CO2 + NADH+ H+
Kofaktory dehydrogenazy pirogronianowej
B1 B2 B3 B5 Liponian
Dehydrogenaza pirogronianowa- podjednostki
E1: dekarboksylaza pirogronianowa
E2: transacetylaza dihydroliponianowa
E3: dehydrogenaza dihydroliponianowa
Dekarboksylaza pirogronianowa- koenzym
TPP
Transacetylaza dihydroliponianowa- koenzym
Liponian
Dehydrogenaza dihydroliponianowa- koenzym
FAD
Dehydrogenaza pirogronianowa- hamowanie
Acetylo-CoA
NADH
ATP
Dehydrogenaza pirogronianowa- stymulacja
AMP
Przez co inaktywowana jest dehydrogenaza pirogronianowa
Fosforylacja
Co jest odłączane w procesie syntazy cytrynianowej?
CoA
cis-Akonitam powstaje w wyniku jakiego procesu?
Dehydratacji
Jaki enzym konwertuje cytrynian do izocytrynianu?
Akonitaza
Do czego utleniany jest izocytrynian?
Do alfa-ketoglutaranu
Co dodawane jest w procesie dehydrogenazy alfa-ketoglutaranu?
CoA-SH
Dehydrogenaza alfa-ketoglutaranu- koenzymy
DPT Kwas liponowy FAD NAD+ CoA
Co powstaje w procesie syntazy bursztynylo-CoA
GTP
CoA
Bursztynian
Syntetaza burstzynylo-CoA- przykład reakcji
Fosforylacja substratowa
Przez co hamowana jest dehydrogenaza bursztynianowa?
Malonian
Jak przekształcić fumaran do jabłczanu?
Hydratacja
Co napędza reakcję konwersji jabłczanu do szczawiooctanu?
Zużycie szczawioctanu (bo delta G jest dodatnia!)
Akonitaza- hamowanie
NADH
ATP
Bursztynylo-CoA
Akonitaza- stymulacja
ADP
Dehydrogenaza izocytrynianowa- hamowanie
NADH
Dehydrogenaza izocytrynianowa- aktywacja
ADP
Dehydrogenaza alfa-ketoglutaranu- hamowanie
Bursztynylo-CoA
NADH